MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB8

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009933	ATCT	2	8	775	782	25 %	50 %	0 %	25 %	158341504
2	NC_009933	GTTG	2	8	1782	1789	0 %	50 %	50 %	0 %	158341505
3	NC_009933	AATT	2	8	2052	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	158341505
4	NC_009933	TCCA	2	8	2509	2516	25 %	25 %	0 %	50 %	158341506
5	NC_009933	CATC	2	8	3107	3114	25 %	25 %	0 %	50 %	158341506
6	NC_009933	ATAG	2	8	4397	4404	50 %	25 %	25 %	0 %	158341507
7	NC_009933	CTGA	2	8	4973	4980	25 %	25 %	25 %	25 %	158341507
8	NC_009933	ATCC	2	8	5286	5293	25 %	25 %	0 %	50 %	158341507
9	NC_009933	GGGT	2	8	6742	6749	0 %	25 %	75 %	0 %	158341507
10	NC_009933	CTTT	2	8	8343	8350	0 %	75 %	0 %	25 %	158341508
11	NC_009933	AACT	2	8	8786	8793	50 %	25 %	0 %	25 %	158341508
12	NC_009933	AGAA	2	8	9124	9131	75 %	0 %	25 %	0 %	158341508
13	NC_009933	AATC	2	8	9996	10003	50 %	25 %	0 %	25 %	158341509
14	NC_009933	GGGC	2	8	10173	10180	0 %	0 %	75 %	25 %	158341509
15	NC_009933	GATG	2	8	10807	10814	25 %	25 %	50 %	0 %	158341509
16	NC_009933	ATGA	2	8	11083	11090	50 %	25 %	25 %	0 %	158341510
17	NC_009933	GGAT	2	8	12098	12105	25 %	25 %	50 %	0 %	158341512
18	NC_009933	TCAG	2	8	12176	12183	25 %	25 %	25 %	25 %	158341512
19	NC_009933	GACC	2	8	13475	13482	25 %	0 %	25 %	50 %	158341515
20	NC_009933	CTGG	2	8	14047	14054	0 %	25 %	50 %	25 %	158341517
21	NC_009933	CTTG	2	8	15321	15328	0 %	50 %	25 %	25 %	158341520
22	NC_009933	CAAG	2	8	15349	15356	50 %	0 %	25 %	25 %	158341520
23	NC_009933	TCAG	2	8	16786	16793	25 %	25 %	25 %	25 %	158341522
24	NC_009933	CAAT	2	8	17728	17735	50 %	25 %	0 %	25 %	158341523
25	NC_009933	TTGT	2	8	18487	18494	0 %	75 %	25 %	0 %	158341524
26	NC_009933	ACCA	2	8	20197	20204	50 %	0 %	0 %	50 %	158341524
27	NC_009933	AACA	2	8	20441	20448	75 %	0 %	0 %	25 %	158341524
28	NC_009933	TTCT	2	8	20455	20462	0 %	75 %	0 %	25 %	158341524
29	NC_009933	ACCC	2	8	20659	20666	25 %	0 %	0 %	75 %	158341524
30	NC_009933	GACC	2	8	20786	20793	25 %	0 %	25 %	50 %	158341524
31	NC_009933	TCCC	2	8	21111	21118	0 %	25 %	0 %	75 %	158341524
32	NC_009933	GATG	2	8	24729	24736	25 %	25 %	50 %	0 %	158341528
33	NC_009933	AATT	2	8	25040	25047	50 %	50 %	0 %	0 %	158341528
34	NC_009933	GAAC	2	8	25051	25058	50 %	0 %	25 %	25 %	158341528
35	NC_009933	CGAG	2	8	25081	25088	25 %	0 %	50 %	25 %	158341528
36	NC_009933	TCTG	2	8	25493	25500	0 %	50 %	25 %	25 %	158341530
37	NC_009933	GGAC	2	8	26149	26156	25 %	0 %	50 %	25 %	158341530
38	NC_009933	CTTC	2	8	26810	26817	0 %	50 %	0 %	50 %	158341529
39	NC_009933	TTCC	2	8	27906	27913	0 %	50 %	0 %	50 %	158341532
40	NC_009933	GTAT	2	8	29283	29290	25 %	50 %	25 %	0 %	158341537
41	NC_009933	CACC	2	8	29692	29699	25 %	0 %	0 %	75 %	158341538
42	NC_009933	TTTG	2	8	29816	29823	0 %	75 %	25 %	0 %	158341538
43	NC_009933	CCAA	2	8	30759	30766	50 %	0 %	0 %	50 %	158341540
44	NC_009933	GGAA	2	8	31095	31102	50 %	0 %	50 %	0 %	158341540
45	NC_009933	AGTG	2	8	31382	31389	25 %	25 %	50 %	0 %	158341540
46	NC_009933	TGCC	2	8	31431	31438	0 %	25 %	25 %	50 %	158341540
47	NC_009933	ACCA	2	8	31587	31594	50 %	0 %	0 %	50 %	158341541
48	NC_009933	GTTC	2	8	31861	31868	0 %	50 %	25 %	25 %	158341541
49	NC_009933	TGAA	2	8	32624	32631	50 %	25 %	25 %	0 %	158341543
50	NC_009933	TTGC	2	8	33779	33786	0 %	50 %	25 %	25 %	158341545
51	NC_009933	CAAT	2	8	34784	34791	50 %	25 %	0 %	25 %	158341548
52	NC_009933	AACT	2	8	35007	35014	50 %	25 %	0 %	25 %	158341549
53	NC_009933	CCCT	2	8	35026	35033	0 %	25 %	0 %	75 %	158341549
54	NC_009933	TAAT	2	8	37781	37788	50 %	50 %	0 %	0 %	158341553
55	NC_009933	TATC	2	8	37801	37808	25 %	50 %	0 %	25 %	158341553
56	NC_009933	ATTT	2	8	37867	37874	25 %	75 %	0 %	0 %	158341553
57	NC_009933	CAAG	2	8	38040	38047	50 %	0 %	25 %	25 %	158341553
58	NC_009933	AATC	2	8	39136	39143	50 %	25 %	0 %	25 %	158341554
59	NC_009933	GAAG	2	8	39384	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	158341554
60	NC_009933	TGGT	2	8	39472	39479	0 %	50 %	50 %	0 %	158341554
61	NC_009933	AGCC	2	8	40844	40851	25 %	0 %	25 %	50 %	158341557
62	NC_009933	TGTT	2	8	41008	41015	0 %	75 %	25 %	0 %	158341557
63	NC_009933	AAAG	2	8	43083	43090	75 %	0 %	25 %	0 %	158341558
64	NC_009933	AAAC	2	8	43117	43124	75 %	0 %	0 %	25 %	158341558
65	NC_009933	CCAA	2	8	43250	43257	50 %	0 %	0 %	50 %	158341558
66	NC_009933	TCAG	2	8	43653	43660	25 %	25 %	25 %	25 %	158341558
67	NC_009933	ATCA	2	8	44393	44400	50 %	25 %	0 %	25 %	158341559
68	NC_009933	GCTA	2	8	45646	45653	25 %	25 %	25 %	25 %	158341560
69	NC_009933	ACTC	2	8	46147	46154	25 %	25 %	0 %	50 %	158341560
70	NC_009933	AAGT	2	8	46512	46519	50 %	25 %	25 %	0 %	158341561
71	NC_009933	ATTG	2	8	47941	47948	25 %	50 %	25 %	0 %	158341562
72	NC_009933	TGGT	2	8	48304	48311	0 %	50 %	50 %	0 %	158341562
73	NC_009933	CATG	2	8	48590	48597	25 %	25 %	25 %	25 %	158341562
74	NC_009933	TTTA	2	8	48712	48719	25 %	75 %	0 %	0 %	158341562
75	NC_009933	CAGT	2	8	49188	49195	25 %	25 %	25 %	25 %	158341562
76	NC_009933	GCTA	2	8	49527	49534	25 %	25 %	25 %	25 %	158341563
77	NC_009933	TTGA	2	8	50480	50487	25 %	50 %	25 %	0 %	158341563
78	NC_009933	AATC	2	8	50551	50558	50 %	25 %	0 %	25 %	158341563
79	NC_009933	CCCA	2	8	51033	51040	25 %	0 %	0 %	75 %	158341563
80	NC_009933	AGCT	2	8	51380	51387	25 %	25 %	25 %	25 %	158341563
81	NC_009933	CAGC	2	8	51404	51411	25 %	0 %	25 %	50 %	158341563
82	NC_009933	CCCA	2	8	51485	51492	25 %	0 %	0 %	75 %	158341563
83	NC_009933	ATGT	2	8	53936	53943	25 %	50 %	25 %	0 %	158341565
84	NC_009933	ATGT	2	8	54692	54699	25 %	50 %	25 %	0 %	158341565
85	NC_009933	CTGC	2	8	55040	55047	0 %	25 %	25 %	50 %	158341565
86	NC_009933	ATCC	2	8	55079	55086	25 %	25 %	0 %	50 %	158341565
87	NC_009933	GGTT	2	8	55397	55404	0 %	50 %	50 %	0 %	158341565
88	NC_009933	ACCC	2	8	55635	55642	25 %	0 %	0 %	75 %	158341565
89	NC_009933	GAAG	2	8	58058	58065	50 %	0 %	50 %	0 %	158341567
90	NC_009933	GTCA	2	8	58077	58084	25 %	25 %	25 %	25 %	158341567
91	NC_009933	AATT	2	8	58377	58384	50 %	50 %	0 %	0 %	158341568
92	NC_009933	ACCT	2	8	58542	58549	25 %	25 %	0 %	50 %	158341568
93	NC_009933	TAAA	2	8	58635	58642	75 %	25 %	0 %	0 %	158341568
94	NC_009933	CCGA	2	8	59043	59050	25 %	0 %	25 %	50 %	158341568
95	NC_009933	AATT	2	8	59982	59989	50 %	50 %	0 %	0 %	158341568
96	NC_009933	CAGC	2	8	60416	60423	25 %	0 %	25 %	50 %	158341568
97	NC_009933	ATCA	2	8	60813	60820	50 %	25 %	0 %	25 %	158341568
98	NC_009933	GAAA	2	8	61140	61147	75 %	0 %	25 %	0 %	158341568
99	NC_009933	CCAG	2	8	61357	61364	25 %	0 %	25 %	50 %	158341568
100	NC_009933	TTAC	2	8	62049	62056	25 %	50 %	0 %	25 %	158341569
101	NC_009933	ATTG	2	8	64387	64394	25 %	50 %	25 %	0 %	158341571
102	NC_009933	CATA	2	8	64466	64473	50 %	25 %	0 %	25 %	158341571
103	NC_009933	AAGT	2	8	64989	64996	50 %	25 %	25 %	0 %	158341572
104	NC_009933	TCCT	2	8	65004	65011	0 %	50 %	0 %	50 %	158341572
105	NC_009933	ATCA	2	8	65169	65176	50 %	25 %	0 %	25 %	158341572
106	NC_009933	GAAA	2	8	65843	65850	75 %	0 %	25 %	0 %	158341572
107	NC_009933	TTTG	2	8	66767	66774	0 %	75 %	25 %	0 %	158341573
108	NC_009933	ATCT	2	8	67910	67917	25 %	50 %	0 %	25 %	158341574
109	NC_009933	GTTG	2	8	68917	68924	0 %	50 %	50 %	0 %	158341575
110	NC_009933	AATT	2	8	69187	69194	50 %	50 %	0 %	0 %	158341575
111	NC_009933	ACTC	2	8	70740	70747	25 %	25 %	0 %	50 %	158341579
112	NC_009933	ATCC	2	8	70954	70961	25 %	25 %	0 %	50 %	158341580
113	NC_009933	CAAA	2	8	70994	71001	75 %	0 %	0 %	25 %	158341580
114	NC_009933	ATCT	2	8	71064	71071	25 %	50 %	0 %	25 %	158341580
115	NC_009933	GTTT	2	8	71167	71174	0 %	75 %	25 %	0 %	158341580
116	NC_009933	TTTG	2	8	71274	71281	0 %	75 %	25 %	0 %	158341580
117	NC_009933	CTTT	2	8	71501	71508	0 %	75 %	0 %	25 %	158341580
118	NC_009933	TTCC	2	8	71894	71901	0 %	50 %	0 %	50 %	158341580
119	NC_009933	TTTA	2	8	71907	71914	25 %	75 %	0 %	0 %	158341580
120	NC_009933	TTCC	2	8	72107	72114	0 %	50 %	0 %	50 %	158341580
121	NC_009933	TTTA	2	8	72120	72127	25 %	75 %	0 %	0 %	158341580
122	NC_009933	TTCC	2	8	72395	72402	0 %	50 %	0 %	50 %	158341580
123	NC_009933	TTTA	2	8	72408	72415	25 %	75 %	0 %	0 %	158341580
124	NC_009933	TTCC	2	8	72608	72615	0 %	50 %	0 %	50 %	158341580
125	NC_009933	TTTA	2	8	72621	72628	25 %	75 %	0 %	0 %	158341580
126	NC_009933	TCTT	2	8	73308	73315	0 %	75 %	0 %	25 %	158341581
127	NC_009933	CGTG	2	8	75099	75106	0 %	25 %	50 %	25 %	158341582
128	NC_009933	TCAA	2	8	75410	75417	50 %	25 %	0 %	25 %	158341582
129	NC_009933	AAGC	2	8	75793	75800	50 %	0 %	25 %	25 %	158341582
130	NC_009933	GAAC	2	8	77347	77354	50 %	0 %	25 %	25 %	158341582
131	NC_009933	GATA	2	8	77364	77371	50 %	25 %	25 %	0 %	158341582
132	NC_009933	CTCC	2	8	77453	77460	0 %	25 %	0 %	75 %	158341582
133	NC_009933	CCAA	2	8	78906	78913	50 %	0 %	0 %	50 %	158341584
134	NC_009933	ATTG	2	8	79012	79019	25 %	50 %	25 %	0 %	158341584
135	NC_009933	CTAT	2	8	79250	79257	25 %	50 %	0 %	25 %	158341584
136	NC_009933	GACT	2	8	79647	79654	25 %	25 %	25 %	25 %	158341584
137	NC_009933	TTTG	2	8	80378	80385	0 %	75 %	25 %	0 %	158341585
138	NC_009933	CTTT	2	8	80425	80432	0 %	75 %	0 %	25 %	158341585
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.