MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus succinogenes 130Z chromosome

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009655	AATCAA	2	12	2493	2504	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977690
2	NC_009655	ATCTTT	2	12	9982	9993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977697
3	NC_009655	AAAAAG	2	12	16654	16665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152977706
4	NC_009655	ATCAAT	2	12	19711	19722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977709
5	NC_009655	CGCCTG	2	12	21175	21186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152977709
6	NC_009655	TCCCTC	2	12	39585	39596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152977718
7	NC_009655	AAGACA	2	12	42616	42627	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152977721
8	NC_009655	CCACTT	2	12	48881	48892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152977727
9	NC_009655	CTTTAT	2	12	59247	59258	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977732
10	NC_009655	GGAAAC	2	12	60830	60841	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152977734
11	NC_009655	GCAATT	2	12	61546	61557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977735
12	NC_009655	TGCCAT	2	12	64579	64590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152977739
13	NC_009655	TCCGCT	2	12	67457	67468	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152977740
14	NC_009655	ACTTTC	2	12	72586	72597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	152977744
15	NC_009655	ACGCTG	2	12	72673	72684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977744
16	NC_009655	GCTTCC	2	12	75022	75033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152977745
17	NC_009655	CACCCA	2	12	81698	81709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152977751
18	NC_009655	CCGTCA	2	12	90566	90577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152977760
19	NC_009655	GATGCG	2	12	90688	90699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152977760
20	NC_009655	ATTTTT	2	12	92060	92071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	152977761
21	NC_009655	CGTCAT	2	12	93615	93626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152977764
22	NC_009655	CGACCG	2	12	93629	93640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977764
23	NC_009655	GAACTG	2	12	98841	98852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152977769
24	NC_009655	ATTCCG	2	12	100489	100500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152977770
25	NC_009655	AAAATC	2	12	103211	103222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977772
26	NC_009655	GGCATT	2	12	103324	103335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977772
27	NC_009655	TACGGT	2	12	107071	107082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977775
28	NC_009655	TTTTCC	2	12	108054	108065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152977777
29	NC_009655	TTAACC	2	12	112572	112583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152977781
30	NC_009655	CAGCCC	2	12	115572	115583	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	152977782
31	NC_009655	AAACCA	2	12	122467	122478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152977789
32	NC_009655	CGGTTA	2	12	123232	123243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977789
33	NC_009655	CAATAA	2	12	125173	125184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977791
34	NC_009655	TTCCCA	2	12	126869	126880	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152977792
35	NC_009655	CCGCGC	2	12	129710	129721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152977795
36	NC_009655	CTTTGG	2	12	131634	131645	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152977797
37	NC_009655	GAAAGC	2	12	137410	137421	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152977801
38	NC_009655	CGGCAT	2	12	138924	138935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977801
39	NC_009655	CCATGA	2	12	151561	151572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977812
40	NC_009655	ACTAAA	2	12	153362	153373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977814
41	NC_009655	GTAAAA	2	12	153467	153478	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152977814
42	NC_009655	TTGCGG	2	12	156140	156151	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152977816
43	NC_009655	GATAAA	2	12	159063	159074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152977818
44	NC_009655	CCGCAA	2	12	159458	159469	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977818
45	NC_009655	CCGCAG	2	12	162320	162331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977821
46	NC_009655	TAACTG	2	12	166454	166465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977827
47	NC_009655	TATTCA	2	12	167209	167220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152977827
48	NC_009655	CACCAT	2	12	167375	167386	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152977827
49	NC_009655	TTCGGA	2	12	167934	167945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977828
50	NC_009655	CTTATT	2	12	168524	168535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977828
51	NC_009655	TTCGCC	2	12	168834	168845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152977828
52	NC_009655	GGCTGC	2	12	169735	169746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152977829
53	NC_009655	TGTCGG	2	12	172490	172501	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152977831
54	NC_009655	CCGATG	2	12	177300	177311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977835
55	NC_009655	TATCAA	2	12	178643	178654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977835
56	NC_009655	AAACCA	2	12	186332	186343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152977842
57	NC_009655	TTTTCA	2	12	190439	190450	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977846
58	NC_009655	GTTGCT	2	12	191803	191814	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152977848
59	NC_009655	GGTTAA	2	12	193517	193528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152977849
60	NC_009655	GCGGAA	2	12	193910	193921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152977850
61	NC_009655	ACCGAA	2	12	193958	193969	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152977850
62	NC_009655	TCAGCA	2	12	194764	194775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977851
63	NC_009655	CGGCAA	2	12	195065	195076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152977851
64	NC_009655	TTCCGG	2	12	196587	196598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977852
65	NC_009655	ATCGGT	2	12	198112	198123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977853
66	NC_009655	CATCGA	2	12	198663	198674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977853
67	NC_009655	TGTTGA	2	12	203361	203372	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152977856
68	NC_009655	AGTAAA	2	12	205409	205420	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152977858
69	NC_009655	GCTTTA	2	12	208404	208415	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152977861
70	NC_009655	GCGTCG	2	12	211606	211617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152977864
71	NC_009655	ATACCG	2	12	212065	212076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977864
72	NC_009655	TTTTCC	2	12	213334	213345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152977866
73	NC_009655	GGCGCC	2	12	215158	215169	0 %	0 %	50 %	50 %	152977868
74	NC_009655	TCGGTT	2	12	218045	218056	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152977869
75	NC_009655	TGGCAT	2	12	221434	221445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977871
76	NC_009655	TCGGCA	2	12	226811	226822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977877
77	NC_009655	CATTGT	2	12	231909	231920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152977881
78	NC_009655	CCATCG	2	12	235705	235716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152977885
79	NC_009655	GTTTAA	2	12	237152	237163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152977887
80	NC_009655	TTTTTC	2	12	238536	238547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152977889
81	NC_009655	AGGCGT	2	12	239026	239037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152977889
82	NC_009655	GTATGC	2	12	239149	239160	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977889
83	NC_009655	ATCCGC	2	12	241391	241402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152977891
84	NC_009655	GTCTTT	2	12	243345	243356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152977893
85	NC_009655	CGGACA	2	12	247439	247450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152977897
86	NC_009655	CCAAAC	2	12	248506	248517	50 %	0 %	0 %	50 %	152977898
87	NC_009655	GACCAA	2	12	250034	250045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152977899
88	NC_009655	ATTTTC	2	12	250430	250441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977899
89	NC_009655	CTTGCG	2	12	251186	251197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977900
90	NC_009655	AGCCCA	2	12	254121	254132	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977903
91	NC_009655	CGAACC	2	12	259174	259185	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977908
92	NC_009655	ACTTCT	2	12	260026	260037	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	152977909
93	NC_009655	GAACCG	2	12	260735	260746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152977910
94	NC_009655	CGGATA	2	12	261252	261263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152977911
95	NC_009655	GGATGC	2	12	264969	264980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152977914
96	NC_009655	AGGTAA	2	12	270047	270058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152977920
97	NC_009655	GCAGCC	2	12	274691	274702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977924
98	NC_009655	ACGGTT	2	12	274725	274736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977924
99	NC_009655	CAACCG	2	12	277232	277243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977927
100	NC_009655	TTCGTC	2	12	278780	278791	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152977929
101	NC_009655	AAATCC	2	12	285679	285690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152977938
102	NC_009655	TACGGC	2	12	286004	286015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977938
103	NC_009655	AGCAAT	2	12	291910	291921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152977944
104	NC_009655	AAACTT	2	12	293189	293200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977944
105	NC_009655	TGCGCT	2	12	295184	295195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977946
106	NC_009655	AATCTG	2	12	303840	303851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977954
107	NC_009655	GGCACC	2	12	312975	312986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977962
108	NC_009655	CATTAA	2	12	313056	313067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977962
109	NC_009655	CAACAG	2	12	315808	315819	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152977964
110	NC_009655	AACGCT	2	12	316104	316115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977964
111	NC_009655	GTTCTT	2	12	316888	316899	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152977964
112	NC_009655	CAGCGG	2	12	330598	330609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152977974
113	NC_009655	ATGGCG	2	12	331507	331518	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152977975
114	NC_009655	TTCCGG	2	12	331917	331928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977975
115	NC_009655	GGTTCC	2	12	332254	332265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977975
116	NC_009655	TTCCAC	2	12	332647	332658	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152977976
117	NC_009655	GCAACC	2	12	336970	336981	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977982
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122	NC_009655	TGCAAT	2	12	351176	351187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977996
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224	NC_009655	TTAGCA	2	12	647278	647289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152978267
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226	NC_009655	CCTGGA	2	12	650466	650477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152978269
227	NC_009655	TACCTG	2	12	656912	656923	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152978272
228	NC_009655	TAAAGC	2	12	660666	660677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152978275
229	NC_009655	TGTTAG	2	12	662535	662546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152978277
230	NC_009655	TGGCAT	2	12	665846	665857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152978280
231	NC_009655	GGTATT	2	12	680066	680077	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152978298
232	NC_009655	CTGTAC	2	12	684191	684202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152978303
233	NC_009655	CGTCGG	2	12	688871	688882	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152978307
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336	NC_009655	TGTACC	2	12	965725	965736	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152978574
337	NC_009655	ACCGCC	2	12	970685	970696	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	152978579
338	NC_009655	TCACGC	2	12	971977	971988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152978581
339	NC_009655	AACGTA	2	12	977242	977253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152978585
340	NC_009655	GCTGGC	2	12	977285	977296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152978585
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448	NC_009655	CCAATA	2	12	1291130	1291141	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152978829
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451	NC_009655	ACGACT	2	12	1292815	1292826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152978829
452	NC_009655	CTATCG	2	12	1294337	1294348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152978829
453	NC_009655	CGGTAC	2	12	1294896	1294907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152978829
454	NC_009655	GATCTT	2	12	1295149	1295160	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152978829
455	NC_009655	TTGCGT	2	12	1295330	1295341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152978829
456	NC_009655	GAACGC	2	12	1295583	1295594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152978829
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463	NC_009655	CATTAC	2	12	1302561	1302572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152978829
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465	NC_009655	CATTAC	2	12	1304604	1304615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152978829
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