MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 1414

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	ACTC	2	8	62	69	25 %	25 %	0 %	50 %	121582467
2	NC_008765	CG	4	8	80	87	0 %	0 %	50 %	50 %	121582467
3	NC_008765	CA	3	6	203	208	50 %	0 %	0 %	50 %	121582467
4	NC_008765	GGC	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582468
5	NC_008765	GC	4	8	486	493	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
6	NC_008765	ACC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582468
7	NC_008765	GGC	2	6	551	556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582468
8	NC_008765	GGT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582468
9	NC_008765	AGG	2	6	579	584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582468
10	NC_008765	GCT	2	6	587	592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582468
11	NC_008765	AGC	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582468
12	NC_008765	GCA	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582468
13	NC_008765	CTT	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582468
14	NC_008765	GGC	2	6	793	798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582468
15	NC_008765	GC	3	6	875	880	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
16	NC_008765	GC	3	6	889	894	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
17	NC_008765	TTGGC	2	10	943	952	0 %	40 %	40 %	20 %	121582468
18	NC_008765	GCC	2	6	992	997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582468
19	NC_008765	ATG	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582468
20	NC_008765	T	6	6	1207	1212	0 %	100 %	0 %	0 %	121582469
21	NC_008765	GTTG	2	8	1237	1244	0 %	50 %	50 %	0 %	121582469
22	NC_008765	CAG	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582469
23	NC_008765	GC	3	6	1307	1312	0 %	0 %	50 %	50 %	121582469
24	NC_008765	TGCC	2	8	1319	1326	0 %	25 %	25 %	50 %	121582469
25	NC_008765	TCA	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582469
26	NC_008765	GCC	2	6	1384	1389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582469
27	NC_008765	GCT	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582469
28	NC_008765	GCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582470
29	NC_008765	GCA	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582470
30	NC_008765	GCC	2	6	1618	1623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582470
31	NC_008765	GTG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582470
32	NC_008765	GAC	2	6	1750	1755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582470
33	NC_008765	CCT	2	6	1766	1771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582470
34	NC_008765	CCCTTT	2	12	2117	2128	0 %	50 %	0 %	50 %	121582471
35	NC_008765	GTT	2	6	2139	2144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
36	NC_008765	GGC	2	6	2157	2162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582471
37	NC_008765	TGT	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
38	NC_008765	CGC	2	6	2213	2218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
39	NC_008765	TGT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
40	NC_008765	TGC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
41	NC_008765	TTC	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
42	NC_008765	GAGCG	2	10	2463	2472	20 %	0 %	60 %	20 %	121582471
43	NC_008765	CCG	2	6	2476	2481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
44	NC_008765	CTT	3	9	2499	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
45	NC_008765	CTG	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
46	NC_008765	TGG	3	9	2618	2626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582471
47	NC_008765	CTG	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
48	NC_008765	TCAC	2	8	2647	2654	25 %	25 %	0 %	50 %	121582471
49	NC_008765	TTGG	2	8	2691	2698	0 %	50 %	50 %	0 %	121582471
50	NC_008765	GC	3	6	2724	2729	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
51	NC_008765	ACG	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582471
52	NC_008765	CACG	2	8	2846	2853	25 %	0 %	25 %	50 %	121582471
53	NC_008765	GGC	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582471
54	NC_008765	GATT	2	8	2914	2921	25 %	50 %	25 %	0 %	121582471
55	NC_008765	GTGC	2	8	2974	2981	0 %	25 %	50 %	25 %	121582471
56	NC_008765	CAC	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582471
57	NC_008765	CGG	2	6	3032	3037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582471
58	NC_008765	TGA	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
59	NC_008765	GCC	2	6	3108	3113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
60	NC_008765	TTC	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
61	NC_008765	CGC	2	6	3155	3160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
62	NC_008765	CG	3	6	3194	3199	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
63	NC_008765	CCG	3	9	3238	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
64	NC_008765	GCC	2	6	3301	3306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
65	NC_008765	CCA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582471
66	NC_008765	ACCC	2	8	3374	3381	25 %	0 %	0 %	75 %	121582471
67	NC_008765	GCC	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
68	NC_008765	GC	3	6	3480	3485	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
69	NC_008765	GATGT	2	10	3502	3511	20 %	40 %	40 %	0 %	121582471
70	NC_008765	CGGC	2	8	3535	3542	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
71	NC_008765	GCT	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
72	NC_008765	CCGA	2	8	3645	3652	25 %	0 %	25 %	50 %	121582471
73	NC_008765	CGC	2	6	3662	3667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
74	NC_008765	TTGC	2	8	3766	3773	0 %	50 %	25 %	25 %	121582471
75	NC_008765	CCG	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
76	NC_008765	TCA	2	6	3806	3811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582471
77	NC_008765	TGA	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
78	NC_008765	GCC	2	6	3901	3906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
79	NC_008765	GCC	2	6	3961	3966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
80	NC_008765	GC	5	10	3974	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
81	NC_008765	GGT	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582471
82	NC_008765	TGA	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
83	NC_008765	CAT	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582471
84	NC_008765	TCT	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
85	NC_008765	CAC	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582471
86	NC_008765	AAC	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582471
87	NC_008765	GAT	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
88	NC_008765	CAG	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582471
89	NC_008765	GCCGC	2	10	4229	4238	0 %	0 %	40 %	60 %	121582471
90	NC_008765	CAG	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582471
91	NC_008765	CCT	2	6	4316	4321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582471
92	NC_008765	TGT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
93	NC_008765	GTT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
94	NC_008765	CGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
95	NC_008765	GGT	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582471
96	NC_008765	GTT	2	6	4599	4604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
97	NC_008765	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
98	NC_008765	CTG	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
99	NC_008765	CGT	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
100	NC_008765	TGA	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
101	NC_008765	TCG	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
102	NC_008765	GC	3	6	4841	4846	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
103	NC_008765	GTC	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
104	NC_008765	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
105	NC_008765	CG	4	8	4946	4953	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
106	NC_008765	GCT	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
107	NC_008765	CAT	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582471
108	NC_008765	GTA	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
109	NC_008765	GCGA	2	8	5208	5215	25 %	0 %	50 %	25 %	121582472
110	NC_008765	CCT	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582472
111	NC_008765	TGT	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582472
112	NC_008765	CG	4	8	5333	5340	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
113	NC_008765	TCC	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582472
114	NC_008765	CGG	2	6	5377	5382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582472
115	NC_008765	CGCGC	2	10	5420	5429	0 %	0 %	40 %	60 %	121582472
116	NC_008765	GGC	2	6	5471	5476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582472
117	NC_008765	GTT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582472
118	NC_008765	GTC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
119	NC_008765	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
120	NC_008765	GTC	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
121	NC_008765	T	6	6	5641	5646	0 %	100 %	0 %	0 %	121582472
122	NC_008765	TCT	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582472
123	NC_008765	TGG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
124	NC_008765	TCGG	2	8	5697	5704	0 %	25 %	50 %	25 %	121582472
125	NC_008765	AGC	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582472
126	NC_008765	TGG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
127	NC_008765	GGT	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
128	NC_008765	CACC	2	8	5779	5786	25 %	0 %	0 %	75 %	121582472
129	NC_008765	GCA	2	6	5812	5817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582472
130	NC_008765	TGC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
131	NC_008765	ATC	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582472
132	NC_008765	TCG	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
133	NC_008765	CTT	2	6	5915	5920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582472
134	NC_008765	CG	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
135	NC_008765	GCC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582472
136	NC_008765	TCA	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582472
137	NC_008765	CG	3	6	6103	6108	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
138	NC_008765	GCC	2	6	6147	6152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582472
139	NC_008765	GCA	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582472
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143	NC_008765	CGG	2	6	6374	6379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582472
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169	NC_008765	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582474
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256	NC_008765	CG	4	8	12038	12045	0 %	0 %	50 %	50 %	121582478
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261	NC_008765	GAA	2	6	12338	12343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582479
262	NC_008765	CAC	2	6	12401	12406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582479
263	NC_008765	CGT	2	6	12415	12420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582479
264	NC_008765	GTC	2	6	12423	12428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582479
265	NC_008765	GC	3	6	12469	12474	0 %	0 %	50 %	50 %	121582479
266	NC_008765	GC	3	6	12477	12482	0 %	0 %	50 %	50 %	121582479
267	NC_008765	GGT	2	6	12485	12490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582479
268	NC_008765	TGC	2	6	12520	12525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582479
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271	NC_008765	CGC	2	6	12568	12573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582479
272	NC_008765	CTT	2	6	12593	12598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582479
273	NC_008765	TCC	2	6	12621	12626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582479
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277	NC_008765	CAG	2	6	12695	12700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582479
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279	NC_008765	GCCA	2	8	12945	12952	25 %	0 %	25 %	50 %	121582480
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281	NC_008765	GGT	2	6	12975	12980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582480
282	NC_008765	CTT	2	6	13032	13037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582480
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288	NC_008765	TTG	2	6	13254	13259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582481
289	NC_008765	CTT	2	6	13310	13315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582481
290	NC_008765	GC	3	6	13347	13352	0 %	0 %	50 %	50 %	121582481
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293	NC_008765	TGA	2	6	13465	13470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582481
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297	NC_008765	CGGC	2	8	13567	13574	0 %	0 %	50 %	50 %	121582481
298	NC_008765	GTTGG	2	10	13590	13599	0 %	40 %	60 %	0 %	121582481
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301	NC_008765	GTT	2	6	13640	13645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582482
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331	NC_008765	CGCC	2	8	14747	14754	0 %	0 %	25 %	75 %	121582482
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381	NC_008765	GC	3	6	17092	17097	0 %	0 %	50 %	50 %	121582484
382	NC_008765	TCT	2	6	17128	17133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582484
383	NC_008765	CAGG	2	8	17149	17156	25 %	0 %	50 %	25 %	121582484
384	NC_008765	CAC	2	6	17192	17197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582484
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387	NC_008765	CTT	2	6	17261	17266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582484
388	NC_008765	GCTC	2	8	17281	17288	0 %	25 %	25 %	50 %	121582484
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391	NC_008765	TCG	2	6	17616	17621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582484
392	NC_008765	GTC	2	6	17694	17699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582484
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432	NC_008765	GTCC	2	8	19183	19190	0 %	25 %	25 %	50 %	121582486
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439	NC_008765	CCA	2	6	19338	19343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582486
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500	NC_008765	ACT	2	6	22710	22715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582492

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