MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011206	GC	3	6	150952	150957	0 %	0 %	50 %	50 %	198282308
3002	NC_011206	GCG	2	6	151013	151018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282308
3003	NC_011206	CGT	2	6	151103	151108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282308
3004	NC_011206	ATC	2	6	151166	151171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282308
3005	NC_011206	GTG	2	6	151211	151216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282308
3006	NC_011206	GACA	2	8	151247	151254	50 %	0 %	25 %	25 %	198282308
3007	NC_011206	CTT	2	6	151324	151329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282308
3008	NC_011206	GC	3	6	151337	151342	0 %	0 %	50 %	50 %	198282308
3009	NC_011206	CCG	2	6	151549	151554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282309
3010	NC_011206	CAC	2	6	151563	151568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282309
3011	NC_011206	CGC	2	6	151601	151606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282309
3012	NC_011206	GCA	2	6	151607	151612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282309
3013	NC_011206	TGC	2	6	151681	151686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282309
3014	NC_011206	AAT	2	6	151710	151715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282309
3015	NC_011206	GC	3	6	151753	151758	0 %	0 %	50 %	50 %	198282309
3016	NC_011206	CG	3	6	151861	151866	0 %	0 %	50 %	50 %	198282309
3017	NC_011206	CGC	2	6	151899	151904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282309
3018	NC_011206	CCG	2	6	151906	151911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282309
3019	NC_011206	ATG	2	6	151918	151923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282309
3020	NC_011206	TG	3	6	151928	151933	0 %	50 %	50 %	0 %	198282309
3021	NC_011206	AAT	2	6	151973	151978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282309
3022	NC_011206	GCC	2	6	152017	152022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282309
3023	NC_011206	AGC	2	6	152116	152121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282309
3024	NC_011206	GAT	2	6	152281	152286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282310
3025	NC_011206	ATG	2	6	152291	152296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282310
3026	NC_011206	TGG	3	9	152417	152425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282310
3027	NC_011206	AAG	2	6	152449	152454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282310
3028	NC_011206	TGT	2	6	152634	152639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282310
3029	NC_011206	ACCGG	2	10	152836	152845	20 %	0 %	40 %	40 %	198282311
3030	NC_011206	GAA	2	6	152933	152938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282311
3031	NC_011206	GCTG	2	8	152956	152963	0 %	25 %	50 %	25 %	198282311
3032	NC_011206	GGC	2	6	152983	152988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282311
3033	NC_011206	CAG	2	6	153089	153094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282311
3034	NC_011206	CCG	2	6	153560	153565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282312
3035	NC_011206	CGT	2	6	153627	153632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282312
3036	NC_011206	CTC	2	6	153723	153728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282312
3037	NC_011206	C	6	6	153793	153798	0 %	0 %	0 %	100 %	198282312
3038	NC_011206	CAAA	2	8	153845	153852	75 %	0 %	0 %	25 %	198282312
3039	NC_011206	TGG	2	6	153873	153878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282312
3040	NC_011206	CA	3	6	153901	153906	50 %	0 %	0 %	50 %	198282312
3041	NC_011206	CGT	2	6	154039	154044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282312
3042	NC_011206	CA	3	6	154088	154093	50 %	0 %	0 %	50 %	198282312
3043	NC_011206	AT	3	6	154162	154167	50 %	50 %	0 %	0 %	198282312
3044	NC_011206	CCA	2	6	154283	154288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282312
3045	NC_011206	ACT	2	6	154342	154347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282312
3046	NC_011206	TACC	2	8	154406	154413	25 %	25 %	0 %	50 %	198282312
3047	NC_011206	GCAT	2	8	154429	154436	25 %	25 %	25 %	25 %	198282312
3048	NC_011206	CGA	2	6	155573	155578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282313
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3051	NC_011206	GCA	2	6	155653	155658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282313
3052	NC_011206	TGT	2	6	155675	155680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282313
3053	NC_011206	CAC	2	6	155692	155697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282313
3054	NC_011206	CCA	2	6	155747	155752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282313
3055	NC_011206	CCG	2	6	155786	155791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282313
3056	NC_011206	TGCC	2	8	155810	155817	0 %	25 %	25 %	50 %	198282313
3057	NC_011206	GGGC	2	8	155849	155856	0 %	0 %	75 %	25 %	198282313
3058	NC_011206	TCT	2	6	155918	155923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282313
3059	NC_011206	GCA	2	6	155939	155944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282313
3060	NC_011206	AAT	2	6	155954	155959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282313
3061	NC_011206	ATC	2	6	156019	156024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282313
3062	NC_011206	TCG	2	6	156115	156120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282313
3063	NC_011206	ACC	2	6	156133	156138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282313
3064	NC_011206	CT	3	6	156307	156312	0 %	50 %	0 %	50 %	198282313
3065	NC_011206	CGG	2	6	156332	156337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282313
3066	NC_011206	GCG	2	6	156370	156375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282313
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3068	NC_011206	GC	3	6	156486	156491	0 %	0 %	50 %	50 %	198282313
3069	NC_011206	AGC	2	6	156520	156525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282313
3070	NC_011206	TGC	2	6	156529	156534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282313
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3073	NC_011206	C	6	6	156678	156683	0 %	0 %	0 %	100 %	198282313
3074	NC_011206	ACC	2	6	156852	156857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282313
3075	NC_011206	GGT	2	6	156924	156929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282313
3076	NC_011206	CGA	2	6	156938	156943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282313
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3078	NC_011206	CAT	2	6	157062	157067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282313
3079	NC_011206	ACATC	2	10	157136	157145	40 %	20 %	0 %	40 %	198282313
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3081	NC_011206	ACG	2	6	157195	157200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282313
3082	NC_011206	TCA	2	6	157247	157252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282313
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3084	NC_011206	AGGA	2	8	157294	157301	50 %	0 %	50 %	0 %	198282313
3085	NC_011206	GCC	2	6	157305	157310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282313
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3087	NC_011206	CAG	2	6	157386	157391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282313
3088	NC_011206	GCG	2	6	157403	157408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282313
3089	NC_011206	A	7	7	157411	157417	100 %	0 %	0 %	0 %	198282313
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3092	NC_011206	CCG	2	6	157492	157497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282313
3093	NC_011206	GGT	2	6	157928	157933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282314
3094	NC_011206	CAA	2	6	157993	157998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282314
3095	NC_011206	GCAAA	2	10	158018	158027	60 %	0 %	20 %	20 %	198282314
3096	NC_011206	CCGAC	2	10	158050	158059	20 %	0 %	20 %	60 %	198282314
3097	NC_011206	A	6	6	158076	158081	100 %	0 %	0 %	0 %	198282314
3098	NC_011206	CAT	2	6	158087	158092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282314
3099	NC_011206	AAAT	2	8	159277	159284	75 %	25 %	0 %	0 %	198282315
3100	NC_011206	TGA	2	6	159348	159353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282315
3101	NC_011206	CCT	2	6	159603	159608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282315
3102	NC_011206	GCA	2	6	159631	159636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282315
3103	NC_011206	GGC	3	9	159655	159663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282315
3104	NC_011206	TGC	2	6	159702	159707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282315
3105	NC_011206	CAGA	2	8	159776	159783	50 %	0 %	25 %	25 %	198282315
3106	NC_011206	GCG	2	6	159794	159799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282315
3107	NC_011206	GC	3	6	159857	159862	0 %	0 %	50 %	50 %	198282315
3108	NC_011206	ATCA	2	8	159881	159888	50 %	25 %	0 %	25 %	198282315
3109	NC_011206	GCGA	2	8	159905	159912	25 %	0 %	50 %	25 %	198282315
3110	NC_011206	CCG	2	6	159950	159955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282315
3111	NC_011206	CCT	2	6	160033	160038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282315
3112	NC_011206	CG	3	6	160059	160064	0 %	0 %	50 %	50 %	198282315
3113	NC_011206	CCAGGA	2	12	160213	160224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282315
3114	NC_011206	CGC	3	9	160228	160236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282315
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3116	NC_011206	CCTTG	2	10	160282	160291	0 %	40 %	20 %	40 %	198282315
3117	NC_011206	CAG	2	6	160295	160300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282315
3118	NC_011206	GC	3	6	160301	160306	0 %	0 %	50 %	50 %	198282315
3119	NC_011206	ACC	2	6	160307	160312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282315
3120	NC_011206	CGC	2	6	160402	160407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282315
3121	NC_011206	CGG	2	6	160413	160418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282315
3122	NC_011206	TGC	2	6	160440	160445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282315
3123	NC_011206	AGAA	2	8	160452	160459	75 %	0 %	25 %	0 %	198282315
3124	NC_011206	CCG	2	6	160492	160497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282315
3125	NC_011206	CAC	2	6	160534	160539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282315
3126	NC_011206	GCAAC	2	10	160547	160556	40 %	0 %	20 %	40 %	198282315
3127	NC_011206	ATC	2	6	160576	160581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282316
3128	NC_011206	CTG	2	6	160591	160596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282316
3129	NC_011206	GTG	2	6	160629	160634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282316
3130	NC_011206	GCC	2	6	160726	160731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282316
3131	NC_011206	ATTC	2	8	160747	160754	25 %	50 %	0 %	25 %	198282316
3132	NC_011206	GCG	2	6	161025	161030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282316
3133	NC_011206	ACG	2	6	161113	161118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282316
3134	NC_011206	CTG	2	6	161131	161136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282316
3135	NC_011206	CTG	2	6	161161	161166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282316
3136	NC_011206	GGT	2	6	161250	161255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282316
3137	NC_011206	GGT	2	6	161278	161283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282316
3138	NC_011206	CGGG	2	8	161510	161517	0 %	0 %	75 %	25 %	198282316
3139	NC_011206	CGCCAC	2	12	161538	161549	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	198282316
3140	NC_011206	AGCC	2	8	161556	161563	25 %	0 %	25 %	50 %	198282316
3141	NC_011206	GAG	2	6	161566	161571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282316
3142	NC_011206	CAG	2	6	161586	161591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282316
3143	NC_011206	GTG	2	6	161731	161736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282316
3144	NC_011206	GC	3	6	161741	161746	0 %	0 %	50 %	50 %	198282316
3145	NC_011206	G	6	6	161799	161804	0 %	0 %	100 %	0 %	198282316
3146	NC_011206	CAC	2	6	161817	161822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282316
3147	NC_011206	CTG	2	6	161906	161911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3148	NC_011206	TCG	2	6	161937	161942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3149	NC_011206	TGA	2	6	161958	161963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282317
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3151	NC_011206	CCT	2	6	162018	162023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282317
3152	NC_011206	ACC	2	6	162077	162082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282317
3153	NC_011206	AGG	2	6	162087	162092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282317
3154	NC_011206	CGTG	2	8	162109	162116	0 %	25 %	50 %	25 %	198282317
3155	NC_011206	CTATGT	2	12	162139	162150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	198282317
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3158	NC_011206	G	6	6	162406	162411	0 %	0 %	100 %	0 %	198282317
3159	NC_011206	GGT	3	9	162430	162438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3160	NC_011206	CTC	2	6	162452	162457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282317
3161	NC_011206	GCC	2	6	162488	162493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3162	NC_011206	GCC	2	6	162500	162505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3163	NC_011206	GGT	2	6	162526	162531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
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3165	NC_011206	ACG	2	6	162621	162626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282317
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3172	NC_011206	GTC	2	6	162824	162829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
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3179	NC_011206	TCG	2	6	162963	162968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
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3233	NC_011206	ATG	2	6	165090	165095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282318
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3240	NC_011206	GC	3	6	165252	165257	0 %	0 %	50 %	50 %	198282318
3241	NC_011206	CCT	2	6	165266	165271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282318
3242	NC_011206	CCG	2	6	165335	165340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282318
3243	NC_011206	CCGGC	2	10	165376	165385	0 %	0 %	40 %	60 %	198282318
3244	NC_011206	TTCT	2	8	165501	165508	0 %	75 %	0 %	25 %	198282318
3245	NC_011206	GCT	2	6	165509	165514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282318
3246	NC_011206	GCC	2	6	165565	165570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282318
3247	NC_011206	GCG	2	6	165679	165684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282318
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3250	NC_011206	TGGC	2	8	166093	166100	0 %	25 %	50 %	25 %	198282319
3251	NC_011206	GA	3	6	166161	166166	50 %	0 %	50 %	0 %	198282319
3252	NC_011206	CCG	2	6	166194	166199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282319
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3259	NC_011206	GACA	2	8	166531	166538	50 %	0 %	25 %	25 %	198282320
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3271	NC_011206	GGC	2	6	167421	167426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282322
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3358	NC_011206	GAT	2	6	173575	173580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282328
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3360	NC_011206	CCA	2	6	173589	173594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282328
3361	NC_011206	CGATGG	2	12	173601	173612	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198282328
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3485	NC_011206	CCA	2	6	178670	178675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282331
3486	NC_011206	TGA	2	6	178679	178684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282331
3487	NC_011206	GGT	2	6	178695	178700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282331
3488	NC_011206	CCG	2	6	178712	178717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282331
3489	NC_011206	GCC	2	6	178813	178818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282331
3490	NC_011206	GCT	2	6	178839	178844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282331
3491	NC_011206	TCT	2	6	178865	178870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282331
3492	NC_011206	CCGG	2	8	178874	178881	0 %	0 %	50 %	50 %	198282331
3493	NC_011206	ACTTGC	2	12	178900	178911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	198282331
3494	NC_011206	ACCTCG	2	12	178921	178932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198282331
3495	NC_011206	CG	3	6	178951	178956	0 %	0 %	50 %	50 %	198282331
3496	NC_011206	CTGC	2	8	178988	178995	0 %	25 %	25 %	50 %	198282331
3497	NC_011206	CGG	2	6	179006	179011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282331
3498	NC_011206	GAA	2	6	179043	179048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282331
3499	NC_011206	GCT	2	6	179062	179067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282331
3500	NC_011206	CGA	2	6	179093	179098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282331

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