MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76

Total Repeats: 887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010939	TAATTT	2	12	3008	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149272
2	NC_010939	TTTTCG	2	12	3704	3715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190149272
3	NC_010939	ACCGCC	2	12	4108	4119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	190149273
4	NC_010939	ATGATC	2	12	4570	4581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149273
5	NC_010939	GGTGCG	2	12	5331	5342	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	190149274
6	NC_010939	AAAGCG	2	12	8801	8812	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190149277
7	NC_010939	TGGCGA	2	12	12731	12742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190149281
8	NC_010939	TACGGT	2	12	13159	13170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149281
9	NC_010939	AAGGCG	2	12	13340	13351	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190149281
10	NC_010939	CACCGA	2	12	13611	13622	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190149281
11	NC_010939	ATTTAG	2	12	16577	16588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190149283
12	NC_010939	ATAAAG	2	12	18076	18087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190149285
13	NC_010939	ATGAAT	2	12	18514	18525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190149285
14	NC_010939	TATCGG	2	12	21883	21894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149288
15	NC_010939	TTGCGG	2	12	22176	22187	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	190149288
16	NC_010939	CTTACA	2	12	22357	22368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190149288
17	NC_010939	TTCCGT	2	12	24845	24856	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149290
18	NC_010939	CAAGCA	2	12	25540	25551	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190149291
19	NC_010939	TTCAGG	2	12	29550	29561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149294
20	NC_010939	TAAACT	2	12	31859	31870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190149295
21	NC_010939	CCCATT	2	12	32210	32221	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	190149296
22	NC_010939	TTTCCA	2	12	36937	36948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	190149299
23	NC_010939	GTATCG	2	12	38859	38870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149302
24	NC_010939	TCATAT	2	12	52869	52880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	190149315
25	NC_010939	AGCAAA	2	12	53033	53044	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149315
26	NC_010939	ATTTGG	2	12	53201	53212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190149315
27	NC_010939	TCCGCA	2	12	54401	54412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190149316
28	NC_010939	TTAGCA	2	12	55570	55581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149318
29	NC_010939	GGCGTA	2	12	55633	55644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190149318
30	NC_010939	GGTTAC	2	12	55927	55938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149318
31	NC_010939	TTTACG	2	12	57199	57210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149320
32	NC_010939	ATCGGT	2	12	59178	59189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149322
33	NC_010939	AACGGT	2	12	59222	59233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190149322
34	NC_010939	AACCGT	2	12	61206	61217	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149324
35	NC_010939	GGTGAG	2	12	62048	62059	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	190149325
36	NC_010939	TTTTAT	2	12	63552	63563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	190149327
37	NC_010939	GTTTAC	2	12	65857	65868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149329
38	NC_010939	GAAAGC	2	12	75753	75764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190149332
39	NC_010939	AAAGCC	2	12	77523	77534	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190149333
40	NC_010939	GCAAAA	2	12	78898	78909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149334
41	NC_010939	ATTGCG	2	12	79758	79769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149335
42	NC_010939	TGCCGG	2	12	79856	79867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190149335
43	NC_010939	TTACCG	2	12	86706	86717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190149345
44	NC_010939	TTTTTC	2	12	87104	87115	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190149345
45	NC_010939	GGTTTT	2	12	87138	87149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190149345
46	NC_010939	TCGACT	2	12	87237	87248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190149345
47	NC_010939	TCCGGC	2	12	87252	87263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190149345
48	NC_010939	GCGTTA	2	12	89607	89618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149349
49	NC_010939	CTGCGA	2	12	90135	90146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149350
50	NC_010939	AAAGGC	2	12	92495	92506	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190149353
51	NC_010939	CGGTTG	2	12	92553	92564	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	190149353
52	NC_010939	TTTTTC	2	12	95376	95387	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190149356
53	NC_010939	TCGCTT	2	12	95606	95617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149356
54	NC_010939	ATCTTG	2	12	96902	96913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149358
55	NC_010939	ACCGAT	2	12	101130	101141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149364
56	NC_010939	TAAATG	2	12	101331	101342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190149364
57	NC_010939	AAATCC	2	12	104610	104621	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	190149367
58	NC_010939	CAATAT	3	18	104746	104763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190149367
59	NC_010939	AGTAAA	2	12	110218	110229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190149372
60	NC_010939	CTATTG	2	12	110972	110983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149372
61	NC_010939	CAATTG	2	12	111173	111184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149372
62	NC_010939	GCAATC	2	12	111853	111864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149372
63	NC_010939	ATACTA	2	12	111887	111898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190149372
64	NC_010939	AGCGGT	2	12	114448	114459	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190149372
65	NC_010939	AAACTA	2	12	116300	116311	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	190149372
66	NC_010939	TGTAAA	2	12	116965	116976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190149373
67	NC_010939	CAAATG	3	18	117288	117305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190149373
68	NC_010939	TGCGAT	2	12	117481	117492	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149373
69	NC_010939	GTGAAT	2	12	118838	118849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149373
70	NC_010939	GATAAA	2	12	121631	121642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190149373
71	NC_010939	AATTGC	2	12	126362	126373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149374
72	NC_010939	CGCAAT	2	12	127753	127764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149375
73	NC_010939	GTTTCC	2	12	130928	130939	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149375
74	NC_010939	ACCGAT	2	12	131791	131802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149376
75	NC_010939	TCCGGA	2	12	136268	136279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149381
76	NC_010939	ACGATT	2	12	137362	137373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149382
77	NC_010939	CAGAAA	2	12	139665	139676	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149386
78	NC_010939	GCCGAA	2	12	140143	140154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149387
79	NC_010939	AGCAAA	2	12	144916	144927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149391
80	NC_010939	CGGCAA	2	12	144947	144958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149391
81	NC_010939	CTGTTG	2	12	147248	147259	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190149395
82	NC_010939	ATATGG	2	12	148289	148300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149397
83	NC_010939	CGGTAA	2	12	155544	155555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190149405
84	NC_010939	TTACCG	2	12	156030	156041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190149406
85	NC_010939	CGTCAC	2	12	158540	158551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190149407
86	NC_010939	AACCCG	2	12	160312	160323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190149410
87	NC_010939	GTAACA	2	12	163045	163056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190149412
88	NC_010939	GCATTA	2	12	163420	163431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149412
89	NC_010939	GATTGC	2	12	165028	165039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149413
90	NC_010939	TATCGA	2	12	171597	171608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149419
91	NC_010939	TGCGTA	2	12	177590	177601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149424
92	NC_010939	CTTATT	2	12	177854	177865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	190149424
93	NC_010939	TAAGTG	2	12	180456	180467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149427
94	NC_010939	GATTGC	2	12	191331	191342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149437
95	NC_010939	AAAAAG	2	12	193329	193340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	190149438
96	NC_010939	CGGAAG	2	12	194124	194135	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190149438
97	NC_010939	AATTTA	2	12	194829	194840	50 %	50 %	0 %	0 %	190149439
98	NC_010939	TTTCTT	2	12	198684	198695	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190149444
99	NC_010939	GCGGAA	2	12	199969	199980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190149445
100	NC_010939	ACCGTG	2	12	201130	201141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149446
101	NC_010939	TTTGCG	2	12	204269	204280	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190149450
102	NC_010939	TCGCTT	2	12	204506	204517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149450
103	NC_010939	ATCGTG	2	12	207326	207337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149451
104	NC_010939	GAAAGT	2	12	207586	207597	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190149452
105	NC_010939	ATTGAT	2	12	208229	208240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190149453
106	NC_010939	AATACG	2	12	218363	218374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190149462
107	NC_010939	AAAATA	2	12	218904	218915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	190149462
108	NC_010939	CGAAAA	2	12	232204	232215	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149478
109	NC_010939	GGTAAA	2	12	234383	234394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190149479
110	NC_010939	ACAAAA	2	12	251673	251684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	190149491
111	NC_010939	GAAAAA	2	12	253496	253507	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	190149494
112	NC_010939	TAAACG	2	12	254172	254183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190149495
113	NC_010939	AAAAAC	2	12	255434	255445	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	190149498
114	NC_010939	CGGTTA	2	12	255558	255569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149498
115	NC_010939	CCTTGC	2	12	265629	265640	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190149509
116	NC_010939	AAACAT	2	12	268172	268183	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	190149512
117	NC_010939	AGGGTG	2	12	270063	270074	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	190149514
118	NC_010939	GAAACG	2	12	271917	271928	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190149516
119	NC_010939	TTAAGT	2	12	272618	272629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190149517
120	NC_010939	CTTTTA	2	12	280547	280558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	190149521
121	NC_010939	GTTGCT	2	12	283713	283724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190149523
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123	NC_010939	TCGGTA	2	12	292534	292545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149525
124	NC_010939	TATTTT	2	12	294131	294142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	190149527
125	NC_010939	GTTTGA	2	12	297917	297928	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190149532
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128	NC_010939	TGGTAT	2	12	316465	316476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190149550
129	NC_010939	ATTTAA	2	12	317541	317552	50 %	50 %	0 %	0 %	190149551
130	NC_010939	ATTGCG	2	12	317903	317914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149551
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132	NC_010939	GATTAT	2	12	320131	320142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190149553
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134	NC_010939	AAGCGC	2	12	324787	324798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149558
135	NC_010939	GGTAAA	2	12	325122	325133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190149558
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220	NC_010939	CGATTA	2	12	569521	569532	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149783
221	NC_010939	TACGTT	2	12	569569	569580	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149783
222	NC_010939	CGTCAG	2	12	575834	575845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149788
223	NC_010939	GATAAA	2	12	579724	579735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190149789
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225	NC_010939	AGCCGT	2	12	585530	585541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149791
226	NC_010939	AACCGA	2	12	588534	588545	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190149793
227	NC_010939	ATTTTA	2	12	591477	591488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149795
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344	NC_010939	AAACCG	2	12	871908	871919	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190150050
345	NC_010939	AATTCT	2	12	873696	873707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	190150052
346	NC_010939	TGCCGG	2	12	880365	880376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190150059
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372	NC_010939	GCGATA	2	12	937177	937188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190150109
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441	NC_010939	TATCGG	2	12	1129716	1129727	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150280
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446	NC_010939	TGACGG	2	12	1146133	1146144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190150287
447	NC_010939	ATCGGT	2	12	1160172	1160183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150302
448	NC_010939	AGCGAA	2	12	1166976	1166987	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190150308
449	NC_010939	AAATCC	2	12	1167541	1167552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	190150309
450	NC_010939	ACGGTT	2	12	1169830	1169841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150310
451	NC_010939	GAAGCG	2	12	1170048	1170059	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190150310
452	NC_010939	ATCCAC	2	12	1177315	1177326	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	190150316
453	NC_010939	ATTGAT	2	12	1178109	1178120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190150317
454	NC_010939	CCCGTT	2	12	1180397	1180408	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190150319
455	NC_010939	ATCTAA	2	12	1192122	1192133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150322
456	NC_010939	GCTGAC	2	12	1193019	1193030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190150323
457	NC_010939	TATCTT	2	12	1194324	1194335	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	190150324
458	NC_010939	CAAAAT	2	12	1194585	1194596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	190150324
459	NC_010939	ATTTTG	2	12	1197090	1197101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	190150327
460	NC_010939	AAAGAT	2	12	1201042	1201053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190150329
461	NC_010939	AAGCAA	2	12	1202795	1202806	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190150331
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