MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 5330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009053	CCAA	2	8	577	584	50 %	0 %	0 %	50 %	126207489
2	NC_009053	CGGT	2	8	694	701	0 %	25 %	50 %	25 %	126207489
3	NC_009053	TCGC	2	8	1351	1358	0 %	25 %	25 %	50 %	126207489
4	NC_009053	GTTA	2	8	1857	1864	25 %	50 %	25 %	0 %	126207490
5	NC_009053	TGAT	2	8	1979	1986	25 %	50 %	25 %	0 %	126207490
6	NC_009053	ACGG	2	8	2080	2087	25 %	0 %	50 %	25 %	126207490
7	NC_009053	GTGA	2	8	2191	2198	25 %	25 %	50 %	0 %	126207490
8	NC_009053	TGCG	2	8	2369	2376	0 %	25 %	50 %	25 %	126207490
9	NC_009053	GCGT	2	8	2405	2412	0 %	25 %	50 %	25 %	126207490
10	NC_009053	CGGT	2	8	3144	3151	0 %	25 %	50 %	25 %	126207491
11	NC_009053	GGTC	2	8	3242	3249	0 %	25 %	50 %	25 %	126207491
12	NC_009053	TGCG	2	8	3572	3579	0 %	25 %	50 %	25 %	126207491
13	NC_009053	TAAA	2	8	4077	4084	75 %	25 %	0 %	0 %	126207491
14	NC_009053	TTTC	2	8	4429	4436	0 %	75 %	0 %	25 %	126207492
15	NC_009053	ACGA	2	8	5128	5135	50 %	0 %	25 %	25 %	126207493
16	NC_009053	CCGA	2	8	5536	5543	25 %	0 %	25 %	50 %	126207493
17	NC_009053	CGGT	2	8	5882	5889	0 %	25 %	50 %	25 %	126207493
18	NC_009053	CGTT	2	8	6438	6445	0 %	50 %	25 %	25 %	126207494
19	NC_009053	GATT	2	8	6456	6463	25 %	50 %	25 %	0 %	126207494
20	NC_009053	GTTT	2	8	6831	6838	0 %	75 %	25 %	0 %	126207494
21	NC_009053	TTTA	2	8	7073	7080	25 %	75 %	0 %	0 %	126207494
22	NC_009053	AGCG	2	8	7745	7752	25 %	0 %	50 %	25 %	126207495
23	NC_009053	CATT	2	8	7763	7770	25 %	50 %	0 %	25 %	126207495
24	NC_009053	CAAC	2	8	7828	7835	50 %	0 %	0 %	50 %	126207495
25	NC_009053	GCGA	2	8	8016	8023	25 %	0 %	50 %	25 %	126207495
26	NC_009053	TTGG	2	8	8312	8319	0 %	50 %	50 %	0 %	126207495
27	NC_009053	AATT	2	8	8389	8396	50 %	50 %	0 %	0 %	126207495
28	NC_009053	GAAA	2	8	8629	8636	75 %	0 %	25 %	0 %	126207496
29	NC_009053	GTTT	2	8	8934	8941	0 %	75 %	25 %	0 %	126207496
30	NC_009053	GCGT	2	8	9179	9186	0 %	25 %	50 %	25 %	126207496
31	NC_009053	TCGG	2	8	9227	9234	0 %	25 %	50 %	25 %	126207496
32	NC_009053	CAAA	2	8	9358	9365	75 %	0 %	0 %	25 %	126207496
33	NC_009053	CCGC	2	8	9424	9431	0 %	0 %	25 %	75 %	126207496
34	NC_009053	GCAC	2	8	10213	10220	25 %	0 %	25 %	50 %	126207497
35	NC_009053	TAAA	2	8	10254	10261	75 %	25 %	0 %	0 %	126207497
36	NC_009053	CTTT	2	8	10361	10368	0 %	75 %	0 %	25 %	126207497
37	NC_009053	CTCG	2	8	11011	11018	0 %	25 %	25 %	50 %	126207498
38	NC_009053	TAAA	2	8	11224	11231	75 %	25 %	0 %	0 %	126207498
39	NC_009053	GTTG	2	8	12767	12774	0 %	50 %	50 %	0 %	126207500
40	NC_009053	ACTC	2	8	14098	14105	25 %	25 %	0 %	50 %	126207501
41	NC_009053	GTTT	2	8	14454	14461	0 %	75 %	25 %	0 %	126207501
42	NC_009053	AATT	2	8	14751	14758	50 %	50 %	0 %	0 %	126207501
43	NC_009053	GCAA	2	8	16082	16089	50 %	0 %	25 %	25 %	126207502
44	NC_009053	CTTA	2	8	16321	16328	25 %	50 %	0 %	25 %	126207502
45	NC_009053	CGGT	2	8	16378	16385	0 %	25 %	50 %	25 %	126207502
46	NC_009053	TTGT	2	8	16469	16476	0 %	75 %	25 %	0 %	126207502
47	NC_009053	CTTT	2	8	16842	16849	0 %	75 %	0 %	25 %	126207502
48	NC_009053	GGTT	2	8	17291	17298	0 %	50 %	50 %	0 %	126207503
49	NC_009053	TTCT	2	8	17494	17501	0 %	75 %	0 %	25 %	126207503
50	NC_009053	AAGC	2	8	18212	18219	50 %	0 %	25 %	25 %	126207504
51	NC_009053	TGAT	2	8	18231	18238	25 %	50 %	25 %	0 %	126207504
52	NC_009053	GACT	2	8	18777	18784	25 %	25 %	25 %	25 %	126207504
53	NC_009053	GCGT	2	8	19056	19063	0 %	25 %	50 %	25 %	126207504
54	NC_009053	CCGC	2	8	19312	19319	0 %	0 %	25 %	75 %	126207504
55	NC_009053	CCGA	2	8	19680	19687	25 %	0 %	25 %	50 %	126207505
56	NC_009053	CCAA	2	8	20475	20482	50 %	0 %	0 %	50 %	126207505
57	NC_009053	TCGC	2	8	21182	21189	0 %	25 %	25 %	50 %	126207506
58	NC_009053	GTGC	2	8	22159	22166	0 %	25 %	50 %	25 %	126207507
59	NC_009053	GTCG	2	8	22603	22610	0 %	25 %	50 %	25 %	126207507
60	NC_009053	GTTG	2	8	22902	22909	0 %	50 %	50 %	0 %	126207507
61	NC_009053	CCGA	2	8	22927	22934	25 %	0 %	25 %	50 %	126207507
62	NC_009053	AAAC	2	8	22974	22981	75 %	0 %	0 %	25 %	126207507
63	NC_009053	ATTT	2	8	23027	23034	25 %	75 %	0 %	0 %	126207507
64	NC_009053	ATCG	2	8	25001	25008	25 %	25 %	25 %	25 %	126207509
65	NC_009053	GGAA	2	8	25042	25049	50 %	0 %	50 %	0 %	126207509
66	NC_009053	CGGT	2	8	25579	25586	0 %	25 %	50 %	25 %	126207510
67	NC_009053	GAGC	2	8	25668	25675	25 %	0 %	50 %	25 %	126207510
68	NC_009053	AATT	2	8	26125	26132	50 %	50 %	0 %	0 %	126207510
69	NC_009053	ATTA	2	8	26953	26960	50 %	50 %	0 %	0 %	126207511
70	NC_009053	TTAA	2	8	27089	27096	50 %	50 %	0 %	0 %	126207511
71	NC_009053	AGTA	2	8	27259	27266	50 %	25 %	25 %	0 %	126207511
72	NC_009053	TATT	2	8	28040	28047	25 %	75 %	0 %	0 %	126207512
73	NC_009053	TCAA	2	8	28309	28316	50 %	25 %	0 %	25 %	126207512
74	NC_009053	TGAA	2	8	28377	28384	50 %	25 %	25 %	0 %	126207512
75	NC_009053	TTAT	2	8	28445	28452	25 %	75 %	0 %	0 %	126207512
76	NC_009053	TGAA	2	8	28844	28851	50 %	25 %	25 %	0 %	126207513
77	NC_009053	GTGA	2	8	29641	29648	25 %	25 %	50 %	0 %	126207513
78	NC_009053	GCTG	2	8	29868	29875	0 %	25 %	50 %	25 %	126207513
79	NC_009053	AAAT	2	8	30135	30142	75 %	25 %	0 %	0 %	126207513
80	NC_009053	TGCT	2	8	30419	30426	0 %	50 %	25 %	25 %	126207513
81	NC_009053	AAAC	2	8	30603	30610	75 %	0 %	0 %	25 %	126207514
82	NC_009053	TCAA	2	8	30644	30651	50 %	25 %	0 %	25 %	126207514
83	NC_009053	ATTG	2	8	30699	30706	25 %	50 %	25 %	0 %	126207514
84	NC_009053	CGGT	2	8	30960	30967	0 %	25 %	50 %	25 %	126207514
85	NC_009053	GCAA	2	8	31310	31317	50 %	0 %	25 %	25 %	126207514
86	NC_009053	CGTG	2	8	31401	31408	0 %	25 %	50 %	25 %	126207514
87	NC_009053	GCTT	2	8	31822	31829	0 %	50 %	25 %	25 %	126207514
88	NC_009053	CCAC	2	8	32357	32364	25 %	0 %	0 %	75 %	126207515
89	NC_009053	AGCA	2	8	32604	32611	50 %	0 %	25 %	25 %	126207515
90	NC_009053	AGCA	2	8	32661	32668	50 %	0 %	25 %	25 %	126207515
91	NC_009053	GCAG	2	8	33234	33241	25 %	0 %	50 %	25 %	126207516
92	NC_009053	CCGA	2	8	33681	33688	25 %	0 %	25 %	50 %	126207516
93	NC_009053	GTTT	2	8	33975	33982	0 %	75 %	25 %	0 %	126207517
94	NC_009053	TTTG	2	8	34378	34385	0 %	75 %	25 %	0 %	126207517
95	NC_009053	CATC	2	8	34567	34574	25 %	25 %	0 %	50 %	126207517
96	NC_009053	ACGA	2	8	34926	34933	50 %	0 %	25 %	25 %	126207517
97	NC_009053	CTTT	2	8	35307	35314	0 %	75 %	0 %	25 %	126207517
98	NC_009053	ACCG	2	8	35865	35872	25 %	0 %	25 %	50 %	126207518
99	NC_009053	ACGG	2	8	35900	35907	25 %	0 %	50 %	25 %	126207518
100	NC_009053	TACG	2	8	36185	36192	25 %	25 %	25 %	25 %	126207518
101	NC_009053	CGTA	2	8	36327	36334	25 %	25 %	25 %	25 %	126207518
102	NC_009053	ACCG	2	8	36531	36538	25 %	0 %	25 %	50 %	126207518
103	NC_009053	GACG	2	8	36969	36976	25 %	0 %	50 %	25 %	126207518
104	NC_009053	ATTT	2	8	37429	37436	25 %	75 %	0 %	0 %	126207519
105	NC_009053	TATT	2	8	37634	37641	25 %	75 %	0 %	0 %	126207519
106	NC_009053	ATTT	2	8	37748	37755	25 %	75 %	0 %	0 %	126207519
107	NC_009053	GCAA	2	8	37812	37819	50 %	0 %	25 %	25 %	126207519
108	NC_009053	GGTT	2	8	37947	37954	0 %	50 %	50 %	0 %	126207520
109	NC_009053	TAAT	2	8	37960	37967	50 %	50 %	0 %	0 %	126207520
110	NC_009053	AGAA	2	8	38200	38207	75 %	0 %	25 %	0 %	126207520
111	NC_009053	TTTA	2	8	38297	38304	25 %	75 %	0 %	0 %	126207520
112	NC_009053	CGGT	2	8	38743	38750	0 %	25 %	50 %	25 %	126207521
113	NC_009053	TGAA	2	8	39835	39842	50 %	25 %	25 %	0 %	126207522
114	NC_009053	ACTT	2	8	40053	40060	25 %	50 %	0 %	25 %	126207522
115	NC_009053	GTGC	2	8	40080	40087	0 %	25 %	50 %	25 %	126207522
116	NC_009053	TATT	2	8	40404	40411	25 %	75 %	0 %	0 %	126207523
117	NC_009053	CAAA	2	8	40571	40578	75 %	0 %	0 %	25 %	126207523
118	NC_009053	ACCG	2	8	41361	41368	25 %	0 %	25 %	50 %	126207525
119	NC_009053	TAAA	2	8	41600	41607	75 %	25 %	0 %	0 %	126207525
120	NC_009053	TGAA	2	8	41675	41682	50 %	25 %	25 %	0 %	126207526
121	NC_009053	CTGA	2	8	41798	41805	25 %	25 %	25 %	25 %	126207526
122	NC_009053	CCGT	2	8	42026	42033	0 %	25 %	25 %	50 %	126207526
123	NC_009053	CTTT	2	8	42042	42049	0 %	75 %	0 %	25 %	126207526
124	NC_009053	TCAT	2	8	42105	42112	25 %	50 %	0 %	25 %	126207526
125	NC_009053	CAAG	2	8	42636	42643	50 %	0 %	25 %	25 %	126207527
126	NC_009053	GAAA	2	8	42728	42735	75 %	0 %	25 %	0 %	126207527
127	NC_009053	GCCA	2	8	42894	42901	25 %	0 %	25 %	50 %	126207527
128	NC_009053	AATT	2	8	43561	43568	50 %	50 %	0 %	0 %	126207527
129	NC_009053	AATT	2	8	43805	43812	50 %	50 %	0 %	0 %	126207527
130	NC_009053	GCGT	2	8	43829	43836	0 %	25 %	50 %	25 %	126207527
131	NC_009053	TTTA	2	8	44358	44365	25 %	75 %	0 %	0 %	126207528
132	NC_009053	CGGT	2	8	44496	44503	0 %	25 %	50 %	25 %	126207528
133	NC_009053	TTGG	2	8	45135	45142	0 %	50 %	50 %	0 %	126207528
134	NC_009053	ATTT	2	8	46029	46036	25 %	75 %	0 %	0 %	126207529
135	NC_009053	GTTC	2	8	46683	46690	0 %	50 %	25 %	25 %	126207530
136	NC_009053	TTTA	2	8	47602	47609	25 %	75 %	0 %	0 %	126207531
137	NC_009053	TAAA	2	8	48214	48221	75 %	25 %	0 %	0 %	126207531
138	NC_009053	AACG	2	8	48531	48538	50 %	0 %	25 %	25 %	126207532
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140	NC_009053	AACA	2	8	49907	49914	75 %	0 %	0 %	25 %	126207532
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