MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii AB0057 plasmid pAB0057

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011585	AAC	2	6	65	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155359
2	NC_011585	TTG	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213155359
3	NC_011585	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155359
4	NC_011585	GAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155359
5	NC_011585	TAG	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155359
6	NC_011585	TAG	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155359
7	NC_011585	AGA	3	9	680	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155359
8	NC_011585	ATC	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155360
9	NC_011585	AAG	2	6	1125	1130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155360
10	NC_011585	TGA	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155360
11	NC_011585	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155360
12	NC_011585	CAA	2	6	1211	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155360
13	NC_011585	CAG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155360
14	NC_011585	CAC	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213155360
15	NC_011585	ACA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155360
16	NC_011585	CAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155360
17	NC_011585	AAT	2	6	1352	1357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155360
18	NC_011585	CCA	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213155361
19	NC_011585	TTA	2	6	1971	1976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155361
20	NC_011585	TCA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155361
21	NC_011585	TGC	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155361
22	NC_011585	CTG	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155361
23	NC_011585	TAA	2	6	2348	2353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155361
24	NC_011585	GAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155362
25	NC_011585	TGG	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213155362
26	NC_011585	TGA	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155362
27	NC_011585	ATC	2	6	2984	2989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155362
28	NC_011585	TGA	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155363
29	NC_011585	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155363
30	NC_011585	TCA	2	6	3341	3346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155363
31	NC_011585	TAC	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
32	NC_011585	TGA	2	6	3594	3599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
33	NC_011585	TAT	2	6	3753	3758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155364
34	NC_011585	AAT	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
35	NC_011585	GTG	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213155364
36	NC_011585	TAC	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
37	NC_011585	CAG	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155364
38	NC_011585	CTC	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213155364
39	NC_011585	AGA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155364
40	NC_011585	ATA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
41	NC_011585	ATG	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
42	NC_011585	TAT	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155364
43	NC_011585	TCA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
44	NC_011585	ATG	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
45	NC_011585	ATT	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155364
46	NC_011585	ATA	2	6	4739	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
47	NC_011585	AAG	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155364
48	NC_011585	ACC	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213155364
49	NC_011585	CAG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155364
50	NC_011585	TAA	2	6	4962	4967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
51	NC_011585	TAA	2	6	4995	5000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
52	NC_011585	CTA	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
53	NC_011585	AAT	2	6	5233	5238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
54	NC_011585	GAT	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
55	NC_011585	CTG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155364
56	NC_011585	CCT	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213155364
57	NC_011585	TGA	2	6	5628	5633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
58	NC_011585	ATA	2	6	5678	5683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
59	NC_011585	AAT	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
60	NC_011585	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155364
61	NC_011585	CAA	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155365
62	NC_011585	AAC	2	6	6255	6260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155365
63	NC_011585	ACT	2	6	6319	6324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155365
64	NC_011585	ATG	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155365
65	NC_011585	TGA	2	6	6442	6447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155365
66	NC_011585	GCA	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155365
67	NC_011585	TCA	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155365
68	NC_011585	TGA	2	6	6574	6579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155365
69	NC_011585	ACT	2	6	7148	7153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155366
70	NC_011585	ATC	2	6	7170	7175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155366
71	NC_011585	CAT	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155366
72	NC_011585	ATC	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155366
73	NC_011585	AAT	2	6	7417	7422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155366
74	NC_011585	GTG	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213155367
75	NC_011585	ATT	2	6	8521	8526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155369

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.