MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 2181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009348	GGCCGA	3	18	4269855	4269872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145300835
2002	NC_009348	CAGGAA	2	12	4270090	4270101	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	145300835
2003	NC_009348	CATGAA	2	12	4271690	4271701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145300836
2004	NC_009348	AGCCGT	2	12	4278130	4278141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145300840
2005	NC_009348	TCTCCT	2	12	4278436	4278447	0 %	50 %	0 %	50 %	145300840
2006	NC_009348	CGATGA	2	12	4278775	4278786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300840
2007	NC_009348	CCGCCA	2	12	4279060	4279071	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145300840
2008	NC_009348	GCTGGC	2	12	4282547	4282558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145300844
2009	NC_009348	CACGGC	2	12	4282830	4282841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145300844
2010	NC_009348	CGACAA	2	12	4283384	4283395	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145300844
2011	NC_009348	CCTGGT	2	12	4283772	4283783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145300845
2012	NC_009348	TAGGTG	2	12	4286636	4286647	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	145300848
2013	NC_009348	TCCGGC	2	12	4293659	4293670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145300855
2014	NC_009348	TGGCCC	2	12	4295589	4295600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145300856
2015	NC_009348	CCTGGA	2	12	4295905	4295916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145300856
2016	NC_009348	CCAGAA	2	12	4300220	4300231	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145300858
2017	NC_009348	CCAGCA	2	12	4303135	4303146	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145300860
2018	NC_009348	GATGGC	2	12	4303614	4303625	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145300861
2019	NC_009348	GACCCT	2	12	4303777	4303788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145300862
2020	NC_009348	CAGCGG	2	12	4308406	4308417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145300867
2021	NC_009348	GAAGAG	2	12	4310716	4310727	50 %	0 %	50 %	0 %	145300869
2022	NC_009348	CGAAGT	2	12	4311803	4311814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300871
2023	NC_009348	TGCCGG	2	12	4316825	4316836	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145300875
2024	NC_009348	CGCCAG	2	12	4317531	4317542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145300875
2025	NC_009348	GCGCCG	2	12	4318057	4318068	0 %	0 %	50 %	50 %	145300876
2026	NC_009348	CCAGCC	2	12	4318765	4318776	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145300876
2027	NC_009348	CATCTG	2	12	4324961	4324972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145300878
2028	NC_009348	CTACCT	2	12	4328267	4328278	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	145300881
2029	NC_009348	AGCTCA	2	12	4328536	4328547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145300881
2030	NC_009348	ATGCCA	2	12	4330746	4330757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145300883
2031	NC_009348	GCTGGT	2	12	4332811	4332822	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145300886
2032	NC_009348	CCAGCG	2	12	4333771	4333782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145300887
2033	NC_009348	TCGCCC	2	12	4333785	4333796	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	145300887
2034	NC_009348	ATCGAG	2	12	4335578	4335589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300889
2035	NC_009348	TGCCGA	2	12	4340290	4340301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145300894
2036	NC_009348	GCCTGA	2	12	4342355	4342366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145300896
2037	NC_009348	GAGCTG	2	12	4346100	4346111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145300899
2038	NC_009348	GCTCCG	2	12	4346432	4346443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145300899
2039	NC_009348	TATGAA	2	12	4346456	4346467	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	145300899
2040	NC_009348	CAGCAC	2	12	4351465	4351476	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145300903
2041	NC_009348	CTCAGG	2	12	4351986	4351997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145300904
2042	NC_009348	CAAGGC	2	12	4355345	4355356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145300906
2043	NC_009348	GGTCAA	2	12	4355585	4355596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300906
2044	NC_009348	CGAACA	2	12	4356268	4356279	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145300907
2045	NC_009348	CTGTGG	2	12	4356457	4356468	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145300907
2046	NC_009348	TAAGCT	2	12	4366721	4366732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145300911
2047	NC_009348	ACCACG	2	12	4369544	4369555	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145300916
2048	NC_009348	CAGACC	2	12	4369705	4369716	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145300917
2049	NC_009348	ACCGTA	2	12	4370146	4370157	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145300918
2050	NC_009348	CCCTTG	2	12	4370728	4370739	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145300920
2051	NC_009348	GTTGCA	2	12	4371795	4371806	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145300922
2052	NC_009348	ACGCAG	2	12	4375879	4375890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145300932
2053	NC_009348	CTTGCT	2	12	4376293	4376304	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145300932
2054	NC_009348	CGCTGG	2	12	4379149	4379160	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145300937
2055	NC_009348	TCATCT	2	12	4379419	4379430	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	145300937
2056	NC_009348	GGGCTG	2	12	4379499	4379510	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145300937
2057	NC_009348	CAGCCG	2	12	4379851	4379862	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145300938
2058	NC_009348	GGGCTT	2	12	4385579	4385590	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145300944
2059	NC_009348	GGTCAG	2	12	4390235	4390246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145300950
2060	NC_009348	TCCGGC	2	12	4391378	4391389	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145300952
2061	NC_009348	AACAGC	2	12	4393350	4393361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145300953
2062	NC_009348	AGCTGA	2	12	4393440	4393451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300953
2063	NC_009348	CCGGTG	2	12	4400379	4400390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145300959
2064	NC_009348	CCATCG	2	12	4400610	4400621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145300959
2065	NC_009348	GCTGCC	2	12	4404960	4404971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145300962
2066	NC_009348	ATCTGG	2	12	4405631	4405642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145300962
2067	NC_009348	CAATGG	2	12	4407508	4407519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300963
2068	NC_009348	TGCACC	2	12	4408223	4408234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145300964
2069	NC_009348	GCCGAT	2	12	4411291	4411302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145300966
2070	NC_009348	GCATCG	2	12	4417817	4417828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145300971
2071	NC_009348	GCGCCT	2	12	4419261	4419272	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145300972
2072	NC_009348	CTCCCG	2	12	4425065	4425076	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	145300979
2073	NC_009348	CTGCAA	2	12	4425713	4425724	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145300979
2074	NC_009348	ATCAGG	2	12	4426264	4426275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300980
2075	NC_009348	TCAGAG	2	12	4426990	4427001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145300981
2076	NC_009348	TCCTTG	2	12	4429836	4429847	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145300985
2077	NC_009348	TGGCGG	2	12	4435368	4435379	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145300990
2078	NC_009348	CTCCTG	2	12	4437704	4437715	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145300991
2079	NC_009348	GGAGAG	2	12	4440307	4440318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145300995
2080	NC_009348	GCCAGC	2	12	4440622	4440633	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145300996
2081	NC_009348	CCTTCA	2	12	4441370	4441381	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	145300996
2082	NC_009348	CCTGAT	2	12	4441897	4441908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145300997
2083	NC_009348	TGCCAT	2	12	4442693	4442704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145300998
2084	NC_009348	CTCCCA	2	12	4449321	4449332	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	145301004
2085	NC_009348	TGGCCA	2	12	4452675	4452686	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145301006
2086	NC_009348	CACCGC	2	12	4452745	4452756	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145301006
2087	NC_009348	TTCGGC	2	12	4455118	4455129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301007
2088	NC_009348	CCATCG	2	12	4455224	4455235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301007
2089	NC_009348	TCGGCA	2	12	4455347	4455358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145301007
2090	NC_009348	GCTTCG	2	12	4457785	4457796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301009
2091	NC_009348	CCAGCA	2	12	4468149	4468160	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301020
2092	NC_009348	TCACCA	2	12	4470695	4470706	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	145301021
2093	NC_009348	GTCTGC	2	12	4473059	4473070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301023
2094	NC_009348	GTGCGG	2	12	4474692	4474703	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145301025
2095	NC_009348	CGCCAG	2	12	4477046	4477057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145301027
2096	NC_009348	GCTGGC	2	12	4492109	4492120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301032
2097	NC_009348	TGCCAA	2	12	4492406	4492417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301032
2098	NC_009348	ATGCCA	2	12	4493336	4493347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301034
2099	NC_009348	TGCTGA	2	12	4496516	4496527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301037
2100	NC_009348	CTGGTT	2	12	4497032	4497043	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	145301038
2101	NC_009348	TGGTCG	2	12	4497052	4497063	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301038
2102	NC_009348	GGGCTG	2	12	4498227	4498238	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145301038
2103	NC_009348	GGGAAG	2	12	4502638	4502649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301043
2104	NC_009348	AGGTGC	2	12	4511376	4511387	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145301053
2105	NC_009348	TGAAGT	2	12	4512279	4512290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301054
2106	NC_009348	GTACTC	2	12	4516192	4516203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145301057
2107	NC_009348	GGGAGC	2	12	4516212	4516223	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	145301057
2108	NC_009348	CATGCA	2	12	4524621	4524632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301068
2109	NC_009348	ACCCAG	2	12	4525439	4525450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301070
2110	NC_009348	ATCGGT	2	12	4525877	4525888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301070
2111	NC_009348	GGGGCC	2	12	4531383	4531394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301075
2112	NC_009348	GGGGCT	2	12	4533479	4533490	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145301075
2113	NC_009348	ATCCCC	2	12	4541009	4541020	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	145301077
2114	NC_009348	CCCAGC	2	12	4542985	4542996	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145301079
2115	NC_009348	TCAAGC	2	12	4545281	4545292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301080
2116	NC_009348	GCGCTG	2	12	4546786	4546797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301081
2117	NC_009348	CTACGA	2	12	4548519	4548530	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301082
2118	NC_009348	TGGCCG	2	12	4548719	4548730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301082
2119	NC_009348	CGGCTG	2	12	4551026	4551037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301084
2120	NC_009348	GAGCTG	2	12	4551095	4551106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145301084
2121	NC_009348	GCCCAC	2	12	4551497	4551508	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145301084
2122	NC_009348	CTGGCT	2	12	4552126	4552137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301085
2123	NC_009348	CTGCAG	2	12	4555745	4555756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145301091
2124	NC_009348	CCGCTG	2	12	4556420	4556431	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145301091
2125	NC_009348	TCGGCA	2	12	4558032	4558043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145301092
2126	NC_009348	TGGATC	2	12	4558125	4558136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301092
2127	NC_009348	GTGATG	2	12	4558601	4558612	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	145301092
2128	NC_009348	CGTACC	2	12	4561542	4561553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301096
2129	NC_009348	TCTTGC	2	12	4562339	4562350	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145301097
2130	NC_009348	AGCCCG	2	12	4566779	4566790	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145301100
2131	NC_009348	CTTCAC	2	12	4567867	4567878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	145301102
2132	NC_009348	TCCAGC	2	12	4571983	4571994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301104
2133	NC_009348	TCATGA	2	12	4575862	4575873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145301107
2134	NC_009348	ATGAAG	2	12	4579055	4579066	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	145301110
2135	NC_009348	GCTGGG	2	12	4581200	4581211	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145301112
2136	NC_009348	CAGGGC	2	12	4583567	4583578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145301115
2137	NC_009348	AGCAAC	2	12	4584420	4584431	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301116
2138	NC_009348	GCCCAG	2	12	4585523	4585534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145301118
2139	NC_009348	CCTGAA	2	12	4588415	4588426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301119
2140	NC_009348	GCAACA	2	12	4596055	4596066	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301126
2141	NC_009348	TGACCC	2	12	4597481	4597492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301127
2142	NC_009348	ATCCAG	2	12	4601508	4601519	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301131
2143	NC_009348	CTCCTT	2	12	4604657	4604668	0 %	50 %	0 %	50 %	145301133
2144	NC_009348	CCAGCA	2	12	4610535	4610546	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301140
2145	NC_009348	CCTTGT	2	12	4610589	4610600	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145301140
2146	NC_009348	CAGATC	2	12	4620045	4620056	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301142
2147	NC_009348	GCTTGG	2	12	4620183	4620194	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301143
2148	NC_009348	GCACCT	2	12	4620567	4620578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301143
2149	NC_009348	CCTGCT	2	12	4622862	4622873	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145301146
2150	NC_009348	CCACAG	2	12	4629702	4629713	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301152
2151	NC_009348	TTGACC	2	12	4630574	4630585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145301153
2152	NC_009348	GCCTTG	2	12	4630814	4630825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301153
2153	NC_009348	TTGAGC	2	12	4646653	4646664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301164
2154	NC_009348	GCAGTG	2	12	4646786	4646797	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145301164
2155	NC_009348	CTCGGC	2	12	4646817	4646828	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145301164
2156	NC_009348	TCGGTG	2	12	4647742	4647753	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301164
2157	NC_009348	TGACGC	2	12	4649685	4649696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145301166
2158	NC_009348	CTTCCA	2	12	4654251	4654262	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	145301170
2159	NC_009348	TCATCT	2	12	4654631	4654642	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	145301170
2160	NC_009348	ACGGGC	2	12	4655654	4655665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145301172
2161	NC_009348	TGACCT	2	12	4656729	4656740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145301172
2162	NC_009348	TGCTTC	2	12	4658026	4658037	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145301174
2163	NC_009348	CCCGTT	2	12	4659882	4659893	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145301176
2164	NC_009348	TTGGCC	2	12	4660184	4660195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301176
2165	NC_009348	GTGCTG	2	12	4662923	4662934	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301180
2166	NC_009348	GCTCCA	2	12	4664904	4664915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301183
2167	NC_009348	CTGCAC	2	12	4665364	4665375	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301183
2168	NC_009348	ATCGCA	2	12	4668520	4668531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301185
2169	NC_009348	GCCCAT	2	12	4672267	4672278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301187
2170	NC_009348	GCCATC	2	12	4672279	4672290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301187
2171	NC_009348	GCTGGC	2	12	4674448	4674459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301189
2172	NC_009348	ATGTCG	2	12	4678490	4678501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301191
2173	NC_009348	CCAGTA	2	12	4681732	4681743	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301195
2174	NC_009348	TTGCTG	2	12	4682681	4682692	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	145301195
2175	NC_009348	AGCACC	2	12	4683653	4683664	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301196
2176	NC_009348	ATCCGT	2	12	4687196	4687207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145301198
2177	NC_009348	GCACCA	3	18	4689863	4689880	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301200
2178	NC_009348	GCTGGC	2	12	4693391	4693402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301200
2179	NC_009348	CCTTCT	2	12	4697873	4697884	0 %	50 %	0 %	50 %	145301204
2180	NC_009348	GCGCTT	2	12	4699806	4699817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301207
2181	NC_009348	TGCCGG	2	12	4700734	4700745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301208

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.