MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_009053	TGC	2	6	2217845	2217850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126209445
37002	NC_009053	AAT	2	6	2217868	2217873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209445
37003	NC_009053	CCA	2	6	2217944	2217949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126209445
37004	NC_009053	GGT	2	6	2218020	2218025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126209445
37005	NC_009053	GCC	2	6	2218069	2218074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209445
37006	NC_009053	AAAG	2	8	2218089	2218096	75 %	0 %	25 %	0 %	126209445
37007	NC_009053	TAAA	2	8	2218107	2218114	75 %	25 %	0 %	0 %	126209445
37008	NC_009053	GCC	2	6	2218173	2218178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209445
37009	NC_009053	ATA	2	6	2218198	2218203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209445
37010	NC_009053	TAA	3	9	2218229	2218237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209445
37011	NC_009053	CGG	2	6	2218287	2218292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209445
37012	NC_009053	AGA	2	6	2218316	2218321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126209445
37013	NC_009053	ATAC	2	8	2218365	2218372	50 %	25 %	0 %	25 %	126209445
37014	NC_009053	AT	3	6	2218503	2218508	50 %	50 %	0 %	0 %	126209446
37015	NC_009053	ACC	2	6	2218511	2218516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126209446
37016	NC_009053	CAT	2	6	2218552	2218557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209446
37017	NC_009053	GACC	2	8	2218609	2218616	25 %	0 %	25 %	50 %	126209446
37018	NC_009053	CGTC	2	8	2218660	2218667	0 %	25 %	25 %	50 %	126209446
37019	NC_009053	CTT	2	6	2218726	2218731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209446
37020	NC_009053	AGT	2	6	2218777	2218782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126209446
37021	NC_009053	AACCG	2	10	2218814	2218823	40 %	0 %	20 %	40 %	126209446
37022	NC_009053	GCC	2	6	2218838	2218843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209446
37023	NC_009053	T	6	6	2218844	2218849	0 %	100 %	0 %	0 %	126209446
37024	NC_009053	CAT	2	6	2218850	2218855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209446
37025	NC_009053	AAGTT	2	10	2218891	2218900	40 %	40 %	20 %	0 %	126209446
37026	NC_009053	TCT	2	6	2218926	2218931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209446
37027	NC_009053	TAA	2	6	2218943	2218948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209446
37028	NC_009053	GTT	2	6	2218970	2218975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126209446
37029	NC_009053	ATATCG	2	12	2218983	2218994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126209446
37030	NC_009053	TTC	2	6	2219156	2219161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209446
37031	NC_009053	T	7	7	2219221	2219227	0 %	100 %	0 %	0 %	126209446
37032	NC_009053	CAT	2	6	2219369	2219374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209447
37033	NC_009053	TACGA	2	10	2219400	2219409	40 %	20 %	20 %	20 %	126209447
37034	NC_009053	T	6	6	2219477	2219482	0 %	100 %	0 %	0 %	126209447
37035	NC_009053	TAA	2	6	2219579	2219584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209447
37036	NC_009053	CTG	2	6	2219792	2219797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126209447
37037	NC_009053	TAA	2	6	2219840	2219845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209447
37038	NC_009053	CCG	2	6	2219891	2219896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209447
37039	NC_009053	TTG	2	6	2219904	2219909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126209447
37040	NC_009053	CA	3	6	2220046	2220051	50 %	0 %	0 %	50 %	126209447
37041	NC_009053	CCG	2	6	2220116	2220121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209447
37042	NC_009053	CAA	2	6	2220188	2220193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209447
37043	NC_009053	AAT	2	6	2220353	2220358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209448
37044	NC_009053	GAC	2	6	2220383	2220388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126209448
37045	NC_009053	ATTT	2	8	2220404	2220411	25 %	75 %	0 %	0 %	126209448
37046	NC_009053	CCG	2	6	2220496	2220501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209448
37047	NC_009053	CAT	2	6	2220533	2220538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209448
37048	NC_009053	GCG	2	6	2220547	2220552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209448
37049	NC_009053	AGC	2	6	2220608	2220613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126209448
37050	NC_009053	GTT	2	6	2220633	2220638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126209448
37051	NC_009053	CCG	2	6	2220650	2220655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209448
37052	NC_009053	T	6	6	2220729	2220734	0 %	100 %	0 %	0 %	126209448
37053	NC_009053	ACG	2	6	2220744	2220749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126209448
37054	NC_009053	ATC	3	9	2220762	2220770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209448
37055	NC_009053	TCT	2	6	2220817	2220822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209448
37056	NC_009053	GC	3	6	2220929	2220934	0 %	0 %	50 %	50 %	126209448
37057	NC_009053	CAA	2	6	2220945	2220950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209448
37058	NC_009053	TTG	2	6	2221038	2221043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126209448
37059	NC_009053	GTT	2	6	2221067	2221072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126209448
37060	NC_009053	TTA	2	6	2221122	2221127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209449
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37062	NC_009053	ATAA	2	8	2221145	2221152	75 %	25 %	0 %	0 %	126209449
37063	NC_009053	TTGT	2	8	2221170	2221177	0 %	75 %	25 %	0 %	126209449
37064	NC_009053	CTT	2	6	2221223	2221228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209449
37065	NC_009053	GCA	2	6	2221385	2221390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126209449
37066	NC_009053	ATC	2	6	2221419	2221424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209449
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37068	NC_009053	AAC	2	6	2221505	2221510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209449
37069	NC_009053	GTA	2	6	2221633	2221638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126209449
37070	NC_009053	CATTCA	2	12	2221646	2221657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209449
37071	NC_009053	TCA	2	6	2221739	2221744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209449
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37083	NC_009053	ATTA	2	8	2222508	2222515	50 %	50 %	0 %	0 %	126209450
37084	NC_009053	TTA	2	6	2222595	2222600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209450
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37087	NC_009053	TGG	2	6	2222818	2222823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126209450
37088	NC_009053	A	6	6	2222835	2222840	100 %	0 %	0 %	0 %	126209450
37089	NC_009053	ATT	2	6	2222907	2222912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209450
37090	NC_009053	TTTA	2	8	2222963	2222970	25 %	75 %	0 %	0 %	126209450
37091	NC_009053	AAC	2	6	2223067	2223072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209450
37092	NC_009053	CGTC	2	8	2223090	2223097	0 %	25 %	25 %	50 %	126209450
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37096	NC_009053	A	8	8	2223396	2223403	100 %	0 %	0 %	0 %	126209451
37097	NC_009053	GCA	2	6	2223425	2223430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126209451
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37100	NC_009053	CGG	2	6	2223627	2223632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209451
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37102	NC_009053	GTATC	2	10	2223713	2223722	20 %	40 %	20 %	20 %	126209451
37103	NC_009053	GCG	2	6	2223727	2223732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209451
37104	NC_009053	CGG	2	6	2223741	2223746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209451
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37107	NC_009053	CGG	2	6	2223783	2223788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209451
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37111	NC_009053	ACGGC	2	10	2224222	2224231	20 %	0 %	40 %	40 %	126209452
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37113	NC_009053	CGG	2	6	2224304	2224309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209452
37114	NC_009053	CGG	3	9	2224322	2224330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209452
37115	NC_009053	TTA	2	6	2224335	2224340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209452
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37117	NC_009053	GTA	2	6	2224479	2224484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126209452
37118	NC_009053	TTC	2	6	2224485	2224490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209452
37119	NC_009053	TTA	2	6	2224491	2224496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209452
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37124	NC_009053	AGT	2	6	2225064	2225069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126209453
37125	NC_009053	AGT	2	6	2225082	2225087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126209453
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37129	NC_009053	TGG	2	6	2225258	2225263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126209454
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37132	NC_009053	CTG	2	6	2225425	2225430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126209454
37133	NC_009053	ACA	2	6	2225583	2225588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209455
37134	NC_009053	CTT	2	6	2225601	2225606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209455
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37136	NC_009053	TTC	2	6	2225773	2225778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209455
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37139	NC_009053	CGG	2	6	2225864	2225869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209455
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37144	NC_009053	A	6	6	2225957	2225962	100 %	0 %	0 %	0 %	126209455
37145	NC_009053	GTTA	2	8	2225988	2225995	25 %	50 %	25 %	0 %	126209455
37146	NC_009053	TAA	2	6	2226003	2226008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209455
37147	NC_009053	A	6	6	2226104	2226109	100 %	0 %	0 %	0 %	126209455
37148	NC_009053	CAA	2	6	2226133	2226138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209455
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37223	NC_009053	CGA	2	6	2230978	2230983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126209459
37224	NC_009053	TGTT	2	8	2231128	2231135	0 %	75 %	25 %	0 %	126209459
37225	NC_009053	A	6	6	2231147	2231152	100 %	0 %	0 %	0 %	126209459
37226	NC_009053	AG	4	8	2231356	2231363	50 %	0 %	50 %	0 %	126209459
37227	NC_009053	ATC	2	6	2231604	2231609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209460
37228	NC_009053	CAT	2	6	2231711	2231716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209460
37229	NC_009053	T	6	6	2231721	2231726	0 %	100 %	0 %	0 %	126209460
37230	NC_009053	A	7	7	2231764	2231770	100 %	0 %	0 %	0 %	126209460
37231	NC_009053	GCA	2	6	2231791	2231796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126209460
37232	NC_009053	GGC	2	6	2231854	2231859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209460
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37469	NC_009053	TTA	2	6	2244133	2244138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209470
37470	NC_009053	CTTATA	2	12	2244140	2244151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126209470
37471	NC_009053	AAT	2	6	2244166	2244171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209470
37472	NC_009053	ATT	2	6	2244184	2244189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209470
37473	NC_009053	CATA	2	8	2244196	2244203	50 %	25 %	0 %	25 %	126209470
37474	NC_009053	ATT	2	6	2244218	2244223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209470
37475	NC_009053	GTACGA	2	12	2244281	2244292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126209470
37476	NC_009053	A	6	6	2244403	2244408	100 %	0 %	0 %	0 %	126209470
37477	NC_009053	TA	3	6	2244409	2244414	50 %	50 %	0 %	0 %	126209470
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37480	NC_009053	CAAAA	2	10	2244779	2244788	80 %	0 %	0 %	20 %	126209471
37481	NC_009053	TTA	2	6	2244814	2244819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209471
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37484	NC_009053	TAA	2	6	2244973	2244978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126209472
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37489	NC_009053	CGG	2	6	2245105	2245110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209472
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37492	NC_009053	CCG	2	6	2245260	2245265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209472
37493	NC_009053	CGC	2	6	2245285	2245290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209472
37494	NC_009053	TTC	2	6	2245336	2245341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126209472
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37496	NC_009053	CTA	2	6	2245422	2245427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209472
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37499	NC_009053	ATC	2	6	2245699	2245704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126209472
37500	NC_009053	CGGT	2	8	2245730	2245737	0 %	25 %	50 %	25 %	126209472

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