MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009468	AT	3	6	98	103	50 %	50 %	0 %	0 %	148243808
2	NC_009468	CG	3	6	128	133	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
3	NC_009468	CG	3	6	155	160	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
4	NC_009468	TC	3	6	483	488	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
5	NC_009468	CT	3	6	501	506	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
6	NC_009468	GC	3	6	1541	1546	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
7	NC_009468	TC	3	6	2129	2134	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
8	NC_009468	GC	4	8	2764	2771	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
9	NC_009468	GC	3	6	3130	3135	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
10	NC_009468	CG	3	6	3963	3968	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
11	NC_009468	GC	3	6	4182	4187	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
12	NC_009468	CG	3	6	4294	4299	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
13	NC_009468	GC	3	6	4788	4793	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
14	NC_009468	GC	3	6	5945	5950	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
15	NC_009468	CG	3	6	7127	7132	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
16	NC_009468	TC	3	6	7548	7553	0 %	50 %	0 %	50 %	148243810
17	NC_009468	GC	3	6	7783	7788	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
18	NC_009468	GC	3	6	7904	7909	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
19	NC_009468	GC	3	6	7934	7939	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
20	NC_009468	CG	3	6	8999	9004	0 %	0 %	50 %	50 %	148243812
21	NC_009468	CG	4	8	9368	9375	0 %	0 %	50 %	50 %	148243812
22	NC_009468	CG	3	6	9469	9474	0 %	0 %	50 %	50 %	148243812
23	NC_009468	GC	4	8	9984	9991	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
24	NC_009468	CG	3	6	10238	10243	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
25	NC_009468	GC	3	6	10419	10424	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
26	NC_009468	GC	3	6	10548	10553	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
27	NC_009468	CG	3	6	10874	10879	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
28	NC_009468	GC	3	6	10974	10979	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
29	NC_009468	CG	3	6	11937	11942	0 %	0 %	50 %	50 %	148243814
30	NC_009468	CG	3	6	14140	14145	0 %	0 %	50 %	50 %	148243817
31	NC_009468	GC	4	8	15237	15244	0 %	0 %	50 %	50 %	148243818
32	NC_009468	CG	3	6	15778	15783	0 %	0 %	50 %	50 %	148243818
33	NC_009468	CG	3	6	15949	15954	0 %	0 %	50 %	50 %	148243819
34	NC_009468	GA	3	6	17069	17074	50 %	0 %	50 %	0 %	148243820
35	NC_009468	AC	3	6	17254	17259	50 %	0 %	0 %	50 %	148243820
36	NC_009468	CG	3	6	17334	17339	0 %	0 %	50 %	50 %	148243820
37	NC_009468	GC	3	6	18257	18262	0 %	0 %	50 %	50 %	148243821
38	NC_009468	GC	3	6	19651	19656	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
39	NC_009468	CG	3	6	19755	19760	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
40	NC_009468	GA	3	6	19953	19958	50 %	0 %	50 %	0 %	148243822
41	NC_009468	CG	3	6	19987	19992	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
42	NC_009468	CG	3	6	20346	20351	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
43	NC_009468	GC	3	6	22727	22732	0 %	0 %	50 %	50 %	148243824
44	NC_009468	GC	3	6	22841	22846	0 %	0 %	50 %	50 %	148243824
45	NC_009468	CG	3	6	24792	24797	0 %	0 %	50 %	50 %	148243826
46	NC_009468	GT	3	6	24822	24827	0 %	50 %	50 %	0 %	148243826
47	NC_009468	AT	3	6	25008	25013	50 %	50 %	0 %	0 %	148243826
48	NC_009468	CG	3	6	26804	26809	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
49	NC_009468	CG	3	6	26864	26869	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
50	NC_009468	GC	3	6	26911	26916	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
51	NC_009468	AC	3	6	26954	26959	50 %	0 %	0 %	50 %	148243829
52	NC_009468	GC	4	8	27976	27983	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
53	NC_009468	AG	3	6	28079	28084	50 %	0 %	50 %	0 %	148243829
54	NC_009468	CG	3	6	28115	28120	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
55	NC_009468	CG	3	6	29257	29262	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
56	NC_009468	TC	3	6	29682	29687	0 %	50 %	0 %	50 %	148243830
57	NC_009468	CG	3	6	30468	30473	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
58	NC_009468	GC	3	6	30516	30521	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
59	NC_009468	GC	3	6	30603	30608	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
60	NC_009468	GC	3	6	30980	30985	0 %	0 %	50 %	50 %	148243831
61	NC_009468	GC	3	6	31392	31397	0 %	0 %	50 %	50 %	148243832
62	NC_009468	GC	3	6	31579	31584	0 %	0 %	50 %	50 %	148243832
63	NC_009468	GA	3	6	31949	31954	50 %	0 %	50 %	0 %	148243832
64	NC_009468	CT	3	6	32328	32333	0 %	50 %	0 %	50 %	148243832
65	NC_009468	GC	3	6	32972	32977	0 %	0 %	50 %	50 %	148243833
66	NC_009468	GC	3	6	33142	33147	0 %	0 %	50 %	50 %	148243834
67	NC_009468	GC	3	6	33721	33726	0 %	0 %	50 %	50 %	148243834
68	NC_009468	CT	3	6	38624	38629	0 %	50 %	0 %	50 %	148243836
69	NC_009468	GC	4	8	38677	38684	0 %	0 %	50 %	50 %	148243836
70	NC_009468	CG	3	6	38881	38886	0 %	0 %	50 %	50 %	148243836
71	NC_009468	TC	3	6	39279	39284	0 %	50 %	0 %	50 %	148243836
72	NC_009468	GC	3	6	40263	40268	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
73	NC_009468	GC	3	6	40494	40499	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
74	NC_009468	CG	3	6	40669	40674	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
75	NC_009468	GC	3	6	40754	40759	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
76	NC_009468	CG	4	8	40933	40940	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
77	NC_009468	CG	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	148243838
78	NC_009468	GC	4	8	41408	41415	0 %	0 %	50 %	50 %	148243838
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81	NC_009468	CG	3	6	45099	45104	0 %	0 %	50 %	50 %	148243842
82	NC_009468	CG	3	6	45725	45730	0 %	0 %	50 %	50 %	148243843
83	NC_009468	CG	3	6	47766	47771	0 %	0 %	50 %	50 %	148243846
84	NC_009468	CG	3	6	48056	48061	0 %	0 %	50 %	50 %	148243846
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87	NC_009468	GC	3	6	50110	50115	0 %	0 %	50 %	50 %	148243848
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89	NC_009468	AC	3	6	50929	50934	50 %	0 %	0 %	50 %	148243848
90	NC_009468	AC	3	6	51771	51776	50 %	0 %	0 %	50 %	148243849
91	NC_009468	AC	3	6	53145	53150	50 %	0 %	0 %	50 %	148243850
92	NC_009468	AG	3	6	53368	53373	50 %	0 %	50 %	0 %	148243850
93	NC_009468	GA	3	6	53480	53485	50 %	0 %	50 %	0 %	148243850
94	NC_009468	CG	3	6	54078	54083	0 %	0 %	50 %	50 %	148243851
95	NC_009468	GC	3	6	54213	54218	0 %	0 %	50 %	50 %	148243851
96	NC_009468	CG	3	6	54629	54634	0 %	0 %	50 %	50 %	148243852
97	NC_009468	CG	3	6	54979	54984	0 %	0 %	50 %	50 %	148243852
98	NC_009468	CG	3	6	55490	55495	0 %	0 %	50 %	50 %	148243853
99	NC_009468	CG	3	6	55679	55684	0 %	0 %	50 %	50 %	148243853
100	NC_009468	CG	3	6	56298	56303	0 %	0 %	50 %	50 %	148243854
101	NC_009468	GC	3	6	56564	56569	0 %	0 %	50 %	50 %	148243855
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103	NC_009468	CG	3	6	58658	58663	0 %	0 %	50 %	50 %	148243858
104	NC_009468	CA	3	6	59098	59103	50 %	0 %	0 %	50 %	148243858
105	NC_009468	CG	4	8	59152	59159	0 %	0 %	50 %	50 %	148243858
106	NC_009468	GC	3	6	60232	60237	0 %	0 %	50 %	50 %	148243860
107	NC_009468	TC	3	6	60530	60535	0 %	50 %	0 %	50 %	148243860
108	NC_009468	CG	3	6	61165	61170	0 %	0 %	50 %	50 %	148243861
109	NC_009468	GA	3	6	61395	61400	50 %	0 %	50 %	0 %	148243861
110	NC_009468	CG	3	6	61484	61489	0 %	0 %	50 %	50 %	148243861
111	NC_009468	CG	3	6	61959	61964	0 %	0 %	50 %	50 %	148243862
112	NC_009468	GC	3	6	62350	62355	0 %	0 %	50 %	50 %	148243862
113	NC_009468	GC	3	6	62426	62431	0 %	0 %	50 %	50 %	148243862
114	NC_009468	GA	3	6	62488	62493	50 %	0 %	50 %	0 %	148243862
115	NC_009468	GC	4	8	62871	62878	0 %	0 %	50 %	50 %	148243862
116	NC_009468	CG	3	6	63607	63612	0 %	0 %	50 %	50 %	148243863
117	NC_009468	GC	3	6	66254	66259	0 %	0 %	50 %	50 %	148243864
118	NC_009468	CG	5	10	67477	67486	0 %	0 %	50 %	50 %	148243865
119	NC_009468	CG	3	6	68230	68235	0 %	0 %	50 %	50 %	148243866
120	NC_009468	CT	3	6	68707	68712	0 %	50 %	0 %	50 %	148243867
121	NC_009468	CG	3	6	69193	69198	0 %	0 %	50 %	50 %	148243868
122	NC_009468	GC	3	6	69282	69287	0 %	0 %	50 %	50 %	148243868
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125	NC_009468	CG	3	6	70348	70353	0 %	0 %	50 %	50 %	148243869
126	NC_009468	CG	3	6	70771	70776	0 %	0 %	50 %	50 %	148243870
127	NC_009468	GC	3	6	70894	70899	0 %	0 %	50 %	50 %	148243870
128	NC_009468	GC	3	6	71227	71232	0 %	0 %	50 %	50 %	148243871
129	NC_009468	CG	3	6	71277	71282	0 %	0 %	50 %	50 %	148243871
130	NC_009468	GT	3	6	71415	71420	0 %	50 %	50 %	0 %	148243871
131	NC_009468	CG	3	6	72102	72107	0 %	0 %	50 %	50 %	148243872
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140	NC_009468	GC	3	6	75514	75519	0 %	0 %	50 %	50 %	148243874
141	NC_009468	GA	3	6	76157	76162	50 %	0 %	50 %	0 %	148243875
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143	NC_009468	GA	3	6	76750	76755	50 %	0 %	50 %	0 %	148243876
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.