MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 3474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009927	TCA	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339872
2	NC_009927	AAC	2	6	176	181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339872
3	NC_009927	TCA	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339872
4	NC_009927	ATT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339872
5	NC_009927	CAA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339872
6	NC_009927	ACG	2	6	597	602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339872
7	NC_009927	CAG	2	6	642	647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339872
8	NC_009927	ACG	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339872
9	NC_009927	CAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339872
10	NC_009927	AAT	2	6	1128	1133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339872
11	NC_009927	ATT	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339873
12	NC_009927	ATG	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339873
13	NC_009927	CAT	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339873
14	NC_009927	CAA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339873
15	NC_009927	AGG	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339874
16	NC_009927	GGA	2	6	2173	2178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339874
17	NC_009927	TGT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339874
18	NC_009927	GGC	2	6	2241	2246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339874
19	NC_009927	GCT	3	9	2293	2301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
20	NC_009927	GCA	2	6	2340	2345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339874
21	NC_009927	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339874
22	NC_009927	CCA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339874
23	NC_009927	GAC	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339874
24	NC_009927	TGC	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
25	NC_009927	CTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
26	NC_009927	TTC	2	6	2892	2897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339874
27	NC_009927	TGT	2	6	2947	2952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339874
28	NC_009927	TCG	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
29	NC_009927	CGG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339874
30	NC_009927	CCT	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339874
31	NC_009927	GAT	2	6	3146	3151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339874
32	NC_009927	GCA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339874
33	NC_009927	GGC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339874
34	NC_009927	TAA	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339875
35	NC_009927	GAT	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
36	NC_009927	AAC	2	6	4372	4377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339876
37	NC_009927	CAG	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339876
38	NC_009927	TGG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339876
39	NC_009927	CGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339876
40	NC_009927	GGC	2	6	4694	4699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339876
41	NC_009927	TGA	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
42	NC_009927	ATG	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
43	NC_009927	ACA	2	6	5123	5128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339876
44	NC_009927	TGA	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
45	NC_009927	ATT	2	6	5511	5516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339878
46	NC_009927	GTC	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339878
47	NC_009927	ACT	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339878
48	NC_009927	GCC	2	6	5800	5805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339878
49	NC_009927	CTG	3	9	5964	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339878
50	NC_009927	TAA	2	6	5982	5987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339878
51	NC_009927	GAC	2	6	6002	6007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339878
52	NC_009927	TCG	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339878
53	NC_009927	CAG	2	6	6098	6103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339878
54	NC_009927	GAT	2	6	6140	6145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339878
55	NC_009927	CAC	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339878
56	NC_009927	CAG	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339878
57	NC_009927	TTC	2	6	6378	6383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339878
58	NC_009927	ATC	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339878
59	NC_009927	ACT	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339878
60	NC_009927	CCA	2	6	6742	6747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339878
61	NC_009927	TCC	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339878
62	NC_009927	AGA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339878
63	NC_009927	CAA	2	6	6982	6987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339878
64	NC_009927	GAA	2	6	7003	7008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339878
65	NC_009927	TTG	2	6	7086	7091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339878
66	NC_009927	CTG	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339879
67	NC_009927	AAT	2	6	7261	7266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339879
68	NC_009927	ATC	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339880
69	NC_009927	ATC	2	6	7444	7449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339880
70	NC_009927	AGG	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339880
71	NC_009927	GTG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339880
72	NC_009927	CTG	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339880
73	NC_009927	GGA	2	6	7733	7738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339880
74	NC_009927	ATA	2	6	7748	7753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339880
75	NC_009927	CAA	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339880
76	NC_009927	GTT	2	6	7938	7943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339880
77	NC_009927	ATC	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339880
78	NC_009927	CAG	2	6	8352	8357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339882
79	NC_009927	GCC	2	6	8427	8432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339882
80	NC_009927	ACT	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339882
81	NC_009927	ATG	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339882
82	NC_009927	AAG	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339882
83	NC_009927	CAT	2	6	8657	8662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339882
84	NC_009927	TGG	2	6	8854	8859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339882
85	NC_009927	GGC	2	6	8912	8917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339882
86	NC_009927	CAA	2	6	8983	8988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339882
87	NC_009927	ACG	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339882
88	NC_009927	TCG	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339882
89	NC_009927	CAC	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339882
90	NC_009927	GAA	2	6	9400	9405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339882
91	NC_009927	GCA	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339882
92	NC_009927	CGC	2	6	9595	9600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339882
93	NC_009927	CAG	2	6	9734	9739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339882
94	NC_009927	TGA	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339882
95	NC_009927	CGA	2	6	9842	9847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339882
96	NC_009927	GCT	2	6	10038	10043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339883
97	NC_009927	AAC	2	6	10061	10066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339883
98	NC_009927	GTA	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339883
99	NC_009927	CAA	2	6	10206	10211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339883
100	NC_009927	TAT	2	6	10249	10254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339883
101	NC_009927	TCA	2	6	10279	10284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339883
102	NC_009927	TGA	2	6	10286	10291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339883
103	NC_009927	TCA	2	6	10375	10380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339883
104	NC_009927	GAT	2	6	10427	10432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339883
105	NC_009927	CAC	2	6	10461	10466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339883
106	NC_009927	CCA	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339883
107	NC_009927	AAG	2	6	10507	10512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339883
108	NC_009927	ATG	2	6	10699	10704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339884
109	NC_009927	GTT	2	6	11035	11040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339885
110	NC_009927	TGC	2	6	11082	11087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339885
111	NC_009927	GCA	2	6	11100	11105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339885
112	NC_009927	GGC	2	6	11174	11179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339885
113	NC_009927	TGT	2	6	11209	11214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339885
114	NC_009927	TCA	2	6	11239	11244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339885
115	NC_009927	ATC	2	6	11480	11485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339885
116	NC_009927	TGC	2	6	11507	11512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339885
117	NC_009927	GTT	2	6	11549	11554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339885
118	NC_009927	TTG	2	6	11633	11638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339885
119	NC_009927	CCA	2	6	11697	11702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339885
120	NC_009927	TTG	2	6	11721	11726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339885
121	NC_009927	GAG	2	6	11874	11879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339885
122	NC_009927	TCA	2	6	11988	11993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339885
123	NC_009927	TCA	2	6	12235	12240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339885
124	NC_009927	ACA	2	6	12704	12709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339886
125	NC_009927	GAT	2	6	12743	12748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339886
126	NC_009927	TGC	2	6	12956	12961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339886
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128	NC_009927	TCC	2	6	13060	13065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339886
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