MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 57966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009922	TTG	2	6	97530	97535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319132
1502	NC_009922	ATC	2	6	97559	97564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319132
1503	NC_009922	AAC	2	6	97580	97585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319132
1504	NC_009922	AGA	2	6	97609	97614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319132
1505	NC_009922	ATTACG	2	12	97674	97685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319132
1506	NC_009922	AGGGT	2	10	97790	97799	20 %	20 %	60 %	0 %	158319132
1507	NC_009922	GCT	3	9	97877	97885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319132
1508	NC_009922	AGA	2	6	97897	97902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319132
1509	NC_009922	GAT	2	6	97951	97956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319132
1510	NC_009922	GAA	2	6	97970	97975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319132
1511	NC_009922	TA	3	6	97988	97993	50 %	50 %	0 %	0 %	158319132
1512	NC_009922	TTTATG	2	12	98009	98020	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158319132
1513	NC_009922	TGA	2	6	98058	98063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319132
1514	NC_009922	ATC	2	6	98072	98077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319132
1515	NC_009922	AGTA	2	8	98119	98126	50 %	25 %	25 %	0 %	158319132
1516	NC_009922	TAAA	2	8	98178	98185	75 %	25 %	0 %	0 %	158319132
1517	NC_009922	TGC	3	9	98192	98200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319132
1518	NC_009922	TAA	2	6	98204	98209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319132
1519	NC_009922	A	6	6	98797	98802	100 %	0 %	0 %	0 %	158319133
1520	NC_009922	AAG	2	6	98902	98907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319133
1521	NC_009922	AGGA	2	8	98935	98942	50 %	0 %	50 %	0 %	158319133
1522	NC_009922	AAG	2	6	98953	98958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319133
1523	NC_009922	T	7	7	98965	98971	0 %	100 %	0 %	0 %	158319133
1524	NC_009922	ATC	2	6	98979	98984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319133
1525	NC_009922	TCT	2	6	98989	98994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319133
1526	NC_009922	GA	3	6	99021	99026	50 %	0 %	50 %	0 %	158319133
1527	NC_009922	AGA	2	6	99089	99094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319133
1528	NC_009922	GAA	2	6	99114	99119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319133
1529	NC_009922	AAAG	2	8	99131	99138	75 %	0 %	25 %	0 %	158319133
1530	NC_009922	A	6	6	99191	99196	100 %	0 %	0 %	0 %	158319133
1531	NC_009922	A	6	6	99223	99228	100 %	0 %	0 %	0 %	158319133
1532	NC_009922	ATG	2	6	99271	99276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319133
1533	NC_009922	TGA	2	6	99329	99334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319133
1534	NC_009922	GAA	2	6	99389	99394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319133
1535	NC_009922	AGA	2	6	99506	99511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319133
1536	NC_009922	ACA	2	6	99661	99666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319133
1537	NC_009922	CAA	2	6	99737	99742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319133
1538	NC_009922	CACC	2	8	99747	99754	25 %	0 %	0 %	75 %	158319133
1539	NC_009922	A	6	6	99775	99780	100 %	0 %	0 %	0 %	158319133
1540	NC_009922	AGA	2	6	99951	99956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319133
1541	NC_009922	TA	3	6	100125	100130	50 %	50 %	0 %	0 %	158319134
1542	NC_009922	TTAA	2	8	100158	100165	50 %	50 %	0 %	0 %	158319134
1543	NC_009922	A	7	7	100164	100170	100 %	0 %	0 %	0 %	158319134
1544	NC_009922	A	6	6	100187	100192	100 %	0 %	0 %	0 %	158319134
1545	NC_009922	GTG	2	6	100216	100221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319134
1546	NC_009922	T	6	6	100378	100383	0 %	100 %	0 %	0 %	158319134
1547	NC_009922	GTA	2	6	100398	100403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319134
1548	NC_009922	AAT	2	6	100410	100415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319134
1549	NC_009922	TTA	2	6	100476	100481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319134
1550	NC_009922	A	6	6	100541	100546	100 %	0 %	0 %	0 %	158319134
1551	NC_009922	ATAAA	2	10	100600	100609	80 %	20 %	0 %	0 %	158319134
1552	NC_009922	TTA	2	6	100695	100700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319134
1553	NC_009922	AGG	2	6	100747	100752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319134
1554	NC_009922	ATA	2	6	100799	100804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319134
1555	NC_009922	T	6	6	100827	100832	0 %	100 %	0 %	0 %	158319135
1556	NC_009922	AGG	2	6	100879	100884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319135
1557	NC_009922	GTT	2	6	100941	100946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319135
1558	NC_009922	A	6	6	100976	100981	100 %	0 %	0 %	0 %	158319135
1559	NC_009922	TGT	2	6	100996	101001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319135
1560	NC_009922	CGGCAA	2	12	101005	101016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319135
1561	NC_009922	GATG	2	8	101032	101039	25 %	25 %	50 %	0 %	158319135
1562	NC_009922	AGG	2	6	101109	101114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319135
1563	NC_009922	T	7	7	101172	101178	0 %	100 %	0 %	0 %	158319135
1564	NC_009922	AGA	2	6	101278	101283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319135
1565	NC_009922	GGAA	2	8	101337	101344	50 %	0 %	50 %	0 %	158319135
1566	NC_009922	GAT	2	6	101369	101374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319135
1567	NC_009922	TGA	2	6	101392	101397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319135
1568	NC_009922	ATA	2	6	101610	101615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319135
1569	NC_009922	AT	3	6	101618	101623	50 %	50 %	0 %	0 %	158319135
1570	NC_009922	T	7	7	101666	101672	0 %	100 %	0 %	0 %	158319135
1571	NC_009922	AATT	2	8	101687	101694	50 %	50 %	0 %	0 %	158319135
1572	NC_009922	ATT	2	6	101846	101851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319136
1573	NC_009922	AGA	2	6	101861	101866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319136
1574	NC_009922	GCC	2	6	101941	101946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158319136
1575	NC_009922	AAG	2	6	101990	101995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319136
1576	NC_009922	T	7	7	102031	102037	0 %	100 %	0 %	0 %	158319136
1577	NC_009922	AAAG	2	8	102052	102059	75 %	0 %	25 %	0 %	158319136
1578	NC_009922	CCA	2	6	102179	102184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319136
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1580	NC_009922	ATTCAA	2	12	102333	102344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158319136
1581	NC_009922	AGC	2	6	102368	102373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319136
1582	NC_009922	TCC	2	6	102407	102412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319136
1583	NC_009922	AAT	2	6	102427	102432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319136
1584	NC_009922	ATT	2	6	103126	103131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319137
1585	NC_009922	AGAA	2	8	103136	103143	75 %	0 %	25 %	0 %	158319137
1586	NC_009922	T	6	6	103149	103154	0 %	100 %	0 %	0 %	158319137
1587	NC_009922	CCG	2	6	103169	103174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158319137
1588	NC_009922	TTAC	2	8	103251	103258	25 %	50 %	0 %	25 %	158319137
1589	NC_009922	TGG	2	6	103264	103269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319137
1590	NC_009922	ATA	2	6	103281	103286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319137
1591	NC_009922	CAT	2	6	103306	103311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319137
1592	NC_009922	AAAT	2	8	103315	103322	75 %	25 %	0 %	0 %	158319137
1593	NC_009922	GAAGG	2	10	103457	103466	40 %	0 %	60 %	0 %	158319137
1594	NC_009922	AGA	2	6	103507	103512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319137
1595	NC_009922	GCA	2	6	103535	103540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319137
1596	NC_009922	GGAA	2	8	103564	103571	50 %	0 %	50 %	0 %	158319137
1597	NC_009922	CTAAAG	2	12	103598	103609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158319137
1598	NC_009922	GAG	2	6	103610	103615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319137
1599	NC_009922	ATT	2	6	103659	103664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319137
1600	NC_009922	AGA	2	6	103687	103692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319137
1601	NC_009922	A	6	6	103742	103747	100 %	0 %	0 %	0 %	158319137
1602	NC_009922	TTG	2	6	103761	103766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319137
1603	NC_009922	AAG	2	6	103799	103804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319137
1604	NC_009922	ATA	2	6	103824	103829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319137
1605	NC_009922	GA	3	6	103840	103845	50 %	0 %	50 %	0 %	158319137
1606	NC_009922	ATCC	2	8	103957	103964	25 %	25 %	0 %	50 %	158319137
1607	NC_009922	GAAG	2	8	103993	104000	50 %	0 %	50 %	0 %	158319137
1608	NC_009922	AAAT	2	8	104069	104076	75 %	25 %	0 %	0 %	158319138
1609	NC_009922	GGA	2	6	104153	104158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319138
1610	NC_009922	T	6	6	104196	104201	0 %	100 %	0 %	0 %	158319138
1611	NC_009922	A	6	6	104213	104218	100 %	0 %	0 %	0 %	158319138
1612	NC_009922	A	6	6	104234	104239	100 %	0 %	0 %	0 %	158319138
1613	NC_009922	AGA	2	6	104524	104529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319138
1614	NC_009922	CAT	2	6	104583	104588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319138
1615	NC_009922	AT	3	6	104587	104592	50 %	50 %	0 %	0 %	158319138
1616	NC_009922	TAA	2	6	104681	104686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319138
1617	NC_009922	ACC	2	6	104691	104696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319138
1618	NC_009922	ACAGA	2	10	104868	104877	60 %	0 %	20 %	20 %	158319139
1619	NC_009922	TCAT	2	8	105044	105051	25 %	50 %	0 %	25 %	158319139
1620	NC_009922	AGT	2	6	105057	105062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319139
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1622	NC_009922	GGT	2	6	105189	105194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319139
1623	NC_009922	GAAG	2	8	105517	105524	50 %	0 %	50 %	0 %	158319139
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1625	NC_009922	GCT	2	6	105605	105610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319139
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1872	NC_009922	ATG	2	6	117735	117740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319148
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1993	NC_009922	ATC	2	6	124779	124784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319155
1994	NC_009922	ATC	2	6	124839	124844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319155
1995	NC_009922	A	6	6	124878	124883	100 %	0 %	0 %	0 %	158319156
1996	NC_009922	ATT	2	6	124889	124894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319156
1997	NC_009922	TTG	2	6	124917	124922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319156
1998	NC_009922	TCC	2	6	124973	124978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319156
1999	NC_009922	GAA	2	6	124979	124984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319156
2000	NC_009922	AG	3	6	125061	125066	50 %	0 %	50 %	0 %	158319156

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