MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009484	TCA	2	6	261506	261511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
6502	NC_009484	GTGCGC	2	12	261577	261588	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259245
6503	NC_009484	TGC	2	6	261590	261595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6504	NC_009484	ATC	2	6	261655	261660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
6505	NC_009484	CTA	2	6	261729	261734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
6506	NC_009484	CAT	2	6	261738	261743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
6507	NC_009484	GCG	2	6	261902	261907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
6508	NC_009484	CTG	2	6	261919	261924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6509	NC_009484	CGT	2	6	261933	261938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6510	NC_009484	CCA	2	6	261942	261947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259245
6511	NC_009484	GAC	2	6	261979	261984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6512	NC_009484	GC	3	6	261997	262002	0 %	0 %	50 %	50 %	148259245
6513	NC_009484	GCG	2	6	262099	262104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259246
6514	NC_009484	GCAGCG	2	12	262118	262129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148259246
6515	NC_009484	GGA	2	6	262139	262144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259246
6516	NC_009484	ATCG	2	8	262293	262300	25 %	25 %	25 %	25 %	148259246
6517	NC_009484	GCG	2	6	262339	262344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259246
6518	NC_009484	CCAG	2	8	262391	262398	25 %	0 %	25 %	50 %	148259246
6519	NC_009484	TCT	2	6	262463	262468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259246
6520	NC_009484	CGC	2	6	262525	262530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
6521	NC_009484	TGG	2	6	262554	262559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259247
6522	NC_009484	CCA	2	6	262599	262604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259247
6523	NC_009484	CGC	2	6	262618	262623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
6524	NC_009484	GGC	2	6	262641	262646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
6525	NC_009484	GC	3	6	262721	262726	0 %	0 %	50 %	50 %	148259247
6526	NC_009484	CGC	2	6	262795	262800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
6527	NC_009484	CGG	2	6	262809	262814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
6528	NC_009484	CGC	2	6	262870	262875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
6529	NC_009484	CCCG	2	8	262932	262939	0 %	0 %	25 %	75 %	148259247
6530	NC_009484	TCG	2	6	263022	263027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259247
6531	NC_009484	GCG	2	6	263129	263134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
6532	NC_009484	CTCGC	2	10	263153	263162	0 %	20 %	20 %	60 %	148259247
6533	NC_009484	GCC	2	6	263242	263247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
6534	NC_009484	GCC	2	6	263254	263259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
6535	NC_009484	GCC	2	6	263303	263308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259247
6536	NC_009484	GC	3	6	263378	263383	0 %	0 %	50 %	50 %	148259247
6537	NC_009484	GCG	2	6	263405	263410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259247
6538	NC_009484	GCGG	2	8	263428	263435	0 %	0 %	75 %	25 %	148259247
6539	NC_009484	C	6	6	263439	263444	0 %	0 %	0 %	100 %	148259247
6540	NC_009484	GCC	2	6	263493	263498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6541	NC_009484	GGA	2	6	263518	263523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259248
6542	NC_009484	GCA	2	6	263593	263598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6543	NC_009484	CGC	3	9	263633	263641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6544	NC_009484	CCG	2	6	263673	263678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6545	NC_009484	TCG	2	6	263710	263715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6546	NC_009484	CGA	2	6	263756	263761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6547	NC_009484	CCTG	2	8	263804	263811	0 %	25 %	25 %	50 %	148259248
6548	NC_009484	GCGG	2	8	263821	263828	0 %	0 %	75 %	25 %	148259248
6549	NC_009484	GTC	2	6	263832	263837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6550	NC_009484	GAT	2	6	263838	263843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
6551	NC_009484	GGT	2	6	263909	263914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259248
6552	NC_009484	CCG	2	6	264071	264076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6553	NC_009484	G	6	6	264110	264115	0 %	0 %	100 %	0 %	148259248
6554	NC_009484	CCA	2	6	264164	264169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259248
6555	NC_009484	TGGGC	2	10	264185	264194	0 %	20 %	60 %	20 %	148259248
6556	NC_009484	GTT	2	6	264286	264291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259248
6557	NC_009484	CTGC	2	8	264296	264303	0 %	25 %	25 %	50 %	148259248
6558	NC_009484	GGC	2	6	264333	264338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6559	NC_009484	GC	3	6	264346	264351	0 %	0 %	50 %	50 %	148259248
6560	NC_009484	GCGT	2	8	264355	264362	0 %	25 %	50 %	25 %	148259248
6561	NC_009484	CG	5	10	264377	264386	0 %	0 %	50 %	50 %	148259248
6562	NC_009484	CGG	2	6	264437	264442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6563	NC_009484	CCG	2	6	264488	264493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6564	NC_009484	CG	3	6	264578	264583	0 %	0 %	50 %	50 %	148259248
6565	NC_009484	GCG	2	6	264616	264621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6566	NC_009484	TGA	2	6	264659	264664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
6567	NC_009484	TCG	2	6	264721	264726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6568	NC_009484	GCC	2	6	264735	264740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6569	NC_009484	GCC	2	6	264831	264836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6570	NC_009484	GCATC	2	10	264851	264860	20 %	20 %	20 %	40 %	148259248
6571	NC_009484	ATCCG	2	10	264869	264878	20 %	20 %	20 %	40 %	148259248
6572	NC_009484	CGAT	2	8	264891	264898	25 %	25 %	25 %	25 %	148259248
6573	NC_009484	GGA	2	6	264920	264925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259248
6574	NC_009484	GAT	2	6	264930	264935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
6575	NC_009484	GAT	2	6	265005	265010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
6576	NC_009484	TCCA	2	8	265162	265169	25 %	25 %	0 %	50 %	148259248
6577	NC_009484	GAA	2	6	265188	265193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259248
6578	NC_009484	TGA	2	6	265246	265251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
6579	NC_009484	GAT	2	6	265377	265382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
6580	NC_009484	GGC	2	6	265453	265458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6581	NC_009484	GGGCG	2	10	265483	265492	0 %	0 %	80 %	20 %	148259248
6582	NC_009484	GC	3	6	265496	265501	0 %	0 %	50 %	50 %	148259248
6583	NC_009484	CG	3	6	265557	265562	0 %	0 %	50 %	50 %	148259248
6584	NC_009484	TCC	2	6	265639	265644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259248
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6587	NC_009484	GTC	2	6	265851	265856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6588	NC_009484	CGAG	2	8	265909	265916	25 %	0 %	50 %	25 %	148259248
6589	NC_009484	TCA	2	6	265939	265944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259248
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6591	NC_009484	TCC	2	6	266046	266051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259248
6592	NC_009484	CCG	2	6	266174	266179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259248
6593	NC_009484	GGT	2	6	266189	266194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259248
6594	NC_009484	CAG	3	9	266229	266237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6595	NC_009484	GC	3	6	266242	266247	0 %	0 %	50 %	50 %	148259248
6596	NC_009484	ATG	2	6	266292	266297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
6597	NC_009484	CGT	2	6	266390	266395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259248
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6601	NC_009484	GGC	2	6	266590	266595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6602	NC_009484	CCG	2	6	267103	267108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259249
6603	NC_009484	CCGCT	2	10	267181	267190	0 %	20 %	20 %	60 %	148259249
6604	NC_009484	GCC	2	6	267206	267211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259249
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6606	NC_009484	GCT	2	6	267264	267269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259249
6607	NC_009484	CGGAG	2	10	267319	267328	20 %	0 %	60 %	20 %	148259249
6608	NC_009484	AT	3	6	267357	267362	50 %	50 %	0 %	0 %	148259249
6609	NC_009484	TTC	2	6	267469	267474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259249
6610	NC_009484	CGGCA	2	10	267653	267662	20 %	0 %	40 %	40 %	148259249
6611	NC_009484	AAGG	2	8	267709	267716	50 %	0 %	50 %	0 %	148259249
6612	NC_009484	GC	3	6	267811	267816	0 %	0 %	50 %	50 %	148259249
6613	NC_009484	GAT	2	6	267904	267909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259249
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6615	NC_009484	CAG	2	6	268540	268545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259250
6616	NC_009484	GAT	2	6	268597	268602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259250
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6618	NC_009484	GCG	2	6	268655	268660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259250
6619	NC_009484	TGCC	2	8	268673	268680	0 %	25 %	25 %	50 %	148259250
6620	NC_009484	GA	3	6	268694	268699	50 %	0 %	50 %	0 %	148259250
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6622	NC_009484	CTT	2	6	268839	268844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259250
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6986	NC_009484	GCC	2	6	282840	282845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259266
6987	NC_009484	ACC	2	6	282847	282852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259266
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