MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 36066

< Previous12...61626364656667686970717273Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_009922	CTT	2	6	3116439	3116444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321887
36002	NC_009922	CTA	2	6	3116473	3116478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321887
36003	NC_009922	TGG	2	6	3116728	3116733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158321888
36004	NC_009922	TCC	2	6	3116781	3116786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158321888
36005	NC_009922	CTA	2	6	3116891	3116896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321888
36006	NC_009922	GCT	2	6	3116908	3116913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158321888
36007	NC_009922	TCT	3	9	3117220	3117228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321888
36008	NC_009922	CTT	2	6	3117335	3117340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321888
36009	NC_009922	TCC	2	6	3117537	3117542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158321889
36010	NC_009922	TCA	2	6	3117964	3117969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321889
36011	NC_009922	TCT	2	6	3118056	3118061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321889
36012	NC_009922	TGC	3	9	3118106	3118114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158321889
36013	NC_009922	ATT	2	6	3118160	3118165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158321889
36014	NC_009922	AAG	2	6	3118183	3118188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158321889
36015	NC_009922	CTT	2	6	3118294	3118299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321889
36016	NC_009922	TGA	2	6	3118486	3118491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321889
36017	NC_009922	GAT	2	6	3118862	3118867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321889
36018	NC_009922	ACT	2	6	3118872	3118877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321889
36019	NC_009922	CCA	2	6	3119091	3119096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158321889
36020	NC_009922	GCA	2	6	3119113	3119118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158321889
36021	NC_009922	CAT	2	6	3119147	3119152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321889
36022	NC_009922	CTA	2	6	3119212	3119217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321889
36023	NC_009922	CAT	2	6	3119224	3119229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321889
36024	NC_009922	TCC	2	6	3119234	3119239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158321889
36025	NC_009922	GAT	2	6	3119484	3119489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321890
36026	NC_009922	CAA	2	6	3119555	3119560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158321890
36027	NC_009922	ATG	2	6	3119602	3119607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321890
36028	NC_009922	TCT	2	6	3119734	3119739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321890
36029	NC_009922	TGA	2	6	3119753	3119758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321890
36030	NC_009922	GAT	2	6	3119772	3119777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321890
36031	NC_009922	CTG	2	6	3119805	3119810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158321890
36032	NC_009922	TGA	2	6	3119825	3119830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321890
36033	NC_009922	AAT	2	6	3119913	3119918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321890
36034	NC_009922	TTC	2	6	3120042	3120047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321890
36035	NC_009922	CAA	2	6	3120146	3120151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158321890
36036	NC_009922	CAG	2	6	3120201	3120206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158321890
36037	NC_009922	ATA	2	6	3120424	3120429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321890
36038	NC_009922	TCA	2	6	3120628	3120633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321890
36039	NC_009922	AAT	2	6	3120657	3120662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321890
36040	NC_009922	TTC	2	6	3120677	3120682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321890
36041	NC_009922	ATC	2	6	3120819	3120824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321890
36042	NC_009922	AAC	2	6	3120946	3120951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158321891
36043	NC_009922	AAT	2	6	3121018	3121023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321891
36044	NC_009922	AGC	2	6	3121096	3121101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158321891
36045	NC_009922	TCT	2	6	3121118	3121123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321891
36046	NC_009922	AAT	2	6	3121240	3121245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321891
36047	NC_009922	ATC	2	6	3121285	3121290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321891
36048	NC_009922	TTG	2	6	3121294	3121299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158321891
36049	NC_009922	TCT	2	6	3121340	3121345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321891
36050	NC_009922	CTT	2	6	3121509	3121514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321891
36051	NC_009922	CCT	2	6	3121561	3121566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158321892
36052	NC_009922	TGT	2	6	3121599	3121604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158321892
36053	NC_009922	CTG	2	6	3121648	3121653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158321892
36054	NC_009922	ATT	2	6	3121701	3121706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158321892
36055	NC_009922	CAG	2	6	3121891	3121896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158321892
36056	NC_009922	AAT	3	9	3121907	3121915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321892
36057	NC_009922	CCA	2	6	3121944	3121949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158321892
36058	NC_009922	AAT	2	6	3122132	3122137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321892
36059	NC_009922	ATT	2	6	3122150	3122155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158321892
36060	NC_009922	TCT	2	6	3122452	3122457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321893
36061	NC_009922	ATT	2	6	3122597	3122602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158321894
36062	NC_009922	CAA	2	6	3122621	3122626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158321894
36063	NC_009922	CTT	2	6	3122640	3122645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321894
36064	NC_009922	AGT	2	6	3122727	3122732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321894
36065	NC_009922	TTG	2	6	3122924	3122929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158321895
36066	NC_009922	TCT	2	6	3122969	3122974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321895

< Previous12...61626364656667686970717273Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.