MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	CG	4	8	80	87	0 %	0 %	50 %	50 %	121582467
2	NC_008765	CA	3	6	203	208	50 %	0 %	0 %	50 %	121582467
3	NC_008765	GC	4	8	486	493	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
4	NC_008765	GC	3	6	875	880	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
5	NC_008765	GC	3	6	889	894	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
6	NC_008765	GC	3	6	1307	1312	0 %	0 %	50 %	50 %	121582469
7	NC_008765	GC	3	6	2724	2729	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
8	NC_008765	CG	3	6	3194	3199	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
9	NC_008765	GC	3	6	3480	3485	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
10	NC_008765	GC	5	10	3974	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
11	NC_008765	GC	3	6	4841	4846	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
12	NC_008765	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
13	NC_008765	CG	4	8	4946	4953	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
14	NC_008765	CG	4	8	5333	5340	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
15	NC_008765	CG	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
16	NC_008765	CG	3	6	6103	6108	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
17	NC_008765	GC	3	6	6761	6766	0 %	0 %	50 %	50 %	121582473
18	NC_008765	CG	4	8	7728	7735	0 %	0 %	50 %	50 %	121582474
19	NC_008765	AG	4	8	7768	7775	50 %	0 %	50 %	0 %	121582474
20	NC_008765	GC	3	6	8630	8635	0 %	0 %	50 %	50 %	121582475
21	NC_008765	GC	3	6	10784	10789	0 %	0 %	50 %	50 %	121582477
22	NC_008765	CG	4	8	12038	12045	0 %	0 %	50 %	50 %	121582478
23	NC_008765	GC	3	6	12469	12474	0 %	0 %	50 %	50 %	121582479
24	NC_008765	GC	3	6	12477	12482	0 %	0 %	50 %	50 %	121582479
25	NC_008765	AC	3	6	13148	13153	50 %	0 %	0 %	50 %	121582480
26	NC_008765	GC	3	6	13347	13352	0 %	0 %	50 %	50 %	121582481
27	NC_008765	CA	3	6	14016	14021	50 %	0 %	0 %	50 %	121582482
28	NC_008765	CG	3	6	14680	14685	0 %	0 %	50 %	50 %	121582482
29	NC_008765	GC	3	6	15646	15651	0 %	0 %	50 %	50 %	121582482
30	NC_008765	GC	3	6	16729	16734	0 %	0 %	50 %	50 %	121582483
31	NC_008765	GC	3	6	17092	17097	0 %	0 %	50 %	50 %	121582484
32	NC_008765	GC	3	6	17308	17313	0 %	0 %	50 %	50 %	121582484
33	NC_008765	GC	3	6	18128	18133	0 %	0 %	50 %	50 %	121582485
34	NC_008765	GC	3	6	19229	19234	0 %	0 %	50 %	50 %	121582486
35	NC_008765	CG	3	6	20348	20353	0 %	0 %	50 %	50 %	121582487
36	NC_008765	GA	4	8	20697	20704	50 %	0 %	50 %	0 %	121582488
37	NC_008765	GA	3	6	21432	21437	50 %	0 %	50 %	0 %	121582490
38	NC_008765	GC	3	6	21810	21815	0 %	0 %	50 %	50 %	121582491
39	NC_008765	GC	3	6	21857	21862	0 %	0 %	50 %	50 %	121582491
40	NC_008765	CG	3	6	21905	21910	0 %	0 %	50 %	50 %	121582491
41	NC_008765	GC	3	6	25004	25009	0 %	0 %	50 %	50 %	121582495
42	NC_008765	GA	3	6	25023	25028	50 %	0 %	50 %	0 %	121582495
43	NC_008765	CG	3	6	25263	25268	0 %	0 %	50 %	50 %	121582495
44	NC_008765	GC	3	6	25892	25897	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
45	NC_008765	GA	4	8	26076	26083	50 %	0 %	50 %	0 %	121582496
46	NC_008765	CG	3	6	26157	26162	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
47	NC_008765	CG	3	6	26475	26480	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
48	NC_008765	CG	3	6	26711	26716	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
49	NC_008765	GC	3	6	27398	27403	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
50	NC_008765	GC	3	6	27650	27655	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
51	NC_008765	GC	3	6	27778	27783	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
52	NC_008765	GC	3	6	27816	27821	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
53	NC_008765	GA	3	6	28300	28305	50 %	0 %	50 %	0 %	121582496
54	NC_008765	CG	4	8	29126	29133	0 %	0 %	50 %	50 %	121582498
55	NC_008765	GC	3	6	29504	29509	0 %	0 %	50 %	50 %	121582498
56	NC_008765	GT	3	6	29749	29754	0 %	50 %	50 %	0 %	121582498
57	NC_008765	GC	3	6	30478	30483	0 %	0 %	50 %	50 %	121582498
58	NC_008765	CT	4	8	31040	31047	0 %	50 %	0 %	50 %	121582498
59	NC_008765	GC	3	6	33975	33980	0 %	0 %	50 %	50 %	121582502
60	NC_008765	CG	3	6	34041	34046	0 %	0 %	50 %	50 %	121582502
61	NC_008765	GC	3	6	34575	34580	0 %	0 %	50 %	50 %	121582504
62	NC_008765	CG	3	6	34740	34745	0 %	0 %	50 %	50 %	121582505
63	NC_008765	GC	3	6	34748	34753	0 %	0 %	50 %	50 %	121582505
64	NC_008765	GC	3	6	35355	35360	0 %	0 %	50 %	50 %	121582506
65	NC_008765	CG	3	6	35443	35448	0 %	0 %	50 %	50 %	121582506
66	NC_008765	GC	3	6	36680	36685	0 %	0 %	50 %	50 %	121582508
67	NC_008765	GC	3	6	37079	37084	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
68	NC_008765	GC	3	6	37187	37192	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
69	NC_008765	CG	3	6	37321	37326	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
70	NC_008765	CG	3	6	37342	37347	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
71	NC_008765	GC	3	6	37983	37988	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
72	NC_008765	GC	3	6	38089	38094	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
73	NC_008765	CG	3	6	38448	38453	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
74	NC_008765	GC	3	6	38638	38643	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
75	NC_008765	GC	3	6	39052	39057	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
76	NC_008765	GC	3	6	39213	39218	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
77	NC_008765	GC	3	6	39235	39240	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
78	NC_008765	GC	3	6	39280	39285	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
79	NC_008765	CG	3	6	40618	40623	0 %	0 %	50 %	50 %	121582511
80	NC_008765	GC	4	8	41035	41042	0 %	0 %	50 %	50 %	121582512
81	NC_008765	CA	3	6	42148	42153	50 %	0 %	0 %	50 %	121582514
82	NC_008765	CG	3	6	42388	42393	0 %	0 %	50 %	50 %	121582514
83	NC_008765	CG	4	8	44483	44490	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
84	NC_008765	CG	3	6	44703	44708	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
85	NC_008765	CG	3	6	44726	44731	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
86	NC_008765	GC	3	6	44900	44905	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
87	NC_008765	CG	3	6	45197	45202	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
88	NC_008765	CG	3	6	45747	45752	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
89	NC_008765	GC	4	8	45855	45862	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
90	NC_008765	GC	4	8	45870	45877	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
91	NC_008765	GC	3	6	46699	46704	0 %	0 %	50 %	50 %	121582520
92	NC_008765	GC	3	6	46931	46936	0 %	0 %	50 %	50 %	121582521
93	NC_008765	CA	4	8	47613	47620	50 %	0 %	0 %	50 %	121582521
94	NC_008765	CG	3	6	48109	48114	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
95	NC_008765	GC	4	8	48123	48130	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
96	NC_008765	GC	3	6	48186	48191	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
97	NC_008765	CG	3	6	48222	48227	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
98	NC_008765	GC	3	6	48245	48250	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
99	NC_008765	GC	3	6	48642	48647	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
100	NC_008765	GC	3	6	50551	50556	0 %	0 %	50 %	50 %	121582523
101	NC_008765	TG	3	6	51618	51623	0 %	50 %	50 %	0 %	121582524
102	NC_008765	GC	3	6	51651	51656	0 %	0 %	50 %	50 %	121582524
103	NC_008765	GC	3	6	51845	51850	0 %	0 %	50 %	50 %	121582525
104	NC_008765	CA	3	6	51885	51890	50 %	0 %	0 %	50 %	121582525
105	NC_008765	GT	3	6	52528	52533	0 %	50 %	50 %	0 %	121582526
106	NC_008765	CG	3	6	53303	53308	0 %	0 %	50 %	50 %	121582527
107	NC_008765	CG	4	8	54239	54246	0 %	0 %	50 %	50 %	121582528
108	NC_008765	CG	3	6	54413	54418	0 %	0 %	50 %	50 %	121582528
109	NC_008765	GA	5	10	56361	56370	50 %	0 %	50 %	0 %	121582530
110	NC_008765	CA	3	6	56809	56814	50 %	0 %	0 %	50 %	121582531
111	NC_008765	GC	3	6	57196	57201	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
112	NC_008765	CG	3	6	57558	57563	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
113	NC_008765	GC	3	6	57613	57618	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
114	NC_008765	GC	3	6	57794	57799	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
115	NC_008765	CG	3	6	58156	58161	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
116	NC_008765	GC	3	6	58213	58218	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
117	NC_008765	GC	3	6	58443	58448	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
118	NC_008765	GC	4	8	58622	58629	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
119	NC_008765	AC	3	6	58844	58849	50 %	0 %	0 %	50 %	121582531
120	NC_008765	GC	3	6	59403	59408	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
121	NC_008765	GT	3	6	59627	59632	0 %	50 %	50 %	0 %	121582531
122	NC_008765	CG	3	6	59873	59878	0 %	0 %	50 %	50 %	121582532
123	NC_008765	CG	4	8	59938	59945	0 %	0 %	50 %	50 %	121582532
124	NC_008765	GC	3	6	59984	59989	0 %	0 %	50 %	50 %	121582532
125	NC_008765	GC	3	6	60200	60205	0 %	0 %	50 %	50 %	121582532
126	NC_008765	CA	3	6	60496	60501	50 %	0 %	0 %	50 %	121582533
127	NC_008765	CG	4	8	61134	61141	0 %	0 %	50 %	50 %	121582533
128	NC_008765	GC	3	6	61412	61417	0 %	0 %	50 %	50 %	121582534
129	NC_008765	GC	3	6	61932	61937	0 %	0 %	50 %	50 %	121582535
130	NC_008765	GC	4	8	62535	62542	0 %	0 %	50 %	50 %	121582536
131	NC_008765	GC	3	6	63966	63971	0 %	0 %	50 %	50 %	121582538
132	NC_008765	GC	3	6	64483	64488	0 %	0 %	50 %	50 %	121582538
133	NC_008765	GC	3	6	64525	64530	0 %	0 %	50 %	50 %	121582538
134	NC_008765	GC	3	6	64614	64619	0 %	0 %	50 %	50 %	121582538
135	NC_008765	GC	3	6	64939	64944	0 %	0 %	50 %	50 %	121582539
136	NC_008765	GC	3	6	64967	64972	0 %	0 %	50 %	50 %	121582539
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139	NC_008765	GC	3	6	67549	67554	0 %	0 %	50 %	50 %	121582542
140	NC_008765	GC	3	6	67687	67692	0 %	0 %	50 %	50 %	121582542
141	NC_008765	GC	3	6	68158	68163	0 %	0 %	50 %	50 %	121582542
142	NC_008765	CG	3	6	68483	68488	0 %	0 %	50 %	50 %	121582542
143	NC_008765	GC	3	6	68557	68562	0 %	0 %	50 %	50 %	121582542
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145	NC_008765	GC	3	6	69605	69610	0 %	0 %	50 %	50 %	121582545
146	NC_008765	CG	3	6	69976	69981	0 %	0 %	50 %	50 %	121582545
147	NC_008765	CG	3	6	70039	70044	0 %	0 %	50 %	50 %	121582545
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149	NC_008765	CG	3	6	70159	70164	0 %	0 %	50 %	50 %	121582545
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155	NC_008765	GC	3	6	72164	72169	0 %	0 %	50 %	50 %	121582550
156	NC_008765	GC	3	6	72290	72295	0 %	0 %	50 %	50 %	121582550

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.