MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 11123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	TTTA	2	8	494	501	25 %	75 %	0 %	0 %	150387854
2	NC_009633	AATG	2	8	532	539	50 %	25 %	25 %	0 %	150387854
3	NC_009633	AATT	2	8	615	622	50 %	50 %	0 %	0 %	150387854
4	NC_009633	AAAG	2	8	716	723	75 %	0 %	25 %	0 %	150387854
5	NC_009633	ATGC	2	8	1301	1308	25 %	25 %	25 %	25 %	150387854
6	NC_009633	AGGA	2	8	1816	1823	50 %	0 %	50 %	0 %	150387855
7	NC_009633	AATT	2	8	2317	2324	50 %	50 %	0 %	0 %	150387855
8	NC_009633	ATTA	2	8	2349	2356	50 %	50 %	0 %	0 %	150387855
9	NC_009633	AAGG	2	8	2448	2455	50 %	0 %	50 %	0 %	150387855
10	NC_009633	GTTT	2	8	2631	2638	0 %	75 %	25 %	0 %	150387855
11	NC_009633	AAAC	2	8	3597	3604	75 %	0 %	0 %	25 %	150387857
12	NC_009633	TTAT	2	8	4533	4540	25 %	75 %	0 %	0 %	150387858
13	NC_009633	ATTT	2	8	5381	5388	25 %	75 %	0 %	0 %	150387859
14	NC_009633	TAAT	2	8	5535	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
15	NC_009633	GAAA	2	8	5569	5576	75 %	0 %	25 %	0 %	150387859
16	NC_009633	TAGA	2	8	6033	6040	50 %	25 %	25 %	0 %	150387859
17	NC_009633	CTTT	2	8	6192	6199	0 %	75 %	0 %	25 %	150387859
18	NC_009633	ATAG	2	8	7146	7153	50 %	25 %	25 %	0 %	150387860
19	NC_009633	TGAA	2	8	7354	7361	50 %	25 %	25 %	0 %	150387860
20	NC_009633	AGCA	2	8	7828	7835	50 %	0 %	25 %	25 %	150387860
21	NC_009633	GAAG	2	8	9428	9435	50 %	0 %	50 %	0 %	150387861
22	NC_009633	ATTG	2	8	9477	9484	25 %	50 %	25 %	0 %	150387861
23	NC_009633	ATGA	2	8	9691	9698	50 %	25 %	25 %	0 %	150387862
24	NC_009633	CAAA	2	8	9731	9738	75 %	0 %	0 %	25 %	150387862
25	NC_009633	TTAA	2	8	9985	9992	50 %	50 %	0 %	0 %	150387862
26	NC_009633	AGGG	2	8	10001	10008	25 %	0 %	75 %	0 %	150387862
27	NC_009633	GATG	2	8	10035	10042	25 %	25 %	50 %	0 %	150387862
28	NC_009633	TAAA	2	8	10288	10295	75 %	25 %	0 %	0 %	150387863
29	NC_009633	AATT	2	8	10672	10679	50 %	50 %	0 %	0 %	150387863
30	NC_009633	AATG	2	8	10811	10818	50 %	25 %	25 %	0 %	150387863
31	NC_009633	TATT	2	8	17206	17213	25 %	75 %	0 %	0 %	150387865
32	NC_009633	AAAC	2	8	17551	17558	75 %	0 %	0 %	25 %	150387866
33	NC_009633	CAAT	2	8	18556	18563	50 %	25 %	0 %	25 %	150387867
34	NC_009633	TTTA	2	8	19260	19267	25 %	75 %	0 %	0 %	150387868
35	NC_009633	ATGA	2	8	19366	19373	50 %	25 %	25 %	0 %	150387868
36	NC_009633	AAAT	2	8	19875	19882	75 %	25 %	0 %	0 %	150387868
37	NC_009633	TTTA	2	8	20201	20208	25 %	75 %	0 %	0 %	150387868
38	NC_009633	CTTT	2	8	20324	20331	0 %	75 %	0 %	25 %	150387868
39	NC_009633	TCCA	2	8	20411	20418	25 %	25 %	0 %	50 %	150387868
40	NC_009633	CAGC	2	8	20910	20917	25 %	0 %	25 %	50 %	150387869
41	NC_009633	TGAT	2	8	21412	21419	25 %	50 %	25 %	0 %	150387869
42	NC_009633	GTTT	2	8	21650	21657	0 %	75 %	25 %	0 %	150387869
43	NC_009633	TGAT	2	8	21718	21725	25 %	50 %	25 %	0 %	150387869
44	NC_009633	CACC	2	8	21735	21742	25 %	0 %	0 %	75 %	150387869
45	NC_009633	TGAT	2	8	28115	28122	25 %	50 %	25 %	0 %	150387870
46	NC_009633	GAAA	2	8	28329	28336	75 %	0 %	25 %	0 %	150387870
47	NC_009633	TTTA	2	8	28595	28602	25 %	75 %	0 %	0 %	150387870
48	NC_009633	TAAA	2	8	28749	28756	75 %	25 %	0 %	0 %	150387870
49	NC_009633	AGTA	2	8	29198	29205	50 %	25 %	25 %	0 %	150387871
50	NC_009633	ATTC	2	8	29447	29454	25 %	50 %	0 %	25 %	150387871
51	NC_009633	TTTA	2	8	29659	29666	25 %	75 %	0 %	0 %	150387871
52	NC_009633	ATTC	2	8	29690	29697	25 %	50 %	0 %	25 %	150387871
53	NC_009633	TTAA	2	8	30009	30016	50 %	50 %	0 %	0 %	150387871
54	NC_009633	AAAC	2	8	30093	30100	75 %	0 %	0 %	25 %	150387871
55	NC_009633	GTAT	2	8	30110	30117	25 %	50 %	25 %	0 %	150387871
56	NC_009633	AATC	2	8	30224	30231	50 %	25 %	0 %	25 %	150387871
57	NC_009633	ATAA	2	8	30315	30322	75 %	25 %	0 %	0 %	150387871
58	NC_009633	AGTT	2	8	30530	30537	25 %	50 %	25 %	0 %	150387872
59	NC_009633	AGCT	2	8	31278	31285	25 %	25 %	25 %	25 %	150387873
60	NC_009633	GATC	2	8	31471	31478	25 %	25 %	25 %	25 %	150387873
61	NC_009633	TTAA	2	8	31709	31716	50 %	50 %	0 %	0 %	150387873
62	NC_009633	TGGT	2	8	32391	32398	0 %	50 %	50 %	0 %	150387874
63	NC_009633	TTTC	2	8	32975	32982	0 %	75 %	0 %	25 %	150387875
64	NC_009633	GTTT	2	8	33217	33224	0 %	75 %	25 %	0 %	150387875
65	NC_009633	ATCA	2	8	34172	34179	50 %	25 %	0 %	25 %	150387875
66	NC_009633	GAAT	2	8	34551	34558	50 %	25 %	25 %	0 %	150387875
67	NC_009633	CATT	2	8	34569	34576	25 %	50 %	0 %	25 %	150387875
68	NC_009633	CATA	2	8	34593	34600	50 %	25 %	0 %	25 %	150387875
69	NC_009633	ATTT	2	8	34809	34816	25 %	75 %	0 %	0 %	150387875
70	NC_009633	TCAG	2	8	34885	34892	25 %	25 %	25 %	25 %	150387875
71	NC_009633	AAAG	2	8	36712	36719	75 %	0 %	25 %	0 %	150387877
72	NC_009633	GTTC	2	8	37657	37664	0 %	50 %	25 %	25 %	150387877
73	NC_009633	AATC	2	8	39281	39288	50 %	25 %	0 %	25 %	150387879
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78	NC_009633	TTAA	2	8	41252	41259	50 %	50 %	0 %	0 %	150387882
79	NC_009633	TTAT	2	8	43048	43055	25 %	75 %	0 %	0 %	150387884
80	NC_009633	TTGG	2	8	43096	43103	0 %	50 %	50 %	0 %	150387884
81	NC_009633	CAAG	2	8	43145	43152	50 %	0 %	25 %	25 %	150387884
82	NC_009633	TACA	2	8	43162	43169	50 %	25 %	0 %	25 %	150387884
83	NC_009633	TAAA	2	8	43192	43199	75 %	25 %	0 %	0 %	150387884
84	NC_009633	CTTT	2	8	43429	43436	0 %	75 %	0 %	25 %	150387884
85	NC_009633	ATGA	2	8	43944	43951	50 %	25 %	25 %	0 %	150387885
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88	NC_009633	AGGA	2	8	45263	45270	50 %	0 %	50 %	0 %	150387888
89	NC_009633	AGTT	2	8	45272	45279	25 %	50 %	25 %	0 %	150387888
90	NC_009633	AATG	2	8	45303	45310	50 %	25 %	25 %	0 %	150387888
91	NC_009633	ATTA	2	8	45666	45673	50 %	50 %	0 %	0 %	150387888
92	NC_009633	GATG	2	8	45885	45892	25 %	25 %	50 %	0 %	150387888
93	NC_009633	AAAG	2	8	46523	46530	75 %	0 %	25 %	0 %	150387889
94	NC_009633	AATT	2	8	46573	46580	50 %	50 %	0 %	0 %	150387889
95	NC_009633	GATT	2	8	46642	46649	25 %	50 %	25 %	0 %	150387889
96	NC_009633	CTAT	2	8	47361	47368	25 %	50 %	0 %	25 %	150387890
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98	NC_009633	ATAC	2	8	48081	48088	50 %	25 %	0 %	25 %	150387891
99	NC_009633	AATT	2	8	59655	59662	50 %	50 %	0 %	0 %	150387892
100	NC_009633	ACCT	2	8	60215	60222	25 %	25 %	0 %	50 %	150387892
101	NC_009633	AGGT	2	8	61045	61052	25 %	25 %	50 %	0 %	150387893
102	NC_009633	AGAT	2	8	61562	61569	50 %	25 %	25 %	0 %	150387893
103	NC_009633	AATA	2	8	61871	61878	75 %	25 %	0 %	0 %	150387893
104	NC_009633	TATG	2	8	62689	62696	25 %	50 %	25 %	0 %	150387894
105	NC_009633	TTGC	2	8	63254	63261	0 %	50 %	25 %	25 %	150387894
106	NC_009633	TCCA	2	8	63295	63302	25 %	25 %	0 %	50 %	150387894
107	NC_009633	GAGG	2	8	64845	64852	25 %	0 %	75 %	0 %	150387895
108	NC_009633	ATCA	2	8	67335	67342	50 %	25 %	0 %	25 %	150387897
109	NC_009633	TGAA	2	8	67666	67673	50 %	25 %	25 %	0 %	150387898
110	NC_009633	CTTG	2	8	68065	68072	0 %	50 %	25 %	25 %	150387899
111	NC_009633	TAAG	2	8	68860	68867	50 %	25 %	25 %	0 %	150387899
112	NC_009633	TAAT	2	8	69657	69664	50 %	50 %	0 %	0 %	150387900
113	NC_009633	ACAA	2	8	69964	69971	75 %	0 %	0 %	25 %	150387900
114	NC_009633	TGAA	2	8	70236	70243	50 %	25 %	25 %	0 %	150387900
115	NC_009633	TCAT	2	8	70447	70454	25 %	50 %	0 %	25 %	150387901
116	NC_009633	TTAA	2	8	70594	70601	50 %	50 %	0 %	0 %	150387901
117	NC_009633	TTTA	2	8	70617	70624	25 %	75 %	0 %	0 %	150387901
118	NC_009633	GAAG	2	8	70804	70811	50 %	0 %	50 %	0 %	150387901
119	NC_009633	TGAC	2	8	71296	71303	25 %	25 %	25 %	25 %	150387902
120	NC_009633	CTTC	2	8	71333	71340	0 %	50 %	0 %	50 %	150387902
121	NC_009633	AGAA	2	8	71443	71450	75 %	0 %	25 %	0 %	150387902
122	NC_009633	GGTT	2	8	71659	71666	0 %	50 %	50 %	0 %	150387903
123	NC_009633	CCAG	2	8	72904	72911	25 %	0 %	25 %	50 %	150387904
124	NC_009633	GTTC	2	8	73524	73531	0 %	50 %	25 %	25 %	150387905
125	NC_009633	CGAT	2	8	73632	73639	25 %	25 %	25 %	25 %	150387905
126	NC_009633	GATT	2	8	73693	73700	25 %	50 %	25 %	0 %	150387905
127	NC_009633	AATG	2	8	74086	74093	50 %	25 %	25 %	0 %	150387905
128	NC_009633	TATT	2	8	74903	74910	25 %	75 %	0 %	0 %	150387906
129	NC_009633	GCTA	2	8	74961	74968	25 %	25 %	25 %	25 %	150387906
130	NC_009633	GTAT	2	8	75227	75234	25 %	50 %	25 %	0 %	150387906
131	NC_009633	TTGG	2	8	75430	75437	0 %	50 %	50 %	0 %	150387906
132	NC_009633	TTGG	2	8	75471	75478	0 %	50 %	50 %	0 %	150387906
133	NC_009633	CATT	2	8	75920	75927	25 %	50 %	0 %	25 %	150387906
134	NC_009633	AATC	2	8	76228	76235	50 %	25 %	0 %	25 %	150387907
135	NC_009633	AGAA	2	8	77156	77163	75 %	0 %	25 %	0 %	150387909
136	NC_009633	TGGT	2	8	77638	77645	0 %	50 %	50 %	0 %	150387909
137	NC_009633	TTTG	2	8	77759	77766	0 %	75 %	25 %	0 %	150387909
138	NC_009633	AATT	2	8	77899	77906	50 %	50 %	0 %	0 %	150387910
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