MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 378

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009467	CT	3	6	167	172	0 %	50 %	0 %	50 %	148243636
2	NC_009467	GC	3	6	264	269	0 %	0 %	50 %	50 %	148243636
3	NC_009467	CG	3	6	1202	1207	0 %	0 %	50 %	50 %	148243636
4	NC_009467	GC	4	8	1320	1327	0 %	0 %	50 %	50 %	148243636
5	NC_009467	GA	3	6	2309	2314	50 %	0 %	50 %	0 %	148243637
6	NC_009467	CG	3	6	2571	2576	0 %	0 %	50 %	50 %	148243637
7	NC_009467	GC	4	8	3003	3010	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
8	NC_009467	CG	3	6	4114	4119	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
9	NC_009467	CG	3	6	4163	4168	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
10	NC_009467	CG	3	6	4252	4257	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
11	NC_009467	CG	3	6	4554	4559	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
12	NC_009467	CG	3	6	4825	4830	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
13	NC_009467	GC	3	6	4925	4930	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
14	NC_009467	CG	3	6	5246	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
15	NC_009467	TC	3	6	5261	5266	0 %	50 %	0 %	50 %	148243639
16	NC_009467	GC	4	8	5513	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
17	NC_009467	GC	3	6	6118	6123	0 %	0 %	50 %	50 %	148243640
18	NC_009467	CG	3	6	6388	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	148243640
19	NC_009467	GC	3	6	6839	6844	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
20	NC_009467	GC	3	6	7003	7008	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
21	NC_009467	TC	3	6	7249	7254	0 %	50 %	0 %	50 %	148243641
22	NC_009467	CG	3	6	7584	7589	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
23	NC_009467	GC	3	6	8231	8236	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
24	NC_009467	GC	3	6	8276	8281	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
25	NC_009467	GC	3	6	8772	8777	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
26	NC_009467	CG	3	6	8863	8868	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
27	NC_009467	GC	3	6	10102	10107	0 %	0 %	50 %	50 %	148243642
28	NC_009467	GC	3	6	10431	10436	0 %	0 %	50 %	50 %	148243642
29	NC_009467	GC	3	6	11523	11528	0 %	0 %	50 %	50 %	148243643
30	NC_009467	CG	3	6	12251	12256	0 %	0 %	50 %	50 %	148243644
31	NC_009467	GC	3	6	13568	13573	0 %	0 %	50 %	50 %	148243646
32	NC_009467	CG	3	6	14997	15002	0 %	0 %	50 %	50 %	148243647
33	NC_009467	GC	3	6	16162	16167	0 %	0 %	50 %	50 %	148243648
34	NC_009467	GC	3	6	16259	16264	0 %	0 %	50 %	50 %	148243648
35	NC_009467	AC	3	6	18565	18570	50 %	0 %	0 %	50 %	148243651
36	NC_009467	TG	4	8	19990	19997	0 %	50 %	50 %	0 %	148243652
37	NC_009467	AG	3	6	22673	22678	50 %	0 %	50 %	0 %	148243654
38	NC_009467	GC	3	6	23408	23413	0 %	0 %	50 %	50 %	148243654
39	NC_009467	GC	3	6	23453	23458	0 %	0 %	50 %	50 %	148243654
40	NC_009467	CG	3	6	24802	24807	0 %	0 %	50 %	50 %	148243655
41	NC_009467	GC	4	8	25131	25138	0 %	0 %	50 %	50 %	148243656
42	NC_009467	AG	3	6	25764	25769	50 %	0 %	50 %	0 %	148243657
43	NC_009467	GC	3	6	26128	26133	0 %	0 %	50 %	50 %	148243657
44	NC_009467	CG	5	10	26160	26169	0 %	0 %	50 %	50 %	148243657
45	NC_009467	GC	3	6	26825	26830	0 %	0 %	50 %	50 %	148243658
46	NC_009467	TA	3	6	27115	27120	50 %	50 %	0 %	0 %	148243659
47	NC_009467	GT	3	6	28108	28113	0 %	50 %	50 %	0 %	148243661
48	NC_009467	CG	3	6	28278	28283	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
49	NC_009467	GC	3	6	28335	28340	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
50	NC_009467	GC	3	6	28455	28460	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
51	NC_009467	CG	3	6	28757	28762	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
52	NC_009467	CG	3	6	28999	29004	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
53	NC_009467	GC	3	6	29166	29171	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
54	NC_009467	GA	3	6	29190	29195	50 %	0 %	50 %	0 %	148243661
55	NC_009467	CG	4	8	29252	29259	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
56	NC_009467	CG	3	6	29353	29358	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
57	NC_009467	CG	3	6	29755	29760	0 %	0 %	50 %	50 %	148243662
58	NC_009467	CG	3	6	29851	29856	0 %	0 %	50 %	50 %	148243662
59	NC_009467	CG	3	6	31407	31412	0 %	0 %	50 %	50 %	148243663
60	NC_009467	GC	3	6	32412	32417	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
61	NC_009467	GC	3	6	32658	32663	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
62	NC_009467	GC	3	6	32729	32734	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
63	NC_009467	GC	3	6	32975	32980	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
64	NC_009467	GA	3	6	33473	33478	50 %	0 %	50 %	0 %	148243664
65	NC_009467	GC	3	6	34179	34184	0 %	0 %	50 %	50 %	148243665
66	NC_009467	CG	3	6	34233	34238	0 %	0 %	50 %	50 %	148243665
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68	NC_009467	CG	3	6	35138	35143	0 %	0 %	50 %	50 %	148243666
69	NC_009467	GC	3	6	36463	36468	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
70	NC_009467	AT	3	6	37110	37115	50 %	50 %	0 %	0 %	148243668
71	NC_009467	CG	3	6	37781	37786	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
72	NC_009467	GC	3	6	38741	38746	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
73	NC_009467	GC	3	6	38804	38809	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
74	NC_009467	CG	3	6	38994	38999	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
75	NC_009467	GC	4	8	39289	39296	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
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77	NC_009467	CG	3	6	39993	39998	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
78	NC_009467	TC	3	6	40000	40005	0 %	50 %	0 %	50 %	148243668
79	NC_009467	GC	3	6	40042	40047	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
80	NC_009467	GC	4	8	40173	40180	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
81	NC_009467	GC	3	6	40211	40216	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
82	NC_009467	GC	3	6	40365	40370	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
83	NC_009467	CG	3	6	40655	40660	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
84	NC_009467	GC	3	6	41123	41128	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
85	NC_009467	CG	3	6	41265	41270	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
86	NC_009467	CG	3	6	41501	41506	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
87	NC_009467	GC	3	6	41790	41795	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
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89	NC_009467	GA	3	6	42158	42163	50 %	0 %	50 %	0 %	148243668
90	NC_009467	CG	3	6	42294	42299	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
91	NC_009467	CG	3	6	42476	42481	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
92	NC_009467	CT	3	6	42662	42667	0 %	50 %	0 %	50 %	148243668
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94	NC_009467	GC	3	6	43095	43100	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
95	NC_009467	GC	3	6	43548	43553	0 %	0 %	50 %	50 %	148243668
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97	NC_009467	CT	3	6	44946	44951	0 %	50 %	0 %	50 %	148243669
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102	NC_009467	CG	3	6	50411	50416	0 %	0 %	50 %	50 %	148243673
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109	NC_009467	GA	3	6	52925	52930	50 %	0 %	50 %	0 %	148243675
110	NC_009467	GC	3	6	53158	53163	0 %	0 %	50 %	50 %	148243676
111	NC_009467	GT	3	6	53395	53400	0 %	50 %	50 %	0 %	148243676
112	NC_009467	GC	3	6	53813	53818	0 %	0 %	50 %	50 %	148243677
113	NC_009467	CG	3	6	54011	54016	0 %	0 %	50 %	50 %	148243677
114	NC_009467	GC	3	6	54543	54548	0 %	0 %	50 %	50 %	148243678
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124	NC_009467	GC	3	6	61689	61694	0 %	0 %	50 %	50 %	148243684
125	NC_009467	CG	3	6	62092	62097	0 %	0 %	50 %	50 %	148243685
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127	NC_009467	CT	3	6	65087	65092	0 %	50 %	0 %	50 %	148243686
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.