MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009468	CGG	2	6	26719	26724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
502	NC_009468	GATTG	2	10	26773	26782	20 %	40 %	40 %	0 %	148243829
503	NC_009468	CG	3	6	26804	26809	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
504	NC_009468	ATT	2	6	26840	26845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243829
505	NC_009468	CG	3	6	26864	26869	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
506	NC_009468	GC	3	6	26911	26916	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
507	NC_009468	AC	3	6	26954	26959	50 %	0 %	0 %	50 %	148243829
508	NC_009468	ATC	2	6	27019	27024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243829
509	NC_009468	GGC	2	6	27054	27059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
510	NC_009468	TCT	2	6	27107	27112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243829
511	NC_009468	ACCT	2	8	27166	27173	25 %	25 %	0 %	50 %	148243829
512	NC_009468	ATCG	2	8	27201	27208	25 %	25 %	25 %	25 %	148243829
513	NC_009468	CTC	2	6	27270	27275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243829
514	NC_009468	GGGAGG	2	12	27290	27301	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	148243829
515	NC_009468	CTC	2	6	27397	27402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243829
516	NC_009468	CGC	2	6	27425	27430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
517	NC_009468	GCT	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
518	NC_009468	TGGG	2	8	27539	27546	0 %	25 %	75 %	0 %	148243829
519	NC_009468	CTGA	2	8	27595	27602	25 %	25 %	25 %	25 %	148243829
520	NC_009468	CCG	2	6	27609	27614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
521	NC_009468	CCA	2	6	27668	27673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243829
522	NC_009468	TGG	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243829
523	NC_009468	CGGG	2	8	27715	27722	0 %	0 %	75 %	25 %	148243829
524	NC_009468	CGC	2	6	27789	27794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
525	NC_009468	TGA	2	6	27834	27839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243829
526	NC_009468	GCC	2	6	27850	27855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
527	NC_009468	GCG	2	6	27856	27861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
528	NC_009468	GC	4	8	27976	27983	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
529	NC_009468	GTC	2	6	28006	28011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
530	NC_009468	CTGGAT	2	12	28021	28032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243829
531	NC_009468	CTG	2	6	28039	28044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
532	NC_009468	AG	3	6	28079	28084	50 %	0 %	50 %	0 %	148243829
533	NC_009468	GGC	2	6	28088	28093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
534	NC_009468	CG	3	6	28115	28120	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
535	NC_009468	TCG	2	6	28121	28126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
536	NC_009468	GCC	2	6	28127	28132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
537	NC_009468	GGCT	2	8	28180	28187	0 %	25 %	50 %	25 %	148243829
538	NC_009468	GCT	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
539	NC_009468	CAA	2	6	28209	28214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243829
540	NC_009468	GCT	2	6	28233	28238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
541	NC_009468	GGCGC	2	10	28241	28250	0 %	0 %	60 %	40 %	148243829
542	NC_009468	GGC	2	6	28311	28316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
543	NC_009468	GGC	2	6	28353	28358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
544	NC_009468	CGGC	2	8	28400	28407	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
545	NC_009468	CGA	2	6	28422	28427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243829
546	NC_009468	CCGAC	2	10	28474	28483	20 %	0 %	20 %	60 %	148243829
547	NC_009468	GAG	2	6	28486	28491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243829
548	NC_009468	GGT	2	6	28536	28541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243829
549	NC_009468	AGC	2	6	28617	28622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243829
550	NC_009468	CAC	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243829
551	NC_009468	CGG	2	6	28634	28639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
552	NC_009468	GCG	2	6	28651	28656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
553	NC_009468	TGC	2	6	28706	28711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
554	NC_009468	AGG	2	6	28736	28741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243829
555	NC_009468	GGACG	2	10	29177	29186	20 %	0 %	60 %	20 %	148243830
556	NC_009468	GGA	2	6	29216	29221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243830
557	NC_009468	CG	3	6	29257	29262	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
558	NC_009468	GCTG	2	8	29291	29298	0 %	25 %	50 %	25 %	148243830
559	NC_009468	GAT	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243830
560	NC_009468	CTC	2	6	29359	29364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243830
561	NC_009468	TGA	2	6	29468	29473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243830
562	NC_009468	CGG	2	6	29560	29565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243830
563	NC_009468	CGG	2	6	29606	29611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243830
564	NC_009468	TGG	2	6	29659	29664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243830
565	NC_009468	TC	3	6	29682	29687	0 %	50 %	0 %	50 %	148243830
566	NC_009468	CAC	2	6	29691	29696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243830
567	NC_009468	GAT	2	6	29808	29813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243830
568	NC_009468	TGG	2	6	29835	29840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243830
569	NC_009468	GGC	2	6	29938	29943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243830
570	NC_009468	TGG	2	6	30050	30055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243830
571	NC_009468	GCCG	2	8	30109	30116	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
572	NC_009468	GAA	2	6	30162	30167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243830
573	NC_009468	GGC	2	6	30192	30197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243830
574	NC_009468	ACA	2	6	30208	30213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243830
575	NC_009468	AGG	2	6	30268	30273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243830
576	NC_009468	AGCG	2	8	30318	30325	25 %	0 %	50 %	25 %	148243830
577	NC_009468	ATC	2	6	30367	30372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243830
578	NC_009468	TTC	2	6	30450	30455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243830
579	NC_009468	CG	3	6	30468	30473	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
580	NC_009468	GC	3	6	30516	30521	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
581	NC_009468	CGA	2	6	30548	30553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243830
582	NC_009468	GC	3	6	30603	30608	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
583	NC_009468	A	7	7	30694	30700	100 %	0 %	0 %	0 %	148243830
584	NC_009468	GAAAG	2	10	30704	30713	60 %	0 %	40 %	0 %	148243830
585	NC_009468	ATCG	2	8	30729	30736	25 %	25 %	25 %	25 %	148243831
586	NC_009468	GCC	2	6	30737	30742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243831
587	NC_009468	TGG	2	6	30749	30754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243831
588	NC_009468	TGC	2	6	30793	30798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243831
589	NC_009468	CGC	2	6	30812	30817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243831
590	NC_009468	GAA	2	6	30845	30850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243831
591	NC_009468	CCG	2	6	30868	30873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243831
592	NC_009468	CGC	2	6	30916	30921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243831
593	NC_009468	C	6	6	30966	30971	0 %	0 %	0 %	100 %	148243831
594	NC_009468	GGTC	2	8	30972	30979	0 %	25 %	50 %	25 %	148243831
595	NC_009468	GC	3	6	30980	30985	0 %	0 %	50 %	50 %	148243831
596	NC_009468	AGAC	2	8	31002	31009	50 %	0 %	25 %	25 %	148243831
597	NC_009468	CGC	2	6	31032	31037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243831
598	NC_009468	CTG	2	6	31052	31057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243831
599	NC_009468	AGC	2	6	31077	31082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243831
600	NC_009468	CTG	2	6	31151	31156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243831
601	NC_009468	CGC	4	12	31172	31183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243831
602	NC_009468	GAG	2	6	31244	31249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243831
603	NC_009468	TGA	2	6	31256	31261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243831
604	NC_009468	CTT	2	6	31290	31295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243832
605	NC_009468	CGG	2	6	31350	31355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243832
606	NC_009468	TCC	2	6	31375	31380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243832
607	NC_009468	GC	3	6	31392	31397	0 %	0 %	50 %	50 %	148243832
608	NC_009468	GAG	2	6	31468	31473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243832
609	NC_009468	GC	3	6	31579	31584	0 %	0 %	50 %	50 %	148243832
610	NC_009468	CAG	2	6	31588	31593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243832
611	NC_009468	TGC	2	6	31650	31655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243832
612	NC_009468	CTG	2	6	31747	31752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243832
613	NC_009468	GCC	2	6	31831	31836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243832
614	NC_009468	CAC	2	6	31857	31862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243832
615	NC_009468	GAC	3	9	31879	31887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243832
616	NC_009468	TAC	2	6	31888	31893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243832
617	NC_009468	GAT	2	6	31903	31908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243832
618	NC_009468	GA	3	6	31949	31954	50 %	0 %	50 %	0 %	148243832
619	NC_009468	TCT	2	6	31973	31978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243832
620	NC_009468	CCT	2	6	32004	32009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243832
621	NC_009468	GCG	2	6	32024	32029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243832
622	NC_009468	TGC	2	6	32064	32069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243832
623	NC_009468	GGC	2	6	32079	32084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243832
624	NC_009468	CCA	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243832
625	NC_009468	CGC	2	6	32121	32126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243832
626	NC_009468	CGGG	2	8	32130	32137	0 %	0 %	75 %	25 %	148243832
627	NC_009468	TGG	2	6	32316	32321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243832
628	NC_009468	CT	3	6	32328	32333	0 %	50 %	0 %	50 %	148243832
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880	NC_009468	CCG	2	6	48248	48253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243846
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1000	NC_009468	CAC	2	6	55719	55724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243853

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