MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY04

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009470	GCC	2	6	1051	1056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244056
2	NC_009470	GCG	2	6	1083	1088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244056
3	NC_009470	GCC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244056
4	NC_009470	TCC	2	6	2529	2534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244057
5	NC_009470	CCT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244057
6	NC_009470	GAG	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244057
7	NC_009470	CCT	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244057
8	NC_009470	GGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244057
9	NC_009470	CCG	2	6	2638	2643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244057
10	NC_009470	AGG	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244057
11	NC_009470	TAT	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244058
12	NC_009470	GAA	2	6	3044	3049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244058
13	NC_009470	GTT	2	6	3136	3141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244058
14	NC_009470	ACA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244058
15	NC_009470	GTC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244058
16	NC_009470	TGG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244059
17	NC_009470	ACC	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244059
18	NC_009470	CAC	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244059
19	NC_009470	GCC	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244059
20	NC_009470	CGC	2	6	4566	4571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244059
21	NC_009470	CCG	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244059
22	NC_009470	GTC	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244059
23	NC_009470	CTT	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244059
24	NC_009470	CGT	3	9	4649	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244059
25	NC_009470	CCG	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
26	NC_009470	GCG	2	6	4742	4747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244060
27	NC_009470	GCC	2	6	4765	4770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
28	NC_009470	TGC	2	6	4785	4790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
29	NC_009470	GCC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
30	NC_009470	CGC	2	6	4924	4929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
31	NC_009470	CGC	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
32	NC_009470	CAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244060
33	NC_009470	CGC	2	6	5073	5078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
34	NC_009470	CAT	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244060
35	NC_009470	GCT	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
36	NC_009470	CGC	2	6	5307	5312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
37	NC_009470	TCC	2	6	5374	5379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244060
38	NC_009470	TCC	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244060
39	NC_009470	TCC	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244060
40	NC_009470	CCG	2	6	5576	5581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
41	NC_009470	GCT	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
42	NC_009470	GCC	2	6	5819	5824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
43	NC_009470	CGC	2	6	5828	5833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
44	NC_009470	GCC	2	6	5854	5859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
45	NC_009470	CGC	2	6	5987	5992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
46	NC_009470	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
47	NC_009470	TCA	2	6	6076	6081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244060
48	NC_009470	TGC	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
49	NC_009470	AAC	2	6	6359	6364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244060
50	NC_009470	CGC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
51	NC_009470	GGC	2	6	6678	6683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244061
52	NC_009470	ACG	2	6	6718	6723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244061
53	NC_009470	CGG	2	6	6734	6739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244061
54	NC_009470	CGC	2	6	6749	6754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244061
55	NC_009470	GCC	3	9	6791	6799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244061
56	NC_009470	GGT	2	6	6844	6849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244061
57	NC_009470	GCT	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244062
58	NC_009470	GAA	2	6	7185	7190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244062
59	NC_009470	ATC	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244062
60	NC_009470	GAA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244062
61	NC_009470	AAG	2	6	7350	7355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244062
62	NC_009470	GCC	2	6	7421	7426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244062
63	NC_009470	GAT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244063
64	NC_009470	GCA	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244063
65	NC_009470	ATC	2	6	7639	7644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
66	NC_009470	TCG	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
67	NC_009470	CTA	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
68	NC_009470	CAC	2	6	7821	7826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244063
69	NC_009470	TCA	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
70	NC_009470	GCG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244063
71	NC_009470	TTG	2	6	8224	8229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244063
72	NC_009470	AAC	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244063
73	NC_009470	TCA	2	6	8648	8653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
74	NC_009470	CGA	2	6	8661	8666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244063
75	NC_009470	GCT	2	6	8676	8681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
76	NC_009470	TCG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
77	NC_009470	CCG	2	6	8769	8774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244063
78	NC_009470	CGG	2	6	8856	8861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244063
79	NC_009470	TGT	2	6	8863	8868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244063
80	NC_009470	TGT	2	6	8955	8960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244063
81	NC_009470	GAA	2	6	8989	8994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244063
82	NC_009470	GCT	2	6	9003	9008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
83	NC_009470	CGC	2	6	9215	9220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244063
84	NC_009470	TGG	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244064
85	NC_009470	CTG	2	6	9398	9403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244064
86	NC_009470	GGC	2	6	9490	9495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244064
87	NC_009470	CCA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244064
88	NC_009470	AGC	2	6	9544	9549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244064
89	NC_009470	AAG	2	6	9614	9619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244064
90	NC_009470	GTG	2	6	9740	9745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244064
91	NC_009470	TGG	2	6	9825	9830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244064
92	NC_009470	TGG	2	6	10087	10092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244065
93	NC_009470	GTC	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244065
94	NC_009470	TGA	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244065
95	NC_009470	ACA	2	6	10374	10379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244065
96	NC_009470	TCA	2	6	10441	10446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244065
97	NC_009470	ATG	2	6	10512	10517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244065
98	NC_009470	GCA	2	6	10567	10572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244065
99	NC_009470	GGC	2	6	10596	10601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244065
100	NC_009470	TTG	2	6	10668	10673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244065
101	NC_009470	TCC	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244066
102	NC_009470	GCC	2	6	10774	10779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244066
103	NC_009470	CTG	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244066
104	NC_009470	CGA	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244066
105	NC_009470	CTG	2	6	10887	10892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244066
106	NC_009470	CAA	2	6	10893	10898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244066
107	NC_009470	GCC	2	6	10927	10932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244066
108	NC_009470	GGA	2	6	11136	11141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244066
109	NC_009470	CCG	2	6	11544	11549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
110	NC_009470	CTG	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
111	NC_009470	TCA	2	6	11745	11750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244067
112	NC_009470	TGA	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244067
113	NC_009470	CGC	2	6	11867	11872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
114	NC_009470	GAT	2	6	11884	11889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244067
115	NC_009470	TGA	2	6	11961	11966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244067
116	NC_009470	CGC	2	6	12031	12036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
117	NC_009470	CTG	2	6	12059	12064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
118	NC_009470	TCG	2	6	12102	12107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
119	NC_009470	CAC	2	6	12256	12261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244067
120	NC_009470	TTC	2	6	12281	12286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244067
121	NC_009470	GTG	2	6	12299	12304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244067
122	NC_009470	CTG	2	6	12314	12319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
123	NC_009470	CGC	2	6	12331	12336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
124	NC_009470	ATC	2	6	12392	12397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244067
125	NC_009470	CGC	2	6	12615	12620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
126	NC_009470	GCG	2	6	12668	12673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244067
127	NC_009470	TGC	2	6	12684	12689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
128	NC_009470	CGG	2	6	12750	12755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244067
129	NC_009470	CTG	2	6	12767	12772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
130	NC_009470	TGC	2	6	12774	12779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
131	NC_009470	CGC	2	6	13048	13053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244068
132	NC_009470	CGC	2	6	13075	13080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244068
133	NC_009470	GCA	2	6	13147	13152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244068
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247	NC_009470	GCC	2	6	21316	21321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244073
248	NC_009470	GCG	2	6	21404	21409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244073
249	NC_009470	GTG	2	6	21412	21417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244073
250	NC_009470	AGA	2	6	21481	21486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244073
251	NC_009470	TCG	2	6	21604	21609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244073
252	NC_009470	CGA	2	6	22477	22482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244074
253	NC_009470	AAG	2	6	22527	22532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244074
254	NC_009470	GCT	2	6	22543	22548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244074
255	NC_009470	ATC	2	6	22583	22588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244074
256	NC_009470	TCA	2	6	22620	22625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244074
257	NC_009470	TGC	2	6	22716	22721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244074
258	NC_009470	TCG	2	6	22781	22786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244074
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376	NC_009470	TCC	2	6	33878	33883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244085
377	NC_009470	GGC	2	6	33924	33929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244085
378	NC_009470	TCA	2	6	34185	34190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244085
379	NC_009470	GAT	2	6	34285	34290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244086
380	NC_009470	CGC	2	6	34314	34319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244086
381	NC_009470	AGA	2	6	34403	34408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244086
382	NC_009470	CTG	2	6	34682	34687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244086
383	NC_009470	ATG	2	6	34940	34945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244086
384	NC_009470	CTG	2	6	35047	35052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244086
385	NC_009470	CAA	2	6	35108	35113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244086
386	NC_009470	TCC	2	6	35238	35243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244086
387	NC_009470	GCG	2	6	35266	35271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244086
388	NC_009470	CTC	3	9	35713	35721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244087
389	NC_009470	TTC	2	6	35797	35802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244087
390	NC_009470	AAT	2	6	35833	35838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244087
391	NC_009470	CGC	2	6	35962	35967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244087
392	NC_009470	AAC	2	6	35968	35973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244087
393	NC_009470	CCA	2	6	36080	36085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244087
394	NC_009470	ATG	2	6	36116	36121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244087

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.