MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO02

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008766	GC	3	6	312	317	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
2	NC_008766	GC	3	6	887	892	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
3	NC_008766	CG	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
4	NC_008766	GC	3	6	1122	1127	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
5	NC_008766	GC	3	6	3169	3174	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
6	NC_008766	GC	3	6	3331	3336	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
7	NC_008766	GC	3	6	3797	3802	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
8	NC_008766	AG	3	6	5091	5096	50 %	0 %	50 %	0 %	121582555
9	NC_008766	CG	3	6	6821	6826	0 %	0 %	50 %	50 %	121582558
10	NC_008766	CG	4	8	8344	8351	0 %	0 %	50 %	50 %	121582560
11	NC_008766	CG	3	6	9085	9090	0 %	0 %	50 %	50 %	121582562
12	NC_008766	CG	3	6	9199	9204	0 %	0 %	50 %	50 %	121582562
13	NC_008766	GC	3	6	10581	10586	0 %	0 %	50 %	50 %	121582564
14	NC_008766	GC	3	6	10829	10834	0 %	0 %	50 %	50 %	121582564
15	NC_008766	GC	3	6	11351	11356	0 %	0 %	50 %	50 %	121582565
16	NC_008766	GC	3	6	11622	11627	0 %	0 %	50 %	50 %	121582566
17	NC_008766	CG	3	6	12901	12906	0 %	0 %	50 %	50 %	121582568
18	NC_008766	GC	3	6	13050	13055	0 %	0 %	50 %	50 %	121582568
19	NC_008766	GC	3	6	14138	14143	0 %	0 %	50 %	50 %	121582569
20	NC_008766	GC	3	6	15129	15134	0 %	0 %	50 %	50 %	121582571
21	NC_008766	CG	3	6	16300	16305	0 %	0 %	50 %	50 %	121582572
22	NC_008766	GC	3	6	16479	16484	0 %	0 %	50 %	50 %	121582572
23	NC_008766	GC	3	6	16688	16693	0 %	0 %	50 %	50 %	121582572
24	NC_008766	CG	3	6	16774	16779	0 %	0 %	50 %	50 %	121582572
25	NC_008766	CG	3	6	16992	16997	0 %	0 %	50 %	50 %	121582572
26	NC_008766	CG	3	6	17162	17167	0 %	0 %	50 %	50 %	121582572
27	NC_008766	GC	3	6	17649	17654	0 %	0 %	50 %	50 %	121582573
28	NC_008766	GA	4	8	17793	17800	50 %	0 %	50 %	0 %	121582573
29	NC_008766	CG	3	6	17876	17881	0 %	0 %	50 %	50 %	121582574
30	NC_008766	GA	3	6	18102	18107	50 %	0 %	50 %	0 %	121582574
31	NC_008766	GC	3	6	18481	18486	0 %	0 %	50 %	50 %	121582574
32	NC_008766	CG	3	6	18578	18583	0 %	0 %	50 %	50 %	121582574
33	NC_008766	GC	4	8	18843	18850	0 %	0 %	50 %	50 %	121582575
34	NC_008766	GC	3	6	18977	18982	0 %	0 %	50 %	50 %	121582575
35	NC_008766	GC	4	8	19114	19121	0 %	0 %	50 %	50 %	121582575
36	NC_008766	CG	3	6	19155	19160	0 %	0 %	50 %	50 %	121582575
37	NC_008766	CG	3	6	19373	19378	0 %	0 %	50 %	50 %	121582575
38	NC_008766	CG	3	6	19449	19454	0 %	0 %	50 %	50 %	121582575
39	NC_008766	CG	3	6	19750	19755	0 %	0 %	50 %	50 %	121582576
40	NC_008766	GC	3	6	20023	20028	0 %	0 %	50 %	50 %	121582576
41	NC_008766	CG	3	6	20242	20247	0 %	0 %	50 %	50 %	121582576
42	NC_008766	GC	3	6	22210	22215	0 %	0 %	50 %	50 %	121582577
43	NC_008766	GC	3	6	22273	22278	0 %	0 %	50 %	50 %	121582577
44	NC_008766	CG	3	6	22364	22369	0 %	0 %	50 %	50 %	121582577
45	NC_008766	GC	3	6	22474	22479	0 %	0 %	50 %	50 %	121582578
46	NC_008766	AG	3	6	22833	22838	50 %	0 %	50 %	0 %	121582578
47	NC_008766	GC	3	6	23053	23058	0 %	0 %	50 %	50 %	121582579
48	NC_008766	GC	3	6	23391	23396	0 %	0 %	50 %	50 %	121582579
49	NC_008766	GC	3	6	25211	25216	0 %	0 %	50 %	50 %	121582582
50	NC_008766	GC	3	6	25507	25512	0 %	0 %	50 %	50 %	121582582
51	NC_008766	GC	3	6	25645	25650	0 %	0 %	50 %	50 %	121582582
52	NC_008766	CG	3	6	26470	26475	0 %	0 %	50 %	50 %	121582583
53	NC_008766	CA	3	6	26781	26786	50 %	0 %	0 %	50 %	121582584
54	NC_008766	GC	3	6	27168	27173	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
55	NC_008766	CG	3	6	27530	27535	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
56	NC_008766	GC	3	6	27585	27590	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
57	NC_008766	GC	3	6	27766	27771	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
58	NC_008766	CG	3	6	28128	28133	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
59	NC_008766	GC	3	6	28185	28190	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
60	NC_008766	GC	3	6	28415	28420	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
61	NC_008766	GC	4	8	28594	28601	0 %	0 %	50 %	50 %	121582584
62	NC_008766	CA	4	8	28967	28974	50 %	0 %	0 %	50 %	121582584
63	NC_008766	GC	3	6	33259	33264	0 %	0 %	50 %	50 %	121582586
64	NC_008766	CA	4	8	33895	33902	50 %	0 %	0 %	50 %	121582586
65	NC_008766	GC	4	8	34468	34475	0 %	0 %	50 %	50 %	121582587
66	NC_008766	CG	3	6	34690	34695	0 %	0 %	50 %	50 %	121582587
67	NC_008766	AG	3	6	35285	35290	50 %	0 %	50 %	0 %	121582588
68	NC_008766	CA	3	6	35871	35876	50 %	0 %	0 %	50 %	121582589
69	NC_008766	GC	3	6	36258	36263	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
70	NC_008766	CG	3	6	36620	36625	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
71	NC_008766	GC	3	6	36675	36680	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
72	NC_008766	GC	3	6	36856	36861	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
73	NC_008766	CG	3	6	37218	37223	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
74	NC_008766	GC	3	6	37275	37280	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
75	NC_008766	GC	3	6	37505	37510	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
76	NC_008766	GC	4	8	37684	37691	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
77	NC_008766	AC	3	6	37906	37911	50 %	0 %	0 %	50 %	121582589
78	NC_008766	GC	3	6	38465	38470	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
79	NC_008766	GT	3	6	38689	38694	0 %	50 %	50 %	0 %	121582589
80	NC_008766	TG	3	6	39796	39801	0 %	50 %	50 %	0 %	121582590
81	NC_008766	GC	3	6	39952	39957	0 %	0 %	50 %	50 %	121582590
82	NC_008766	TG	3	6	42233	42238	0 %	50 %	50 %	0 %	121582591
83	NC_008766	GT	3	6	42283	42288	0 %	50 %	50 %	0 %	121582591
84	NC_008766	TG	3	6	42496	42501	0 %	50 %	50 %	0 %	121582591
85	NC_008766	GC	3	6	46351	46356	0 %	0 %	50 %	50 %	121582597
86	NC_008766	GC	3	6	46505	46510	0 %	0 %	50 %	50 %	121582597
87	NC_008766	GC	3	6	48535	48540	0 %	0 %	50 %	50 %	121582601
88	NC_008766	GC	3	6	48925	48930	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
89	NC_008766	GC	3	6	49355	49360	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
90	NC_008766	GC	3	6	49456	49461	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
91	NC_008766	CG	3	6	49697	49702	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
92	NC_008766	GC	3	6	49777	49782	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
93	NC_008766	CG	3	6	49844	49849	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
94	NC_008766	GC	3	6	49868	49873	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
95	NC_008766	CG	3	6	50625	50630	0 %	0 %	50 %	50 %	121582603
96	NC_008766	CG	3	6	51493	51498	0 %	0 %	50 %	50 %	121582604
97	NC_008766	GC	3	6	53013	53018	0 %	0 %	50 %	50 %	121582606
98	NC_008766	GC	3	6	53106	53111	0 %	0 %	50 %	50 %	121582606
99	NC_008766	GC	3	6	53210	53215	0 %	0 %	50 %	50 %	121582606
100	NC_008766	CG	3	6	54202	54207	0 %	0 %	50 %	50 %	121582608
101	NC_008766	CG	3	6	55706	55711	0 %	0 %	50 %	50 %	121582610
102	NC_008766	GC	3	6	55858	55863	0 %	0 %	50 %	50 %	121582611
103	NC_008766	AC	3	6	56533	56538	50 %	0 %	0 %	50 %	121582612
104	NC_008766	GC	3	6	56736	56741	0 %	0 %	50 %	50 %	121582612
105	NC_008766	CG	3	6	57116	57121	0 %	0 %	50 %	50 %	121582612
106	NC_008766	GC	3	6	57328	57333	0 %	0 %	50 %	50 %	121582612
107	NC_008766	CG	3	6	57495	57500	0 %	0 %	50 %	50 %	121582612
108	NC_008766	CG	3	6	57507	57512	0 %	0 %	50 %	50 %	121582612
109	NC_008766	CG	3	6	57605	57610	0 %	0 %	50 %	50 %	121582612
110	NC_008766	CG	3	6	58195	58200	0 %	0 %	50 %	50 %	121582612
111	NC_008766	GC	4	8	58571	58578	0 %	0 %	50 %	50 %	121582613
112	NC_008766	CG	3	6	59080	59085	0 %	0 %	50 %	50 %	121582614
113	NC_008766	GC	3	6	59805	59810	0 %	0 %	50 %	50 %	121582614
114	NC_008766	GC	3	6	60720	60725	0 %	0 %	50 %	50 %	121582615
115	NC_008766	CG	3	6	62034	62039	0 %	0 %	50 %	50 %	121582616
116	NC_008766	GC	3	6	62531	62536	0 %	0 %	50 %	50 %	121582616
117	NC_008766	GC	3	6	62617	62622	0 %	0 %	50 %	50 %	121582616
118	NC_008766	CG	3	6	62644	62649	0 %	0 %	50 %	50 %	121582616
119	NC_008766	CG	3	6	62732	62737	0 %	0 %	50 %	50 %	121582616
120	NC_008766	GC	3	6	63296	63301	0 %	0 %	50 %	50 %	121582617
121	NC_008766	CG	3	6	63582	63587	0 %	0 %	50 %	50 %	121582617

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.