MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009931	ATGA	2	8	273	280	50 %	25 %	25 %	0 %	158341328
2	NC_009931	TATC	2	8	742	749	25 %	50 %	0 %	25 %	158341141
3	NC_009931	CATT	2	8	1459	1466	25 %	50 %	0 %	25 %	158341141
4	NC_009931	TGGG	2	8	1514	1521	0 %	25 %	75 %	0 %	158341141
5	NC_009931	GCAA	2	8	1771	1778	50 %	0 %	25 %	25 %	158341141
6	NC_009931	TGTC	2	8	1837	1844	0 %	50 %	25 %	25 %	158341141
7	NC_009931	CAAG	2	8	1907	1914	50 %	0 %	25 %	25 %	158341141
8	NC_009931	TCAT	2	8	2816	2823	25 %	50 %	0 %	25 %	158341327
9	NC_009931	AATA	2	8	3431	3438	75 %	25 %	0 %	0 %	158341327
10	NC_009931	CATA	2	8	3699	3706	50 %	25 %	0 %	25 %	158341326
11	NC_009931	GACC	2	8	4402	4409	25 %	0 %	25 %	50 %	158341326
12	NC_009931	GCTT	2	8	4671	4678	0 %	50 %	25 %	25 %	158341326
13	NC_009931	TCCA	2	8	5195	5202	25 %	25 %	0 %	50 %	158341326
14	NC_009931	AATC	2	8	6423	6430	50 %	25 %	0 %	25 %	158341325
15	NC_009931	CTGG	2	8	6846	6853	0 %	25 %	50 %	25 %	158341325
16	NC_009931	TATC	2	8	8618	8625	25 %	50 %	0 %	25 %	158341324
17	NC_009931	CATT	2	8	9335	9342	25 %	50 %	0 %	25 %	158341324
18	NC_009931	TGGG	2	8	9390	9397	0 %	25 %	75 %	0 %	158341324
19	NC_009931	GCAA	2	8	9647	9654	50 %	0 %	25 %	25 %	158341324
20	NC_009931	TGTC	2	8	9713	9720	0 %	50 %	25 %	25 %	158341324
21	NC_009931	CAAG	2	8	9783	9790	50 %	0 %	25 %	25 %	158341324
22	NC_009931	AGCC	2	8	11682	11689	25 %	0 %	25 %	50 %	158341320
23	NC_009931	ACCC	2	8	11787	11794	25 %	0 %	0 %	75 %	158341320
24	NC_009931	TCTT	2	8	11990	11997	0 %	75 %	0 %	25 %	158341319
25	NC_009931	GATT	2	8	12122	12129	25 %	50 %	25 %	0 %	158341319
26	NC_009931	CCAC	2	8	12756	12763	25 %	0 %	0 %	75 %	158341318
27	NC_009931	CTGT	2	8	12990	12997	0 %	50 %	25 %	25 %	158341318
28	NC_009931	TGCC	2	8	13316	13323	0 %	25 %	25 %	50 %	158341318
29	NC_009931	CCAG	2	8	13352	13359	25 %	0 %	25 %	50 %	158341318
30	NC_009931	GATT	2	8	13845	13852	25 %	50 %	25 %	0 %	158341317
31	NC_009931	TTGC	2	8	14620	14627	0 %	50 %	25 %	25 %	158341315
32	NC_009931	TTGA	2	8	15028	15035	25 %	50 %	25 %	0 %	158341314
33	NC_009931	CAAT	2	8	15450	15457	50 %	25 %	0 %	25 %	158341313
34	NC_009931	GCTG	2	8	17924	17931	0 %	25 %	50 %	25 %	158341308
35	NC_009931	CTAT	2	8	18070	18077	25 %	50 %	0 %	25 %	158341307
36	NC_009931	ACCG	2	8	18240	18247	25 %	0 %	25 %	50 %	158341307
37	NC_009931	GGCG	2	8	18344	18351	0 %	0 %	75 %	25 %	158341307
38	NC_009931	TGGA	2	8	20137	20144	25 %	25 %	50 %	0 %	158341303
39	NC_009931	TGAT	2	8	20601	20608	25 %	50 %	25 %	0 %	158341302
40	NC_009931	CTTG	2	8	20836	20843	0 %	50 %	25 %	25 %	158341302
41	NC_009931	GTCG	2	8	22452	22459	0 %	25 %	50 %	25 %	158341297
42	NC_009931	TGGT	2	8	22780	22787	0 %	50 %	50 %	0 %	158341298
43	NC_009931	TTGT	2	8	23162	23169	0 %	75 %	25 %	0 %	158341296
44	NC_009931	GTCA	2	8	23317	23324	25 %	25 %	25 %	25 %	158341296
45	NC_009931	CCTT	2	8	23402	23409	0 %	50 %	0 %	50 %	158341296
46	NC_009931	GGAA	2	8	23493	23500	50 %	0 %	50 %	0 %	158341296
47	NC_009931	GGTT	2	8	23599	23606	0 %	50 %	50 %	0 %	158341296
48	NC_009931	CAAA	2	8	24071	24078	75 %	0 %	0 %	25 %	158341295
49	NC_009931	ATCT	2	8	24395	24402	25 %	50 %	0 %	25 %	158341295
50	NC_009931	CTAG	2	8	24922	24929	25 %	25 %	25 %	25 %	158341294
51	NC_009931	GAAA	2	8	26073	26080	75 %	0 %	25 %	0 %	158341293
52	NC_009931	AATT	2	8	26351	26358	50 %	50 %	0 %	0 %	158341293
53	NC_009931	ATGA	2	8	26695	26702	50 %	25 %	25 %	0 %	158341292
54	NC_009931	TGTT	2	8	26918	26925	0 %	75 %	25 %	0 %	158341292
55	NC_009931	TCGT	2	8	27204	27211	0 %	50 %	25 %	25 %	158341292
56	NC_009931	ATGG	2	8	28384	28391	25 %	25 %	50 %	0 %	158341292
57	NC_009931	CTTC	2	8	28445	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	158341292
58	NC_009931	AACT	2	8	28591	28598	50 %	25 %	0 %	25 %	158341292
59	NC_009931	TTGA	2	8	29074	29081	25 %	50 %	25 %	0 %	158341292
60	NC_009931	CCCT	2	8	29119	29126	0 %	25 %	0 %	75 %	158341292
61	NC_009931	AGCC	2	8	29191	29198	25 %	0 %	25 %	50 %	158341292
62	NC_009931	AGCC	2	8	29395	29402	25 %	0 %	25 %	50 %	158341292
63	NC_009931	AATA	2	8	29720	29727	75 %	25 %	0 %	0 %	158341292
64	NC_009931	CAAG	2	8	30517	30524	50 %	0 %	25 %	25 %	158341292
65	NC_009931	GGGT	2	8	32043	32050	0 %	25 %	75 %	0 %	158341289
66	NC_009931	CTTC	2	8	33530	33537	0 %	50 %	0 %	50 %	158341288
67	NC_009931	GGTT	2	8	33797	33804	0 %	50 %	50 %	0 %	158341288
68	NC_009931	GCCA	2	8	33883	33890	25 %	0 %	25 %	50 %	158341288
69	NC_009931	TGTC	2	8	34712	34719	0 %	50 %	25 %	25 %	158341288
70	NC_009931	GCAG	2	8	34760	34767	25 %	0 %	50 %	25 %	158341288
71	NC_009931	TGGT	2	8	35896	35903	0 %	50 %	50 %	0 %	158341286
72	NC_009931	TGCA	2	8	35930	35937	25 %	25 %	25 %	25 %	158341286
73	NC_009931	CGTC	2	8	35982	35989	0 %	25 %	25 %	50 %	158341286
74	NC_009931	TTAG	2	8	36525	36532	25 %	50 %	25 %	0 %	158341284
75	NC_009931	TGGT	2	8	36597	36604	0 %	50 %	50 %	0 %	158341284
76	NC_009931	TCAA	2	8	36817	36824	50 %	25 %	0 %	25 %	158341284
77	NC_009931	TTGA	2	8	36976	36983	25 %	50 %	25 %	0 %	158341285
78	NC_009931	GGGT	2	8	37344	37351	0 %	25 %	75 %	0 %	158341283
79	NC_009931	TCGC	2	8	37631	37638	0 %	25 %	25 %	50 %	158341283
80	NC_009931	GATG	2	8	37716	37723	25 %	25 %	50 %	0 %	158341283
81	NC_009931	GCTC	2	8	38073	38080	0 %	25 %	25 %	50 %	158341283
82	NC_009931	ATCG	2	8	38254	38261	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
83	NC_009931	AAAG	2	8	38585	38592	75 %	0 %	25 %	0 %	158341283
84	NC_009931	CGGT	2	8	39384	39391	0 %	25 %	50 %	25 %	158341283
85	NC_009931	ATCG	2	8	39772	39779	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
86	NC_009931	GATC	2	8	39870	39877	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
87	NC_009931	CCAG	2	8	40021	40028	25 %	0 %	25 %	50 %	158341283
88	NC_009931	CCAT	2	8	40681	40688	25 %	25 %	0 %	50 %	158341282
89	NC_009931	GCGG	2	8	41105	41112	0 %	0 %	75 %	25 %	158341282
90	NC_009931	TGAG	2	8	41275	41282	25 %	25 %	50 %	0 %	158341282
91	NC_009931	TGAT	2	8	44449	44456	25 %	50 %	25 %	0 %	158341276
92	NC_009931	GAAA	2	8	45579	45586	75 %	0 %	25 %	0 %	158341276
93	NC_009931	ACTC	2	8	45710	45717	25 %	25 %	0 %	50 %	158341276
94	NC_009931	TAAC	2	8	46940	46947	50 %	25 %	0 %	25 %	158341273
95	NC_009931	AATT	2	8	47361	47368	50 %	50 %	0 %	0 %	158341273
96	NC_009931	ACCA	2	8	47409	47416	50 %	0 %	0 %	50 %	158341273
97	NC_009931	ATAA	2	8	47761	47768	75 %	25 %	0 %	0 %	158341273
98	NC_009931	GCTG	2	8	48070	48077	0 %	25 %	50 %	25 %	158341273
99	NC_009931	AAAT	2	8	49041	49048	75 %	25 %	0 %	0 %	158341273
100	NC_009931	GTAA	2	8	49206	49213	50 %	25 %	25 %	0 %	158341273
101	NC_009931	TCCC	2	8	51065	51072	0 %	25 %	0 %	75 %	158341271
102	NC_009931	ATTG	2	8	51173	51180	25 %	50 %	25 %	0 %	158341271
103	NC_009931	CATA	2	8	52549	52556	50 %	25 %	0 %	25 %	158341270
104	NC_009931	GACC	2	8	53252	53259	25 %	0 %	25 %	50 %	158341270
105	NC_009931	GCTT	2	8	53521	53528	0 %	50 %	25 %	25 %	158341270
106	NC_009931	TCCA	2	8	54045	54052	25 %	25 %	0 %	50 %	158341270
107	NC_009931	CTTG	2	8	57613	57620	0 %	50 %	25 %	25 %	158341269
108	NC_009931	GACA	2	8	57683	57690	50 %	0 %	25 %	25 %	158341269
109	NC_009931	TTGC	2	8	57749	57756	0 %	50 %	25 %	25 %	158341269
110	NC_009931	CCCA	2	8	58006	58013	25 %	0 %	0 %	75 %	158341269
111	NC_009931	GAAT	2	8	58060	58067	50 %	25 %	25 %	0 %	158341269
112	NC_009931	CGTT	2	8	58464	58471	0 %	50 %	25 %	25 %	158341269
113	NC_009931	TTAC	2	8	59219	59226	25 %	50 %	0 %	25 %	158341267
114	NC_009931	ATCA	2	8	59794	59801	50 %	25 %	0 %	25 %	158341268
115	NC_009931	ACGC	2	8	61738	61745	25 %	0 %	25 %	50 %	158341263
116	NC_009931	GGAT	2	8	61843	61850	25 %	25 %	50 %	0 %	158341263
117	NC_009931	TCAA	2	8	61878	61885	50 %	25 %	0 %	25 %	158341263
118	NC_009931	CAAT	2	8	64578	64585	50 %	25 %	0 %	25 %	158341261
119	NC_009931	GGCA	2	8	64890	64897	25 %	0 %	50 %	25 %	158341261
120	NC_009931	GATC	2	8	65039	65046	25 %	25 %	25 %	25 %	158341261
121	NC_009931	TGGA	2	8	65711	65718	25 %	25 %	50 %	0 %	158341260
122	NC_009931	GTTT	2	8	66505	66512	0 %	75 %	25 %	0 %	158341260
123	NC_009931	GCTC	2	8	67138	67145	0 %	25 %	25 %	50 %	158341258
124	NC_009931	ACCT	2	8	67194	67201	25 %	25 %	0 %	50 %	158341258
125	NC_009931	TGGC	2	8	69371	69378	0 %	25 %	50 %	25 %	158341256
126	NC_009931	GACT	2	8	69763	69770	25 %	25 %	25 %	25 %	158341255
127	NC_009931	TGGC	2	8	70178	70185	0 %	25 %	50 %	25 %	158341255
128	NC_009931	ACCG	2	8	70394	70401	25 %	0 %	25 %	50 %	158341255
129	NC_009931	ATGT	2	8	70595	70602	25 %	50 %	25 %	0 %	158341255
130	NC_009931	GCTT	2	8	70735	70742	0 %	50 %	25 %	25 %	158341255
131	NC_009931	TCGT	2	8	70757	70764	0 %	50 %	25 %	25 %	158341255
132	NC_009931	CCTC	2	8	70976	70983	0 %	25 %	0 %	75 %	158341255
133	NC_009931	AACT	2	8	71562	71569	50 %	25 %	0 %	25 %	158341253
134	NC_009931	ATCC	2	8	72303	72310	25 %	25 %	0 %	50 %	158341251
135	NC_009931	TTCT	2	8	72865	72872	0 %	75 %	0 %	25 %	158341250
136	NC_009931	CTGT	2	8	73202	73209	0 %	50 %	25 %	25 %	158341249
137	NC_009931	ATCT	2	8	74199	74206	25 %	50 %	0 %	25 %	158341247
138	NC_009931	TCAG	2	8	74299	74306	25 %	25 %	25 %	25 %	158341247
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140	NC_009931	CAGC	2	8	74675	74682	25 %	0 %	25 %	50 %	158341247
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.