MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008340	GCC	2	6	88926	88931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319244
2002	NC_008340	GTC	2	6	88964	88969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319244
2003	NC_008340	GGA	2	6	88999	89004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319244
2004	NC_008340	CCA	2	6	89008	89013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319244
2005	NC_008340	CGGTGA	2	12	89074	89085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319244
2006	NC_008340	TGA	2	6	89143	89148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319244
2007	NC_008340	TGA	2	6	89430	89435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319245
2008	NC_008340	GCA	2	6	89475	89480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319245
2009	NC_008340	GAG	2	6	89557	89562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319245
2010	NC_008340	GC	3	6	89587	89592	0 %	0 %	50 %	50 %	114319245
2011	NC_008340	GGA	2	6	89607	89612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319245
2012	NC_008340	GCC	3	9	89641	89649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319245
2013	NC_008340	CGC	3	9	89664	89672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319245
2014	NC_008340	CCGG	2	8	89674	89681	0 %	0 %	50 %	50 %	114319245
2015	NC_008340	AAG	2	6	89713	89718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319245
2016	NC_008340	GCC	2	6	89830	89835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
2017	NC_008340	TCG	2	6	89888	89893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319246
2018	NC_008340	CCG	2	6	89906	89911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
2019	NC_008340	GC	3	6	89920	89925	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2020	NC_008340	GCCG	2	8	89971	89978	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2021	NC_008340	CCG	2	6	89999	90004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
2022	NC_008340	GCG	2	6	90017	90022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
2023	NC_008340	TCC	2	6	90053	90058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319246
2024	NC_008340	GCC	2	6	90125	90130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
2025	NC_008340	GCT	2	6	90147	90152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319246
2026	NC_008340	GC	3	6	90169	90174	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2027	NC_008340	CGGG	2	8	90180	90187	0 %	0 %	75 %	25 %	114319246
2028	NC_008340	TGG	2	6	90191	90196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319246
2029	NC_008340	TGTC	2	8	90267	90274	0 %	50 %	25 %	25 %	114319246
2030	NC_008340	GCCG	2	8	90327	90334	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2031	NC_008340	CGC	3	9	90399	90407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
2032	NC_008340	CGG	2	6	90408	90413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
2033	NC_008340	CTG	2	6	90424	90429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319246
2034	NC_008340	CCG	2	6	90436	90441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
2035	NC_008340	GGC	2	6	90462	90467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
2036	NC_008340	GC	3	6	90466	90471	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2037	NC_008340	CCGAGG	2	12	90497	90508	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319246
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2039	NC_008340	CCG	2	6	90570	90575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
2040	NC_008340	CAC	2	6	90592	90597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319246
2041	NC_008340	GGC	2	6	90609	90614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
2042	NC_008340	CGG	3	9	90621	90629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
2043	NC_008340	GCCCGG	2	12	90636	90647	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2044	NC_008340	CCCGG	2	10	90786	90795	0 %	0 %	40 %	60 %	114319246
2045	NC_008340	CCCCTG	2	12	90819	90830	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319246
2046	NC_008340	CCGG	2	8	90847	90854	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2047	NC_008340	CGGC	2	8	90894	90901	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2048	NC_008340	GGA	2	6	90990	90995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319246
2049	NC_008340	GGT	2	6	91002	91007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319246
2050	NC_008340	CGG	2	6	91022	91027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
2051	NC_008340	CGGG	2	8	91048	91055	0 %	0 %	75 %	25 %	114319246
2052	NC_008340	GGGC	2	8	91078	91085	0 %	0 %	75 %	25 %	114319246
2053	NC_008340	GACG	2	8	91113	91120	25 %	0 %	50 %	25 %	114319246
2054	NC_008340	AGC	2	6	91145	91150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319246
2055	NC_008340	ACC	2	6	91172	91177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319246
2056	NC_008340	GC	3	6	91192	91197	0 %	0 %	50 %	50 %	114319246
2057	NC_008340	TAG	2	6	91330	91335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319247
2058	NC_008340	CAC	2	6	91371	91376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319247
2059	NC_008340	GTC	2	6	91392	91397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319247
2060	NC_008340	GCC	2	6	91407	91412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319247
2061	NC_008340	TGA	2	6	91439	91444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319247
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2063	NC_008340	CTC	2	6	91473	91478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319247
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2065	NC_008340	CTC	2	6	91500	91505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319247
2066	NC_008340	GTGGC	2	10	91534	91543	0 %	20 %	60 %	20 %	114319247
2067	NC_008340	GGC	2	6	91554	91559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319247
2068	NC_008340	CTC	2	6	91602	91607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319247
2069	NC_008340	CGG	2	6	91613	91618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319247
2070	NC_008340	TTC	2	6	91620	91625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319247
2071	NC_008340	CGT	2	6	91649	91654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319247
2072	NC_008340	CCCG	2	8	91679	91686	0 %	0 %	25 %	75 %	114319247
2073	NC_008340	GC	3	6	91747	91752	0 %	0 %	50 %	50 %	114319247
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2113	NC_008340	TGGATG	2	12	93346	93357	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	114319249
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2125	NC_008340	TCT	2	6	93828	93833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319250
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2127	NC_008340	CCG	2	6	93851	93856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319250
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2242	NC_008340	TCCGCC	2	12	100249	100260	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319255
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2245	NC_008340	CTG	2	6	100320	100325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319255
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2249	NC_008340	TCC	2	6	100420	100425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319255
2250	NC_008340	GGC	2	6	100455	100460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319255
2251	NC_008340	GAACAG	2	12	100491	100502	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	114319255
2252	NC_008340	CCG	2	6	100553	100558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319255
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2369	NC_008340	GCCT	2	8	105493	105500	0 %	25 %	25 %	50 %	114319260
2370	NC_008340	TGG	2	6	105563	105568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319260
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2490	NC_008340	CGT	2	6	111073	111078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319265
2491	NC_008340	GCA	2	6	111100	111105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319265
2492	NC_008340	GCG	2	6	111151	111156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319265
2493	NC_008340	GGC	3	9	111158	111166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319265
2494	NC_008340	GTCCGG	2	12	111176	111187	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319265
2495	NC_008340	CGG	2	6	111203	111208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319265
2496	NC_008340	GTG	2	6	111218	111223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319265
2497	NC_008340	GTA	2	6	111287	111292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319265
2498	NC_008340	TCG	2	6	111306	111311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319265
2499	NC_008340	GCCA	2	8	111321	111328	25 %	0 %	25 %	50 %	114319265
2500	NC_008340	GGT	2	6	111353	111358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319265

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