MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY08

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009474	AGCA	2	8	1144	1151	50 %	0 %	25 %	25 %	148244134
2	NC_009474	GCG	2	6	1180	1185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244134
3	NC_009474	CG	3	6	1228	1233	0 %	0 %	50 %	50 %	148244134
4	NC_009474	CGG	2	6	1244	1249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244134
5	NC_009474	AGC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244134
6	NC_009474	CGT	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244134
7	NC_009474	CCGG	2	8	1335	1342	0 %	0 %	50 %	50 %	148244134
8	NC_009474	GCC	2	6	1356	1361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244134
9	NC_009474	TGCCC	2	10	1413	1422	0 %	20 %	20 %	60 %	148244134
10	NC_009474	GCC	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244134
11	NC_009474	CGCC	3	12	1448	1459	0 %	0 %	25 %	75 %	148244134
12	NC_009474	AGG	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244134
13	NC_009474	GGT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244134
14	NC_009474	TGA	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244134
15	NC_009474	ATC	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244134
16	NC_009474	GTG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244135
17	NC_009474	GATC	2	8	1856	1863	25 %	25 %	25 %	25 %	148244135
18	NC_009474	GAG	2	6	1905	1910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244135
19	NC_009474	GGT	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244135
20	NC_009474	AGC	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244135
21	NC_009474	TGA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244135
22	NC_009474	GCA	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244135
23	NC_009474	GCTG	2	8	2347	2354	0 %	25 %	50 %	25 %	148244135
24	NC_009474	CAT	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244136
25	NC_009474	GGT	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244136
26	NC_009474	TCG	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244136
27	NC_009474	GCTTG	2	10	3528	3537	0 %	40 %	40 %	20 %	148244136
28	NC_009474	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244136
29	NC_009474	GAG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244136
30	NC_009474	GGC	2	6	3666	3671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244136
31	NC_009474	GC	3	6	3755	3760	0 %	0 %	50 %	50 %	148244136
32	NC_009474	GGC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244137
33	NC_009474	CAG	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244137
34	NC_009474	AGC	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244137
35	NC_009474	CCT	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244137
36	NC_009474	C	6	6	4036	4041	0 %	0 %	0 %	100 %	148244137
37	NC_009474	TGG	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244137
38	NC_009474	GGC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244137
39	NC_009474	CGG	2	6	4322	4327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244138
40	NC_009474	GGC	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244138
41	NC_009474	TCG	3	9	4428	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244138
42	NC_009474	CCG	2	6	4447	4452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244138
43	NC_009474	TGT	2	6	4526	4531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244138
44	NC_009474	CAT	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244138
45	NC_009474	TGC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244138

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.