MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 1

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008537	CCGTC	2	10	705	714	0 %	20 %	20 %	60 %	116662074
2	NC_008537	CAGGG	2	10	1592	1601	20 %	0 %	60 %	20 %	116662074
3	NC_008537	CGTAC	2	10	6140	6149	20 %	20 %	20 %	40 %	116662078
4	NC_008537	GCGCC	2	10	6179	6188	0 %	0 %	40 %	60 %	116662078
5	NC_008537	CCTGC	2	10	6327	6336	0 %	20 %	20 %	60 %	116662079
6	NC_008537	GTGAG	2	10	8610	8619	20 %	20 %	60 %	0 %	116662081
7	NC_008537	GCGCC	2	10	9024	9033	0 %	0 %	40 %	60 %	116662082
8	NC_008537	GCCAG	2	10	9884	9893	20 %	0 %	40 %	40 %	116662082
9	NC_008537	AGACG	2	10	10633	10642	40 %	0 %	40 %	20 %	116662083
10	NC_008537	GGCCC	2	10	11275	11284	0 %	0 %	40 %	60 %	116662084
11	NC_008537	GCGGA	2	10	13637	13646	20 %	0 %	60 %	20 %	116662087
12	NC_008537	TCGGA	2	10	14087	14096	20 %	20 %	40 %	20 %	116662087
13	NC_008537	GGCAG	2	10	15093	15102	20 %	0 %	60 %	20 %	116662088
14	NC_008537	CCGCA	2	10	15417	15426	20 %	0 %	20 %	60 %	116662088
15	NC_008537	CGACC	2	10	15916	15925	20 %	0 %	20 %	60 %	116662089
16	NC_008537	GCGAA	2	10	16937	16946	40 %	0 %	40 %	20 %	116662090
17	NC_008537	AGGCG	2	10	18701	18710	20 %	0 %	60 %	20 %	116662091
18	NC_008537	GGCCC	2	10	18736	18745	0 %	0 %	40 %	60 %	116662091
19	NC_008537	GCGGA	2	10	24584	24593	20 %	0 %	60 %	20 %	116662101
20	NC_008537	CCTCG	2	10	26788	26797	0 %	20 %	20 %	60 %	116662104
21	NC_008537	CCGGG	2	10	27549	27558	0 %	0 %	60 %	40 %	116662104
22	NC_008537	TGCGC	2	10	30004	30013	0 %	20 %	40 %	40 %	116662106
23	NC_008537	GCCTC	2	10	30480	30489	0 %	20 %	20 %	60 %	116662106
24	NC_008537	AGCGC	2	10	31092	31101	20 %	0 %	40 %	40 %	116662107
25	NC_008537	TTTCA	2	10	33658	33667	20 %	60 %	0 %	20 %	116662110
26	NC_008537	TGGGG	2	10	33889	33898	0 %	20 %	80 %	0 %	116662110
27	NC_008537	CGTAG	2	10	35358	35367	20 %	20 %	40 %	20 %	116662111
28	NC_008537	TACCG	2	10	35639	35648	20 %	20 %	20 %	40 %	116662111
29	NC_008537	TGCGC	2	10	39182	39191	0 %	20 %	40 %	40 %	116662115
30	NC_008537	CGATC	2	10	39605	39614	20 %	20 %	20 %	40 %	116662115
31	NC_008537	CCGTG	2	10	42537	42546	0 %	20 %	40 %	40 %	116662117
32	NC_008537	GCCAC	2	10	44532	44541	20 %	0 %	20 %	60 %	116662120
33	NC_008537	TCCGC	2	10	46202	46211	0 %	20 %	20 %	60 %	116662121
34	NC_008537	GACCA	2	10	47385	47394	40 %	0 %	20 %	40 %	116662122
35	NC_008537	CGTTC	2	10	48288	48297	0 %	40 %	20 %	40 %	116662123
36	NC_008537	CCACA	2	10	48987	48996	40 %	0 %	0 %	60 %	116662124
37	NC_008537	CCCGG	2	10	51485	51494	0 %	0 %	40 %	60 %	116662126
38	NC_008537	GCGAT	2	10	51948	51957	20 %	20 %	40 %	20 %	116662126
39	NC_008537	CGGGA	2	10	52217	52226	20 %	0 %	60 %	20 %	116662127
40	NC_008537	CGGGT	2	10	52390	52399	0 %	20 %	60 %	20 %	116662127
41	NC_008537	CCGCC	2	10	53451	53460	0 %	0 %	20 %	80 %	116662129
42	NC_008537	GCATC	2	10	53507	53516	20 %	20 %	20 %	40 %	116662129
43	NC_008537	CGGCC	2	10	54690	54699	0 %	0 %	40 %	60 %	116662130
44	NC_008537	GGGCT	2	10	55480	55489	0 %	20 %	60 %	20 %	116662131
45	NC_008537	CGGAC	2	10	55931	55940	20 %	0 %	40 %	40 %	116662131
46	NC_008537	GGGCT	2	10	56695	56704	0 %	20 %	60 %	20 %	116662133
47	NC_008537	GTCCA	2	10	57223	57232	20 %	20 %	20 %	40 %	116662134
48	NC_008537	GAGTT	2	10	57442	57451	20 %	40 %	40 %	0 %	116662134
49	NC_008537	TCCGG	2	10	58790	58799	0 %	20 %	40 %	40 %	116662135
50	NC_008537	GCGCG	2	10	58899	58908	0 %	0 %	60 %	40 %	116662135
51	NC_008537	ACGGG	2	10	59211	59220	20 %	0 %	60 %	20 %	116662135
52	NC_008537	GCCGG	2	10	65973	65982	0 %	0 %	60 %	40 %	116662141
53	NC_008537	CGGGT	2	10	66009	66018	0 %	20 %	60 %	20 %	116662141
54	NC_008537	GTCCG	2	10	66184	66193	0 %	20 %	40 %	40 %	116662142
55	NC_008537	CCGCA	2	10	69072	69081	20 %	0 %	20 %	60 %	116662144
56	NC_008537	CGGGC	2	10	69258	69267	0 %	0 %	60 %	40 %	116662144
57	NC_008537	CCTGG	2	10	69669	69678	0 %	20 %	40 %	40 %	116662144
58	NC_008537	TGACC	2	10	74568	74577	20 %	20 %	20 %	40 %	116662149
59	NC_008537	GAACG	2	10	78539	78548	40 %	0 %	40 %	20 %	116662153
60	NC_008537	CCCAG	2	10	79044	79053	20 %	0 %	20 %	60 %	116662154
61	NC_008537	GTCGC	2	10	79721	79730	0 %	20 %	40 %	40 %	116662154
62	NC_008537	GCACC	2	10	84609	84618	20 %	0 %	20 %	60 %	116662158
63	NC_008537	TCACC	2	10	87259	87268	20 %	20 %	0 %	60 %	116662161
64	NC_008537	CGGCT	2	10	87468	87477	0 %	20 %	40 %	40 %	116662161
65	NC_008537	GACCC	2	10	89775	89784	20 %	0 %	20 %	60 %	116662162
66	NC_008537	CGGCC	2	10	89834	89843	0 %	0 %	40 %	60 %	116662162
67	NC_008537	CCTGT	2	10	93844	93853	0 %	40 %	20 %	40 %	116662166
68	NC_008537	CGGCG	2	10	94006	94015	0 %	0 %	60 %	40 %	116662166
69	NC_008537	CAGCG	2	10	97168	97177	20 %	0 %	40 %	40 %	116662168
70	NC_008537	CTTGG	2	10	97541	97550	0 %	40 %	40 %	20 %	116662169
71	NC_008537	CCGTG	2	10	97766	97775	0 %	20 %	40 %	40 %	116662169
72	NC_008537	TGGAC	2	10	98026	98035	20 %	20 %	40 %	20 %	116662169
73	NC_008537	GTGGC	2	10	98536	98545	0 %	20 %	60 %	20 %	116662170
74	NC_008537	TGACC	2	10	99656	99665	20 %	20 %	20 %	40 %	116662171
75	NC_008537	GTCTC	2	10	102439	102448	0 %	40 %	20 %	40 %	116662174
76	NC_008537	TGGGC	2	10	105084	105093	0 %	20 %	60 %	20 %	116662176
77	NC_008537	CGCGG	2	10	109312	109321	0 %	0 %	60 %	40 %	116662180
78	NC_008537	CTGGT	2	10	115745	115754	0 %	40 %	40 %	20 %	116662188
79	NC_008537	GGCGA	2	10	116763	116772	20 %	0 %	60 %	20 %	116662189
80	NC_008537	CGGGC	2	10	119282	119291	0 %	0 %	60 %	40 %	116662192
81	NC_008537	GGCCT	2	10	119292	119301	0 %	20 %	40 %	40 %	116662192
82	NC_008537	AGGGC	2	10	120457	120466	20 %	0 %	60 %	20 %	116662192
83	NC_008537	CGGCA	2	10	122597	122606	20 %	0 %	40 %	40 %	116662195
84	NC_008537	TGTCG	2	10	126943	126952	0 %	40 %	40 %	20 %	116662198
85	NC_008537	GCCGG	2	10	128065	128074	0 %	0 %	60 %	40 %	116662199
86	NC_008537	CAGGG	2	10	130390	130399	20 %	0 %	60 %	20 %	116662202
87	NC_008537	CGCGG	2	10	131293	131302	0 %	0 %	60 %	40 %	116662203
88	NC_008537	GCCGC	2	10	131603	131612	0 %	0 %	40 %	60 %	116662203
89	NC_008537	CGGGC	2	10	131698	131707	0 %	0 %	60 %	40 %	116662203
90	NC_008537	GGCTT	2	10	133976	133985	0 %	40 %	40 %	20 %	116662205
91	NC_008537	TGAGC	2	10	134700	134709	20 %	20 %	40 %	20 %	116662207
92	NC_008537	GGACC	2	10	135429	135438	20 %	0 %	40 %	40 %	116662208
93	NC_008537	GGGGC	2	10	136696	136705	0 %	0 %	80 %	20 %	116662210
94	NC_008537	ACCAC	2	10	139432	139441	40 %	0 %	0 %	60 %	116662212
95	NC_008537	ATCGG	2	10	141476	141485	20 %	20 %	40 %	20 %	116662214
96	NC_008537	GATGC	2	10	148038	148047	20 %	20 %	40 %	20 %	116662218
97	NC_008537	GCGGT	2	10	152065	152074	0 %	20 %	60 %	20 %	116662223
98	NC_008537	GCCGA	2	10	153040	153049	20 %	0 %	40 %	40 %	116662224
99	NC_008537	CTGAG	2	10	153265	153274	20 %	20 %	40 %	20 %	116662225
100	NC_008537	TGGCC	2	10	157276	157285	0 %	20 %	40 %	40 %	116662228
101	NC_008537	TCGGT	2	10	159383	159392	0 %	40 %	40 %	20 %	116662231
102	NC_008537	CCTGG	2	10	159414	159423	0 %	20 %	40 %	40 %	116662231

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.