MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	AT	3	6	3588	3593	50 %	50 %	0 %	0 %	145301389
2	NC_009350	CA	3	6	3740	3745	50 %	0 %	0 %	50 %	145301389
3	NC_009350	AG	3	6	4035	4040	50 %	0 %	50 %	0 %	145301390
4	NC_009350	GA	3	6	4170	4175	50 %	0 %	50 %	0 %	145301390
5	NC_009350	GC	3	6	4527	4532	0 %	0 %	50 %	50 %	145301391
6	NC_009350	CA	3	6	4761	4766	50 %	0 %	0 %	50 %	145301391
7	NC_009350	CG	3	6	4932	4937	0 %	0 %	50 %	50 %	145301391
8	NC_009350	TC	3	6	5920	5925	0 %	50 %	0 %	50 %	145301392
9	NC_009350	GC	3	6	8003	8008	0 %	0 %	50 %	50 %	145301394
10	NC_009350	AG	3	6	8541	8546	50 %	0 %	50 %	0 %	145301394
11	NC_009350	GC	3	6	10484	10489	0 %	0 %	50 %	50 %	145301395
12	NC_009350	TG	3	6	14530	14535	0 %	50 %	50 %	0 %	145301399
13	NC_009350	GT	3	6	14576	14581	0 %	50 %	50 %	0 %	145301399
14	NC_009350	CA	4	8	14668	14675	50 %	0 %	0 %	50 %	145301399
15	NC_009350	CT	3	6	19049	19054	0 %	50 %	0 %	50 %	145301404
16	NC_009350	GC	3	6	19081	19086	0 %	0 %	50 %	50 %	145301404
17	NC_009350	TA	3	6	19099	19104	50 %	50 %	0 %	0 %	145301404
18	NC_009350	TG	3	6	19658	19663	0 %	50 %	50 %	0 %	145301405
19	NC_009350	CT	3	6	20083	20088	0 %	50 %	0 %	50 %	145301405
20	NC_009350	AG	3	6	20119	20124	50 %	0 %	50 %	0 %	145301406
21	NC_009350	CA	3	6	20148	20153	50 %	0 %	0 %	50 %	145301406
22	NC_009350	TA	3	6	21646	21651	50 %	50 %	0 %	0 %	145301407
23	NC_009350	TC	3	6	23354	23359	0 %	50 %	0 %	50 %	145301410
24	NC_009350	CA	4	8	23360	23367	50 %	0 %	0 %	50 %	145301410
25	NC_009350	CT	3	6	24364	24369	0 %	50 %	0 %	50 %	145301411
26	NC_009350	CA	3	6	24486	24491	50 %	0 %	0 %	50 %	145301411
27	NC_009350	CT	3	6	25586	25591	0 %	50 %	0 %	50 %	145301412
28	NC_009350	GC	3	6	26125	26130	0 %	0 %	50 %	50 %	145301413
29	NC_009350	CT	3	6	28838	28843	0 %	50 %	0 %	50 %	145301414
30	NC_009350	CT	3	6	29779	29784	0 %	50 %	0 %	50 %	145301416
31	NC_009350	GA	3	6	31407	31412	50 %	0 %	50 %	0 %	145301418
32	NC_009350	CA	3	6	32207	32212	50 %	0 %	0 %	50 %	145301419
33	NC_009350	GA	3	6	32583	32588	50 %	0 %	50 %	0 %	145301419
34	NC_009350	AT	3	6	32760	32765	50 %	50 %	0 %	0 %	145301419
35	NC_009350	GC	3	6	33160	33165	0 %	0 %	50 %	50 %	145301419
36	NC_009350	AC	3	6	34635	34640	50 %	0 %	0 %	50 %	145301421
37	NC_009350	TC	3	6	39628	39633	0 %	50 %	0 %	50 %	145301423
38	NC_009350	AC	3	6	40018	40023	50 %	0 %	0 %	50 %	145301424
39	NC_009350	GC	3	6	44649	44654	0 %	0 %	50 %	50 %	145301426
40	NC_009350	AC	3	6	44987	44992	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
41	NC_009350	AC	3	6	45064	45069	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
42	NC_009350	CA	3	6	45480	45485	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
43	NC_009350	TC	3	6	45679	45684	0 %	50 %	0 %	50 %	145301426
44	NC_009350	TC	3	6	46022	46027	0 %	50 %	0 %	50 %	145301426
45	NC_009350	CA	3	6	47629	47634	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
46	NC_009350	GC	3	6	48463	48468	0 %	0 %	50 %	50 %	145301427
47	NC_009350	CA	3	6	48697	48702	50 %	0 %	0 %	50 %	145301427
48	NC_009350	CG	3	6	48868	48873	0 %	0 %	50 %	50 %	145301427
49	NC_009350	TG	3	6	50419	50424	0 %	50 %	50 %	0 %	145301428
50	NC_009350	AT	3	6	51344	51349	50 %	50 %	0 %	0 %	145301428
51	NC_009350	GA	5	10	51525	51534	50 %	0 %	50 %	0 %	145301429
52	NC_009350	GA	3	6	51674	51679	50 %	0 %	50 %	0 %	145301429
53	NC_009350	AG	3	6	54326	54331	50 %	0 %	50 %	0 %	145301431
54	NC_009350	GC	3	6	55149	55154	0 %	0 %	50 %	50 %	145301433
55	NC_009350	CT	3	6	55510	55515	0 %	50 %	0 %	50 %	145301433
56	NC_009350	CG	3	6	56364	56369	0 %	0 %	50 %	50 %	145301435
57	NC_009350	CT	3	6	56801	56806	0 %	50 %	0 %	50 %	145301436
58	NC_009350	AC	3	6	56873	56878	50 %	0 %	0 %	50 %	145301436
59	NC_009350	GT	3	6	57698	57703	0 %	50 %	50 %	0 %	145301439
60	NC_009350	CG	3	6	58134	58139	0 %	0 %	50 %	50 %	145301439
61	NC_009350	CA	3	6	58756	58761	50 %	0 %	0 %	50 %	145301440
62	NC_009350	GC	3	6	58917	58922	0 %	0 %	50 %	50 %	145301440
63	NC_009350	GA	3	6	58943	58948	50 %	0 %	50 %	0 %	145301440
64	NC_009350	GC	3	6	58985	58990	0 %	0 %	50 %	50 %	145301440
65	NC_009350	GA	3	6	59675	59680	50 %	0 %	50 %	0 %	145301440
66	NC_009350	AT	3	6	62117	62122	50 %	50 %	0 %	0 %	145301443
67	NC_009350	GC	3	6	63693	63698	0 %	0 %	50 %	50 %	145301445
68	NC_009350	CT	3	6	63826	63831	0 %	50 %	0 %	50 %	145301446
69	NC_009350	CT	3	6	63892	63897	0 %	50 %	0 %	50 %	145301446
70	NC_009350	AG	3	6	66702	66707	50 %	0 %	50 %	0 %	145301449
71	NC_009350	AG	3	6	67453	67458	50 %	0 %	50 %	0 %	145301450
72	NC_009350	GC	3	6	69193	69198	0 %	0 %	50 %	50 %	145301453
73	NC_009350	GC	3	6	70396	70401	0 %	0 %	50 %	50 %	145301453
74	NC_009350	GA	3	6	72273	72278	50 %	0 %	50 %	0 %	145301458
75	NC_009350	AG	3	6	72449	72454	50 %	0 %	50 %	0 %	145301458
76	NC_009350	GC	3	6	72551	72556	0 %	0 %	50 %	50 %	145301458
77	NC_009350	GC	3	6	72659	72664	0 %	0 %	50 %	50 %	145301458
78	NC_009350	GC	3	6	72897	72902	0 %	0 %	50 %	50 %	145301458
79	NC_009350	CA	4	8	75409	75416	50 %	0 %	0 %	50 %	145301461
80	NC_009350	TC	3	6	76143	76148	0 %	50 %	0 %	50 %	145301461
81	NC_009350	CT	3	6	76762	76767	0 %	50 %	0 %	50 %	145301462
82	NC_009350	TG	3	6	83448	83453	0 %	50 %	50 %	0 %	145301468
83	NC_009350	AC	3	6	83738	83743	50 %	0 %	0 %	50 %	145301469
84	NC_009350	CT	3	6	84030	84035	0 %	50 %	0 %	50 %	145301469
85	NC_009350	AT	3	6	84821	84826	50 %	50 %	0 %	0 %	145301470
86	NC_009350	GC	3	6	85315	85320	0 %	0 %	50 %	50 %	145301471
87	NC_009350	CA	3	6	85549	85554	50 %	0 %	0 %	50 %	145301471
88	NC_009350	CG	3	6	85720	85725	0 %	0 %	50 %	50 %	145301471
89	NC_009350	GT	3	6	87583	87588	0 %	50 %	50 %	0 %	145301473
90	NC_009350	AG	3	6	88619	88624	50 %	0 %	50 %	0 %	145301473
91	NC_009350	GC	3	6	90012	90017	0 %	0 %	50 %	50 %	145301474
92	NC_009350	CA	3	6	92779	92784	50 %	0 %	0 %	50 %	145301477
93	NC_009350	GA	3	6	94784	94789	50 %	0 %	50 %	0 %	145301479
94	NC_009350	CT	3	6	95554	95559	0 %	50 %	0 %	50 %	145301479
95	NC_009350	TC	3	6	97729	97734	0 %	50 %	0 %	50 %	145301480
96	NC_009350	AG	3	6	97801	97806	50 %	0 %	50 %	0 %	145301480
97	NC_009350	CT	3	6	100565	100570	0 %	50 %	0 %	50 %	145301481
98	NC_009350	TC	3	6	102094	102099	0 %	50 %	0 %	50 %	145301484
99	NC_009350	AC	3	6	102370	102375	50 %	0 %	0 %	50 %	145301485
100	NC_009350	AT	3	6	102604	102609	50 %	50 %	0 %	0 %	145301485
101	NC_009350	CA	3	6	103344	103349	50 %	0 %	0 %	50 %	145301486
102	NC_009350	CA	3	6	110566	110571	50 %	0 %	0 %	50 %	145301496
103	NC_009350	CA	3	6	111443	111448	50 %	0 %	0 %	50 %	145301497
104	NC_009350	TC	3	6	113631	113636	0 %	50 %	0 %	50 %	145301498
105	NC_009350	CA	3	6	115457	115462	50 %	0 %	0 %	50 %	145301500
106	NC_009350	TG	4	8	115519	115526	0 %	50 %	50 %	0 %	145301500
107	NC_009350	TG	3	6	115850	115855	0 %	50 %	50 %	0 %	145301501
108	NC_009350	CG	3	6	116448	116453	0 %	0 %	50 %	50 %	145301502
109	NC_009350	AT	3	6	116588	116593	50 %	50 %	0 %	0 %	145301502
110	NC_009350	CG	3	6	116706	116711	0 %	0 %	50 %	50 %	145301502
111	NC_009350	AT	3	6	116982	116987	50 %	50 %	0 %	0 %	145301502
112	NC_009350	CA	3	6	117546	117551	50 %	0 %	0 %	50 %	145301502
113	NC_009350	GT	3	6	117595	117600	0 %	50 %	50 %	0 %	145301502
114	NC_009350	CG	3	6	117660	117665	0 %	0 %	50 %	50 %	145301502
115	NC_009350	GC	3	6	117670	117675	0 %	0 %	50 %	50 %	145301502
116	NC_009350	GC	3	6	117796	117801	0 %	0 %	50 %	50 %	145301502
117	NC_009350	GC	3	6	118713	118718	0 %	0 %	50 %	50 %	145301502
118	NC_009350	GC	3	6	118986	118991	0 %	0 %	50 %	50 %	145301502
119	NC_009350	AC	3	6	123361	123366	50 %	0 %	0 %	50 %	145301506
120	NC_009350	AC	3	6	123438	123443	50 %	0 %	0 %	50 %	145301506
121	NC_009350	CA	3	6	123854	123859	50 %	0 %	0 %	50 %	145301506
122	NC_009350	TC	3	6	124053	124058	0 %	50 %	0 %	50 %	145301506
123	NC_009350	TC	3	6	124396	124401	0 %	50 %	0 %	50 %	145301506
124	NC_009350	GT	3	6	128065	128070	0 %	50 %	50 %	0 %	145301509
125	NC_009350	CA	3	6	128590	128595	50 %	0 %	0 %	50 %	145301510
126	NC_009350	AT	3	6	128775	128780	50 %	50 %	0 %	0 %	145301511
127	NC_009350	CT	3	6	129211	129216	0 %	50 %	0 %	50 %	145301512
128	NC_009350	GC	3	6	129438	129443	0 %	0 %	50 %	50 %	145301513
129	NC_009350	TA	3	6	130226	130231	50 %	50 %	0 %	0 %	145301515
130	NC_009350	GC	3	6	133588	133593	0 %	0 %	50 %	50 %	145301516
131	NC_009350	CA	3	6	134225	134230	50 %	0 %	0 %	50 %	145301517
132	NC_009350	CG	3	6	135203	135208	0 %	0 %	50 %	50 %	145301518
133	NC_009350	AG	3	6	138226	138231	50 %	0 %	50 %	0 %	145301522
134	NC_009350	TC	3	6	138298	138303	0 %	50 %	0 %	50 %	145301522
135	NC_009350	TG	3	6	138690	138695	0 %	50 %	50 %	0 %	145301523
136	NC_009350	CT	3	6	139456	139461	0 %	50 %	0 %	50 %	145301524
137	NC_009350	AC	3	6	140492	140497	50 %	0 %	0 %	50 %	145301524
138	NC_009350	TG	4	8	142273	142280	0 %	50 %	50 %	0 %	145301527
139	NC_009350	TG	3	6	142320	142325	0 %	50 %	50 %	0 %	145301527
140	NC_009350	GA	3	6	142381	142386	50 %	0 %	50 %	0 %	145301527
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.