MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 336

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	TCCA	2	8	334	341	25 %	25 %	0 %	50 %	145301212
2	NC_009349	GGTG	2	8	1002	1009	0 %	25 %	75 %	0 %	145301212
3	NC_009349	GAAC	2	8	1101	1108	50 %	0 %	25 %	25 %	145301212
4	NC_009349	AGCA	2	8	1429	1436	50 %	0 %	25 %	25 %	145301212
5	NC_009349	ACCT	2	8	2115	2122	25 %	25 %	0 %	50 %	145301213
6	NC_009349	GTCA	2	8	2370	2377	25 %	25 %	25 %	25 %	145301213
7	NC_009349	TGGA	2	8	3412	3419	25 %	25 %	50 %	0 %	145301215
8	NC_009349	CAGC	2	8	4377	4384	25 %	0 %	25 %	50 %	145301216
9	NC_009349	CAAT	2	8	4695	4702	50 %	25 %	0 %	25 %	145301216
10	NC_009349	ATTG	2	8	4774	4781	25 %	50 %	25 %	0 %	145301216
11	NC_009349	TGTA	2	8	5235	5242	25 %	50 %	25 %	0 %	145301216
12	NC_009349	GTTG	2	8	6299	6306	0 %	50 %	50 %	0 %	145301217
13	NC_009349	ATGA	2	8	6802	6809	50 %	25 %	25 %	0 %	145301218
14	NC_009349	GCCT	2	8	7364	7371	0 %	25 %	25 %	50 %	145301219
15	NC_009349	CAGC	2	8	7671	7678	25 %	0 %	25 %	50 %	145301220
16	NC_009349	GGCG	2	8	8238	8245	0 %	0 %	75 %	25 %	145301220
17	NC_009349	GCTC	2	8	8288	8295	0 %	25 %	25 %	50 %	145301220
18	NC_009349	GCAG	2	8	8862	8869	25 %	0 %	50 %	25 %	145301220
19	NC_009349	CATC	2	8	9450	9457	25 %	25 %	0 %	50 %	145301221
20	NC_009349	TCAC	2	8	9530	9537	25 %	25 %	0 %	50 %	145301221
21	NC_009349	AGCG	2	8	9548	9555	25 %	0 %	50 %	25 %	145301221
22	NC_009349	AGGG	2	8	9681	9688	25 %	0 %	75 %	0 %	145301221
23	NC_009349	CGTG	2	8	10126	10133	0 %	25 %	50 %	25 %	145301222
24	NC_009349	AATG	2	8	10614	10621	50 %	25 %	25 %	0 %	145301223
25	NC_009349	CTGC	2	8	11191	11198	0 %	25 %	25 %	50 %	145301223
26	NC_009349	AAAT	2	8	12187	12194	75 %	25 %	0 %	0 %	145301224
27	NC_009349	GCTT	2	8	12277	12284	0 %	50 %	25 %	25 %	145301224
28	NC_009349	CTAT	2	8	12913	12920	25 %	50 %	0 %	25 %	145301224
29	NC_009349	TAAT	2	8	12991	12998	50 %	50 %	0 %	0 %	145301224
30	NC_009349	TGAA	2	8	13058	13065	50 %	25 %	25 %	0 %	145301224
31	NC_009349	CAGA	2	8	13314	13321	50 %	0 %	25 %	25 %	145301224
32	NC_009349	CTGA	2	8	13466	13473	25 %	25 %	25 %	25 %	145301224
33	NC_009349	AGTC	2	8	13718	13725	25 %	25 %	25 %	25 %	145301224
34	NC_009349	CAGA	2	8	13758	13765	50 %	0 %	25 %	25 %	145301224
35	NC_009349	ATTT	2	8	13787	13794	25 %	75 %	0 %	0 %	145301224
36	NC_009349	TGGA	2	8	14380	14387	25 %	25 %	50 %	0 %	145301225
37	NC_009349	CTGG	2	8	16051	16058	0 %	25 %	50 %	25 %	145301228
38	NC_009349	GCGA	2	8	16196	16203	25 %	0 %	50 %	25 %	145301228
39	NC_009349	GCGA	2	8	16214	16221	25 %	0 %	50 %	25 %	145301228
40	NC_009349	AATG	2	8	17581	17588	50 %	25 %	25 %	0 %	145301229
41	NC_009349	TTAA	2	8	18567	18574	50 %	50 %	0 %	0 %	145301230
42	NC_009349	GCCA	2	8	18908	18915	25 %	0 %	25 %	50 %	145301230
43	NC_009349	ATTT	2	8	19063	19070	25 %	75 %	0 %	0 %	145301230
44	NC_009349	GCAA	2	8	20406	20413	50 %	0 %	25 %	25 %	145301232
45	NC_009349	ATGG	2	8	21592	21599	25 %	25 %	50 %	0 %	145301233
46	NC_009349	ATCT	2	8	21647	21654	25 %	50 %	0 %	25 %	145301233
47	NC_009349	ACGA	2	8	22911	22918	50 %	0 %	25 %	25 %	145301235
48	NC_009349	TTAA	2	8	23582	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	145301236
49	NC_009349	CGGG	2	8	23804	23811	0 %	0 %	75 %	25 %	145301236
50	NC_009349	CAAA	2	8	23847	23854	75 %	0 %	0 %	25 %	145301236
51	NC_009349	CAGC	2	8	24003	24010	25 %	0 %	25 %	50 %	145301236
52	NC_009349	CCAT	2	8	24032	24039	25 %	25 %	0 %	50 %	145301236
53	NC_009349	TGGG	2	8	25962	25969	0 %	25 %	75 %	0 %	145301239
54	NC_009349	CCCG	2	8	26236	26243	0 %	0 %	25 %	75 %	145301240
55	NC_009349	TACT	2	8	26286	26293	25 %	50 %	0 %	25 %	145301240
56	NC_009349	CAGT	2	8	27626	27633	25 %	25 %	25 %	25 %	145301243
57	NC_009349	CGCT	2	8	27806	27813	0 %	25 %	25 %	50 %	145301243
58	NC_009349	ACAT	2	8	28010	28017	50 %	25 %	0 %	25 %	145301243
59	NC_009349	CATC	2	8	28517	28524	25 %	25 %	0 %	50 %	145301244
60	NC_009349	ACTG	2	8	29101	29108	25 %	25 %	25 %	25 %	145301244
61	NC_009349	CAGA	2	8	29414	29421	50 %	0 %	25 %	25 %	145301245
62	NC_009349	ATTC	2	8	30050	30057	25 %	50 %	0 %	25 %	145301246
63	NC_009349	TGCC	2	8	31316	31323	0 %	25 %	25 %	50 %	145301247
64	NC_009349	CTTT	2	8	31340	31347	0 %	75 %	0 %	25 %	145301247
65	NC_009349	CAAG	2	8	32460	32467	50 %	0 %	25 %	25 %	145301247
66	NC_009349	ATTC	2	8	32676	32683	25 %	50 %	0 %	25 %	145301247
67	NC_009349	TCCT	2	8	34377	34384	0 %	50 %	0 %	50 %	145301249
68	NC_009349	CCAG	2	8	35035	35042	25 %	0 %	25 %	50 %	145301250
69	NC_009349	CCAC	2	8	35061	35068	25 %	0 %	0 %	75 %	145301250
70	NC_009349	CGGC	2	8	35342	35349	0 %	0 %	50 %	50 %	145301250
71	NC_009349	GCAA	2	8	35403	35410	50 %	0 %	25 %	25 %	145301250
72	NC_009349	ACTT	2	8	35615	35622	25 %	50 %	0 %	25 %	145301250
73	NC_009349	CGGG	2	8	36284	36291	0 %	0 %	75 %	25 %	145301251
74	NC_009349	CGAG	2	8	37683	37690	25 %	0 %	50 %	25 %	145301253
75	NC_009349	CCTG	2	8	37771	37778	0 %	25 %	25 %	50 %	145301253
76	NC_009349	AGAT	2	8	41578	41585	50 %	25 %	25 %	0 %	145301258
77	NC_009349	CCAT	2	8	41726	41733	25 %	25 %	0 %	50 %	145301258
78	NC_009349	AGCG	2	8	43336	43343	25 %	0 %	50 %	25 %	145301260
79	NC_009349	ACAA	2	8	43457	43464	75 %	0 %	0 %	25 %	145301260
80	NC_009349	ATAA	2	8	43637	43644	75 %	25 %	0 %	0 %	145301260
81	NC_009349	GTTG	2	8	43951	43958	0 %	50 %	50 %	0 %	145301260
82	NC_009349	ATGT	2	8	44469	44476	25 %	50 %	25 %	0 %	145301262
83	NC_009349	GTAG	2	8	44805	44812	25 %	25 %	50 %	0 %	145301262
84	NC_009349	CAAA	2	8	44819	44826	75 %	0 %	0 %	25 %	145301262
85	NC_009349	AGAT	2	8	45025	45032	50 %	25 %	25 %	0 %	145301263
86	NC_009349	GCTG	2	8	45120	45127	0 %	25 %	50 %	25 %	145301263
87	NC_009349	ATTT	2	8	45310	45317	25 %	75 %	0 %	0 %	145301264
88	NC_009349	TGCT	2	8	46161	46168	0 %	50 %	25 %	25 %	145301264
89	NC_009349	AAGT	2	8	46445	46452	50 %	25 %	25 %	0 %	145301265
90	NC_009349	CTTG	2	8	46656	46663	0 %	50 %	25 %	25 %	145301265
91	NC_009349	GCCG	2	8	46718	46725	0 %	0 %	50 %	50 %	145301265
92	NC_009349	GGTG	2	8	46998	47005	0 %	25 %	75 %	0 %	145301265
93	NC_009349	CTGG	2	8	47025	47032	0 %	25 %	50 %	25 %	145301265
94	NC_009349	AAGG	2	8	47729	47736	50 %	0 %	50 %	0 %	145301266
95	NC_009349	TGAA	2	8	48000	48007	50 %	25 %	25 %	0 %	145301266
96	NC_009349	TTTG	2	8	48662	48669	0 %	75 %	25 %	0 %	145301267
97	NC_009349	TGAG	2	8	49213	49220	25 %	25 %	50 %	0 %	145301268
98	NC_009349	CAGC	2	8	49765	49772	25 %	0 %	25 %	50 %	145301269
99	NC_009349	GCCA	2	8	49835	49842	25 %	0 %	25 %	50 %	145301269
100	NC_009349	CCTG	2	8	50836	50843	0 %	25 %	25 %	50 %	145301271
101	NC_009349	GGTT	2	8	50986	50993	0 %	50 %	50 %	0 %	145301271
102	NC_009349	TGAA	2	8	51257	51264	50 %	25 %	25 %	0 %	145301271
103	NC_009349	TTCG	2	8	51502	51509	0 %	50 %	25 %	25 %	145301272
104	NC_009349	GCCA	2	8	51877	51884	25 %	0 %	25 %	50 %	145301272
105	NC_009349	GCCC	2	8	52407	52414	0 %	0 %	25 %	75 %	145301272
106	NC_009349	CTGT	2	8	52860	52867	0 %	50 %	25 %	25 %	145301272
107	NC_009349	TGAT	2	8	53919	53926	25 %	50 %	25 %	0 %	145301272
108	NC_009349	GAGT	2	8	54053	54060	25 %	25 %	50 %	0 %	145301272
109	NC_009349	AAGT	2	8	54107	54114	50 %	25 %	25 %	0 %	145301272
110	NC_009349	GATA	2	8	54222	54229	50 %	25 %	25 %	0 %	145301272
111	NC_009349	ATAA	2	8	54662	54669	75 %	25 %	0 %	0 %	145301272
112	NC_009349	AGGT	2	8	55235	55242	25 %	25 %	50 %	0 %	145301273
113	NC_009349	TCGG	2	8	55686	55693	0 %	25 %	50 %	25 %	145301273
114	NC_009349	GAGG	2	8	55787	55794	25 %	0 %	75 %	0 %	145301273
115	NC_009349	TTCA	2	8	55877	55884	25 %	50 %	0 %	25 %	145301273
116	NC_009349	CCAG	2	8	56139	56146	25 %	0 %	25 %	50 %	145301273
117	NC_009349	AGAT	2	8	56616	56623	50 %	25 %	25 %	0 %	145301274
118	NC_009349	CAGC	2	8	56947	56954	25 %	0 %	25 %	50 %	145301274
119	NC_009349	CACC	2	8	58304	58311	25 %	0 %	0 %	75 %	145301275
120	NC_009349	TGTC	2	8	58682	58689	0 %	50 %	25 %	25 %	145301275
121	NC_009349	TGCT	2	8	59605	59612	0 %	50 %	25 %	25 %	145301277
122	NC_009349	ACTG	2	8	59871	59878	25 %	25 %	25 %	25 %	145301277
123	NC_009349	AGGT	2	8	60143	60150	25 %	25 %	50 %	0 %	145301277
124	NC_009349	CGAA	2	8	60684	60691	50 %	0 %	25 %	25 %	145301278
125	NC_009349	CTTG	2	8	60821	60828	0 %	50 %	25 %	25 %	145301278
126	NC_009349	GGTC	2	8	61272	61279	0 %	25 %	50 %	25 %	145301278
127	NC_009349	CAGC	2	8	62790	62797	25 %	0 %	25 %	50 %	145301279
128	NC_009349	GTCG	2	8	62842	62849	0 %	25 %	50 %	25 %	145301279
129	NC_009349	GCCA	2	8	63005	63012	25 %	0 %	25 %	50 %	145301279
130	NC_009349	ACTC	2	8	63339	63346	25 %	25 %	0 %	50 %	145301279
131	NC_009349	CCGG	2	8	63551	63558	0 %	0 %	50 %	50 %	145301279
132	NC_009349	CCAG	2	8	64062	64069	25 %	0 %	25 %	50 %	145301280
133	NC_009349	CAGC	2	8	64329	64336	25 %	0 %	25 %	50 %	145301280
134	NC_009349	CTTG	2	8	64395	64402	0 %	50 %	25 %	25 %	145301280
135	NC_009349	TTCA	2	8	64652	64659	25 %	50 %	0 %	25 %	145301280
136	NC_009349	GCGT	2	8	65083	65090	0 %	25 %	50 %	25 %	145301281
137	NC_009349	ATCA	2	8	65127	65134	50 %	25 %	0 %	25 %	145301281
138	NC_009349	CTCC	2	8	66455	66462	0 %	25 %	0 %	75 %	145301281
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.