MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 2255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	ACG	2	6	594	599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340644
2	NC_009929	TTG	2	6	702	707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340644
3	NC_009929	GAA	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340644
4	NC_009929	GAA	2	6	743	748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340644
5	NC_009929	TAA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340644
6	NC_009929	GCG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340645
7	NC_009929	TCT	3	9	1023	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340645
8	NC_009929	GCT	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340645
9	NC_009929	TGA	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340646
10	NC_009929	GTT	2	6	1372	1377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340646
11	NC_009929	TCG	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340646
12	NC_009929	TGG	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340646
13	NC_009929	CGC	2	6	1529	1534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340646
14	NC_009929	GCT	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340646
15	NC_009929	GAA	2	6	1793	1798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340646
16	NC_009929	TCC	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340646
17	NC_009929	TGC	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340646
18	NC_009929	CAA	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340646
19	NC_009929	CTT	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340646
20	NC_009929	GAT	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340646
21	NC_009929	CAG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340646
22	NC_009929	GCA	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340646
23	NC_009929	TCA	2	6	2769	2774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340646
24	NC_009929	TGG	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340646
25	NC_009929	CCG	2	6	2899	2904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340646
26	NC_009929	GTT	2	6	3018	3023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340646
27	NC_009929	TGC	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340646
28	NC_009929	CTT	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340646
29	NC_009929	GCA	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340646
30	NC_009929	TGC	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340646
31	NC_009929	GAA	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340646
32	NC_009929	TCC	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340647
33	NC_009929	GAA	2	6	3479	3484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340647
34	NC_009929	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340648
35	NC_009929	ATG	3	9	3790	3798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340648
36	NC_009929	TCC	2	6	3802	3807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340648
37	NC_009929	ACA	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340649
38	NC_009929	GCT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340649
39	NC_009929	AGA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340649
40	NC_009929	AAG	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340649
41	NC_009929	AGA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340649
42	NC_009929	AGA	2	6	4383	4388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340649
43	NC_009929	AGC	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340649
44	NC_009929	GAA	2	6	4444	4449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340649
45	NC_009929	GAT	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340649
46	NC_009929	GAT	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340649
47	NC_009929	GCC	2	6	4577	4582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340649
48	NC_009929	AAT	2	6	4601	4606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340649
49	NC_009929	CAA	2	6	4674	4679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340649
50	NC_009929	CAT	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340650
51	NC_009929	ATG	2	6	4779	4784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340650
52	NC_009929	AGT	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340650
53	NC_009929	GCC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340650
54	NC_009929	ATC	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340650
55	NC_009929	GAA	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340650
56	NC_009929	CTC	2	6	5038	5043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340650
57	NC_009929	TCT	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340651
58	NC_009929	AAT	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340651
59	NC_009929	CAA	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340651
60	NC_009929	TGC	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340651
61	NC_009929	TGT	2	6	6005	6010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340651
62	NC_009929	CTG	2	6	6017	6022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340651
63	NC_009929	GTT	2	6	6076	6081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340651
64	NC_009929	CAC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340651
65	NC_009929	CTA	2	6	6399	6404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340652
66	NC_009929	GCA	2	6	6412	6417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340652
67	NC_009929	GCT	3	9	6455	6463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340652
68	NC_009929	CTA	2	6	6736	6741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340653
69	NC_009929	ACT	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340654
70	NC_009929	AAC	2	6	7206	7211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340654
71	NC_009929	ACT	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340654
72	NC_009929	GAT	2	6	7283	7288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340654
73	NC_009929	TTG	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340654
74	NC_009929	ATG	2	6	7401	7406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340654
75	NC_009929	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340654
76	NC_009929	CAT	2	6	7583	7588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340654
77	NC_009929	CAG	3	9	7651	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340654
78	NC_009929	CAT	2	6	7676	7681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340654
79	NC_009929	TCG	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340654
80	NC_009929	TCA	3	9	7719	7727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340654
81	NC_009929	TGC	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340654
82	NC_009929	ATT	2	6	7760	7765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340654
83	NC_009929	CTC	2	6	8150	8155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340655
84	NC_009929	TTC	2	6	8220	8225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340655
85	NC_009929	CGC	2	6	8250	8255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340655
86	NC_009929	TCC	2	6	8378	8383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340655
87	NC_009929	CTC	2	6	8387	8392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340655
88	NC_009929	CTA	2	6	8454	8459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340655
89	NC_009929	GAT	2	6	8501	8506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340655
90	NC_009929	GAG	2	6	8617	8622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340656
91	NC_009929	CAC	2	6	8659	8664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340656
92	NC_009929	TTC	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340656
93	NC_009929	CTT	2	6	8776	8781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340656
94	NC_009929	CAA	2	6	9021	9026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340657
95	NC_009929	TCT	2	6	9053	9058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340657
96	NC_009929	AAC	2	6	9104	9109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340657
97	NC_009929	TCA	2	6	9208	9213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340658
98	NC_009929	CTT	2	6	9257	9262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340658
99	NC_009929	CTG	2	6	9288	9293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340658
100	NC_009929	TCT	2	6	9349	9354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340658
101	NC_009929	ATC	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340658
102	NC_009929	GCT	2	6	9392	9397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340658
103	NC_009929	TAG	2	6	9405	9410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340658
104	NC_009929	GAT	2	6	9488	9493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340659
105	NC_009929	CTT	2	6	9902	9907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340659
106	NC_009929	AAT	2	6	9998	10003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340659
107	NC_009929	TGT	2	6	10091	10096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340659
108	NC_009929	CTT	2	6	10190	10195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340659
109	NC_009929	TTG	2	6	10230	10235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340659
110	NC_009929	GTT	2	6	10254	10259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340659
111	NC_009929	GCA	2	6	10446	10451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340659
112	NC_009929	TGT	2	6	10721	10726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340660
113	NC_009929	GAA	2	6	10746	10751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340660
114	NC_009929	TTA	2	6	11315	11320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340661
115	NC_009929	GGA	2	6	11351	11356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340661
116	NC_009929	CTA	2	6	11373	11378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340661
117	NC_009929	TTC	2	6	11530	11535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340661
118	NC_009929	ATG	2	6	11538	11543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340661
119	NC_009929	ATT	2	6	11558	11563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340661
120	NC_009929	TAA	2	6	11623	11628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340662
121	NC_009929	ATT	2	6	11861	11866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340662
122	NC_009929	TAT	2	6	12029	12034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340662
123	NC_009929	ATC	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340662
124	NC_009929	GCT	2	6	12055	12060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340662
125	NC_009929	TCT	2	6	12132	12137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340662
126	NC_009929	AGA	2	6	12383	12388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340663
127	NC_009929	ATT	2	6	12424	12429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340663
128	NC_009929	TTC	2	6	12437	12442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340663
129	NC_009929	CCA	2	6	12460	12465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340663
130	NC_009929	TGC	2	6	12470	12475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340663
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133	NC_009929	TGG	2	6	12776	12781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340663
134	NC_009929	GTG	2	6	12824	12829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340663
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