MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009053	GCG	2	6	120592	120597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207593
2002	NC_009053	TAA	2	6	120621	120626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207593
2003	NC_009053	GCC	2	6	120690	120695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207593
2004	NC_009053	AGTA	2	8	120730	120737	50 %	25 %	25 %	0 %	126207593
2005	NC_009053	ATG	2	6	120820	120825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207593
2006	NC_009053	AGAA	2	8	120837	120844	75 %	0 %	25 %	0 %	126207593
2007	NC_009053	ATA	3	9	121024	121032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207593
2008	NC_009053	ACCA	2	8	121041	121048	50 %	0 %	0 %	50 %	126207593
2009	NC_009053	CGG	2	6	121053	121058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207593
2010	NC_009053	GAAG	2	8	121203	121210	50 %	0 %	50 %	0 %	126207593
2011	NC_009053	CGG	2	6	121271	121276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207593
2012	NC_009053	AGG	2	6	121279	121284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126207593
2013	NC_009053	CAA	2	6	121361	121366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207593
2014	NC_009053	TGA	2	6	121393	121398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207593
2015	NC_009053	TCA	2	6	121580	121585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207594
2016	NC_009053	ACC	2	6	121596	121601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207594
2017	NC_009053	GGC	2	6	121602	121607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207594
2018	NC_009053	ATT	2	6	121773	121778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207594
2019	NC_009053	GTC	2	6	121782	121787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207594
2020	NC_009053	T	7	7	121842	121848	0 %	100 %	0 %	0 %	126207594
2021	NC_009053	ACC	2	6	121849	121854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207594
2022	NC_009053	CGCAAT	2	12	121872	121883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126207594
2023	NC_009053	TTAC	2	8	121915	121922	25 %	50 %	0 %	25 %	126207594
2024	NC_009053	AGT	2	6	121952	121957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207594
2025	NC_009053	AG	3	6	122027	122032	50 %	0 %	50 %	0 %	126207594
2026	NC_009053	CGCTT	2	10	122037	122046	0 %	40 %	20 %	40 %	126207594
2027	NC_009053	CCG	2	6	122173	122178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207594
2028	NC_009053	CCG	2	6	122209	122214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207594
2029	NC_009053	ACC	2	6	122230	122235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207594
2030	NC_009053	ACCG	2	8	122238	122245	25 %	0 %	25 %	50 %	126207594
2031	NC_009053	AAACCG	2	12	122335	122346	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126207594
2032	NC_009053	TCA	2	6	122359	122364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207594
2033	NC_009053	TCGG	2	8	122379	122386	0 %	25 %	50 %	25 %	126207594
2034	NC_009053	GTA	2	6	122405	122410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207594
2035	NC_009053	ATA	2	6	122517	122522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2036	NC_009053	T	6	6	122543	122548	0 %	100 %	0 %	0 %	126207594
2037	NC_009053	CGAT	2	8	122581	122588	25 %	25 %	25 %	25 %	126207594
2038	NC_009053	TCT	2	6	122683	122688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207594
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2040	NC_009053	CCG	2	6	122726	122731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207594
2041	NC_009053	CCA	2	6	122759	122764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207594
2042	NC_009053	CCG	2	6	122809	122814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207594
2043	NC_009053	CGG	2	6	122921	122926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207594
2044	NC_009053	TTA	2	6	122932	122937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207594
2045	NC_009053	AAT	2	6	123001	123006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2046	NC_009053	CCG	2	6	123041	123046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207594
2047	NC_009053	AAC	2	6	123084	123089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207594
2048	NC_009053	AAT	2	6	123138	123143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2049	NC_009053	ATA	2	6	123192	123197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2050	NC_009053	ATT	2	6	123237	123242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207594
2051	NC_009053	TCT	2	6	123314	123319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207594
2052	NC_009053	CGG	2	6	123449	123454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207594
2053	NC_009053	GGCAC	2	10	123508	123517	20 %	0 %	40 %	40 %	126207594
2054	NC_009053	AAT	2	6	123619	123624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2055	NC_009053	CGG	2	6	123659	123664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207594
2056	NC_009053	TTGA	2	8	123729	123736	25 %	50 %	25 %	0 %	126207594
2057	NC_009053	TAA	2	6	123786	123791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2058	NC_009053	ACT	2	6	123853	123858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207594
2059	NC_009053	GCC	2	6	123988	123993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207594
2060	NC_009053	ATT	2	6	124140	124145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207594
2061	NC_009053	AAT	2	6	124166	124171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2062	NC_009053	TAA	2	6	124251	124256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207594
2063	NC_009053	CGAT	2	8	124258	124265	25 %	25 %	25 %	25 %	126207594
2064	NC_009053	CTT	2	6	124295	124300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207594
2065	NC_009053	AAAT	2	8	124344	124351	75 %	25 %	0 %	0 %	126207594
2066	NC_009053	GAA	2	6	124444	124449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207594
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2068	NC_009053	TGT	2	6	124519	124524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207594
2069	NC_009053	TTA	2	6	124582	124587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207594
2070	NC_009053	ACT	2	6	124722	124727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207594
2071	NC_009053	TGCT	2	8	124734	124741	0 %	50 %	25 %	25 %	126207594
2072	NC_009053	AAGG	2	8	124801	124808	50 %	0 %	50 %	0 %	126207594
2073	NC_009053	CTT	2	6	124928	124933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207594
2074	NC_009053	GTAC	2	8	124993	125000	25 %	25 %	25 %	25 %	126207594
2075	NC_009053	GTTTCC	2	12	125047	125058	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126207594
2076	NC_009053	GCT	2	6	125072	125077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207594
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2080	NC_009053	CGG	3	9	125337	125345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207595
2081	NC_009053	CTA	2	6	125468	125473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207595
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2084	NC_009053	GCCC	2	8	125556	125563	0 %	0 %	25 %	75 %	126207595
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2089	NC_009053	CCG	2	6	125993	125998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207595
2090	NC_009053	ACG	2	6	126010	126015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207595
2091	NC_009053	ATG	2	6	126169	126174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207595
2092	NC_009053	ACC	2	6	126252	126257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207595
2093	NC_009053	A	7	7	126388	126394	100 %	0 %	0 %	0 %	126207595
2094	NC_009053	ATA	2	6	126415	126420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207595
2095	NC_009053	CGC	2	6	126473	126478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207595
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2097	NC_009053	TAA	2	6	126606	126611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207595
2098	NC_009053	CGG	2	6	126635	126640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207595
2099	NC_009053	ACG	2	6	126666	126671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207595
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2101	NC_009053	ATT	2	6	126696	126701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207595
2102	NC_009053	AAT	2	6	126741	126746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207595
2103	NC_009053	TTC	2	6	127384	127389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207596
2104	NC_009053	GGT	2	6	127405	127410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207596
2105	NC_009053	AACGT	2	10	127422	127431	40 %	20 %	20 %	20 %	126207596
2106	NC_009053	TGA	2	6	127499	127504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207596
2107	NC_009053	CATC	2	8	127554	127561	25 %	25 %	0 %	50 %	126207596
2108	NC_009053	TTG	2	6	127567	127572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207596
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2110	NC_009053	GTA	2	6	127613	127618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207596
2111	NC_009053	TTG	2	6	127636	127641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207596
2112	NC_009053	AAT	2	6	127665	127670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207596
2113	NC_009053	TCA	2	6	127764	127769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207596
2114	NC_009053	TGCGG	2	10	127871	127880	0 %	20 %	60 %	20 %	126207596
2115	NC_009053	GC	4	8	127908	127915	0 %	0 %	50 %	50 %	126207596
2116	NC_009053	ACGA	2	8	127972	127979	50 %	0 %	25 %	25 %	126207596
2117	NC_009053	CTT	2	6	127983	127988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207596
2118	NC_009053	TGTC	2	8	128139	128146	0 %	50 %	25 %	25 %	126207596
2119	NC_009053	CAA	2	6	128210	128215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207597
2120	NC_009053	CAAG	2	8	128320	128327	50 %	0 %	25 %	25 %	126207597
2121	NC_009053	ATC	2	6	128341	128346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207597
2122	NC_009053	TACG	2	8	128372	128379	25 %	25 %	25 %	25 %	126207597
2123	NC_009053	TGA	2	6	128414	128419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207597
2124	NC_009053	CAT	2	6	128432	128437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207597
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2126	NC_009053	TTTGT	2	10	128496	128505	0 %	80 %	20 %	0 %	126207597
2127	NC_009053	TGT	3	9	128503	128511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207597
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2130	NC_009053	GATT	2	8	128631	128638	25 %	50 %	25 %	0 %	126207597
2131	NC_009053	GTT	2	6	128639	128644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207597
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2231	NC_009053	GAA	2	6	133988	133993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207605
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2241	NC_009053	GGAT	2	8	134469	134476	25 %	25 %	50 %	0 %	126207605
2242	NC_009053	TGC	2	6	134513	134518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207605
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2490	NC_009053	GCG	2	6	148270	148275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207621
2491	NC_009053	CGAA	2	8	148353	148360	50 %	0 %	25 %	25 %	126207621
2492	NC_009053	CGG	2	6	148388	148393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207621
2493	NC_009053	A	6	6	148397	148402	100 %	0 %	0 %	0 %	126207621
2494	NC_009053	GC	3	6	148414	148419	0 %	0 %	50 %	50 %	126207621
2495	NC_009053	GAA	2	6	148459	148464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207621
2496	NC_009053	GC	3	6	148516	148521	0 %	0 %	50 %	50 %	126207621
2497	NC_009053	GCC	2	6	148530	148535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207621
2498	NC_009053	ATT	2	6	148537	148542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207621
2499	NC_009053	GGCG	2	8	148623	148630	0 %	0 %	75 %	25 %	126207621
2500	NC_009053	GCA	2	6	148659	148664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207621

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