MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 19968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011313	CAA	2	6	182402	182407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808980
3002	NC_011313	AAC	2	6	182419	182424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808980
3003	NC_011313	AAG	2	6	182526	182531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808980
3004	NC_011313	CCA	2	6	182561	182566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808980
3005	NC_011313	TGA	2	6	182581	182586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808980
3006	NC_011313	CCA	2	6	182593	182598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808980
3007	NC_011313	AAT	2	6	182603	182608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808980
3008	NC_011313	TGA	3	9	182665	182673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808980
3009	NC_011313	TCA	2	6	182772	182777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808980
3010	NC_011313	GCATT	2	10	182875	182884	20 %	40 %	20 %	20 %	209808980
3011	NC_011313	CTG	2	6	182987	182992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808980
3012	NC_011313	TTG	2	6	183006	183011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808980
3013	NC_011313	CAT	2	6	183052	183057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808980
3014	NC_011313	CT	3	6	183145	183150	0 %	50 %	0 %	50 %	209808980
3015	NC_011313	AT	3	6	184842	184847	50 %	50 %	0 %	0 %	209808981
3016	NC_011313	GAT	2	6	184859	184864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808981
3017	NC_011313	TTG	2	6	184902	184907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808981
3018	NC_011313	GA	3	6	184916	184921	50 %	0 %	50 %	0 %	209808981
3019	NC_011313	GTCA	2	8	184932	184939	25 %	25 %	25 %	25 %	209808981
3020	NC_011313	CTA	2	6	184947	184952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808981
3021	NC_011313	TCA	2	6	184981	184986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808981
3022	NC_011313	TCA	2	6	185029	185034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808981
3023	NC_011313	GCCTA	2	10	185092	185101	20 %	20 %	20 %	40 %	209808981
3024	NC_011313	TG	3	6	185112	185117	0 %	50 %	50 %	0 %	209808981
3025	NC_011313	TTG	2	6	185160	185165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808981
3026	NC_011313	ATT	2	6	185306	185311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808981
3027	NC_011313	TGAG	2	8	185421	185428	25 %	25 %	50 %	0 %	209808981
3028	NC_011313	A	6	6	185470	185475	100 %	0 %	0 %	0 %	209808981
3029	NC_011313	GAA	2	6	185557	185562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808981
3030	NC_011313	TC	3	6	185565	185570	0 %	50 %	0 %	50 %	209808981
3031	NC_011313	A	7	7	185647	185653	100 %	0 %	0 %	0 %	209808981
3032	NC_011313	AAT	2	6	186249	186254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808982
3033	NC_011313	ACCA	2	8	186325	186332	50 %	0 %	0 %	50 %	209808982
3034	NC_011313	CAA	2	6	186346	186351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808982
3035	NC_011313	CAA	2	6	186400	186405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808982
3036	NC_011313	A	6	6	186409	186414	100 %	0 %	0 %	0 %	209808982
3037	NC_011313	ATA	2	6	186429	186434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808982
3038	NC_011313	TTG	2	6	186488	186493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808982
3039	NC_011313	TAGT	2	8	186588	186595	25 %	50 %	25 %	0 %	209808982
3040	NC_011313	CAA	2	6	186643	186648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808982
3041	NC_011313	CCG	2	6	186727	186732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808982
3042	NC_011313	A	6	6	186795	186800	100 %	0 %	0 %	0 %	209808982
3043	NC_011313	ATTG	2	8	186812	186819	25 %	50 %	25 %	0 %	209808982
3044	NC_011313	ATT	2	6	186884	186889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808982
3045	NC_011313	CAC	2	6	186890	186895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808982
3046	NC_011313	CAT	3	9	187069	187077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808983
3047	NC_011313	TTA	2	6	187082	187087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808983
3048	NC_011313	AAATA	2	10	187199	187208	80 %	20 %	0 %	0 %	209808983
3049	NC_011313	GA	3	6	187235	187240	50 %	0 %	50 %	0 %	209808983
3050	NC_011313	ACA	2	6	187247	187252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808983
3051	NC_011313	TAAGA	2	10	187309	187318	60 %	20 %	20 %	0 %	209808983
3052	NC_011313	CAA	2	6	187407	187412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808984
3053	NC_011313	AC	3	6	187427	187432	50 %	0 %	0 %	50 %	209808984
3054	NC_011313	TCA	2	6	187490	187495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808984
3055	NC_011313	AC	4	8	187530	187537	50 %	0 %	0 %	50 %	209808984
3056	NC_011313	AAG	2	6	187591	187596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808984
3057	NC_011313	AGC	2	6	187687	187692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808984
3058	NC_011313	TAAT	2	8	187697	187704	50 %	50 %	0 %	0 %	209808984
3059	NC_011313	AAT	2	6	187746	187751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808984
3060	NC_011313	TAC	2	6	187769	187774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808984
3061	NC_011313	TAA	2	6	187782	187787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808984
3062	NC_011313	CAA	2	6	187796	187801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808984
3063	NC_011313	CAAA	2	8	187889	187896	75 %	0 %	0 %	25 %	209808984
3064	NC_011313	TTCAT	2	10	187936	187945	20 %	60 %	0 %	20 %	209808984
3065	NC_011313	TGA	2	6	187954	187959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808984
3066	NC_011313	ATC	2	6	187965	187970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808984
3067	NC_011313	ATG	2	6	190073	190078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808985
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3069	NC_011313	AAT	2	6	190165	190170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808985
3070	NC_011313	TCA	2	6	190228	190233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808985
3071	NC_011313	TCA	2	6	190399	190404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808985
3072	NC_011313	GAAT	2	8	190448	190455	50 %	25 %	25 %	0 %	209808985
3073	NC_011313	ATA	2	6	190458	190463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808985
3074	NC_011313	GATA	2	8	190543	190550	50 %	25 %	25 %	0 %	209808985
3075	NC_011313	CTAA	2	8	190605	190612	50 %	25 %	0 %	25 %	209808985
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3081	NC_011313	CAGTG	2	10	190826	190835	20 %	20 %	40 %	20 %	209808985
3082	NC_011313	CAA	2	6	190861	190866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808985
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3089	NC_011313	T	6	6	191792	191797	0 %	100 %	0 %	0 %	209808986
3090	NC_011313	TTA	2	6	191879	191884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808986
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3092	NC_011313	ACC	2	6	191912	191917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808986
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3098	NC_011313	CT	4	8	192042	192049	0 %	50 %	0 %	50 %	209808986
3099	NC_011313	GGT	2	6	192133	192138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808986
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3101	NC_011313	GGC	2	6	192191	192196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808986
3102	NC_011313	TTGCTT	2	12	192300	192311	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	209808986
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3105	NC_011313	A	6	6	192456	192461	100 %	0 %	0 %	0 %	209808987
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3107	NC_011313	ATT	2	6	192647	192652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808987
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3109	NC_011313	TAC	2	6	192690	192695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808987
3110	NC_011313	GCA	2	6	192752	192757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808987
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3120	NC_011313	AGA	2	6	193187	193192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808988
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3122	NC_011313	TTA	2	6	193252	193257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808988
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3490	NC_011313	CGG	2	6	212609	212614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809007
3491	NC_011313	TGC	2	6	212635	212640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809007
3492	NC_011313	TTA	2	6	214520	214525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809008
3493	NC_011313	TGC	2	6	214526	214531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809008
3494	NC_011313	CTGA	2	8	214540	214547	25 %	25 %	25 %	25 %	209809008
3495	NC_011313	GAC	2	6	214609	214614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809008
3496	NC_011313	ACG	3	9	214745	214753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809008
3497	NC_011313	A	6	6	214761	214766	100 %	0 %	0 %	0 %	209809008
3498	NC_011313	GTA	2	6	214769	214774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809008
3499	NC_011313	ATC	2	6	214779	214784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809008
3500	NC_011313	CTA	2	6	214810	214815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809008

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