MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009053	AAG	2	6	29090	29095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
502	NC_009053	AAT	2	6	29116	29121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207513
503	NC_009053	ATT	3	9	29196	29204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
504	NC_009053	TTG	2	6	29257	29262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207513
505	NC_009053	AATGA	2	10	29263	29272	60 %	20 %	20 %	0 %	126207513
506	NC_009053	GAA	2	6	29292	29297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
507	NC_009053	GCT	2	6	29358	29363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207513
508	NC_009053	GAA	2	6	29425	29430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
509	NC_009053	TA	3	6	29528	29533	50 %	50 %	0 %	0 %	126207513
510	NC_009053	AGA	2	6	29550	29555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
511	NC_009053	TTCAGG	2	12	29615	29626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207513
512	NC_009053	GTGA	2	8	29641	29648	25 %	25 %	50 %	0 %	126207513
513	NC_009053	TGG	2	6	29798	29803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207513
514	NC_009053	GAA	2	6	29818	29823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
515	NC_009053	TCA	2	6	29850	29855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207513
516	NC_009053	GCTG	2	8	29868	29875	0 %	25 %	50 %	25 %	126207513
517	NC_009053	A	6	6	29908	29913	100 %	0 %	0 %	0 %	126207513
518	NC_009053	ATG	2	6	29987	29992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207513
519	NC_009053	TGA	2	6	30018	30023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207513
520	NC_009053	AATTT	2	10	30029	30038	40 %	60 %	0 %	0 %	126207513
521	NC_009053	CGG	2	6	30087	30092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207513
522	NC_009053	AAAT	2	8	30135	30142	75 %	25 %	0 %	0 %	126207513
523	NC_009053	ATT	2	6	30157	30162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
524	NC_009053	TGA	2	6	30165	30170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207513
525	NC_009053	AAT	2	6	30322	30327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207513
526	NC_009053	TTA	2	6	30349	30354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
527	NC_009053	ATT	2	6	30387	30392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
528	NC_009053	TGCT	2	8	30419	30426	0 %	50 %	25 %	25 %	126207513
529	NC_009053	AAAC	2	8	30603	30610	75 %	0 %	0 %	25 %	126207514
530	NC_009053	TCAA	2	8	30644	30651	50 %	25 %	0 %	25 %	126207514
531	NC_009053	ATTG	2	8	30699	30706	25 %	50 %	25 %	0 %	126207514
532	NC_009053	TAA	2	6	30709	30714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207514
533	NC_009053	AAT	2	6	30791	30796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207514
534	NC_009053	TTA	2	6	30923	30928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207514
535	NC_009053	CGGT	2	8	30960	30967	0 %	25 %	50 %	25 %	126207514
536	NC_009053	T	6	6	31012	31017	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
537	NC_009053	T	6	6	31220	31225	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
538	NC_009053	ATCGG	2	10	31262	31271	20 %	20 %	40 %	20 %	126207514
539	NC_009053	TGC	2	6	31298	31303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207514
540	NC_009053	GCAA	2	8	31310	31317	50 %	0 %	25 %	25 %	126207514
541	NC_009053	CTG	2	6	31323	31328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207514
542	NC_009053	TAA	2	6	31339	31344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207514
543	NC_009053	T	6	6	31351	31356	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
544	NC_009053	CGC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207514
545	NC_009053	CGTG	2	8	31401	31408	0 %	25 %	50 %	25 %	126207514
546	NC_009053	TTG	2	6	31426	31431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207514
547	NC_009053	CCG	2	6	31520	31525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207514
548	NC_009053	AAG	2	6	31545	31550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207514
549	NC_009053	CCG	2	6	31565	31570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207514
550	NC_009053	T	6	6	31627	31632	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
551	NC_009053	T	6	6	31640	31645	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
552	NC_009053	T	6	6	31660	31665	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
553	NC_009053	CAA	2	6	31668	31673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207514
554	NC_009053	ACG	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207514
555	NC_009053	GCTT	2	8	31822	31829	0 %	50 %	25 %	25 %	126207514
556	NC_009053	TAAACT	2	12	31924	31935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126207514
557	NC_009053	ATT	2	6	32003	32008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207514
558	NC_009053	TAG	2	6	32092	32097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207515
559	NC_009053	AAT	2	6	32104	32109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207515
560	NC_009053	TCA	2	6	32114	32119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207515
561	NC_009053	CTG	2	6	32132	32137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207515
562	NC_009053	AAG	2	6	32223	32228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207515
563	NC_009053	CCCATT	2	12	32275	32286	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126207515
564	NC_009053	CCAC	2	8	32357	32364	25 %	0 %	0 %	75 %	126207515
565	NC_009053	AAT	3	9	32434	32442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207515
566	NC_009053	CCG	2	6	32497	32502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207515
567	NC_009053	AGC	2	6	32527	32532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207515
568	NC_009053	AGCA	2	8	32604	32611	50 %	0 %	25 %	25 %	126207515
569	NC_009053	GAT	2	6	32624	32629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207515
570	NC_009053	AGCA	2	8	32661	32668	50 %	0 %	25 %	25 %	126207515
571	NC_009053	T	6	6	32762	32767	0 %	100 %	0 %	0 %	126207515
572	NC_009053	CA	3	6	32851	32856	50 %	0 %	0 %	50 %	126207516
573	NC_009053	GA	3	6	32888	32893	50 %	0 %	50 %	0 %	126207516
574	NC_009053	ATC	2	6	32904	32909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207516
575	NC_009053	AAT	2	6	32924	32929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207516
576	NC_009053	CCG	2	6	33228	33233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207516
577	NC_009053	GCAG	2	8	33234	33241	25 %	0 %	50 %	25 %	126207516
578	NC_009053	ATA	2	6	33285	33290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207516
579	NC_009053	A	6	6	33341	33346	100 %	0 %	0 %	0 %	126207516
580	NC_009053	CCA	2	6	33539	33544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207516
581	NC_009053	CGG	3	9	33580	33588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207516
582	NC_009053	CCGA	2	8	33681	33688	25 %	0 %	25 %	50 %	126207516
583	NC_009053	AAT	2	6	33701	33706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207516
584	NC_009053	AAT	2	6	33725	33730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207516
585	NC_009053	TCT	2	6	33860	33865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207517
586	NC_009053	ATA	2	6	33923	33928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207517
587	NC_009053	AAT	2	6	33938	33943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207517
588	NC_009053	TCA	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207517
589	NC_009053	GTTT	2	8	33975	33982	0 %	75 %	25 %	0 %	126207517
590	NC_009053	TC	3	6	34231	34236	0 %	50 %	0 %	50 %	126207517
591	NC_009053	AAT	2	6	34262	34267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207517
592	NC_009053	CTT	2	6	34321	34326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207517
593	NC_009053	TTTG	2	8	34378	34385	0 %	75 %	25 %	0 %	126207517
594	NC_009053	CCG	2	6	34459	34464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207517
595	NC_009053	CATC	2	8	34567	34574	25 %	25 %	0 %	50 %	126207517
596	NC_009053	TAAAT	2	10	34658	34667	60 %	40 %	0 %	0 %	126207517
597	NC_009053	GCT	2	6	34718	34723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207517
598	NC_009053	AAT	2	6	34729	34734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207517
599	NC_009053	GAA	2	6	34741	34746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207517
600	NC_009053	T	6	6	34792	34797	0 %	100 %	0 %	0 %	126207517
601	NC_009053	CAC	2	6	34847	34852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207517
602	NC_009053	T	7	7	34857	34863	0 %	100 %	0 %	0 %	126207517
603	NC_009053	TGG	2	6	34891	34896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207517
604	NC_009053	A	6	6	34908	34913	100 %	0 %	0 %	0 %	126207517
605	NC_009053	ACGA	2	8	34926	34933	50 %	0 %	25 %	25 %	126207517
606	NC_009053	TAA	2	6	35021	35026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207517
607	NC_009053	T	6	6	35286	35291	0 %	100 %	0 %	0 %	126207517
608	NC_009053	CTTT	2	8	35307	35314	0 %	75 %	0 %	25 %	126207517
609	NC_009053	ATT	2	6	35315	35320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207517
610	NC_009053	AAT	2	6	35367	35372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207517
611	NC_009053	T	6	6	35399	35404	0 %	100 %	0 %	0 %	126207517
612	NC_009053	AAG	2	6	35620	35625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207518
613	NC_009053	TAAGT	2	10	35683	35692	40 %	40 %	20 %	0 %	126207518
614	NC_009053	CGC	2	6	35696	35701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207518
615	NC_009053	TTC	2	6	35739	35744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207518
616	NC_009053	TTC	2	6	35749	35754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207518
617	NC_009053	ACC	2	6	35842	35847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207518
618	NC_009053	ACCG	2	8	35865	35872	25 %	0 %	25 %	50 %	126207518
619	NC_009053	ACGG	2	8	35900	35907	25 %	0 %	50 %	25 %	126207518
620	NC_009053	CTT	2	6	35924	35929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207518
621	NC_009053	ACG	2	6	35991	35996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207518
622	NC_009053	TCA	2	6	36035	36040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207518
623	NC_009053	ATA	2	6	36097	36102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207518
624	NC_009053	CTT	2	6	36116	36121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207518
625	NC_009053	TACG	2	8	36185	36192	25 %	25 %	25 %	25 %	126207518
626	NC_009053	AAC	2	6	36228	36233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207518
627	NC_009053	CGTA	2	8	36327	36334	25 %	25 %	25 %	25 %	126207518
628	NC_009053	GAA	2	6	36423	36428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207518
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630	NC_009053	ATC	2	6	36525	36530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207518
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