MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 56264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_011761	GAC	2	6	195916	195921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4003	NC_011761	T	6	6	195963	195968	0 %	100 %	0 %	0 %	218666535
4004	NC_011761	GCG	2	6	195969	195974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666535
4005	NC_011761	CGG	2	6	195987	195992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666535
4006	NC_011761	TCTT	2	8	196007	196014	0 %	75 %	0 %	25 %	218666535
4007	NC_011761	GACG	2	8	196132	196139	25 %	0 %	50 %	25 %	218666535
4008	NC_011761	GGC	2	6	196237	196242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666535
4009	NC_011761	GAA	2	6	196303	196308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666535
4010	NC_011761	GCG	2	6	196329	196334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666535
4011	NC_011761	CGC	2	6	196335	196340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666535
4012	NC_011761	GAA	2	6	196348	196353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666535
4013	NC_011761	GCCC	2	8	196362	196369	0 %	0 %	25 %	75 %	218666535
4014	NC_011761	CAG	2	6	196393	196398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4015	NC_011761	GCG	2	6	196399	196404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666535
4016	NC_011761	GC	3	6	196423	196428	0 %	0 %	50 %	50 %	218666535
4017	NC_011761	C	6	6	196458	196463	0 %	0 %	0 %	100 %	218666535
4018	NC_011761	CGGT	2	8	196489	196496	0 %	25 %	50 %	25 %	218666535
4019	NC_011761	TCG	2	6	196507	196512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4020	NC_011761	AGT	2	6	196526	196531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666535
4021	NC_011761	CG	3	6	196539	196544	0 %	0 %	50 %	50 %	218666535
4022	NC_011761	GGA	2	6	196587	196592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218666535
4023	NC_011761	CAG	2	6	196630	196635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4024	NC_011761	CGT	2	6	196792	196797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4025	NC_011761	TTC	2	6	196852	196857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218666535
4026	NC_011761	TGC	2	6	196879	196884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4027	NC_011761	TTC	2	6	196889	196894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218666535
4028	NC_011761	GCC	2	6	196931	196936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666535
4029	NC_011761	GCA	2	6	196944	196949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4030	NC_011761	GTC	2	6	196957	196962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4031	NC_011761	C	6	6	196976	196981	0 %	0 %	0 %	100 %	218666535
4032	NC_011761	C	6	6	196985	196990	0 %	0 %	0 %	100 %	218666535
4033	NC_011761	CAG	2	6	197017	197022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4034	NC_011761	CG	3	6	197064	197069	0 %	0 %	50 %	50 %	218666535
4035	NC_011761	AG	3	6	197085	197090	50 %	0 %	50 %	0 %	218666535
4036	NC_011761	CGCGCC	2	12	197207	197218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666535
4037	NC_011761	GCT	2	6	197237	197242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4038	NC_011761	CGT	2	6	197262	197267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666535
4039	NC_011761	CCG	2	6	197291	197296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666535
4040	NC_011761	GCG	2	6	197457	197462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666650
4041	NC_011761	AG	3	6	197466	197471	50 %	0 %	50 %	0 %	218666650
4042	NC_011761	GTC	2	6	197531	197536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666650
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4044	NC_011761	GAT	2	6	197870	197875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666650
4045	NC_011761	T	7	7	197962	197968	0 %	100 %	0 %	0 %	218666650
4046	NC_011761	GCT	2	6	197969	197974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666650
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4050	NC_011761	CAT	2	6	198578	198583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667627
4051	NC_011761	TGA	2	6	198766	198771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667627
4052	NC_011761	CGG	2	6	198776	198781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667627
4053	NC_011761	AGG	2	6	198784	198789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667627
4054	NC_011761	CTT	2	6	198811	198816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218667627
4055	NC_011761	GCG	2	6	198875	198880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667627
4056	NC_011761	CGG	2	6	198896	198901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667627
4057	NC_011761	CGA	2	6	198926	198931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667627
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4061	NC_011761	GCT	2	6	199094	199099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667627
4062	NC_011761	GCG	2	6	199139	199144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667627
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4086	NC_011761	TAC	2	6	200400	200405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665025
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4102	NC_011761	CCA	2	6	201166	201171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218665025
4103	NC_011761	GGC	2	6	201204	201209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665025
4104	NC_011761	AGG	2	6	201259	201264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665025
4105	NC_011761	A	6	6	201265	201270	100 %	0 %	0 %	0 %	218665025
4106	NC_011761	CGG	2	6	201273	201278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665025
4107	NC_011761	TC	3	6	201285	201290	0 %	50 %	0 %	50 %	218665025
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4111	NC_011761	GCGG	2	8	201394	201401	0 %	0 %	75 %	25 %	218665025
4112	NC_011761	GCC	2	6	201406	201411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665025
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4119	NC_011761	GAT	2	6	201687	201692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665025
4120	NC_011761	CGA	2	6	201719	201724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665025
4121	NC_011761	GCC	2	6	201744	201749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665025
4122	NC_011761	CTCA	2	8	201867	201874	25 %	25 %	0 %	50 %	218665025
4123	NC_011761	TC	3	6	201933	201938	0 %	50 %	0 %	50 %	218665025
4124	NC_011761	CTG	2	6	201978	201983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665025
4125	NC_011761	ATC	2	6	202027	202032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665025
4126	NC_011761	AGA	2	6	202066	202071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665025
4127	NC_011761	GAA	2	6	202137	202142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665025
4128	NC_011761	TCCGGC	2	12	202175	202186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218665025
4129	NC_011761	GCC	2	6	202218	202223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665025
4130	NC_011761	GCG	3	9	202263	202271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665025
4131	NC_011761	AGG	2	6	202330	202335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665025
4132	NC_011761	GAC	2	6	202359	202364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665025
4133	NC_011761	TCC	2	6	202466	202471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667262
4134	NC_011761	GGC	2	6	202583	202588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4135	NC_011761	TGG	2	6	202627	202632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667262
4136	NC_011761	CAT	2	6	202638	202643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667262
4137	NC_011761	CAATGC	2	12	202688	202699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218667262
4138	NC_011761	GCGG	2	8	202721	202728	0 %	0 %	75 %	25 %	218667262
4139	NC_011761	GC	3	6	202768	202773	0 %	0 %	50 %	50 %	218667262
4140	NC_011761	TGC	2	6	202783	202788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667262
4141	NC_011761	A	6	6	202831	202836	100 %	0 %	0 %	0 %	218667262
4142	NC_011761	CGC	2	6	202838	202843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667262
4143	NC_011761	GCG	3	9	202896	202904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4144	NC_011761	ACC	2	6	202911	202916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667262
4145	NC_011761	GAT	2	6	203000	203005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667262
4146	NC_011761	GCA	2	6	203072	203077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667262
4147	NC_011761	CCA	2	6	203137	203142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667262
4148	NC_011761	GACGG	2	10	203165	203174	20 %	0 %	60 %	20 %	218667262
4149	NC_011761	GCG	2	6	203175	203180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4150	NC_011761	GA	3	6	203225	203230	50 %	0 %	50 %	0 %	218667262
4151	NC_011761	TGGC	2	8	203253	203260	0 %	25 %	50 %	25 %	218667262
4152	NC_011761	CGGG	2	8	203317	203324	0 %	0 %	75 %	25 %	218667262
4153	NC_011761	ATG	2	6	203326	203331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667262
4154	NC_011761	GGC	2	6	203426	203431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4155	NC_011761	CGA	2	6	203450	203455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667262
4156	NC_011761	GGCG	2	8	203465	203472	0 %	0 %	75 %	25 %	218667262
4157	NC_011761	CTGG	2	8	203480	203487	0 %	25 %	50 %	25 %	218667262
4158	NC_011761	GGC	2	6	203537	203542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4159	NC_011761	AGG	2	6	203563	203568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667262
4160	NC_011761	G	6	6	203596	203601	0 %	0 %	100 %	0 %	218667262
4161	NC_011761	CCG	2	6	203602	203607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667262
4162	NC_011761	CTG	2	6	203726	203731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667936
4163	NC_011761	TGCGC	2	10	203734	203743	0 %	20 %	40 %	40 %	218667936
4164	NC_011761	CGG	2	6	203782	203787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667936
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4214	NC_011761	GAC	2	6	206074	206079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666135
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4221	NC_011761	GCCCG	2	10	206230	206239	0 %	0 %	40 %	60 %	218666135
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4228	NC_011761	GCTG	2	8	206710	206717	0 %	25 %	50 %	25 %	218667413
4229	NC_011761	CCG	2	6	206791	206796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667413
4230	NC_011761	GC	3	6	206870	206875	0 %	0 %	50 %	50 %	218667413
4231	NC_011761	GT	3	6	206941	206946	0 %	50 %	50 %	0 %	218667413
4232	NC_011761	CGC	2	6	206969	206974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667413
4233	NC_011761	G	6	6	207011	207016	0 %	0 %	100 %	0 %	218667413
4234	NC_011761	GC	3	6	207038	207043	0 %	0 %	50 %	50 %	218667413
4235	NC_011761	GGA	2	6	207050	207055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667413
4236	NC_011761	CAT	2	6	207066	207071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667413
4237	NC_011761	CTG	2	6	207072	207077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667413
4238	NC_011761	CTTGC	2	10	207123	207132	0 %	40 %	20 %	40 %	218667413
4239	NC_011761	GTCT	2	8	207162	207169	0 %	50 %	25 %	25 %	218667413
4240	NC_011761	G	6	6	207212	207217	0 %	0 %	100 %	0 %	218667413
4241	NC_011761	GCG	2	6	207234	207239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667413
4242	NC_011761	TGCC	2	8	207259	207266	0 %	25 %	25 %	50 %	218667413
4243	NC_011761	TCC	2	6	207295	207300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667413
4244	NC_011761	CGG	2	6	207307	207312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667413
4245	NC_011761	GCC	2	6	207339	207344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667413
4246	NC_011761	CAT	2	6	207377	207382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667413
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4353	NC_011761	GCC	2	6	212916	212921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667929
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4361	NC_011761	TCA	2	6	213612	213617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218668152
4362	NC_011761	GCG	2	6	213659	213664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668152
4363	NC_011761	TGC	2	6	213751	213756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668152
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4365	NC_011761	ATG	2	6	213883	213888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218668152
4366	NC_011761	CGC	2	6	213892	213897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665332
4367	NC_011761	GCT	2	6	213918	213923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665332
4368	NC_011761	GTC	2	6	213931	213936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665332
4369	NC_011761	GCCT	2	8	213969	213976	0 %	25 %	25 %	50 %	218665332
4370	NC_011761	TGG	2	6	213988	213993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665332
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4388	NC_011761	GATA	2	8	214785	214792	50 %	25 %	25 %	0 %	218665332
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4393	NC_011761	CCGG	2	8	214899	214906	0 %	0 %	50 %	50 %	218665332
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4487	NC_011761	CACC	2	8	218970	218977	25 %	0 %	0 %	75 %	218667111
4488	NC_011761	CCA	2	6	219032	219037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667111
4489	NC_011761	GACG	2	8	219062	219069	25 %	0 %	50 %	25 %	218667111
4490	NC_011761	GGCC	2	8	219182	219189	0 %	0 %	50 %	50 %	218667111
4491	NC_011761	AGA	2	6	219233	219238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667111
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4493	NC_011761	ACC	2	6	219502	219507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666125
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4500	NC_011761	CGGCG	2	10	219819	219828	0 %	0 %	60 %	40 %	218666125

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