MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 57966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009922	AGA	2	6	239313	239318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
4003	NC_009922	CTT	2	6	239340	239345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319258
4004	NC_009922	CTG	2	6	239393	239398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319258
4005	NC_009922	CTT	2	6	239456	239461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319258
4006	NC_009922	TTA	2	6	239467	239472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319258
4007	NC_009922	AG	3	6	239484	239489	50 %	0 %	50 %	0 %	158319258
4008	NC_009922	AGA	2	6	239541	239546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
4009	NC_009922	TGG	2	6	239598	239603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319258
4010	NC_009922	GGT	2	6	239683	239688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319258
4011	NC_009922	CAT	2	6	239705	239710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319258
4012	NC_009922	AGC	2	6	239745	239750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319258
4013	NC_009922	AG	3	6	239791	239796	50 %	0 %	50 %	0 %	158319258
4014	NC_009922	ACA	2	6	239815	239820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319258
4015	NC_009922	A	6	6	239848	239853	100 %	0 %	0 %	0 %	158319258
4016	NC_009922	ATT	2	6	240049	240054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319258
4017	NC_009922	AGGT	2	8	240212	240219	25 %	25 %	50 %	0 %	158319258
4018	NC_009922	AAG	2	6	240268	240273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
4019	NC_009922	AGA	2	6	240345	240350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
4020	NC_009922	TTA	2	6	240356	240361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319258
4021	NC_009922	ATG	2	6	240383	240388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
4022	NC_009922	GGA	2	6	240411	240416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319258
4023	NC_009922	GAT	2	6	240418	240423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
4024	NC_009922	GGC	2	6	240462	240467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319258
4025	NC_009922	TGT	2	6	240489	240494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319258
4026	NC_009922	ATG	2	6	240545	240550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
4027	NC_009922	TAG	2	6	240689	240694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
4028	NC_009922	GAA	2	6	240712	240717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319258
4029	NC_009922	AAC	2	6	240772	240777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319258
4030	NC_009922	CTACA	2	10	240782	240791	40 %	20 %	0 %	40 %	158319258
4031	NC_009922	CAA	2	6	240888	240893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319258
4032	NC_009922	GCA	2	6	240977	240982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319258
4033	NC_009922	AGT	2	6	241005	241010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319258
4034	NC_009922	ATA	2	6	241118	241123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319258
4035	NC_009922	ATA	2	6	241185	241190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319259
4036	NC_009922	AGA	2	6	241342	241347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319259
4037	NC_009922	GA	3	6	241355	241360	50 %	0 %	50 %	0 %	158319259
4038	NC_009922	AGCG	2	8	241365	241372	25 %	0 %	50 %	25 %	158319259
4039	NC_009922	ATA	2	6	241383	241388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319259
4040	NC_009922	AAG	2	6	241404	241409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319259
4041	NC_009922	TAT	2	6	241412	241417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319259
4042	NC_009922	T	6	6	241424	241429	0 %	100 %	0 %	0 %	158319259
4043	NC_009922	CAA	2	6	241437	241442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319259
4044	NC_009922	CCT	2	6	241454	241459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319259
4045	NC_009922	TGT	2	6	241471	241476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319259
4046	NC_009922	A	6	6	241489	241494	100 %	0 %	0 %	0 %	158319259
4047	NC_009922	GAA	2	6	241497	241502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319259
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4049	NC_009922	AAG	2	6	241680	241685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319259
4050	NC_009922	TAA	2	6	241701	241706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319259
4051	NC_009922	AAAGAA	2	12	241730	241741	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	158319259
4052	NC_009922	GCT	2	6	241742	241747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319259
4053	NC_009922	GAA	2	6	241756	241761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319259
4054	NC_009922	TAT	2	6	241803	241808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319259
4055	NC_009922	TTTA	2	8	241845	241852	25 %	75 %	0 %	0 %	158319259
4056	NC_009922	TA	3	6	241877	241882	50 %	50 %	0 %	0 %	158319259
4057	NC_009922	AGG	2	6	241911	241916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319259
4058	NC_009922	GTTG	2	8	241967	241974	0 %	50 %	50 %	0 %	158319260
4059	NC_009922	GCT	2	6	241988	241993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319260
4060	NC_009922	AAG	2	6	242019	242024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319260
4061	NC_009922	AGA	2	6	242044	242049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319260
4062	NC_009922	TAGA	2	8	242181	242188	50 %	25 %	25 %	0 %	158319260
4063	NC_009922	AAG	3	9	242247	242255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319260
4064	NC_009922	A	6	6	242261	242266	100 %	0 %	0 %	0 %	158319260
4065	NC_009922	ACA	2	6	242299	242304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319260
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4068	NC_009922	ACT	2	6	242392	242397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319260
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4070	NC_009922	TAT	2	6	242418	242423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319260
4071	NC_009922	TAC	2	6	242453	242458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319260
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4073	NC_009922	A	8	8	242621	242628	100 %	0 %	0 %	0 %	158319261
4074	NC_009922	TAG	2	6	242659	242664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319261
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4082	NC_009922	ACCA	2	8	243003	243010	50 %	0 %	0 %	50 %	158319261
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4087	NC_009922	AC	3	6	243185	243190	50 %	0 %	0 %	50 %	158319261
4088	NC_009922	TA	3	6	243197	243202	50 %	50 %	0 %	0 %	158319261
4089	NC_009922	A	6	6	243208	243213	100 %	0 %	0 %	0 %	158319261
4090	NC_009922	ATAA	2	8	243228	243235	75 %	25 %	0 %	0 %	158319261
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4093	NC_009922	TGA	2	6	243507	243512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319262
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4101	NC_009922	GAT	2	6	243973	243978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319262
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4103	NC_009922	TAATT	2	10	244035	244044	40 %	60 %	0 %	0 %	158319262
4104	NC_009922	GTA	2	6	244118	244123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319262
4105	NC_009922	AAC	2	6	244140	244145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319262
4106	NC_009922	TG	3	6	244232	244237	0 %	50 %	50 %	0 %	158319262
4107	NC_009922	TTG	2	6	244292	244297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319262
4108	NC_009922	A	6	6	244309	244314	100 %	0 %	0 %	0 %	158319262
4109	NC_009922	CAAA	2	8	244361	244368	75 %	0 %	0 %	25 %	158319262
4110	NC_009922	AT	3	6	244388	244393	50 %	50 %	0 %	0 %	158319262
4111	NC_009922	GAA	2	6	244403	244408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319262
4112	NC_009922	A	6	6	244436	244441	100 %	0 %	0 %	0 %	158319262
4113	NC_009922	AGA	2	6	244536	244541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319263
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4116	NC_009922	TGGA	2	8	244676	244683	25 %	25 %	50 %	0 %	158319263
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4121	NC_009922	TGA	2	6	244964	244969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319263
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4365	NC_009922	CCATAA	2	12	257328	257339	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158319275
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4495	NC_009922	AAG	2	6	265016	265021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319281
4496	NC_009922	GAT	2	6	265054	265059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319281
4497	NC_009922	T	6	6	265059	265064	0 %	100 %	0 %	0 %	158319281
4498	NC_009922	T	6	6	265169	265174	0 %	100 %	0 %	0 %	158319281
4499	NC_009922	GCTG	2	8	265183	265190	0 %	25 %	50 %	25 %	158319281
4500	NC_009922	TCA	2	6	265206	265211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319281

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