MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 36761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011312	TCT	2	6	347547	347552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693906
3502	NC_011312	GAT	2	6	347607	347612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693906
3503	NC_011312	TTG	2	6	347671	347676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693906
3504	NC_011312	GTG	2	6	347704	347709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693906
3505	NC_011312	ATG	2	6	347722	347727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693906
3506	NC_011312	ACG	2	6	347728	347733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693906
3507	NC_011312	GAA	2	6	347785	347790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693906
3508	NC_011312	TGT	2	6	347879	347884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693906
3509	NC_011312	ACA	2	6	348084	348089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693906
3510	NC_011312	GAC	2	6	348206	348211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693906
3511	NC_011312	AGA	2	6	348366	348371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693906
3512	NC_011312	TGG	2	6	348510	348515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693907
3513	NC_011312	GAT	2	6	348609	348614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693907
3514	NC_011312	TGT	2	6	348716	348721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693908
3515	NC_011312	GAA	2	6	348750	348755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693908
3516	NC_011312	GTT	3	9	348759	348767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693908
3517	NC_011312	TTG	2	6	348823	348828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693908
3518	NC_011312	AGA	2	6	348890	348895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693908
3519	NC_011312	CTG	2	6	348937	348942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693908
3520	NC_011312	CGA	2	6	349040	349045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693908
3521	NC_011312	GTT	3	9	349047	349055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693908
3522	NC_011312	TGC	2	6	349118	349123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693908
3523	NC_011312	GAA	3	9	349128	349136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693908
3524	NC_011312	TCA	2	6	349154	349159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693908
3525	NC_011312	GTT	2	6	349210	349215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693908
3526	NC_011312	GTG	2	6	349216	349221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693908
3527	NC_011312	AGA	2	6	349247	349252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693908
3528	NC_011312	TGG	3	9	349486	349494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693909
3529	NC_011312	TCT	2	6	349499	349504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693909
3530	NC_011312	ACA	2	6	349550	349555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693909
3531	NC_011312	TTG	3	9	349591	349599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693909
3532	NC_011312	TCA	2	6	349619	349624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693909
3533	NC_011312	GTT	2	6	349680	349685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693909
3534	NC_011312	TGT	2	6	349693	349698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693909
3535	NC_011312	TTC	2	6	349701	349706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693909
3536	NC_011312	GTT	2	6	349754	349759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693910
3537	NC_011312	CAT	2	6	349775	349780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693910
3538	NC_011312	TGG	2	6	349794	349799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693910
3539	NC_011312	CAG	2	6	349877	349882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693910
3540	NC_011312	CAT	2	6	349907	349912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693910
3541	NC_011312	CCA	2	6	350011	350016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693910
3542	NC_011312	TCC	2	6	350139	350144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209693910
3543	NC_011312	GAC	2	6	350433	350438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693910
3544	NC_011312	TGG	2	6	350600	350605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693910
3545	NC_011312	TTA	2	6	350644	350649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693910
3546	NC_011312	TGC	2	6	350873	350878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693911
3547	NC_011312	TGT	2	6	350891	350896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693911
3548	NC_011312	CAG	2	6	350962	350967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693911
3549	NC_011312	CAT	2	6	351028	351033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693911
3550	NC_011312	TGA	2	6	351149	351154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693911
3551	NC_011312	GCT	2	6	351219	351224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693911
3552	NC_011312	AGA	2	6	351278	351283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693911
3553	NC_011312	TAA	2	6	351289	351294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693911
3554	NC_011312	CTG	2	6	351331	351336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693911
3555	NC_011312	GTT	2	6	351519	351524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693911
3556	NC_011312	CTG	2	6	351526	351531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693911
3557	NC_011312	GCA	2	6	351618	351623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693911
3558	NC_011312	AAT	2	6	351634	351639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693911
3559	NC_011312	AGA	2	6	351856	351861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693912
3560	NC_011312	ATC	2	6	351897	351902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693912
3561	NC_011312	CGT	2	6	351925	351930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693912
3562	NC_011312	ATT	2	6	351957	351962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693912
3563	NC_011312	CGG	2	6	352002	352007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693912
3564	NC_011312	GTG	2	6	352140	352145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693912
3565	NC_011312	TGA	2	6	352149	352154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693912
3566	NC_011312	GAA	2	6	352268	352273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693912
3567	NC_011312	TGA	2	6	352315	352320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693912
3568	NC_011312	TTG	2	6	352323	352328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693912
3569	NC_011312	TGA	2	6	352351	352356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693912
3570	NC_011312	AAG	2	6	352371	352376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693912
3571	NC_011312	AAT	2	6	352382	352387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693912
3572	NC_011312	GAA	2	6	352390	352395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693912
3573	NC_011312	GTC	2	6	352558	352563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693913
3574	NC_011312	TTC	2	6	352654	352659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693913
3575	NC_011312	ATG	2	6	352706	352711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693913
3576	NC_011312	CAA	2	6	352735	352740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693913
3577	NC_011312	GCG	2	6	352780	352785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693913
3578	NC_011312	CGT	2	6	352792	352797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693913
3579	NC_011312	GAA	3	9	352810	352818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693913
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3581	NC_011312	GTT	2	6	352896	352901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693913
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3583	NC_011312	CGA	2	6	353177	353182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693914
3584	NC_011312	GCG	2	6	353199	353204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693914
3585	NC_011312	TAA	2	6	353387	353392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693915
3586	NC_011312	AAG	2	6	353497	353502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693915
3587	NC_011312	CTT	2	6	353563	353568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693915
3588	NC_011312	TTG	2	6	353569	353574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693915
3589	NC_011312	GTT	2	6	353823	353828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693916
3590	NC_011312	GTG	2	6	353869	353874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693916
3591	NC_011312	CTA	2	6	353893	353898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693916
3592	NC_011312	CGG	2	6	353978	353983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693916
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3598	NC_011312	GAA	2	6	354449	354454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693917
3599	NC_011312	GTG	2	6	354594	354599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693917
3600	NC_011312	ACT	2	6	354942	354947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693918
3601	NC_011312	ATG	2	6	354997	355002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693918
3602	NC_011312	TGC	2	6	355004	355009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693918
3603	NC_011312	ACC	2	6	355071	355076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693918
3604	NC_011312	ATT	2	6	355122	355127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693918
3605	NC_011312	TGT	3	9	355193	355201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693918
3606	NC_011312	TCA	2	6	355212	355217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693918
3607	NC_011312	TAA	2	6	355289	355294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693918
3608	NC_011312	AGA	3	9	355391	355399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693918
3609	NC_011312	TGG	2	6	355403	355408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693918
3610	NC_011312	AGA	2	6	355556	355561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693918
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3612	NC_011312	AAT	2	6	355638	355643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693918
3613	NC_011312	GTT	2	6	355710	355715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693918
3614	NC_011312	TGA	2	6	355760	355765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693918
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3616	NC_011312	GCA	2	6	355812	355817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693918
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3619	NC_011312	AGA	2	6	356180	356185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693918
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