MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 54558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011312	A	7	7	29144	29150	100 %	0 %	0 %	0 %	209693660
502	NC_011312	TTCT	2	8	29151	29158	0 %	75 %	0 %	25 %	209693660
503	NC_011312	AG	3	6	29207	29212	50 %	0 %	50 %	0 %	209693660
504	NC_011312	TAT	2	6	29598	29603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693661
505	NC_011312	TAT	2	6	29638	29643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693661
506	NC_011312	AGC	3	9	29787	29795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693661
507	NC_011312	ATC	2	6	29828	29833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693661
508	NC_011312	TAT	2	6	29920	29925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693661
509	NC_011312	AGGC	2	8	29927	29934	25 %	0 %	50 %	25 %	209693661
510	NC_011312	AGA	2	6	29982	29987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693661
511	NC_011312	A	6	6	30101	30106	100 %	0 %	0 %	0 %	209693661
512	NC_011312	AAT	2	6	30175	30180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693661
513	NC_011312	TAA	2	6	30195	30200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693661
514	NC_011312	AT	3	6	30234	30239	50 %	50 %	0 %	0 %	209693661
515	NC_011312	CAT	2	6	30314	30319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693661
516	NC_011312	CGC	2	6	30363	30368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693661
517	NC_011312	GGT	2	6	30404	30409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693661
518	NC_011312	CTT	2	6	30469	30474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693661
519	NC_011312	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	209693661
520	NC_011312	A	7	7	30539	30545	100 %	0 %	0 %	0 %	209693661
521	NC_011312	GA	3	6	30880	30885	50 %	0 %	50 %	0 %	209693662
522	NC_011312	TTTC	2	8	30902	30909	0 %	75 %	0 %	25 %	209693662
523	NC_011312	CTT	2	6	30926	30931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693662
524	NC_011312	CTT	2	6	30938	30943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693662
525	NC_011312	CTT	2	6	30962	30967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693662
526	NC_011312	GAC	2	6	30968	30973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693662
527	NC_011312	TTG	2	6	30975	30980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693662
528	NC_011312	CTGT	2	8	31150	31157	0 %	50 %	25 %	25 %	209693662
529	NC_011312	TAA	3	9	31170	31178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693662
530	NC_011312	TGC	2	6	31261	31266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693662
531	NC_011312	AG	3	6	31322	31327	50 %	0 %	50 %	0 %	209693662
532	NC_011312	CAG	2	6	31407	31412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693662
533	NC_011312	AAC	2	6	31416	31421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693662
534	NC_011312	CAC	2	6	31550	31555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693662
535	NC_011312	AAT	2	6	31586	31591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693662
536	NC_011312	GTC	2	6	31602	31607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693662
537	NC_011312	GTT	2	6	31711	31716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693662
538	NC_011312	CAT	2	6	31736	31741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693662
539	NC_011312	GTT	2	6	31747	31752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693662
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541	NC_011312	A	6	6	32241	32246	100 %	0 %	0 %	0 %	209693663
542	NC_011312	A	7	7	32404	32410	100 %	0 %	0 %	0 %	209693663
543	NC_011312	T	6	6	32446	32451	0 %	100 %	0 %	0 %	209693663
544	NC_011312	GAT	2	6	33202	33207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693664
545	NC_011312	TAT	2	6	33226	33231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693664
546	NC_011312	GAA	2	6	33241	33246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693664
547	NC_011312	TCA	2	6	33276	33281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693664
548	NC_011312	CCG	2	6	33311	33316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693664
549	NC_011312	TGA	2	6	33351	33356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693664
550	NC_011312	T	6	6	33382	33387	0 %	100 %	0 %	0 %	209693664
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552	NC_011312	ACTG	2	8	33459	33466	25 %	25 %	25 %	25 %	209693664
553	NC_011312	TTTCA	2	10	33510	33519	20 %	60 %	0 %	20 %	209693664
554	NC_011312	A	6	6	33559	33564	100 %	0 %	0 %	0 %	209693664
555	NC_011312	TTA	2	6	33596	33601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693664
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557	NC_011312	CTT	2	6	33648	33653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693664
558	NC_011312	TCATT	2	10	33657	33666	20 %	60 %	0 %	20 %	209693664
559	NC_011312	ATG	2	6	33668	33673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693664
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565	NC_011312	TC	3	6	33821	33826	0 %	50 %	0 %	50 %	209693664
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598	NC_011312	A	7	7	35593	35599	100 %	0 %	0 %	0 %	209693665
599	NC_011312	GAT	3	9	35610	35618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693665
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601	NC_011312	GAT	2	6	35723	35728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693665
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609	NC_011312	TATTG	2	10	36229	36238	20 %	60 %	20 %	0 %	209693666
610	NC_011312	TAC	2	6	36280	36285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693666
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613	NC_011312	T	8	8	36482	36489	0 %	100 %	0 %	0 %	209693667
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615	NC_011312	TAA	2	6	36592	36597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693667
616	NC_011312	TTC	2	6	36601	36606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693667
617	NC_011312	GAAAA	2	10	36610	36619	80 %	0 %	20 %	0 %	209693667
618	NC_011312	T	6	6	36660	36665	0 %	100 %	0 %	0 %	209693667
619	NC_011312	TAA	2	6	36814	36819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693667
620	NC_011312	TAC	2	6	36832	36837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693667
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627	NC_011312	CTGA	2	8	37293	37300	25 %	25 %	25 %	25 %	209693668
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