MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL54

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011315	AAG	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809833
2	NC_011315	TGT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809833
3	NC_011315	CAC	2	6	819	824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809833
4	NC_011315	ATG	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809833
5	NC_011315	ACG	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809833
6	NC_011315	ACG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809833
7	NC_011315	GCT	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809833
8	NC_011315	CAA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809833
9	NC_011315	AAT	2	6	1658	1663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809834
10	NC_011315	CAT	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809834
11	NC_011315	TTC	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809834
12	NC_011315	ACG	2	6	1898	1903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809834
13	NC_011315	CTA	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809834
14	NC_011315	ATA	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809834
15	NC_011315	TGT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809834
16	NC_011315	TTC	2	6	2197	2202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809834
17	NC_011315	CTT	2	6	2217	2222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809834
18	NC_011315	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809834
19	NC_011315	TTA	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809834
20	NC_011315	GGT	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809835
21	NC_011315	TGA	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
22	NC_011315	TAT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
23	NC_011315	AAT	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809835
24	NC_011315	TAG	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
25	NC_011315	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
26	NC_011315	TAG	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
27	NC_011315	CAA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809835
28	NC_011315	TCT	2	6	4004	4009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809835
29	NC_011315	CAA	2	6	4012	4017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809835
30	NC_011315	ATG	3	9	4029	4037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
31	NC_011315	TTG	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
32	NC_011315	CAG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809835
33	NC_011315	TAA	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809835
34	NC_011315	TGT	3	9	4298	4306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
35	NC_011315	GTT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
36	NC_011315	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809835
37	NC_011315	ATG	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
38	NC_011315	ATG	3	9	4600	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
39	NC_011315	CAA	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809835
40	NC_011315	TTA	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
41	NC_011315	ATC	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809835
42	NC_011315	GCT	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809835
43	NC_011315	ATA	2	6	4930	4935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809835
44	NC_011315	TGT	3	9	5021	5029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
45	NC_011315	TAT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
46	NC_011315	CTA	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809835
47	NC_011315	AGA	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809835
48	NC_011315	TTA	2	6	5279	5284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
49	NC_011315	TGA	3	9	5288	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.