MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB8

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009933	TG	3	6	180	185	0 %	50 %	50 %	0 %	158341504
2	NC_009933	TG	3	6	665	670	0 %	50 %	50 %	0 %	158341504
3	NC_009933	GC	3	6	1792	1797	0 %	0 %	50 %	50 %	158341505
4	NC_009933	TC	3	6	2645	2650	0 %	50 %	0 %	50 %	158341506
5	NC_009933	AG	3	6	2787	2792	50 %	0 %	50 %	0 %	158341506
6	NC_009933	AT	3	6	3032	3037	50 %	50 %	0 %	0 %	158341506
7	NC_009933	GA	3	6	3096	3101	50 %	0 %	50 %	0 %	158341506
8	NC_009933	CT	3	6	3512	3517	0 %	50 %	0 %	50 %	158341506
9	NC_009933	CT	3	6	4889	4894	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
10	NC_009933	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	158341507
11	NC_009933	AT	3	6	5710	5715	50 %	50 %	0 %	0 %	158341507
12	NC_009933	TG	3	6	6252	6257	0 %	50 %	50 %	0 %	158341507
13	NC_009933	TC	4	8	6324	6331	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
14	NC_009933	AG	3	6	6464	6469	50 %	0 %	50 %	0 %	158341507
15	NC_009933	CT	3	6	6866	6871	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
16	NC_009933	GA	3	6	7227	7232	50 %	0 %	50 %	0 %	158341507
17	NC_009933	CT	3	6	8109	8114	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
18	NC_009933	TC	3	6	8983	8988	0 %	50 %	0 %	50 %	158341508
19	NC_009933	CT	3	6	10226	10231	0 %	50 %	0 %	50 %	158341509
20	NC_009933	GA	3	6	10912	10917	50 %	0 %	50 %	0 %	158341509
21	NC_009933	AC	3	6	11613	11618	50 %	0 %	0 %	50 %	158341511
22	NC_009933	TC	3	6	11859	11864	0 %	50 %	0 %	50 %	158341511
23	NC_009933	AG	3	6	12467	12472	50 %	0 %	50 %	0 %	158341513
24	NC_009933	TA	3	6	12964	12969	50 %	50 %	0 %	0 %	158341514
25	NC_009933	GA	3	6	14620	14625	50 %	0 %	50 %	0 %	158341518
26	NC_009933	GA	3	6	14957	14962	50 %	0 %	50 %	0 %	158341519
27	NC_009933	TA	3	6	17345	17350	50 %	50 %	0 %	0 %	158341522
28	NC_009933	AG	3	6	18873	18878	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
29	NC_009933	AG	3	6	18999	19004	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
30	NC_009933	AG	3	6	19290	19295	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
31	NC_009933	GA	3	6	19504	19509	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
32	NC_009933	GA	3	6	19630	19635	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
33	NC_009933	AG	3	6	19755	19760	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
34	NC_009933	GA	3	6	19882	19887	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
35	NC_009933	CT	3	6	20535	20540	0 %	50 %	0 %	50 %	158341524
36	NC_009933	CA	3	6	20670	20675	50 %	0 %	0 %	50 %	158341524
37	NC_009933	AG	3	6	20774	20779	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
38	NC_009933	AG	3	6	25295	25300	50 %	0 %	50 %	0 %	158341528
39	NC_009933	GA	3	6	25959	25964	50 %	0 %	50 %	0 %	158341530
40	NC_009933	AC	3	6	25980	25985	50 %	0 %	0 %	50 %	158341530
41	NC_009933	AG	3	6	26925	26930	50 %	0 %	50 %	0 %	158341529
42	NC_009933	AG	3	6	27896	27901	50 %	0 %	50 %	0 %	158341532
43	NC_009933	CT	3	6	27998	28003	0 %	50 %	0 %	50 %	158341532
44	NC_009933	AG	3	6	29342	29347	50 %	0 %	50 %	0 %	158341537
45	NC_009933	AG	3	6	29873	29878	50 %	0 %	50 %	0 %	158341538
46	NC_009933	TC	3	6	30701	30706	0 %	50 %	0 %	50 %	158341540
47	NC_009933	AT	3	6	30710	30715	50 %	50 %	0 %	0 %	158341540
48	NC_009933	CT	4	8	31374	31381	0 %	50 %	0 %	50 %	158341540
49	NC_009933	TC	3	6	33662	33667	0 %	50 %	0 %	50 %	158341545
50	NC_009933	TG	3	6	34506	34511	0 %	50 %	50 %	0 %	158341547
51	NC_009933	CA	3	6	34857	34862	50 %	0 %	0 %	50 %	158341548
52	NC_009933	AT	3	6	37275	37280	50 %	50 %	0 %	0 %	158341552
53	NC_009933	TC	3	6	37807	37812	0 %	50 %	0 %	50 %	158341553
54	NC_009933	AG	3	6	39954	39959	50 %	0 %	50 %	0 %	158341555
55	NC_009933	AG	3	6	41090	41095	50 %	0 %	50 %	0 %	158341557
56	NC_009933	AT	3	6	43034	43039	50 %	50 %	0 %	0 %	158341558
57	NC_009933	GA	3	6	44191	44196	50 %	0 %	50 %	0 %	158341559
58	NC_009933	TC	3	6	45608	45613	0 %	50 %	0 %	50 %	158341560
59	NC_009933	GA	3	6	45679	45684	50 %	0 %	50 %	0 %	158341560
60	NC_009933	AT	3	6	47590	47595	50 %	50 %	0 %	0 %	158341562
61	NC_009933	GA	3	6	48385	48390	50 %	0 %	50 %	0 %	158341562
62	NC_009933	CA	3	6	52468	52473	50 %	0 %	0 %	50 %	158341564
63	NC_009933	TC	4	8	56114	56121	0 %	50 %	0 %	50 %	158341565
64	NC_009933	TG	3	6	57718	57723	0 %	50 %	50 %	0 %	158341567
65	NC_009933	TA	3	6	58709	58714	50 %	50 %	0 %	0 %	158341568
66	NC_009933	CT	3	6	59225	59230	0 %	50 %	0 %	50 %	158341568
67	NC_009933	TC	3	6	59789	59794	0 %	50 %	0 %	50 %	158341568
68	NC_009933	GA	4	8	59876	59883	50 %	0 %	50 %	0 %	158341568
69	NC_009933	GA	3	6	60329	60334	50 %	0 %	50 %	0 %	158341568
70	NC_009933	TG	3	6	61874	61879	0 %	50 %	50 %	0 %	158341569
71	NC_009933	CT	3	6	62230	62235	0 %	50 %	0 %	50 %	158341570
72	NC_009933	CT	3	6	62503	62508	0 %	50 %	0 %	50 %	158341570
73	NC_009933	TA	3	6	62611	62616	50 %	50 %	0 %	0 %	158341570
74	NC_009933	GA	3	6	65076	65081	50 %	0 %	50 %	0 %	158341572
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79	NC_009933	CT	3	6	69796	69801	0 %	50 %	0 %	50 %	158341576
80	NC_009933	CT	3	6	70009	70014	0 %	50 %	0 %	50 %	158341577
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82	NC_009933	TA	3	6	72937	72942	50 %	50 %	0 %	0 %	158341580
83	NC_009933	TC	3	6	72961	72966	0 %	50 %	0 %	50 %	158341580
84	NC_009933	CT	3	6	73221	73226	0 %	50 %	0 %	50 %	158341581
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86	NC_009933	GA	3	6	75360	75365	50 %	0 %	50 %	0 %	158341582
87	NC_009933	TG	4	8	75701	75708	0 %	50 %	50 %	0 %	158341582
88	NC_009933	GA	3	6	78294	78299	50 %	0 %	50 %	0 %	158341584
89	NC_009933	TC	3	6	78564	78569	0 %	50 %	0 %	50 %	158341584
90	NC_009933	AG	3	6	79236	79241	50 %	0 %	50 %	0 %	158341584
91	NC_009933	TA	3	6	82266	82271	50 %	50 %	0 %	0 %	158341587
92	NC_009933	TA	3	6	83401	83406	50 %	50 %	0 %	0 %	158341588
93	NC_009933	CT	3	6	85963	85968	0 %	50 %	0 %	50 %	158341589
94	NC_009933	TC	3	6	86590	86595	0 %	50 %	0 %	50 %	158341589
95	NC_009933	CA	3	6	87159	87164	50 %	0 %	0 %	50 %	158341589
96	NC_009933	TC	3	6	87563	87568	0 %	50 %	0 %	50 %	158341589
97	NC_009933	GA	3	6	87633	87638	50 %	0 %	50 %	0 %	158341589
98	NC_009933	AG	3	6	87852	87857	50 %	0 %	50 %	0 %	158341589
99	NC_009933	CT	3	6	87933	87938	0 %	50 %	0 %	50 %	158341589
100	NC_009933	AG	3	6	88039	88044	50 %	0 %	50 %	0 %	158341589
101	NC_009933	AC	3	6	88624	88629	50 %	0 %	0 %	50 %	158341590
102	NC_009933	TC	3	6	89184	89189	0 %	50 %	0 %	50 %	158341591
103	NC_009933	TC	3	6	89587	89592	0 %	50 %	0 %	50 %	158341591
104	NC_009933	AC	3	6	91523	91528	50 %	0 %	0 %	50 %	158341593
105	NC_009933	AC	3	6	92393	92398	50 %	0 %	0 %	50 %	158341594
106	NC_009933	CT	3	6	94325	94330	0 %	50 %	0 %	50 %	158341595
107	NC_009933	TC	3	6	94842	94847	0 %	50 %	0 %	50 %	158341595
108	NC_009933	AG	3	6	95575	95580	50 %	0 %	50 %	0 %	158341595
109	NC_009933	CT	3	6	96066	96071	0 %	50 %	0 %	50 %	158341595
110	NC_009933	GA	3	6	97816	97821	50 %	0 %	50 %	0 %	158341597
111	NC_009933	AT	3	6	99010	99015	50 %	50 %	0 %	0 %	158341598
112	NC_009933	CT	3	6	99186	99191	0 %	50 %	0 %	50 %	158341599
113	NC_009933	TG	3	6	100482	100487	0 %	50 %	50 %	0 %	158341600
114	NC_009933	GA	3	6	101567	101572	50 %	0 %	50 %	0 %	158341601
115	NC_009933	AT	3	6	103167	103172	50 %	50 %	0 %	0 %	158341602
116	NC_009933	GA	3	6	110479	110484	50 %	0 %	50 %	0 %	158341608
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118	NC_009933	GA	3	6	113033	113038	50 %	0 %	50 %	0 %	158341611
119	NC_009933	CA	3	6	118181	118186	50 %	0 %	0 %	50 %	158341618
120	NC_009933	GA	3	6	118451	118456	50 %	0 %	50 %	0 %	158341618
121	NC_009933	CT	3	6	120030	120035	0 %	50 %	0 %	50 %	158341620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.