MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	AATCA	2	10	7601	7610	60 %	20 %	0 %	20 %	158340654
2	NC_009929	ACTCA	2	10	7933	7942	40 %	20 %	0 %	40 %	158340655
3	NC_009929	TGACT	2	10	9881	9890	20 %	40 %	20 %	20 %	158340659
4	NC_009929	TGCAT	2	10	10811	10820	20 %	40 %	20 %	20 %	158340660
5	NC_009929	CCCAA	2	10	12606	12615	40 %	0 %	0 %	60 %	158340663
6	NC_009929	CAAAT	2	10	14437	14446	60 %	20 %	0 %	20 %	158340664
7	NC_009929	GAATG	2	10	14460	14469	40 %	20 %	40 %	0 %	158340664
8	NC_009929	GCCGT	2	10	16409	16418	0 %	20 %	40 %	40 %	158340666
9	NC_009929	TTTTG	2	10	16733	16742	0 %	80 %	20 %	0 %	158340666
10	NC_009929	ACCTC	2	10	18537	18546	20 %	20 %	0 %	60 %	158340668
11	NC_009929	GCAGC	2	10	21544	21553	20 %	0 %	40 %	40 %	158340669
12	NC_009929	CTCAA	2	10	23566	23575	40 %	20 %	0 %	40 %	158340672
13	NC_009929	AATCA	2	10	24935	24944	60 %	20 %	0 %	20 %	158340673
14	NC_009929	ACGGG	2	10	28187	28196	20 %	0 %	60 %	20 %	158340679
15	NC_009929	TTGGC	2	10	31131	31140	0 %	40 %	40 %	20 %	158340680
16	NC_009929	CCTAT	2	10	32423	32432	20 %	40 %	0 %	40 %	158340682
17	NC_009929	CCCAG	2	10	33796	33805	20 %	0 %	20 %	60 %	158340683
18	NC_009929	CAGCA	2	10	34536	34545	40 %	0 %	20 %	40 %	158340684
19	NC_009929	GCTCT	2	10	34699	34708	0 %	40 %	20 %	40 %	158340684
20	NC_009929	TGTAC	2	10	39244	39253	20 %	40 %	20 %	20 %	158340689
21	NC_009929	TGGGT	2	10	40264	40273	0 %	40 %	60 %	0 %	158340690
22	NC_009929	GCAGG	2	10	43583	43592	20 %	0 %	60 %	20 %	158340692
23	NC_009929	ATGAG	2	10	44600	44609	40 %	20 %	40 %	0 %	158340694
24	NC_009929	GCAAG	2	10	50860	50869	40 %	0 %	40 %	20 %	158340699
25	NC_009929	TCTTG	2	10	51434	51443	0 %	60 %	20 %	20 %	158340698
26	NC_009929	GATCA	2	10	51711	51720	40 %	20 %	20 %	20 %	158340698
27	NC_009929	GACCT	2	10	52359	52368	20 %	20 %	20 %	40 %	158340698
28	NC_009929	TTGAG	2	10	52612	52621	20 %	40 %	40 %	0 %	158340698
29	NC_009929	CTTTC	2	10	53085	53094	0 %	60 %	0 %	40 %	158340698
30	NC_009929	GTGAC	2	10	53386	53395	20 %	20 %	40 %	20 %	158340698
31	NC_009929	TTCTT	2	10	54431	54440	0 %	80 %	0 %	20 %	158340698
32	NC_009929	AAGGG	2	10	56743	56752	40 %	0 %	60 %	0 %	158340704
33	NC_009929	GCTGG	2	10	57150	57159	0 %	20 %	60 %	20 %	158340705
34	NC_009929	TGGAC	2	10	58851	58860	20 %	20 %	40 %	20 %	158340709
35	NC_009929	ATTTA	2	10	59118	59127	40 %	60 %	0 %	0 %	158340709
36	NC_009929	CTGAA	2	10	62072	62081	40 %	20 %	20 %	20 %	158340713
37	NC_009929	AGAAT	2	10	62119	62128	60 %	20 %	20 %	0 %	158340713
38	NC_009929	CTAGT	2	10	63518	63527	20 %	40 %	20 %	20 %	158340713
39	NC_009929	GTCGA	2	10	63838	63847	20 %	20 %	40 %	20 %	158340713
40	NC_009929	ATTAA	2	10	65032	65041	60 %	40 %	0 %	0 %	158340714
41	NC_009929	TACGC	2	10	65046	65055	20 %	20 %	20 %	40 %	158340714
42	NC_009929	ACAAA	2	10	65607	65616	80 %	0 %	0 %	20 %	158340716
43	NC_009929	ATTAG	2	10	65757	65766	40 %	40 %	20 %	0 %	158340716
44	NC_009929	AAGCA	2	10	66811	66820	60 %	0 %	20 %	20 %	158340716
45	NC_009929	ATATT	2	10	69370	69379	40 %	60 %	0 %	0 %	158340718
46	NC_009929	CCTTT	2	10	71566	71575	0 %	60 %	0 %	40 %	158340720
47	NC_009929	TAATA	2	10	73771	73780	60 %	40 %	0 %	0 %	158340722
48	NC_009929	CTTTA	2	10	75084	75093	20 %	60 %	0 %	20 %	158340724
49	NC_009929	CAATT	2	10	75820	75829	40 %	40 %	0 %	20 %	158340725
50	NC_009929	CAATC	2	10	80163	80172	40 %	20 %	0 %	40 %	158340730
51	NC_009929	GTTGT	2	10	92610	92619	0 %	60 %	40 %	0 %	158340757
52	NC_009929	AGGGA	2	10	94150	94159	40 %	0 %	60 %	0 %	158340761
53	NC_009929	TGATG	2	10	96312	96321	20 %	40 %	40 %	0 %	158340765
54	NC_009929	AGAAC	2	10	96484	96493	60 %	0 %	20 %	20 %	158340766
55	NC_009929	CAGTT	2	10	97220	97229	20 %	40 %	20 %	20 %	158340767
56	NC_009929	ATACA	2	10	99380	99389	60 %	20 %	0 %	20 %	158340769
57	NC_009929	ATGCC	2	10	103072	103081	20 %	20 %	20 %	40 %	158340775
58	NC_009929	CCTCG	2	10	107445	107454	0 %	20 %	20 %	60 %	158340780
59	NC_009929	AGTCA	2	10	107673	107682	40 %	20 %	20 %	20 %	158340780
60	NC_009929	CGGCA	2	10	109246	109255	20 %	0 %	40 %	40 %	158340782
61	NC_009929	ACGGA	2	10	112892	112901	40 %	0 %	40 %	20 %	158340788
62	NC_009929	GGTGA	2	10	114411	114420	20 %	20 %	60 %	0 %	158340790
63	NC_009929	TCTAC	2	10	114504	114513	20 %	40 %	0 %	40 %	158340790
64	NC_009929	TGCTT	2	10	121778	121787	0 %	60 %	20 %	20 %	158340797
65	NC_009929	ACAGG	2	10	122651	122660	40 %	0 %	40 %	20 %	158340797
66	NC_009929	ATGTG	2	10	123345	123354	20 %	40 %	40 %	0 %	158340797
67	NC_009929	GTTTG	2	10	125841	125850	0 %	60 %	40 %	0 %	158340800
68	NC_009929	GTTTT	2	10	126158	126167	0 %	80 %	20 %	0 %	158340801
69	NC_009929	GTGAT	2	10	126332	126341	20 %	40 %	40 %	0 %	158340801
70	NC_009929	CCGAT	2	10	126734	126743	20 %	20 %	20 %	40 %	158340801
71	NC_009929	TTCGG	2	10	131392	131401	0 %	40 %	40 %	20 %	158340808
72	NC_009929	TCCAA	2	10	134897	134906	40 %	20 %	0 %	40 %	158340812
73	NC_009929	TCAGG	2	10	137052	137061	20 %	20 %	40 %	20 %	158340813
74	NC_009929	ATCAG	2	10	137318	137327	40 %	20 %	20 %	20 %	158340814
75	NC_009929	CTTGC	2	10	137472	137481	0 %	40 %	20 %	40 %	158340814
76	NC_009929	CAATC	2	10	138537	138546	40 %	20 %	0 %	40 %	158340815
77	NC_009929	CCTTG	2	10	138732	138741	0 %	40 %	20 %	40 %	158340815
78	NC_009929	TCATC	2	10	139325	139334	20 %	40 %	0 %	40 %	158340816
79	NC_009929	GCAAT	2	10	142717	142726	40 %	20 %	20 %	20 %	158340819
80	NC_009929	CCCTT	2	10	143925	143934	0 %	40 %	0 %	60 %	158340821
81	NC_009929	ATTGG	2	10	146451	146460	20 %	40 %	40 %	0 %	158340824
82	NC_009929	AAATT	2	10	146591	146600	60 %	40 %	0 %	0 %	158340824
83	NC_009929	AGATC	2	10	147392	147401	40 %	20 %	20 %	20 %	158340826
84	NC_009929	AACGG	2	10	147669	147678	40 %	0 %	40 %	20 %	158340826
85	NC_009929	GTTGG	2	10	148265	148274	0 %	40 %	60 %	0 %	158340826
86	NC_009929	CAATT	2	10	148497	148506	40 %	40 %	0 %	20 %	158340826
87	NC_009929	ATCCA	2	10	151945	151954	40 %	20 %	0 %	40 %	158340830
88	NC_009929	AGGTT	2	10	152132	152141	20 %	40 %	40 %	0 %	158340830
89	NC_009929	CAGAA	2	10	157174	157183	60 %	0 %	20 %	20 %	158340836
90	NC_009929	AATTT	2	10	157545	157554	40 %	60 %	0 %	0 %	158340837
91	NC_009929	ATCTC	2	10	158436	158445	20 %	40 %	0 %	40 %	158340838
92	NC_009929	CGCCA	2	10	161036	161045	20 %	0 %	20 %	60 %	158340839
93	NC_009929	AGAGA	2	10	161541	161550	60 %	0 %	40 %	0 %	158340839
94	NC_009929	TTGGA	2	10	162918	162927	20 %	40 %	40 %	0 %	158340839
95	NC_009929	TTGTC	2	10	164489	164498	0 %	60 %	20 %	20 %	158340840
96	NC_009929	TTCAT	2	10	164671	164680	20 %	60 %	0 %	20 %	158340841
97	NC_009929	TCAAC	2	10	165634	165643	40 %	20 %	0 %	40 %	158340841
98	NC_009929	CGATT	2	10	166306	166315	20 %	40 %	20 %	20 %	158340841
99	NC_009929	TCCAT	2	10	170017	170026	20 %	40 %	0 %	40 %	158340845
100	NC_009929	ACCCC	2	10	171256	171265	20 %	0 %	0 %	80 %	158340847
101	NC_009929	TCAAT	2	10	172251	172260	40 %	40 %	0 %	20 %	158340849
102	NC_009929	CCAAT	2	10	172570	172579	40 %	20 %	0 %	40 %	158340849
103	NC_009929	ATTGG	2	10	174823	174832	20 %	40 %	40 %	0 %	158340852
104	NC_009929	AGTCT	2	10	177918	177927	20 %	40 %	20 %	20 %	158340855
105	NC_009929	CACAG	2	10	185880	185889	40 %	0 %	20 %	40 %	158340866
106	NC_009929	GCAGA	2	10	188878	188887	40 %	0 %	40 %	20 %	158340869
107	NC_009929	TGAGT	2	10	188941	188950	20 %	40 %	40 %	0 %	158340869
108	NC_009929	CCACT	2	10	189024	189033	20 %	20 %	0 %	60 %	158340869
109	NC_009929	TGATA	2	10	191201	191210	40 %	40 %	20 %	0 %	158340875
110	NC_009929	TGCCT	2	10	192957	192966	0 %	40 %	20 %	40 %	158340876
111	NC_009929	ATACA	2	10	192989	192998	60 %	20 %	0 %	20 %	158340876
112	NC_009929	ATCAA	2	10	195044	195053	60 %	20 %	0 %	20 %	158340877
113	NC_009929	AGGCG	2	10	195163	195172	20 %	0 %	60 %	20 %	158340877
114	NC_009929	CCGTT	2	10	196112	196121	0 %	40 %	20 %	40 %	158340878
115	NC_009929	ATTCT	2	10	197644	197653	20 %	60 %	0 %	20 %	158340879
116	NC_009929	ATTGG	2	10	198446	198455	20 %	40 %	40 %	0 %	158340880
117	NC_009929	CGATT	2	10	199332	199341	20 %	40 %	20 %	20 %	158340881
118	NC_009929	TCAAC	2	10	200625	200634	40 %	20 %	0 %	40 %	158340882
119	NC_009929	GACCA	2	10	201071	201080	40 %	0 %	20 %	40 %	158340882
120	NC_009929	CCTCA	2	10	202545	202554	20 %	20 %	0 %	60 %	158340884
121	NC_009929	AAAAT	2	10	203187	203196	80 %	20 %	0 %	0 %	158340886
122	NC_009929	CAAGA	2	10	207782	207791	60 %	0 %	20 %	20 %	158340892
123	NC_009929	GCAAT	2	10	210014	210023	40 %	20 %	20 %	20 %	158340895
124	NC_009929	CAAAC	2	10	210664	210673	60 %	0 %	0 %	40 %	158340895
125	NC_009929	TTGGG	2	10	211805	211814	0 %	40 %	60 %	0 %	158340895
126	NC_009929	AGTGA	2	10	212149	212158	40 %	20 %	40 %	0 %	158340895
127	NC_009929	ACCCG	2	10	215739	215748	20 %	0 %	20 %	60 %	158340900
128	NC_009929	TCAAC	2	10	216641	216650	40 %	20 %	0 %	40 %	158340901
129	NC_009929	GCAGA	2	10	218287	218296	40 %	0 %	40 %	20 %	158340902
130	NC_009929	GGCTG	2	10	220492	220501	0 %	20 %	60 %	20 %	158340905
131	NC_009929	GCTTT	2	10	222738	222747	0 %	60 %	20 %	20 %	158340910
132	NC_009929	TGGAA	2	10	223747	223756	40 %	20 %	40 %	0 %	158340911
133	NC_009929	AATCA	2	10	225744	225753	60 %	20 %	0 %	20 %	158340914

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.