MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 2645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	TGC	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
2	NC_009349	CT	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	145301212
3	NC_009349	TCCA	2	8	334	341	25 %	25 %	0 %	50 %	145301212
4	NC_009349	CTC	2	6	346	351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301212
5	NC_009349	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301212
6	NC_009349	GCT	2	6	522	527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
7	NC_009349	GAG	2	6	532	537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301212
8	NC_009349	ACT	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301212
9	NC_009349	CGG	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301212
10	NC_009349	CTG	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
11	NC_009349	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
12	NC_009349	CAAGGC	2	12	987	998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
13	NC_009349	GGTG	2	8	1002	1009	0 %	25 %	75 %	0 %	145301212
14	NC_009349	TCG	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
15	NC_009349	CTT	2	6	1056	1061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301212
16	NC_009349	GAAC	2	8	1101	1108	50 %	0 %	25 %	25 %	145301212
17	NC_009349	GGTCAA	2	12	1227	1238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301212
18	NC_009349	AGC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
19	NC_009349	AC	3	6	1325	1330	50 %	0 %	0 %	50 %	145301212
20	NC_009349	AGCA	2	8	1429	1436	50 %	0 %	25 %	25 %	145301212
21	NC_009349	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
22	NC_009349	TGC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
23	NC_009349	AGC	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
24	NC_009349	CAA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
25	NC_009349	CAA	3	9	1842	1850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
26	NC_009349	CTG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
27	NC_009349	CGAACA	2	12	1910	1921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301213
28	NC_009349	AGC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
29	NC_009349	CTGTGG	2	12	2099	2110	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301213
30	NC_009349	ACCT	2	8	2115	2122	25 %	25 %	0 %	50 %	145301213
31	NC_009349	TAC	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301213
32	NC_009349	CTG	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
33	NC_009349	TGAGC	2	10	2198	2207	20 %	20 %	40 %	20 %	145301213
34	NC_009349	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
35	NC_009349	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
36	NC_009349	CTG	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
37	NC_009349	GAT	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301213
38	NC_009349	CGA	2	6	2359	2364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
39	NC_009349	GTCA	2	8	2370	2377	25 %	25 %	25 %	25 %	145301213
40	NC_009349	ACA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
41	NC_009349	AGC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301214
42	NC_009349	CAC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301214
43	NC_009349	TGA	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301214
44	NC_009349	CAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301215
45	NC_009349	TTA	3	9	3400	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301215
46	NC_009349	TGGA	2	8	3412	3419	25 %	25 %	50 %	0 %	145301215
47	NC_009349	AT	3	6	3421	3426	50 %	50 %	0 %	0 %	145301215
48	NC_009349	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
49	NC_009349	CCT	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
50	NC_009349	TAA	2	6	3528	3533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
51	NC_009349	TGG	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301215
52	NC_009349	TGTAT	2	10	3555	3564	20 %	60 %	20 %	0 %	145301215
53	NC_009349	CCT	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
54	NC_009349	G	7	7	3704	3710	0 %	0 %	100 %	0 %	145301215
55	NC_009349	AAT	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
56	NC_009349	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
57	NC_009349	TTG	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301215
58	NC_009349	CAG	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
59	NC_009349	CGT	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
60	NC_009349	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
61	NC_009349	TCA	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
62	NC_009349	T	7	7	4143	4149	0 %	100 %	0 %	0 %	145301216
63	NC_009349	TTA	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
64	NC_009349	TTG	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301216
65	NC_009349	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
66	NC_009349	GTC	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
67	NC_009349	TAT	2	6	4326	4331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
68	NC_009349	CAGC	2	8	4377	4384	25 %	0 %	25 %	50 %	145301216
69	NC_009349	CAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301216
70	NC_009349	TTGGT	2	10	4495	4504	0 %	60 %	40 %	0 %	145301216
71	NC_009349	ATG	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
72	NC_009349	TGG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
73	NC_009349	TGG	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
74	NC_009349	GCT	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
75	NC_009349	CAAT	2	8	4695	4702	50 %	25 %	0 %	25 %	145301216
76	NC_009349	TCC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301216
77	NC_009349	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
78	NC_009349	TCA	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
79	NC_009349	ATTG	2	8	4774	4781	25 %	50 %	25 %	0 %	145301216
80	NC_009349	AC	3	6	4877	4882	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
81	NC_009349	TGC	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
82	NC_009349	AG	3	6	4935	4940	50 %	0 %	50 %	0 %	145301216
83	NC_009349	TGG	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
84	NC_009349	AC	3	6	5135	5140	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
85	NC_009349	TGTA	2	8	5235	5242	25 %	50 %	25 %	0 %	145301216
86	NC_009349	GGCAG	2	10	5276	5285	20 %	0 %	60 %	20 %	145301216
87	NC_009349	GGC	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301217
88	NC_009349	TCA	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301217
89	NC_009349	TTG	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301217
90	NC_009349	GTC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301217
91	NC_009349	GTTG	2	8	6299	6306	0 %	50 %	50 %	0 %	145301217
92	NC_009349	GAT	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
93	NC_009349	TGA	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
94	NC_009349	CTCAC	2	10	6543	6552	20 %	20 %	0 %	60 %	145301217
95	NC_009349	AGG	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301217
96	NC_009349	GAG	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301218
97	NC_009349	ATGA	2	8	6802	6809	50 %	25 %	25 %	0 %	145301218
98	NC_009349	CTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301218
99	NC_009349	TGG	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301218
100	NC_009349	ACC	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301218
101	NC_009349	CGG	2	6	7320	7325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301219
102	NC_009349	GCCT	2	8	7364	7371	0 %	25 %	25 %	50 %	145301219
103	NC_009349	A	6	6	7391	7396	100 %	0 %	0 %	0 %	145301219
104	NC_009349	TGC	2	6	7436	7441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301219
105	NC_009349	GC	3	6	7456	7461	0 %	0 %	50 %	50 %	145301219
106	NC_009349	TGG	2	6	7491	7496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
107	NC_009349	CGA	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301219
108	NC_009349	GTG	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
109	NC_009349	AGC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
110	NC_009349	CAGC	2	8	7671	7678	25 %	0 %	25 %	50 %	145301220
111	NC_009349	CTG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
112	NC_009349	GTC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
113	NC_009349	GCC	3	9	8016	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
114	NC_009349	ATG	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
115	NC_009349	CTG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
116	NC_009349	GCC	2	6	8127	8132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
117	NC_009349	GGT	2	6	8184	8189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
118	NC_009349	GGCG	2	8	8238	8245	0 %	0 %	75 %	25 %	145301220
119	NC_009349	ACC	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
120	NC_009349	GCTC	2	8	8288	8295	0 %	25 %	25 %	50 %	145301220
121	NC_009349	GGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
122	NC_009349	GGC	2	6	8318	8323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
123	NC_009349	CTG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
124	NC_009349	GAA	2	6	8353	8358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301220
125	NC_009349	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
126	NC_009349	CGG	2	6	8467	8472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
127	NC_009349	AAC	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301220
128	NC_009349	AT	3	6	8654	8659	50 %	50 %	0 %	0 %	145301220
129	NC_009349	AG	3	6	8662	8667	50 %	0 %	50 %	0 %	145301220
130	NC_009349	CGG	2	6	8732	8737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
131	NC_009349	GCC	2	6	8743	8748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
132	NC_009349	CCA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
133	NC_009349	C	6	6	8856	8861	0 %	0 %	0 %	100 %	145301220
134	NC_009349	GCAG	2	8	8862	8869	25 %	0 %	50 %	25 %	145301220
135	NC_009349	GGC	2	6	8914	8919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
136	NC_009349	GAT	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
137	NC_009349	CCCCT	2	10	8942	8951	0 %	20 %	0 %	80 %	145301220
138	NC_009349	GGC	2	6	8962	8967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
139	NC_009349	GCA	2	6	9036	9041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
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142	NC_009349	G	7	7	9372	9378	0 %	0 %	100 %	0 %	145301221
143	NC_009349	TGA	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301221
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147	NC_009349	AGCG	2	8	9548	9555	25 %	0 %	50 %	25 %	145301221
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150	NC_009349	AGGG	2	8	9681	9688	25 %	0 %	75 %	0 %	145301221
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158	NC_009349	GCG	2	6	9906	9911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301221
159	NC_009349	CCA	2	6	9930	9935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301221
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246	NC_009349	TGGA	2	8	14380	14387	25 %	25 %	50 %	0 %	145301225
247	NC_009349	AG	3	6	14396	14401	50 %	0 %	50 %	0 %	145301225
248	NC_009349	GCA	2	6	14402	14407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301225
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251	NC_009349	GAT	2	6	14514	14519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301225
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253	NC_009349	CAA	2	6	15140	15145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301226
254	NC_009349	GCC	2	6	15150	15155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301226
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256	NC_009349	G	6	6	15328	15333	0 %	0 %	100 %	0 %	145301226
257	NC_009349	GAT	2	6	15353	15358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301226
258	NC_009349	CCA	2	6	15368	15373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301226
259	NC_009349	ATGCC	2	10	15380	15389	20 %	20 %	20 %	40 %	145301226
260	NC_009349	ATA	2	6	15646	15651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301227
261	NC_009349	TCC	2	6	15659	15664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301227
262	NC_009349	AGA	2	6	15745	15750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301227
263	NC_009349	ATT	2	6	15752	15757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301227
264	NC_009349	GCA	2	6	15758	15763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301227
265	NC_009349	T	7	7	15786	15792	0 %	100 %	0 %	0 %	145301227
266	NC_009349	AGG	2	6	15869	15874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301228
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268	NC_009349	ATA	2	6	15961	15966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301228
269	NC_009349	CAT	2	6	15971	15976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301228
270	NC_009349	CAT	2	6	16020	16025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301228
271	NC_009349	CTGG	2	8	16051	16058	0 %	25 %	50 %	25 %	145301228
272	NC_009349	CTG	2	6	16108	16113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301228
273	NC_009349	AGT	2	6	16172	16177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301228
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275	NC_009349	GCGA	2	8	16214	16221	25 %	0 %	50 %	25 %	145301228
276	NC_009349	GTT	2	6	16245	16250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301228
277	NC_009349	GA	3	6	16321	16326	50 %	0 %	50 %	0 %	145301228
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281	NC_009349	TCA	3	9	16443	16451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301229
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286	NC_009349	CA	3	6	16810	16815	50 %	0 %	0 %	50 %	145301229
287	NC_009349	CTG	2	6	17006	17011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301229
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289	NC_009349	TGG	2	6	17088	17093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301229
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295	NC_009349	CAT	2	6	17200	17205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301229
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297	NC_009349	ATG	2	6	17250	17255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301229
298	NC_009349	GCT	2	6	17305	17310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301229
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302	NC_009349	AATG	2	8	17581	17588	50 %	25 %	25 %	0 %	145301229
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376	NC_009349	CA	3	6	23447	23452	50 %	0 %	0 %	50 %	145301236
377	NC_009349	GGT	2	6	23464	23469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301236
378	NC_009349	CTT	2	6	23526	23531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301236
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380	NC_009349	GAT	2	6	23635	23640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301236
381	NC_009349	CGGG	2	8	23804	23811	0 %	0 %	75 %	25 %	145301236
382	NC_009349	CAAA	2	8	23847	23854	75 %	0 %	0 %	25 %	145301236
383	NC_009349	CTG	2	6	23943	23948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301236
384	NC_009349	A	6	6	23961	23966	100 %	0 %	0 %	0 %	145301236
385	NC_009349	CAGC	2	8	24003	24010	25 %	0 %	25 %	50 %	145301236
386	NC_009349	CCAT	2	8	24032	24039	25 %	25 %	0 %	50 %	145301236
387	NC_009349	TCT	3	9	24057	24065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301236
388	NC_009349	TGA	2	6	24141	24146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301236
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390	NC_009349	CTG	2	6	24510	24515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301237
391	NC_009349	TTG	2	6	24584	24589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301237
392	NC_009349	CT	4	8	25337	25344	0 %	50 %	0 %	50 %	145301238
393	NC_009349	CATCA	2	10	25412	25421	40 %	20 %	0 %	40 %	145301238
394	NC_009349	CCG	2	6	25442	25447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301238
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398	NC_009349	TGG	2	6	25987	25992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301239
399	NC_009349	CGC	2	6	26045	26050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301239
400	NC_009349	A	6	6	26084	26089	100 %	0 %	0 %	0 %	145301239
401	NC_009349	TTG	2	6	26194	26199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301240
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414	NC_009349	CTT	2	6	26989	26994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301242
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