MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 chromosome

Total Repeats: 1709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010655	GCCAT	2	10	2317367	2317376	20 %	20 %	20 %	40 %	187736393
1502	NC_010655	TGCCT	2	10	2324370	2324379	0 %	40 %	20 %	40 %	187736397
1503	NC_010655	GCTCA	2	10	2324609	2324618	20 %	20 %	20 %	40 %	187736397
1504	NC_010655	GCCTT	2	10	2325678	2325687	0 %	40 %	20 %	40 %	187736397
1505	NC_010655	TGGAA	2	10	2327858	2327867	40 %	20 %	40 %	0 %	187736399
1506	NC_010655	CATGC	2	10	2329999	2330008	20 %	20 %	20 %	40 %	187736400
1507	NC_010655	GATTT	2	10	2330616	2330625	20 %	60 %	20 %	0 %	187736401
1508	NC_010655	CCGGC	2	10	2333026	2333035	0 %	0 %	40 %	60 %	187736403
1509	NC_010655	AGGAT	2	10	2334556	2334565	40 %	20 %	40 %	0 %	187736405
1510	NC_010655	TTCCC	2	10	2334774	2334783	0 %	40 %	0 %	60 %	187736406
1511	NC_010655	GGGAC	2	10	2335207	2335216	20 %	0 %	60 %	20 %	187736406
1512	NC_010655	CATGC	2	10	2339281	2339290	20 %	20 %	20 %	40 %	187736408
1513	NC_010655	ATACC	2	10	2340726	2340735	40 %	20 %	0 %	40 %	187736410
1514	NC_010655	AAGGC	2	10	2344294	2344303	40 %	0 %	40 %	20 %	187736413
1515	NC_010655	CCCCG	2	10	2345209	2345218	0 %	0 %	20 %	80 %	187736414
1516	NC_010655	TTCCC	2	10	2348881	2348890	0 %	40 %	0 %	60 %	187736417
1517	NC_010655	CCACG	2	10	2350345	2350354	20 %	0 %	20 %	60 %	187736419
1518	NC_010655	ACGAT	2	10	2351169	2351178	40 %	20 %	20 %	20 %	187736420
1519	NC_010655	TCCGG	2	10	2352059	2352068	0 %	20 %	40 %	40 %	187736420
1520	NC_010655	GGCTG	2	10	2353200	2353209	0 %	20 %	60 %	20 %	187736420
1521	NC_010655	CTGCG	2	10	2354475	2354484	0 %	20 %	40 %	40 %	187736421
1522	NC_010655	TCCCC	2	10	2357679	2357688	0 %	20 %	0 %	80 %	187736424
1523	NC_010655	ACAAA	2	10	2359687	2359696	80 %	0 %	0 %	20 %	187736425
1524	NC_010655	CCTGG	2	10	2360996	2361005	0 %	20 %	40 %	40 %	187736425
1525	NC_010655	GGCCA	2	10	2362094	2362103	20 %	0 %	40 %	40 %	187736426
1526	NC_010655	GCGCC	2	10	2362915	2362924	0 %	0 %	40 %	60 %	187736427
1527	NC_010655	TTCCT	2	10	2363566	2363575	0 %	60 %	0 %	40 %	187736427
1528	NC_010655	GCATG	2	10	2365437	2365446	20 %	20 %	40 %	20 %	187736429
1529	NC_010655	CCGGG	2	10	2367003	2367012	0 %	0 %	60 %	40 %	187736430
1530	NC_010655	GGCCC	2	10	2369274	2369283	0 %	0 %	40 %	60 %	187736433
1531	NC_010655	ACGGA	2	10	2370984	2370993	40 %	0 %	40 %	20 %	187736435
1532	NC_010655	ATTCA	2	10	2372278	2372287	40 %	40 %	0 %	20 %	187736438
1533	NC_010655	GGCCT	2	10	2373500	2373509	0 %	20 %	40 %	40 %	187736439
1534	NC_010655	TCCGC	2	10	2374332	2374341	0 %	20 %	20 %	60 %	187736439
1535	NC_010655	CCTGT	2	10	2375778	2375787	0 %	40 %	20 %	40 %	187736441
1536	NC_010655	CCGGG	2	10	2376548	2376557	0 %	0 %	60 %	40 %	187736442
1537	NC_010655	GAGCA	2	10	2377649	2377658	40 %	0 %	40 %	20 %	187736443
1538	NC_010655	CAGAA	2	10	2377661	2377670	60 %	0 %	20 %	20 %	187736443
1539	NC_010655	GAATT	2	10	2378046	2378055	40 %	40 %	20 %	0 %	187736443
1540	NC_010655	TGGAC	2	10	2380633	2380642	20 %	20 %	40 %	20 %	187736443
1541	NC_010655	TCCAT	2	10	2382123	2382132	20 %	40 %	0 %	40 %	187736444
1542	NC_010655	TCCCT	2	10	2382467	2382476	0 %	40 %	0 %	60 %	187736445
1543	NC_010655	GGCGC	2	10	2386159	2386168	0 %	0 %	60 %	40 %	187736449
1544	NC_010655	TTTCC	2	10	2387124	2387133	0 %	60 %	0 %	40 %	187736450
1545	NC_010655	TGGAC	2	10	2389756	2389765	20 %	20 %	40 %	20 %	187736452
1546	NC_010655	TACCA	2	10	2390160	2390169	40 %	20 %	0 %	40 %	187736452
1547	NC_010655	CGCGC	2	10	2390455	2390464	0 %	0 %	40 %	60 %	187736452
1548	NC_010655	TTCCC	2	10	2390654	2390663	0 %	40 %	0 %	60 %	187736452
1549	NC_010655	GCCCT	2	10	2391426	2391435	0 %	20 %	20 %	60 %	187736452
1550	NC_010655	CGGAA	2	10	2392010	2392019	40 %	0 %	40 %	20 %	187736452
1551	NC_010655	CCTTT	2	10	2394280	2394289	0 %	60 %	0 %	40 %	187736453
1552	NC_010655	AATTC	2	10	2394904	2394913	40 %	40 %	0 %	20 %	187736454
1553	NC_010655	TCTGC	2	10	2394988	2394997	0 %	40 %	20 %	40 %	187736454
1554	NC_010655	GGTCA	2	10	2396720	2396729	20 %	20 %	40 %	20 %	187736456
1555	NC_010655	ACGCC	2	10	2398312	2398321	20 %	0 %	20 %	60 %	187736456
1556	NC_010655	CGTCC	2	10	2400780	2400789	0 %	20 %	20 %	60 %	187736457
1557	NC_010655	CGGCA	2	10	2403434	2403443	20 %	0 %	40 %	40 %	187736460
1558	NC_010655	AATCC	2	10	2405496	2405505	40 %	20 %	0 %	40 %	187736462
1559	NC_010655	TTTTG	2	10	2408284	2408293	0 %	80 %	20 %	0 %	187736464
1560	NC_010655	GGTCT	2	10	2408412	2408421	0 %	40 %	40 %	20 %	187736464
1561	NC_010655	CCAGG	2	10	2411978	2411987	20 %	0 %	40 %	40 %	187736465
1562	NC_010655	CCCTG	2	10	2413200	2413209	0 %	20 %	20 %	60 %	187736466
1563	NC_010655	ATTGA	2	10	2413445	2413454	40 %	40 %	20 %	0 %	187736466
1564	NC_010655	CGTTC	2	10	2413718	2413727	0 %	40 %	20 %	40 %	187736466
1565	NC_010655	CCGCA	2	10	2413921	2413930	20 %	0 %	20 %	60 %	187736467
1566	NC_010655	CTTTA	2	10	2415061	2415070	20 %	60 %	0 %	20 %	187736468
1567	NC_010655	CGTTC	2	10	2415205	2415214	0 %	40 %	20 %	40 %	187736468
1568	NC_010655	GAACA	2	10	2416093	2416102	60 %	0 %	20 %	20 %	187736468
1569	NC_010655	TACCA	2	10	2416872	2416881	40 %	20 %	0 %	40 %	187736469
1570	NC_010655	CGACC	2	10	2417357	2417366	20 %	0 %	20 %	60 %	187736469
1571	NC_010655	CCATG	2	10	2420269	2420278	20 %	20 %	20 %	40 %	187736472
1572	NC_010655	TCCGA	2	10	2420434	2420443	20 %	20 %	20 %	40 %	187736473
1573	NC_010655	ACGGG	2	10	2420610	2420619	20 %	0 %	60 %	20 %	187736473
1574	NC_010655	ATAAA	2	10	2424053	2424062	80 %	20 %	0 %	0 %	187736475
1575	NC_010655	CCGGA	2	10	2424692	2424701	20 %	0 %	40 %	40 %	187736476
1576	NC_010655	CCATC	2	10	2425363	2425372	20 %	20 %	0 %	60 %	187736477
1577	NC_010655	ATTTC	2	10	2425494	2425503	20 %	60 %	0 %	20 %	187736477
1578	NC_010655	GGGCG	2	10	2426623	2426632	0 %	0 %	80 %	20 %	187736478
1579	NC_010655	AAAAC	2	10	2433245	2433254	80 %	0 %	0 %	20 %	187736482
1580	NC_010655	GCGGA	2	10	2433374	2433383	20 %	0 %	60 %	20 %	187736482
1581	NC_010655	GTTCT	2	10	2440535	2440544	0 %	60 %	20 %	20 %	187736489
1582	NC_010655	TTTTC	2	10	2442247	2442256	0 %	80 %	0 %	20 %	187736489
1583	NC_010655	CCGGG	2	10	2446021	2446030	0 %	0 %	60 %	40 %	187736492
1584	NC_010655	CACGG	2	10	2446364	2446373	20 %	0 %	40 %	40 %	187736492
1585	NC_010655	GGCGC	2	10	2447884	2447893	0 %	0 %	60 %	40 %	187736493
1586	NC_010655	GCGGA	2	10	2448567	2448576	20 %	0 %	60 %	20 %	187736494
1587	NC_010655	TCCGG	2	10	2449956	2449965	0 %	20 %	40 %	40 %	187736496
1588	NC_010655	AGGCC	2	10	2451648	2451657	20 %	0 %	40 %	40 %	187736497
1589	NC_010655	GAAAA	2	10	2456211	2456220	80 %	0 %	20 %	0 %	187736501
1590	NC_010655	ACGGA	2	10	2458838	2458847	40 %	0 %	40 %	20 %	187736504
1591	NC_010655	GCACC	2	10	2461190	2461199	20 %	0 %	20 %	60 %	187736506
1592	NC_010655	TTTCC	2	10	2463116	2463125	0 %	60 %	0 %	40 %	187736508
1593	NC_010655	CGCTG	2	10	2467592	2467601	0 %	20 %	40 %	40 %	187736511
1594	NC_010655	CTTGC	2	10	2470555	2470564	0 %	40 %	20 %	40 %	187736513
1595	NC_010655	TGACC	2	10	2471283	2471292	20 %	20 %	20 %	40 %	187736513
1596	NC_010655	CCGCA	2	10	2473160	2473169	20 %	0 %	20 %	60 %	187736515
1597	NC_010655	GTCCG	2	10	2478325	2478334	0 %	20 %	40 %	40 %	187736519
1598	NC_010655	CGGAA	2	10	2482016	2482025	40 %	0 %	40 %	20 %	187736521
1599	NC_010655	GGAAT	2	10	2482293	2482302	40 %	20 %	40 %	0 %	187736521
1600	NC_010655	GCCTC	2	10	2485552	2485561	0 %	20 %	20 %	60 %	187736522
1601	NC_010655	CTGAC	2	10	2490238	2490247	20 %	20 %	20 %	40 %	187736524
1602	NC_010655	CAGGA	2	10	2491715	2491724	40 %	0 %	40 %	20 %	187736526
1603	NC_010655	CTCAT	2	10	2492448	2492457	20 %	40 %	0 %	40 %	187736527
1604	NC_010655	GCCCA	2	10	2494090	2494099	20 %	0 %	20 %	60 %	187736528
1605	NC_010655	GAATA	2	10	2494866	2494875	60 %	20 %	20 %	0 %	187736529
1606	NC_010655	CGGCC	2	10	2497576	2497585	0 %	0 %	40 %	60 %	187736530
1607	NC_010655	ATGCC	2	10	2498945	2498954	20 %	20 %	20 %	40 %	187736531
1608	NC_010655	ATAAA	2	10	2498970	2498979	80 %	20 %	0 %	0 %	187736531
1609	NC_010655	TATAA	2	10	2499302	2499311	60 %	40 %	0 %	0 %	187736531
1610	NC_010655	GCTCG	2	10	2499867	2499876	0 %	20 %	40 %	40 %	187736532
1611	NC_010655	AAAAT	2	10	2502286	2502295	80 %	20 %	0 %	0 %	187736536
1612	NC_010655	GGATG	2	10	2503060	2503069	20 %	20 %	60 %	0 %	187736537
1613	NC_010655	CATTC	2	10	2503475	2503484	20 %	40 %	0 %	40 %	187736537
1614	NC_010655	GAAAG	2	10	2504019	2504028	60 %	0 %	40 %	0 %	187736538
1615	NC_010655	AATTC	2	10	2505737	2505746	40 %	40 %	0 %	20 %	187736539
1616	NC_010655	AGGGA	2	10	2514456	2514465	40 %	0 %	60 %	0 %	187736546
1617	NC_010655	CATCA	2	10	2519576	2519585	40 %	20 %	0 %	40 %	187736549
1618	NC_010655	GCCGC	2	10	2520034	2520043	0 %	0 %	40 %	60 %	187736549
1619	NC_010655	CCCGG	2	10	2523013	2523022	0 %	0 %	40 %	60 %	187736553
1620	NC_010655	CTTAC	2	10	2523385	2523394	20 %	40 %	0 %	40 %	187736554
1621	NC_010655	AGCCC	2	10	2525252	2525261	20 %	0 %	20 %	60 %	187736554
1622	NC_010655	GCCGG	2	10	2527236	2527245	0 %	0 %	60 %	40 %	187736555
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1624	NC_010655	TTTGT	2	10	2534859	2534868	0 %	80 %	20 %	0 %	187736562
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.