MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 12967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
2	NC_011313	CAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
3	NC_011313	ATT	2	6	1300	1305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
4	NC_011313	ACA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
5	NC_011313	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
6	NC_011313	CAG	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808848
7	NC_011313	TGC	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
8	NC_011313	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
9	NC_011313	TGA	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
10	NC_011313	CAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
11	NC_011313	ATA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
12	NC_011313	CAC	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
13	NC_011313	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
14	NC_011313	TGA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
15	NC_011313	ATC	3	9	1820	1828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
16	NC_011313	GAT	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
17	NC_011313	AAG	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
18	NC_011313	AAG	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
19	NC_011313	ATG	2	6	2159	2164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
20	NC_011313	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
21	NC_011313	CTT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
22	NC_011313	CCA	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
23	NC_011313	CTT	2	6	2244	2249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
24	NC_011313	GAA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
25	NC_011313	CAA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
26	NC_011313	GCC	2	6	2684	2689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808848
27	NC_011313	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
28	NC_011313	AGA	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
29	NC_011313	TGC	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
30	NC_011313	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
31	NC_011313	TAA	2	6	2928	2933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
32	NC_011313	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808849
33	NC_011313	ATA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808850
34	NC_011313	ATC	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808850
35	NC_011313	TTA	2	6	7669	7674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808850
36	NC_011313	GAT	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808851
37	NC_011313	TTG	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808851
38	NC_011313	CTA	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
39	NC_011313	TCA	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
40	NC_011313	TCA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
41	NC_011313	TTG	2	6	8130	8135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808851
42	NC_011313	ATT	2	6	8276	8281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808851
43	NC_011313	GAA	2	6	8527	8532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808851
44	NC_011313	TTA	2	6	10932	10937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808852
45	NC_011313	TGA	2	6	11065	11070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
46	NC_011313	TCA	2	6	11085	11090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808852
47	NC_011313	ATC	2	6	11318	11323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808852
48	NC_011313	ATG	2	6	11424	11429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
49	NC_011313	CCA	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808852
50	NC_011313	CCT	2	6	11499	11504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209808852
51	NC_011313	TGA	2	6	11693	11698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
52	NC_011313	AAG	2	6	11715	11720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808852
53	NC_011313	GCG	2	6	11739	11744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808852
54	NC_011313	ATG	2	6	11964	11969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
55	NC_011313	TAA	3	9	12008	12016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808852
56	NC_011313	CAA	2	6	12073	12078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808852
57	NC_011313	TCT	2	6	12144	12149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808852
58	NC_011313	TCT	2	6	12243	12248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808852
59	NC_011313	ATG	2	6	12299	12304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
60	NC_011313	GTG	2	6	12336	12341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808852
61	NC_011313	ACA	2	6	12363	12368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808852
62	NC_011313	TTG	2	6	12595	12600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
63	NC_011313	GTT	2	6	12613	12618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
64	NC_011313	TGT	2	6	12680	12685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
65	NC_011313	CTT	2	6	12706	12711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
66	NC_011313	TCG	2	6	12718	12723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
67	NC_011313	AAT	2	6	12821	12826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
68	NC_011313	TCT	2	6	12901	12906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
69	NC_011313	AAT	2	6	12916	12921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
70	NC_011313	TGC	2	6	12925	12930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
71	NC_011313	AAT	2	6	13028	13033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
72	NC_011313	ATA	2	6	13135	13140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
73	NC_011313	AAG	2	6	13460	13465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808853
74	NC_011313	AAT	2	6	13502	13507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
75	NC_011313	TCT	2	6	13633	13638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
76	NC_011313	TGT	2	6	13765	13770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
77	NC_011313	TTC	3	9	13800	13808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
78	NC_011313	AAT	2	6	13815	13820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
79	NC_011313	CGA	2	6	14033	14038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808853
80	NC_011313	AAT	2	6	14041	14046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
81	NC_011313	TTC	2	6	14086	14091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
82	NC_011313	ATC	2	6	14107	14112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808853
83	NC_011313	TGC	3	9	14190	14198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
84	NC_011313	TCA	2	6	14234	14239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808853
85	NC_011313	TAA	2	6	14277	14282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
86	NC_011313	GCA	2	6	14335	14340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808853
87	NC_011313	TTG	3	9	14373	14381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
88	NC_011313	ACC	2	6	14382	14387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808853
89	NC_011313	CTG	2	6	14424	14429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
90	NC_011313	CTT	2	6	14450	14455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808854
91	NC_011313	TCT	2	6	14595	14600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808854
92	NC_011313	TTG	2	6	14624	14629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808854
93	NC_011313	TAA	2	6	14635	14640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808854
94	NC_011313	AGG	2	6	14702	14707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209808854
95	NC_011313	TTA	2	6	14757	14762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808854
96	NC_011313	ACC	2	6	14771	14776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808854
97	NC_011313	AGA	2	6	14949	14954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808855
98	NC_011313	TCA	2	6	14967	14972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808855
99	NC_011313	CGA	2	6	15018	15023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808855
100	NC_011313	GTT	2	6	15214	15219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808855
101	NC_011313	TAA	2	6	15507	15512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808856
102	NC_011313	TTG	2	6	15611	15616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808856
103	NC_011313	ATT	2	6	15687	15692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808856
104	NC_011313	ATG	2	6	15704	15709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808856
105	NC_011313	ATA	2	6	15776	15781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808856
106	NC_011313	ATG	2	6	15806	15811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808856
107	NC_011313	TTG	2	6	15911	15916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808856
108	NC_011313	GAA	2	6	15981	15986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808856
109	NC_011313	ATG	2	6	16013	16018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808856
110	NC_011313	AGA	3	9	16095	16103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808856
111	NC_011313	CAG	2	6	16129	16134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808856
112	NC_011313	GAA	2	6	16155	16160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808856
113	NC_011313	GGC	2	6	16237	16242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808856
114	NC_011313	TAC	2	6	16308	16313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808856
115	NC_011313	TTG	2	6	16424	16429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808856
116	NC_011313	CTT	2	6	16654	16659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808857
117	NC_011313	TGA	2	6	16698	16703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808857
118	NC_011313	TTG	3	9	16736	16744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808857
119	NC_011313	CAA	2	6	16771	16776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808857
120	NC_011313	AAG	2	6	16865	16870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808857
121	NC_011313	CTT	3	9	16913	16921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808857
122	NC_011313	TCT	2	6	17013	17018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808857
123	NC_011313	ATT	2	6	17067	17072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808857
124	NC_011313	GTG	2	6	17075	17080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808857
125	NC_011313	TCT	2	6	17206	17211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808857
126	NC_011313	ACT	2	6	17227	17232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808857
127	NC_011313	TTA	2	6	18605	18610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808858
128	NC_011313	TGC	2	6	18611	18616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808858
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