MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 57966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009922	AAAC	2	8	322225	322232	75 %	0 %	0 %	25 %	158319325
5502	NC_009922	GCT	2	6	322285	322290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319325
5503	NC_009922	A	6	6	322342	322347	100 %	0 %	0 %	0 %	158319325
5504	NC_009922	GAA	2	6	322351	322356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319325
5505	NC_009922	AAG	2	6	322372	322377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319325
5506	NC_009922	GAA	2	6	322378	322383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319325
5507	NC_009922	AGA	2	6	322389	322394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319325
5508	NC_009922	A	6	6	322399	322404	100 %	0 %	0 %	0 %	158319325
5509	NC_009922	A	6	6	322414	322419	100 %	0 %	0 %	0 %	158319325
5510	NC_009922	GGA	2	6	322531	322536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319325
5511	NC_009922	GAA	2	6	322599	322604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319325
5512	NC_009922	GCTAAG	2	12	322618	322629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158319325
5513	NC_009922	ATT	2	6	323123	323128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319326
5514	NC_009922	CAA	2	6	323222	323227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319326
5515	NC_009922	TCT	2	6	323350	323355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319326
5516	NC_009922	CTCTGT	2	12	323387	323398	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158319326
5517	NC_009922	CGAT	2	8	323429	323436	25 %	25 %	25 %	25 %	158319326
5518	NC_009922	GCA	2	6	323449	323454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319326
5519	NC_009922	TTG	2	6	323483	323488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319326
5520	NC_009922	CAT	2	6	323613	323618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319326
5521	NC_009922	CCA	2	6	323629	323634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319326
5522	NC_009922	GCA	2	6	323692	323697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319326
5523	NC_009922	ACC	2	6	323745	323750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319326
5524	NC_009922	ACT	2	6	323797	323802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319326
5525	NC_009922	ATA	2	6	323806	323811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319326
5526	NC_009922	AGG	2	6	323820	323825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319326
5527	NC_009922	TAA	2	6	323832	323837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319326
5528	NC_009922	ATA	2	6	323875	323880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319326
5529	NC_009922	ATA	2	6	323926	323931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319326
5530	NC_009922	TGT	2	6	323967	323972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319326
5531	NC_009922	TGT	2	6	324003	324008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319326
5532	NC_009922	CAG	2	6	324158	324163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319326
5533	NC_009922	CTA	2	6	324218	324223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319326
5534	NC_009922	ATA	2	6	324255	324260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319326
5535	NC_009922	CTA	2	6	324410	324415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319326
5536	NC_009922	AAG	2	6	324416	324421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319326
5537	NC_009922	GAT	2	6	324438	324443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319326
5538	NC_009922	ACA	2	6	324502	324507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319326
5539	NC_009922	GCTT	2	8	324535	324542	0 %	50 %	25 %	25 %	158319326
5540	NC_009922	GTT	2	6	324975	324980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319327
5541	NC_009922	A	6	6	325067	325072	100 %	0 %	0 %	0 %	158319327
5542	NC_009922	GATG	2	8	325126	325133	25 %	25 %	50 %	0 %	158319327
5543	NC_009922	TA	3	6	325142	325147	50 %	50 %	0 %	0 %	158319327
5544	NC_009922	AGG	2	6	325290	325295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319327
5545	NC_009922	GAA	2	6	325304	325309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319327
5546	NC_009922	AGA	2	6	325336	325341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319327
5547	NC_009922	TGA	3	9	325398	325406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319327
5548	NC_009922	TAT	2	6	325453	325458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319327
5549	NC_009922	GCT	2	6	325540	325545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319328
5550	NC_009922	TTG	2	6	325724	325729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319328
5551	NC_009922	GA	3	6	325781	325786	50 %	0 %	50 %	0 %	158319328
5552	NC_009922	A	6	6	325799	325804	100 %	0 %	0 %	0 %	158319328
5553	NC_009922	ATT	2	6	325828	325833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319328
5554	NC_009922	TGG	2	6	325866	325871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319328
5555	NC_009922	AGA	2	6	325911	325916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319328
5556	NC_009922	GAA	2	6	325924	325929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319328
5557	NC_009922	AAGG	2	8	325949	325956	50 %	0 %	50 %	0 %	158319328
5558	NC_009922	GCA	2	6	325993	325998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319328
5559	NC_009922	GGAG	2	8	326082	326089	25 %	0 %	75 %	0 %	158319328
5560	NC_009922	ATC	2	6	326116	326121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319328
5561	NC_009922	ATT	2	6	326152	326157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319328
5562	NC_009922	AGA	2	6	326208	326213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319328
5563	NC_009922	TTTGA	2	10	326269	326278	20 %	60 %	20 %	0 %	158319328
5564	NC_009922	AGCAGG	2	12	326286	326297	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158319328
5565	NC_009922	GAA	2	6	326314	326319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319328
5566	NC_009922	ATTG	2	8	326325	326332	25 %	50 %	25 %	0 %	158319328
5567	NC_009922	GCC	2	6	326370	326375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158319328
5568	NC_009922	AG	3	6	326387	326392	50 %	0 %	50 %	0 %	158319328
5569	NC_009922	TAA	2	6	326418	326423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319328
5570	NC_009922	CAA	2	6	326457	326462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319328
5571	NC_009922	TGG	2	6	326463	326468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319328
5572	NC_009922	TGC	2	6	326469	326474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319328
5573	NC_009922	A	7	7	326538	326544	100 %	0 %	0 %	0 %	158319328
5574	NC_009922	CAG	2	6	326672	326677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319328
5575	NC_009922	CAT	2	6	326727	326732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319328
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5577	NC_009922	TGG	2	6	326774	326779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319328
5578	NC_009922	GGAA	2	8	326810	326817	50 %	0 %	50 %	0 %	158319328
5579	NC_009922	CATT	2	8	326832	326839	25 %	50 %	0 %	25 %	158319328
5580	NC_009922	TGAAGG	2	12	326886	326897	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158319328
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5582	NC_009922	A	6	6	326936	326941	100 %	0 %	0 %	0 %	158319328
5583	NC_009922	AG	3	6	327013	327018	50 %	0 %	50 %	0 %	158319328
5584	NC_009922	TTG	2	6	327242	327247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319328
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5586	NC_009922	CGT	2	6	327423	327428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319329
5587	NC_009922	GCT	2	6	327450	327455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319329
5588	NC_009922	GCT	3	9	327543	327551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319329
5589	NC_009922	TGG	2	6	327600	327605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319329
5590	NC_009922	GCCA	2	8	327690	327697	25 %	0 %	25 %	50 %	158319329
5591	NC_009922	CTGC	2	8	327731	327738	0 %	25 %	25 %	50 %	158319329
5592	NC_009922	A	6	6	327807	327812	100 %	0 %	0 %	0 %	158319329
5593	NC_009922	CAG	2	6	327893	327898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319329
5594	NC_009922	TAGCGG	2	12	327908	327919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158319329
5595	NC_009922	GAAG	2	8	327999	328006	50 %	0 %	50 %	0 %	158319329
5596	NC_009922	ATC	2	6	328027	328032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319329
5597	NC_009922	TGG	2	6	328188	328193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319329
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5599	NC_009922	CCG	2	6	328295	328300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158319329
5600	NC_009922	AGA	2	6	328336	328341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
5601	NC_009922	GAAG	2	8	328344	328351	50 %	0 %	50 %	0 %	158319329
5602	NC_009922	CGG	2	6	328358	328363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319329
5603	NC_009922	AGA	3	9	328386	328394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
5604	NC_009922	GAA	2	6	328505	328510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
5605	NC_009922	GAA	2	6	328534	328539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
5606	NC_009922	TGC	2	6	328566	328571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319329
5607	NC_009922	CAG	2	6	328579	328584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319329
5608	NC_009922	GATGT	2	10	328753	328762	20 %	40 %	40 %	0 %	158319329
5609	NC_009922	AG	3	6	328853	328858	50 %	0 %	50 %	0 %	158319329
5610	NC_009922	AGA	3	9	328897	328905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
5611	NC_009922	AAG	2	6	328948	328953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
5612	NC_009922	ATT	2	6	329012	329017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319329
5613	NC_009922	GGA	2	6	329073	329078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319329
5614	NC_009922	TGA	2	6	329148	329153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319329
5615	NC_009922	TGAT	2	8	329180	329187	25 %	50 %	25 %	0 %	158319329
5616	NC_009922	ACC	2	6	329211	329216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319329
5617	NC_009922	A	6	6	329425	329430	100 %	0 %	0 %	0 %	158319329
5618	NC_009922	CTT	2	6	329452	329457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319329
5619	NC_009922	AGGC	2	8	329492	329499	25 %	0 %	50 %	25 %	158319329
5620	NC_009922	TCA	2	6	329519	329524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319329
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