MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 56264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_011761	TGC	2	6	150020	150025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3003	NC_011761	GGC	2	6	150057	150062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666720
3004	NC_011761	GGC	2	6	150066	150071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666720
3005	NC_011761	CAGG	2	8	150075	150082	25 %	0 %	50 %	25 %	218666720
3006	NC_011761	GCA	2	6	150098	150103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3007	NC_011761	TGCC	2	8	150122	150129	0 %	25 %	25 %	50 %	218666720
3008	NC_011761	GC	3	6	150131	150136	0 %	0 %	50 %	50 %	218666720
3009	NC_011761	GCTGA	2	10	150155	150164	20 %	20 %	40 %	20 %	218666720
3010	NC_011761	GTGTG	2	10	150167	150176	0 %	40 %	60 %	0 %	218666720
3011	NC_011761	GGT	2	6	150206	150211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666720
3012	NC_011761	CAG	2	6	150249	150254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3013	NC_011761	TGG	3	9	150296	150304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666720
3014	NC_011761	CTG	2	6	150305	150310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3015	NC_011761	GA	3	6	150337	150342	50 %	0 %	50 %	0 %	218666720
3016	NC_011761	GCT	2	6	150420	150425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3017	NC_011761	GTC	2	6	150481	150486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3018	NC_011761	AAT	2	6	150502	150507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218666720
3019	NC_011761	TCC	2	6	150604	150609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218666720
3020	NC_011761	GCA	2	6	150620	150625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3021	NC_011761	GCCCA	2	10	150631	150640	20 %	0 %	20 %	60 %	218666720
3022	NC_011761	GCCCA	2	10	150649	150658	20 %	0 %	20 %	60 %	218666720
3023	NC_011761	CAG	4	12	150663	150674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3024	NC_011761	CCAG	2	8	150677	150684	25 %	0 %	25 %	50 %	218666720
3025	NC_011761	GCA	2	6	150713	150718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
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3029	NC_011761	TCA	2	6	150851	150856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666720
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3032	NC_011761	CAG	2	6	150975	150980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3033	NC_011761	TGC	2	6	150986	150991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3034	NC_011761	CAG	2	6	151011	151016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
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3036	NC_011761	GGCC	2	8	151026	151033	0 %	0 %	50 %	50 %	218666720
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3040	NC_011761	GCG	2	6	151147	151152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666720
3041	NC_011761	CAG	2	6	151173	151178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3042	NC_011761	TGA	2	6	151208	151213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666720
3043	NC_011761	GCGG	2	8	151269	151276	0 %	0 %	75 %	25 %	218666720
3044	NC_011761	GCT	2	6	151350	151355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666720
3045	NC_011761	GCC	2	6	151365	151370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666720
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3047	NC_011761	AGA	2	6	151592	151597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666386
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3049	NC_011761	G	7	7	151629	151635	0 %	0 %	100 %	0 %	218666386
3050	NC_011761	GCG	2	6	151658	151663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666386
3051	NC_011761	CAGC	2	8	151664	151671	25 %	0 %	25 %	50 %	218666386
3052	NC_011761	GC	3	6	151691	151696	0 %	0 %	50 %	50 %	218666386
3053	NC_011761	CGGT	2	8	151708	151715	0 %	25 %	50 %	25 %	218666386
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3055	NC_011761	CGGCG	2	10	151828	151837	0 %	0 %	60 %	40 %	218666386
3056	NC_011761	AGGA	2	8	151849	151856	50 %	0 %	50 %	0 %	218666386
3057	NC_011761	GGACC	2	10	151957	151966	20 %	0 %	40 %	40 %	218666386
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3059	NC_011761	GGA	2	6	152069	152074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218666386
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3063	NC_011761	GAG	2	6	152142	152147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218666386
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3069	NC_011761	GC	3	6	152435	152440	0 %	0 %	50 %	50 %	218666386
3070	NC_011761	CTG	2	6	152451	152456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666386
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3091	NC_011761	GCG	2	6	153307	153312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665801
3092	NC_011761	TTCA	2	8	153394	153401	25 %	50 %	0 %	25 %	218665801
3093	NC_011761	CCAG	2	8	153410	153417	25 %	0 %	25 %	50 %	218665721
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3101	NC_011761	CG	3	6	153754	153759	0 %	0 %	50 %	50 %	218665721
3102	NC_011761	GGC	2	6	153777	153782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665721
3103	NC_011761	AGGCG	2	10	153800	153809	20 %	0 %	60 %	20 %	218665721
3104	NC_011761	CTT	2	6	153819	153824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218665721
3105	NC_011761	GAC	2	6	153873	153878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665721
3106	NC_011761	CGGC	2	8	153927	153934	0 %	0 %	50 %	50 %	218665721
3107	NC_011761	CTG	2	6	153943	153948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665721
3108	NC_011761	CGC	2	6	153959	153964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665721
3109	NC_011761	GGC	2	6	154119	154124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665721
3110	NC_011761	GC	3	6	154123	154128	0 %	0 %	50 %	50 %	218665721
3111	NC_011761	GCCC	2	8	154231	154238	0 %	0 %	25 %	75 %	218667805
3112	NC_011761	CGG	2	6	154247	154252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667805
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3118	NC_011761	CA	3	6	154420	154425	50 %	0 %	0 %	50 %	218667805
3119	NC_011761	CGT	2	6	154443	154448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667805
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3242	NC_011761	CG	3	6	160636	160641	0 %	0 %	50 %	50 %	218668163
3243	NC_011761	ACA	2	6	160644	160649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218668163
3244	NC_011761	TGA	2	6	160716	160721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218668163
3245	NC_011761	TGC	2	6	160734	160739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3246	NC_011761	GGA	2	6	160804	160809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218668163
3247	NC_011761	TGC	2	6	160882	160887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3248	NC_011761	CGA	2	6	160912	160917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3249	NC_011761	GAA	2	6	160955	160960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218668163
3250	NC_011761	ACG	2	6	160980	160985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3251	NC_011761	GGT	2	6	161005	161010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218668163
3252	NC_011761	CTG	3	9	161027	161035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3253	NC_011761	CCCGG	2	10	161248	161257	0 %	0 %	40 %	60 %	218668163
3254	NC_011761	CCA	2	6	161286	161291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218668163
3255	NC_011761	TGC	2	6	161310	161315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3256	NC_011761	CTG	2	6	161318	161323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3257	NC_011761	AGC	2	6	161373	161378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3258	NC_011761	CCAT	2	8	161397	161404	25 %	25 %	0 %	50 %	218668163
3259	NC_011761	ATCA	2	8	161546	161553	50 %	25 %	0 %	25 %	218668163
3260	NC_011761	CGC	2	6	161587	161592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218668163
3261	NC_011761	TCCT	2	8	161603	161610	0 %	50 %	0 %	50 %	218668163
3262	NC_011761	ATC	2	6	161627	161632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218668163
3263	NC_011761	CCG	2	6	161661	161666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218668163
3264	NC_011761	GCC	2	6	161681	161686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218668163
3265	NC_011761	ATG	2	6	161724	161729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218668163
3266	NC_011761	ATC	2	6	162017	162022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218668163
3267	NC_011761	GGC	2	6	162029	162034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668163
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3269	NC_011761	AGG	2	6	162066	162071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218668163
3270	NC_011761	GGA	2	6	162130	162135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218668163
3271	NC_011761	TGC	2	6	162138	162143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668163
3272	NC_011761	GAT	2	6	162296	162301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665404
3273	NC_011761	GGC	2	6	162310	162315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665404
3274	NC_011761	GCC	2	6	162354	162359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665404
3275	NC_011761	CAT	2	6	162395	162400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665404
3276	NC_011761	CTG	2	6	162423	162428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665404
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3278	NC_011761	CTG	2	6	162471	162476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665404
3279	NC_011761	CTG	2	6	162480	162485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665404
3280	NC_011761	CGC	2	6	162507	162512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665404
3281	NC_011761	CTG	2	6	162543	162548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665404
3282	NC_011761	TGC	5	15	162550	162564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665404
3283	NC_011761	CTG	3	9	162609	162617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665404
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3312	NC_011761	CTG	2	6	163948	163953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667563
3313	NC_011761	GCCCGC	2	12	164011	164022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667563
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3329	NC_011761	GCGCG	2	10	164675	164684	0 %	0 %	60 %	40 %	218667563
3330	NC_011761	CCAC	2	8	164717	164724	25 %	0 %	0 %	75 %	218667563
3331	NC_011761	GCT	2	6	164895	164900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667563
3332	NC_011761	GGAGC	2	10	164973	164982	20 %	0 %	60 %	20 %	218667563
3333	NC_011761	TGC	2	6	165005	165010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667563
3334	NC_011761	CGA	2	6	165012	165017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667563
3335	NC_011761	TCC	2	6	165025	165030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667563
3336	NC_011761	CCG	2	6	165032	165037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667563
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3338	NC_011761	TGC	2	6	165119	165124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667563
3339	NC_011761	GCC	2	6	165163	165168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667563
3340	NC_011761	CTG	2	6	165172	165177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667563
3341	NC_011761	ATT	2	6	165216	165221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218667563
3342	NC_011761	CCT	2	6	165248	165253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218665857
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3344	NC_011761	GCT	2	6	165278	165283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665857
3345	NC_011761	T	6	6	165302	165307	0 %	100 %	0 %	0 %	218665857
3346	NC_011761	GTG	2	6	165312	165317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665857
3347	NC_011761	CGC	2	6	165333	165338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665857
3348	NC_011761	CAT	2	6	165344	165349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665857
3349	NC_011761	GCG	2	6	165451	165456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665857
3350	NC_011761	CTG	2	6	165489	165494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665857
3351	NC_011761	TGG	3	9	165511	165519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665857
3352	NC_011761	CTG	2	6	165576	165581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665857
3353	NC_011761	GATC	2	8	165593	165600	25 %	25 %	25 %	25 %	218665857
3354	NC_011761	GCT	3	9	165653	165661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665857
3355	NC_011761	ATC	2	6	165729	165734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665857
3356	NC_011761	G	6	6	165797	165802	0 %	0 %	100 %	0 %	218665857
3357	NC_011761	GGCTG	2	10	165838	165847	0 %	20 %	60 %	20 %	218665857
3358	NC_011761	CGC	2	6	165875	165880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665857
3359	NC_011761	GCG	2	6	165886	165891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665857
3360	NC_011761	CTG	2	6	165912	165917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665857
3361	NC_011761	GGGAC	2	10	165926	165935	20 %	0 %	60 %	20 %	218665857
3362	NC_011761	ATGCC	2	10	165937	165946	20 %	20 %	20 %	40 %	218665857
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3485	NC_011761	GGC	2	6	171017	171022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665803
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