MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009932	CTTAA	2	10	1748	1757	40 %	40 %	0 %	20 %	158341332
2	NC_009932	TTCTT	2	10	2647	2656	0 %	80 %	0 %	20 %	158341332
3	NC_009932	TAGGC	2	10	8981	8990	20 %	20 %	40 %	20 %	158341336
4	NC_009932	TAATC	2	10	10670	10679	40 %	40 %	0 %	20 %	158341336
5	NC_009932	CCCTG	2	10	12060	12069	0 %	20 %	20 %	60 %	158341338
6	NC_009932	CATCA	2	10	12899	12908	40 %	20 %	0 %	40 %	158341338
7	NC_009932	GTTAA	2	10	19768	19777	40 %	40 %	20 %	0 %	158341343
8	NC_009932	ATTAG	2	10	20224	20233	40 %	40 %	20 %	0 %	158341344
9	NC_009932	TTCAA	2	10	21815	21824	40 %	40 %	0 %	20 %	158341348
10	NC_009932	TGTTC	2	10	22783	22792	0 %	60 %	20 %	20 %	158341348
11	NC_009932	CAGCC	2	10	24463	24472	20 %	0 %	20 %	60 %	158341350
12	NC_009932	TGAAA	2	10	24749	24758	60 %	20 %	20 %	0 %	158341350
13	NC_009932	ACAGC	2	10	26340	26349	40 %	0 %	20 %	40 %	158341350
14	NC_009932	TCGTG	2	10	28185	28194	0 %	40 %	40 %	20 %	158341351
15	NC_009932	TGAAC	2	10	28642	28651	40 %	20 %	20 %	20 %	158341352
16	NC_009932	TGTCA	2	10	34121	34130	20 %	40 %	20 %	20 %	158341361
17	NC_009932	ATCTC	2	10	35548	35557	20 %	40 %	0 %	40 %	158341361
18	NC_009932	AAGTC	2	10	36996	37005	40 %	20 %	20 %	20 %	158341363
19	NC_009932	CTTCA	2	10	37149	37158	20 %	40 %	0 %	40 %	158341364
20	NC_009932	ACCCA	2	10	41226	41235	40 %	0 %	0 %	60 %	158341369
21	NC_009932	ATCCA	2	10	41543	41552	40 %	20 %	0 %	40 %	158341369
22	NC_009932	CAAAG	2	10	43559	43568	60 %	0 %	20 %	20 %	158341371
23	NC_009932	GATGC	2	10	44647	44656	20 %	20 %	40 %	20 %	158341372
24	NC_009932	GCTTG	2	10	50734	50743	0 %	40 %	40 %	20 %	158341376
25	NC_009932	CCCCA	2	10	51507	51516	20 %	0 %	0 %	80 %	158341377
26	NC_009932	AGTCT	2	10	53891	53900	20 %	40 %	20 %	20 %	158341379
27	NC_009932	CTCCC	2	10	54015	54024	0 %	20 %	0 %	80 %	158341380
28	NC_009932	GATTT	2	10	56090	56099	20 %	60 %	20 %	0 %	158341380
29	NC_009932	CGGTC	2	10	59472	59481	0 %	20 %	40 %	40 %	158341383
30	NC_009932	AATGC	2	10	60604	60613	40 %	20 %	20 %	20 %	158341385
31	NC_009932	CCCAA	2	10	61224	61233	40 %	0 %	0 %	60 %	158341386
32	NC_009932	ACAGC	2	10	61273	61282	40 %	0 %	20 %	40 %	158341386
33	NC_009932	CCTCG	2	10	66212	66221	0 %	20 %	20 %	60 %	158341390
34	NC_009932	ATTTG	2	10	67650	67659	20 %	60 %	20 %	0 %	158341391
35	NC_009932	CCCAA	2	10	69279	69288	40 %	0 %	0 %	60 %	158341393
36	NC_009932	ATCAG	2	10	71275	71284	40 %	20 %	20 %	20 %	158341396
37	NC_009932	TAAAG	2	10	71423	71432	60 %	20 %	20 %	0 %	158341396
38	NC_009932	TTTCC	2	10	76683	76692	0 %	60 %	0 %	40 %	158341403
39	NC_009932	GGTTG	2	10	77418	77427	0 %	40 %	60 %	0 %	158341404
40	NC_009932	AAGGC	2	10	79106	79115	40 %	0 %	40 %	20 %	158341404
41	NC_009932	TTGAG	2	10	79279	79288	20 %	40 %	40 %	0 %	158341404
42	NC_009932	CTAGA	2	10	81077	81086	40 %	20 %	20 %	20 %	158341406
43	NC_009932	TAACG	2	10	82592	82601	40 %	20 %	20 %	20 %	158341409
44	NC_009932	TGCAA	2	10	83297	83306	40 %	20 %	20 %	20 %	158341410
45	NC_009932	CATAC	2	10	86570	86579	40 %	20 %	0 %	40 %	158341414
46	NC_009932	TCTAG	2	10	87645	87654	20 %	40 %	20 %	20 %	158341418
47	NC_009932	AGACC	2	10	89751	89760	40 %	0 %	20 %	40 %	158341420
48	NC_009932	GATCA	2	10	93052	93061	40 %	20 %	20 %	20 %	158341424
49	NC_009932	TTCTG	2	10	94253	94262	0 %	60 %	20 %	20 %	158341426
50	NC_009932	TTTGC	2	10	95829	95838	0 %	60 %	20 %	20 %	158341426
51	NC_009932	GGTGC	2	10	95971	95980	0 %	20 %	60 %	20 %	158341426
52	NC_009932	TTGTT	2	10	96335	96344	0 %	80 %	20 %	0 %	158341426
53	NC_009932	TGAGC	2	10	96751	96760	20 %	20 %	40 %	20 %	158341426
54	NC_009932	GATCC	2	10	99504	99513	20 %	20 %	20 %	40 %	158341427
55	NC_009932	TGAAG	2	10	100268	100277	40 %	20 %	40 %	0 %	158341427
56	NC_009932	CAGAC	2	10	102606	102615	40 %	0 %	20 %	40 %	158341431
57	NC_009932	ACCAG	2	10	104349	104358	40 %	0 %	20 %	40 %	158341434
58	NC_009932	AAGGC	2	10	105950	105959	40 %	0 %	40 %	20 %	158341436
59	NC_009932	CAAAT	2	10	107793	107802	60 %	20 %	0 %	20 %	158341440
60	NC_009932	TCATA	2	10	109085	109094	40 %	40 %	0 %	20 %	158341442
61	NC_009932	GGCTG	2	10	110652	110661	0 %	20 %	60 %	20 %	158341444
62	NC_009932	AATCA	2	10	110928	110937	60 %	20 %	0 %	20 %	158341444
63	NC_009932	CAAAG	2	10	118007	118016	60 %	0 %	20 %	20 %	158341452
64	NC_009932	CCTAT	2	10	119616	119625	20 %	40 %	0 %	40 %	158341458
65	NC_009932	ACCTA	2	10	120773	120782	40 %	20 %	0 %	40 %	158341459
66	NC_009932	CAATC	2	10	121693	121702	40 %	20 %	0 %	40 %	158341459
67	NC_009932	GCAGA	2	10	122675	122684	40 %	0 %	40 %	20 %	158341462
68	NC_009932	CCTGA	2	10	124071	124080	20 %	20 %	20 %	40 %	158341464
69	NC_009932	AGTTC	2	10	128611	128620	20 %	40 %	20 %	20 %	158341473
70	NC_009932	GAACT	2	10	129400	129409	40 %	20 %	20 %	20 %	158341475
71	NC_009932	CCAAT	2	10	130310	130319	40 %	20 %	0 %	40 %	158341477
72	NC_009932	TGCTG	2	10	130827	130836	0 %	40 %	40 %	20 %	158341478
73	NC_009932	TGTGA	2	10	130859	130868	20 %	40 %	40 %	0 %	158341478
74	NC_009932	CAGCC	2	10	134727	134736	20 %	0 %	20 %	60 %	158341487
75	NC_009932	CAATA	2	10	135636	135645	60 %	20 %	0 %	20 %	158341488
76	NC_009932	CCCTG	2	10	138142	138151	0 %	20 %	20 %	60 %	158341491
77	NC_009932	AGTCA	2	10	141471	141480	40 %	20 %	20 %	20 %	158341492
78	NC_009932	GACCG	2	10	143159	143168	20 %	0 %	40 %	40 %	158341493
79	NC_009932	TCTGA	2	10	145208	145217	20 %	40 %	20 %	20 %	158341493
80	NC_009932	TAGCC	2	10	150791	150800	20 %	20 %	20 %	40 %	158341502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.