MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 1856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	TGC	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
2	NC_009349	CTC	2	6	346	351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301212
3	NC_009349	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301212
4	NC_009349	GCT	2	6	522	527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
5	NC_009349	GAG	2	6	532	537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301212
6	NC_009349	ACT	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301212
7	NC_009349	CGG	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301212
8	NC_009349	CTG	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
9	NC_009349	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
10	NC_009349	TCG	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
11	NC_009349	CTT	2	6	1056	1061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301212
12	NC_009349	AGC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
13	NC_009349	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
14	NC_009349	TGC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
15	NC_009349	AGC	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
16	NC_009349	CAA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
17	NC_009349	CAA	3	9	1842	1850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
18	NC_009349	CTG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
19	NC_009349	AGC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
20	NC_009349	TAC	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301213
21	NC_009349	CTG	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
22	NC_009349	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
23	NC_009349	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
24	NC_009349	CTG	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
25	NC_009349	GAT	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301213
26	NC_009349	CGA	2	6	2359	2364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
27	NC_009349	ACA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
28	NC_009349	AGC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301214
29	NC_009349	CAC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301214
30	NC_009349	TGA	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301214
31	NC_009349	CAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301215
32	NC_009349	TTA	3	9	3400	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301215
33	NC_009349	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
34	NC_009349	CCT	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
35	NC_009349	TAA	2	6	3528	3533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
36	NC_009349	TGG	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301215
37	NC_009349	CCT	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
38	NC_009349	AAT	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
39	NC_009349	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
40	NC_009349	TTG	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301215
41	NC_009349	CAG	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
42	NC_009349	CGT	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
43	NC_009349	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
44	NC_009349	TCA	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
45	NC_009349	TTA	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
46	NC_009349	TTG	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301216
47	NC_009349	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
48	NC_009349	GTC	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
49	NC_009349	TAT	2	6	4326	4331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
50	NC_009349	CAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301216
51	NC_009349	ATG	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
52	NC_009349	TGG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
53	NC_009349	TGG	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
54	NC_009349	GCT	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
55	NC_009349	TCC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301216
56	NC_009349	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
57	NC_009349	TCA	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
58	NC_009349	TGC	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
59	NC_009349	TGG	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
60	NC_009349	GGC	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301217
61	NC_009349	TCA	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301217
62	NC_009349	TTG	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301217
63	NC_009349	GTC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301217
64	NC_009349	GAT	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
65	NC_009349	TGA	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
66	NC_009349	AGG	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301217
67	NC_009349	GAG	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301218
68	NC_009349	CTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301218
69	NC_009349	TGG	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301218
70	NC_009349	ACC	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301218
71	NC_009349	CGG	2	6	7320	7325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301219
72	NC_009349	TGC	2	6	7436	7441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301219
73	NC_009349	TGG	2	6	7491	7496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
74	NC_009349	CGA	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301219
75	NC_009349	GTG	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
76	NC_009349	AGC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
77	NC_009349	CTG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
78	NC_009349	GTC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
79	NC_009349	GCC	3	9	8016	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
80	NC_009349	ATG	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
81	NC_009349	CTG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
82	NC_009349	GCC	2	6	8127	8132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
83	NC_009349	GGT	2	6	8184	8189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
84	NC_009349	ACC	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
85	NC_009349	GGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
86	NC_009349	GGC	2	6	8318	8323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
87	NC_009349	CTG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
88	NC_009349	GAA	2	6	8353	8358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301220
89	NC_009349	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
90	NC_009349	CGG	2	6	8467	8472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
91	NC_009349	AAC	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301220
92	NC_009349	CGG	2	6	8732	8737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
93	NC_009349	GCC	2	6	8743	8748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
94	NC_009349	CCA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
95	NC_009349	GGC	2	6	8914	8919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
96	NC_009349	GAT	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
97	NC_009349	GGC	2	6	8962	8967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
98	NC_009349	GCA	2	6	9036	9041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
99	NC_009349	CAG	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
100	NC_009349	TGC	2	6	9290	9295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301221
101	NC_009349	TGA	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301221
102	NC_009349	CAT	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301221
103	NC_009349	GTT	2	6	9693	9698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301221
104	NC_009349	ACA	2	6	9702	9707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301221
105	NC_009349	GCA	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301221
106	NC_009349	TGA	2	6	9788	9793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301221
107	NC_009349	GGT	2	6	9798	9803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301221
108	NC_009349	TCT	2	6	9830	9835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301221
109	NC_009349	TAT	2	6	9876	9881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301221
110	NC_009349	GCG	2	6	9906	9911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301221
111	NC_009349	CCA	2	6	9930	9935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301221
112	NC_009349	AAT	2	6	9972	9977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301222
113	NC_009349	TCG	2	6	10047	10052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301222
114	NC_009349	GCT	2	6	10085	10090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301222
115	NC_009349	ACC	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301222
116	NC_009349	AAT	2	6	10250	10255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301223
117	NC_009349	TGT	2	6	10283	10288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301223
118	NC_009349	GCA	2	6	10335	10340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301223
119	NC_009349	CTG	2	6	10366	10371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301223
120	NC_009349	AGC	2	6	10497	10502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301223
121	NC_009349	AAT	2	6	10784	10789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301223
122	NC_009349	AAT	2	6	10841	10846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301223
123	NC_009349	TCC	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301223
124	NC_009349	TGG	2	6	10863	10868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301223
125	NC_009349	GTT	2	6	10876	10881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301223
126	NC_009349	TCG	2	6	10925	10930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301223
127	NC_009349	CAA	2	6	10936	10941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301223
128	NC_009349	CAC	2	6	10972	10977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301223
129	NC_009349	CAA	2	6	11053	11058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301223
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377	NC_009349	CAT	2	6	36005	36010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301251
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