MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009053	TAATTT	2	12	3069	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207491
2	NC_009053	ACCGCC	2	12	4169	4180	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126207492
3	NC_009053	ATGATC	2	12	4631	4642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126207492
4	NC_009053	GGTGCG	2	12	5392	5403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126207493
5	NC_009053	AAAGCG	2	12	8867	8878	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126207496
6	NC_009053	ACGGTT	2	12	9075	9086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207496
7	NC_009053	TGGCGA	2	12	12796	12807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126207500
8	NC_009053	TACGGT	2	12	13224	13235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207500
9	NC_009053	AAGGCG	2	12	13405	13416	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126207500
10	NC_009053	CACCGA	2	12	13676	13687	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126207500
11	NC_009053	ATTTAG	2	12	16642	16653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126207502
12	NC_009053	ATAAAG	2	12	18141	18152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126207504
13	NC_009053	ATGAAT	2	12	18579	18590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126207504
14	NC_009053	TATCGG	2	12	21948	21959	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207507
15	NC_009053	TTGCGG	2	12	22241	22252	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126207507
16	NC_009053	CTTACA	2	12	22422	22433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207507
17	NC_009053	TTCCGT	2	12	24910	24921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126207509
18	NC_009053	CAAGCG	2	12	25605	25616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207510
19	NC_009053	TTCAGG	2	12	29615	29626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207513
20	NC_009053	TAAACT	2	12	31924	31935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126207514
21	NC_009053	CCCATT	2	12	32275	32286	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126207515
22	NC_009053	TTTCCA	2	12	37001	37012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126207518
23	NC_009053	GTATCG	2	12	38923	38934	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207521
24	NC_009053	CTTCCG	2	12	50743	50754	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126207532
25	NC_009053	TCATAT	2	12	52929	52940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126207534
26	NC_009053	AGCAAA	2	12	53093	53104	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126207534
27	NC_009053	ATTTGG	2	12	53261	53272	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126207534
28	NC_009053	TCCGCA	2	12	54461	54472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126207535
29	NC_009053	TTAGCA	2	12	55630	55641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126207537
30	NC_009053	GGCGTA	2	12	55693	55704	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126207537
31	NC_009053	GGTTAC	2	12	55987	55998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207537
32	NC_009053	TTTACG	2	12	58357	58368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126207540
33	NC_009053	ATCGGT	2	12	59464	59475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207541
34	NC_009053	AACGGT	2	12	59508	59519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126207541
35	NC_009053	AACCGT	2	12	61499	61510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126207543
36	NC_009053	GGTGAG	2	12	62341	62352	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	126207544
37	NC_009053	TTTTAT	2	12	63845	63856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	126207546
38	NC_009053	TTACGT	2	12	66151	66162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126207548
39	NC_009053	GAAAGC	2	12	76059	76070	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126207551
40	NC_009053	AAAGCC	2	12	77829	77840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126207552
41	NC_009053	GCAAAA	2	12	79204	79215	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126207553
42	NC_009053	GCGATT	3	18	80061	80078	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207554
43	NC_009053	TGCCGG	2	12	80162	80173	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126207554
44	NC_009053	TTACCG	2	12	87007	87018	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126207564
45	NC_009053	TTTTTC	2	12	87405	87416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	126207564
46	NC_009053	GGTTTT	2	12	87439	87450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207564
47	NC_009053	TCGACT	2	12	87538	87549	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126207564
48	NC_009053	TCCGGC	2	12	87553	87564	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126207564
49	NC_009053	CTGCGA	2	12	90446	90457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126207569
50	NC_009053	AAAGGC	2	12	92806	92817	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126207572
51	NC_009053	CGGTTG	2	12	92864	92875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126207572
52	NC_009053	TTTTTC	2	12	95685	95696	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	126207576
53	NC_009053	TCGCTT	2	12	95915	95926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126207576
54	NC_009053	ACCGAT	2	12	101453	101464	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126207584
55	NC_009053	TAAATG	2	12	101654	101665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126207584
56	NC_009053	AAATCC	2	12	104936	104947	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126207587
57	NC_009053	CAATAT	3	18	105072	105089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126207587
58	NC_009053	AGTAAA	2	12	110544	110555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126207592
59	NC_009053	CTATTG	2	12	111187	111198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126207592
60	NC_009053	ATACTA	2	12	111367	111378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126207592
61	NC_009053	TGTAAA	2	12	112760	112771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126207592
62	NC_009053	CAAATG	3	18	113083	113100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126207592
63	NC_009053	TGCGAT	2	12	113276	113287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207592
64	NC_009053	ATACGG	2	12	115132	115143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126207592
65	NC_009053	AATTGC	2	12	120477	120488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126207593
66	NC_009053	CGCAAT	2	12	121872	121883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126207594
67	NC_009053	AAACCG	2	12	122335	122346	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126207594
68	NC_009053	GTTTCC	2	12	125047	125058	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126207594
69	NC_009053	TCCGGA	2	12	130387	130398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126207600
70	NC_009053	ACGATT	2	12	131481	131492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126207601
71	NC_009053	CAGAAA	2	12	133785	133796	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126207604
72	NC_009053	AGCAAA	2	12	139036	139047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126207609
73	NC_009053	CGGCAA	2	12	139068	139079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207609
74	NC_009053	CTGTTG	2	12	141369	141380	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126207612
75	NC_009053	ATATGG	2	12	142411	142422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207614
76	NC_009053	CGGTAA	2	12	149666	149677	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126207622
77	NC_009053	TTACCG	2	12	150154	150165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126207623
78	NC_009053	CGTCAC	2	12	152664	152675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126207624
79	NC_009053	AACCCG	2	12	154440	154451	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126207627
80	NC_009053	GTAACA	2	12	157171	157182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126207629
81	NC_009053	GCATTA	2	12	157546	157557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126207629
82	NC_009053	TTGCGG	2	12	159156	159167	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126207630
83	NC_009053	TATCGA	2	12	165723	165734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126207636
84	NC_009053	TGCGTA	2	12	171717	171728	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207641
85	NC_009053	CTTATT	2	12	171981	171992	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126207641
86	NC_009053	TAAGTG	2	12	174585	174596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207644
87	NC_009053	GATTGC	2	12	184045	184056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207654
88	NC_009053	AAAAAG	2	12	186043	186054	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	126207655
89	NC_009053	CGGAAG	2	12	186838	186849	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126207655
90	NC_009053	AGCGAA	2	12	186887	186898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126207655
91	NC_009053	GATTGC	2	12	187317	187328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207656
92	NC_009053	TTTCTT	2	12	191397	191408	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	126207661
93	NC_009053	GCGGAA	2	12	192682	192693	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126207662
94	NC_009053	ACCGTG	2	12	193843	193854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126207663
95	NC_009053	TTTGCG	2	12	196986	196997	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126207667
96	NC_009053	TCGCTT	2	12	197223	197234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126207667
97	NC_009053	GAAAGT	2	12	200298	200309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126207669
98	NC_009053	ATTGAT	2	12	200941	200952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126207670
99	NC_009053	AATACG	2	12	211075	211086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126207679
100	NC_009053	AAAATA	2	12	211616	211627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	126207679
101	NC_009053	CGAAAA	2	12	224916	224927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126207694
102	NC_009053	GGTAAA	2	12	227095	227106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126207695
103	NC_009053	CGAAAG	2	12	240697	240708	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126207706
104	NC_009053	ACAAAA	2	12	243981	243992	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	126207708
105	NC_009053	GAAAAA	2	12	245803	245814	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	126207711
106	NC_009053	TAAACG	2	12	246479	246490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126207712
107	NC_009053	AAAAAC	2	12	247741	247752	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	126207715
108	NC_009053	CGGTTA	2	12	247865	247876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207715
109	NC_009053	CCTTGC	2	12	257937	257948	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126207727
110	NC_009053	AAACAT	2	12	260480	260491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	126207730
111	NC_009053	AGGGTG	2	12	262371	262382	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	126207732
112	NC_009053	GAAACG	2	12	264224	264235	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126207733
113	NC_009053	TTAAGT	2	12	264925	264936	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126207734
114	NC_009053	CTTTTA	2	12	272852	272863	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126207738
115	NC_009053	GTTGCT	2	12	276017	276028	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126207740
116	NC_009053	TAACTT	2	12	284418	284429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126207742
117	NC_009053	TCGGTA	2	12	285185	285196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207742
118	NC_009053	TATTTT	2	12	286782	286793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	126207744
119	NC_009053	GTTTGA	2	12	290568	290579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126207749
120	NC_009053	GTTTCC	2	12	293008	293019	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126207752
121	NC_009053	CGGTAT	2	12	303252	303263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207764
122	NC_009053	TCGCCT	2	12	308899	308910	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126207767
123	NC_009053	TGGTAT	2	12	309161	309172	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126207767
124	NC_009053	ATTTAA	2	12	310237	310248	50 %	50 %	0 %	0 %	126207768
125	NC_009053	ACGAAA	2	12	311050	311061	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126207768
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128	NC_009053	GGTAAA	2	12	317290	317301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126207774
129	NC_009053	GCGAGA	2	12	317681	317692	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126207774
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135	NC_009053	AACGCA	2	12	337009	337020	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126207788
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138	NC_009053	ACGTGA	2	12	350990	351001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126207798
139	NC_009053	GTTGCG	2	12	355142	355153	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126207802
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143	NC_009053	ATCTTC	2	12	364167	364178	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126207810
144	NC_009053	CGGTTT	2	12	365276	365287	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126207811
145	NC_009053	TTAATT	2	12	367352	367363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207814
146	NC_009053	GAGCTG	18	108	367873	367980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126207815
147	NC_009053	TCGCTT	2	12	368694	368705	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126207816
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150	NC_009053	TTGGCA	2	12	372667	372678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207820
151	NC_009053	CGATTG	2	12	378965	378976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207827
152	NC_009053	TTCGGT	2	12	381294	381305	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126207828
153	NC_009053	AGCCTA	2	12	385571	385582	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126207830
154	NC_009053	TAAAAG	2	12	388286	388297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126207832
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188	NC_009053	CCGGTA	2	12	494611	494622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126207922
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220	NC_009053	GGGTGA	2	12	580835	580846	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	126207994
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223	NC_009053	GTGTCG	2	12	602085	602096	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126208012
224	NC_009053	ATGGGA	2	12	602392	602403	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126208012
225	NC_009053	CTTTCG	2	12	607936	607947	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126208018
226	NC_009053	ATAAAG	2	12	609528	609539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126208020
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228	NC_009053	GGTTTC	2	12	612057	612068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126208023
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230	NC_009053	GTGAAA	2	12	615596	615607	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126208026
231	NC_009053	AGTAAC	2	12	618373	618384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126208029
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331	NC_009053	GTTTGC	2	12	878504	878515	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126208245
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335	NC_009053	GTCACG	2	12	884986	884997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126208249
336	NC_009053	GCAGGA	2	12	886519	886530	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126208250
337	NC_009053	TTACCT	3	18	887919	887936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126208251
338	NC_009053	TACCGT	2	12	889273	889284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126208251
339	NC_009053	ACGCTG	2	12	894397	894408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126208256
340	NC_009053	GCGATA	2	12	896251	896262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126208257
341	NC_009053	CAATCA	2	12	896519	896530	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126208257
342	NC_009053	CTCTCG	2	12	900148	900159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126208260
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344	NC_009053	ATTCAA	2	12	904356	904367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126208263
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452	NC_009053	CTTTCG	2	12	1223757	1223768	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126208525
453	NC_009053	ATATCA	2	12	1225755	1225766	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126208526
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456	NC_009053	TTTAAC	2	12	1230198	1230209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126208532
457	NC_009053	GCTGAC	2	12	1233481	1233492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126208536
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