MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 6356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008578	GAAG	2	8	248	255	50 %	0 %	50 %	0 %	117927212
2	NC_008578	CCGG	2	8	272	279	0 %	0 %	50 %	50 %	117927212
3	NC_008578	GCCG	2	8	306	313	0 %	0 %	50 %	50 %	117927212
4	NC_008578	AGCA	2	8	533	540	50 %	0 %	25 %	25 %	117927212
5	NC_008578	CTGA	2	8	1353	1360	25 %	25 %	25 %	25 %	117927212
6	NC_008578	TCGA	2	8	1457	1464	25 %	25 %	25 %	25 %	117927212
7	NC_008578	CGTC	2	8	1990	1997	0 %	25 %	25 %	50 %	117927213
8	NC_008578	CGAC	2	8	3260	3267	25 %	0 %	25 %	50 %	117927214
9	NC_008578	CCGT	2	8	3542	3549	0 %	25 %	25 %	50 %	117927214
10	NC_008578	GCGG	2	8	3660	3667	0 %	0 %	75 %	25 %	117927214
11	NC_008578	GCCA	2	8	3955	3962	25 %	0 %	25 %	50 %	117927214
12	NC_008578	GGCT	2	8	4397	4404	0 %	25 %	50 %	25 %	117927215
13	NC_008578	GCCG	2	8	4476	4483	0 %	0 %	50 %	50 %	117927215
14	NC_008578	GACC	2	8	4623	4630	25 %	0 %	25 %	50 %	117927215
15	NC_008578	CTCG	2	8	4961	4968	0 %	25 %	25 %	50 %	117927216
16	NC_008578	CCGA	2	8	5439	5446	25 %	0 %	25 %	50 %	117927216
17	NC_008578	GCCG	2	8	5624	5631	0 %	0 %	50 %	50 %	117927216
18	NC_008578	GCAC	2	8	5854	5861	25 %	0 %	25 %	50 %	117927216
19	NC_008578	AGGG	2	8	5964	5971	25 %	0 %	75 %	0 %	117927216
20	NC_008578	TCGT	2	8	6057	6064	0 %	50 %	25 %	25 %	117927216
21	NC_008578	CGGC	2	8	6301	6308	0 %	0 %	50 %	50 %	117927216
22	NC_008578	GGCC	2	8	6692	6699	0 %	0 %	50 %	50 %	117927216
23	NC_008578	GGCG	2	8	7092	7099	0 %	0 %	75 %	25 %	117927217
24	NC_008578	GAAA	2	8	7417	7424	75 %	0 %	25 %	0 %	117927217
25	NC_008578	CGGC	2	8	7771	7778	0 %	0 %	50 %	50 %	117927217
26	NC_008578	GGAA	2	8	7855	7862	50 %	0 %	50 %	0 %	117927217
27	NC_008578	TATC	2	8	10729	10736	25 %	50 %	0 %	25 %	117927219
28	NC_008578	AACG	2	8	10862	10869	50 %	0 %	25 %	25 %	117927219
29	NC_008578	CTAG	2	8	10929	10936	25 %	25 %	25 %	25 %	117927219
30	NC_008578	TTGC	2	8	11395	11402	0 %	50 %	25 %	25 %	117927220
31	NC_008578	CAAT	2	8	11444	11451	50 %	25 %	0 %	25 %	117927220
32	NC_008578	GGCA	2	8	11672	11679	25 %	0 %	50 %	25 %	117927220
33	NC_008578	AGCG	2	8	11928	11935	25 %	0 %	50 %	25 %	117927221
34	NC_008578	GCTG	2	8	12577	12584	0 %	25 %	50 %	25 %	117927222
35	NC_008578	CCTC	2	8	12661	12668	0 %	25 %	0 %	75 %	117927222
36	NC_008578	CCGG	2	8	13002	13009	0 %	0 %	50 %	50 %	117927223
37	NC_008578	ACCT	2	8	13640	13647	25 %	25 %	0 %	50 %	117927224
38	NC_008578	CGGC	2	8	14020	14027	0 %	0 %	50 %	50 %	117927224
39	NC_008578	CCAG	2	8	14541	14548	25 %	0 %	25 %	50 %	117927225
40	NC_008578	CGCA	2	8	14941	14948	25 %	0 %	25 %	50 %	117927226
41	NC_008578	CCGA	2	8	16156	16163	25 %	0 %	25 %	50 %	117927227
42	NC_008578	CCGA	2	8	16207	16214	25 %	0 %	25 %	50 %	117927227
43	NC_008578	CGGC	2	8	16278	16285	0 %	0 %	50 %	50 %	117927227
44	NC_008578	GGGA	2	8	16331	16338	25 %	0 %	75 %	0 %	117927227
45	NC_008578	GGCT	2	8	16352	16359	0 %	25 %	50 %	25 %	117927228
46	NC_008578	GCTC	2	8	17270	17277	0 %	25 %	25 %	50 %	117927229
47	NC_008578	GCCG	2	8	17718	17725	0 %	0 %	50 %	50 %	117927230
48	NC_008578	GGCG	2	8	18065	18072	0 %	0 %	75 %	25 %	117927230
49	NC_008578	TCGG	2	8	19038	19045	0 %	25 %	50 %	25 %	117927230
50	NC_008578	CCAG	2	8	21225	21232	25 %	0 %	25 %	50 %	117927232
51	NC_008578	GATG	2	8	21627	21634	25 %	25 %	50 %	0 %	117927232
52	NC_008578	GCGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	117927232
53	NC_008578	ACGA	2	8	22336	22343	50 %	0 %	25 %	25 %	117927233
54	NC_008578	CGCC	2	8	22953	22960	0 %	0 %	25 %	75 %	117927233
55	NC_008578	CCCA	2	8	23067	23074	25 %	0 %	0 %	75 %	117927233
56	NC_008578	CGCC	2	8	23434	23441	0 %	0 %	25 %	75 %	117927234
57	NC_008578	GTTG	2	8	23820	23827	0 %	50 %	50 %	0 %	117927235
58	NC_008578	GGTC	2	8	23834	23841	0 %	25 %	50 %	25 %	117927235
59	NC_008578	GCCG	2	8	23999	24006	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
60	NC_008578	CGGC	2	8	24032	24039	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
61	NC_008578	GCGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	117927235
62	NC_008578	CGGC	2	8	25037	25044	0 %	0 %	50 %	50 %	117927236
63	NC_008578	CCGT	2	8	25955	25962	0 %	25 %	25 %	50 %	117927236
64	NC_008578	GTCT	2	8	26054	26061	0 %	50 %	25 %	25 %	117927236
65	NC_008578	GGCT	2	8	26614	26621	0 %	25 %	50 %	25 %	117927236
66	NC_008578	CGTA	2	8	27057	27064	25 %	25 %	25 %	25 %	117927237
67	NC_008578	TTCG	2	8	27516	27523	0 %	50 %	25 %	25 %	117927237
68	NC_008578	CCAT	2	8	27945	27952	25 %	25 %	0 %	50 %	117927237
69	NC_008578	CAGC	2	8	28507	28514	25 %	0 %	25 %	50 %	117927237
70	NC_008578	CGTC	2	8	28725	28732	0 %	25 %	25 %	50 %	117927237
71	NC_008578	GGAC	2	8	28752	28759	25 %	0 %	50 %	25 %	117927237
72	NC_008578	ATCG	2	8	28787	28794	25 %	25 %	25 %	25 %	117927237
73	NC_008578	CCGT	2	8	29999	30006	0 %	25 %	25 %	50 %	117927238
74	NC_008578	TTGC	2	8	30026	30033	0 %	50 %	25 %	25 %	117927238
75	NC_008578	GCCG	2	8	30229	30236	0 %	0 %	50 %	50 %	117927238
76	NC_008578	TCGG	2	8	30372	30379	0 %	25 %	50 %	25 %	117927238
77	NC_008578	CCCG	2	8	31247	31254	0 %	0 %	25 %	75 %	117927239
78	NC_008578	AGGC	2	8	31927	31934	25 %	0 %	50 %	25 %	117927240
79	NC_008578	GTGG	2	8	32474	32481	0 %	25 %	75 %	0 %	117927240
80	NC_008578	CCGT	2	8	32517	32524	0 %	25 %	25 %	50 %	117927240
81	NC_008578	GCTG	2	8	33313	33320	0 %	25 %	50 %	25 %	117927240
82	NC_008578	CCGC	2	8	35244	35251	0 %	0 %	25 %	75 %	117927242
83	NC_008578	GTTC	2	8	35441	35448	0 %	50 %	25 %	25 %	117927242
84	NC_008578	ACGT	2	8	35827	35834	25 %	25 %	25 %	25 %	117927242
85	NC_008578	AGCG	2	8	36194	36201	25 %	0 %	50 %	25 %	117927243
86	NC_008578	GCAG	2	8	37039	37046	25 %	0 %	50 %	25 %	117927244
87	NC_008578	GTCG	3	12	37744	37755	0 %	25 %	50 %	25 %	117927244
88	NC_008578	GCCG	2	8	38560	38567	0 %	0 %	50 %	50 %	117927245
89	NC_008578	GACG	2	8	38621	38628	25 %	0 %	50 %	25 %	117927245
90	NC_008578	CGGC	2	8	38702	38709	0 %	0 %	50 %	50 %	117927245
91	NC_008578	TTGC	2	8	38932	38939	0 %	50 %	25 %	25 %	117927245
92	NC_008578	TTCC	2	8	39592	39599	0 %	50 %	0 %	50 %	117927246
93	NC_008578	CTGC	2	8	39724	39731	0 %	25 %	25 %	50 %	117927246
94	NC_008578	GGCC	2	8	39817	39824	0 %	0 %	50 %	50 %	117927246
95	NC_008578	TCGC	2	8	40338	40345	0 %	25 %	25 %	50 %	117927246
96	NC_008578	TTCG	2	8	40391	40398	0 %	50 %	25 %	25 %	117927246
97	NC_008578	CCGG	2	8	40418	40425	0 %	0 %	50 %	50 %	117927246
98	NC_008578	GGCC	2	8	40427	40434	0 %	0 %	50 %	50 %	117927246
99	NC_008578	GCCG	2	8	40435	40442	0 %	0 %	50 %	50 %	117927246
100	NC_008578	CGAG	2	8	42250	42257	25 %	0 %	50 %	25 %	117927247
101	NC_008578	AGCG	2	8	42435	42442	25 %	0 %	50 %	25 %	117927248
102	NC_008578	ACCG	2	8	42468	42475	25 %	0 %	25 %	50 %	117927248
103	NC_008578	AGCT	2	8	43258	43265	25 %	25 %	25 %	25 %	117927249
104	NC_008578	TCCG	2	8	43533	43540	0 %	25 %	25 %	50 %	117927249
105	NC_008578	TCCG	2	8	43570	43577	0 %	25 %	25 %	50 %	117927249
106	NC_008578	CATC	2	8	43656	43663	25 %	25 %	0 %	50 %	117927249
107	NC_008578	ACCT	2	8	44344	44351	25 %	25 %	0 %	50 %	117927250
108	NC_008578	TCGG	2	8	46121	46128	0 %	25 %	50 %	25 %	117927252
109	NC_008578	TGCT	2	8	46350	46357	0 %	50 %	25 %	25 %	117927252
110	NC_008578	CGGC	2	8	46562	46569	0 %	0 %	50 %	50 %	117927252
111	NC_008578	GCCG	2	8	47828	47835	0 %	0 %	50 %	50 %	117927253
112	NC_008578	GACG	2	8	47878	47885	25 %	0 %	50 %	25 %	117927253
113	NC_008578	GCCG	2	8	48238	48245	0 %	0 %	50 %	50 %	117927254
114	NC_008578	CCTG	2	8	49849	49856	0 %	25 %	25 %	50 %	117927256
115	NC_008578	GGCC	2	8	49957	49964	0 %	0 %	50 %	50 %	117927256
116	NC_008578	GCTG	2	8	50854	50861	0 %	25 %	50 %	25 %	117927256
117	NC_008578	GACG	2	8	51323	51330	25 %	0 %	50 %	25 %	117927257
118	NC_008578	AGGT	2	8	51399	51406	25 %	25 %	50 %	0 %	117927257
119	NC_008578	CCGG	2	8	51526	51533	0 %	0 %	50 %	50 %	117927257
120	NC_008578	CCGC	2	8	51575	51582	0 %	0 %	25 %	75 %	117927258
121	NC_008578	CCAG	2	8	51785	51792	25 %	0 %	25 %	50 %	117927258
122	NC_008578	CGGT	2	8	51983	51990	0 %	25 %	50 %	25 %	117927258
123	NC_008578	CCGT	2	8	52269	52276	0 %	25 %	25 %	50 %	117927258
124	NC_008578	CCGG	2	8	52401	52408	0 %	0 %	50 %	50 %	117927258
125	NC_008578	CAGC	2	8	52808	52815	25 %	0 %	25 %	50 %	117927258
126	NC_008578	ACCG	2	8	53554	53561	25 %	0 %	25 %	50 %	117927259
127	NC_008578	CCGA	2	8	53686	53693	25 %	0 %	25 %	50 %	117927259
128	NC_008578	CGGT	2	8	53813	53820	0 %	25 %	50 %	25 %	117927259
129	NC_008578	AGCG	2	8	53860	53867	25 %	0 %	50 %	25 %	117927259
130	NC_008578	CTGC	2	8	54117	54124	0 %	25 %	25 %	50 %	117927259
131	NC_008578	CCCG	2	8	54385	54392	0 %	0 %	25 %	75 %	117927260
132	NC_008578	CCGC	2	8	54833	54840	0 %	0 %	25 %	75 %	117927260
133	NC_008578	GACG	2	8	55843	55850	25 %	0 %	50 %	25 %	117927261
134	NC_008578	CGGC	2	8	56001	56008	0 %	0 %	50 %	50 %	117927261
135	NC_008578	AATT	2	8	56122	56129	50 %	50 %	0 %	0 %	117927261
136	NC_008578	TCGA	2	8	56617	56624	25 %	25 %	25 %	25 %	117927262
137	NC_008578	GCTC	2	8	58462	58469	0 %	25 %	25 %	50 %	117927263
138	NC_008578	GGCG	2	8	58591	58598	0 %	0 %	75 %	25 %	117927263
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