MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008340	CTC	2	6	69049	69054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319227
1502	NC_008340	TGG	2	6	69117	69122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319227
1503	NC_008340	GGT	2	6	69124	69129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319227
1504	NC_008340	CGG	2	6	69149	69154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1505	NC_008340	CTGG	2	8	69193	69200	0 %	25 %	50 %	25 %	114319227
1506	NC_008340	CGG	2	6	69234	69239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1507	NC_008340	GCG	2	6	69255	69260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1508	NC_008340	TC	3	6	69265	69270	0 %	50 %	0 %	50 %	114319227
1509	NC_008340	CG	3	6	69271	69276	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
1510	NC_008340	CGGC	2	8	69322	69329	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
1511	NC_008340	TGC	2	6	69345	69350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319227
1512	NC_008340	GCCA	2	8	69362	69369	25 %	0 %	25 %	50 %	114319227
1513	NC_008340	CTG	2	6	69371	69376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319227
1514	NC_008340	GTG	2	6	69384	69389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319227
1515	NC_008340	GC	3	6	69394	69399	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
1516	NC_008340	GCT	2	6	69409	69414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319227
1517	NC_008340	CCA	2	6	69432	69437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319227
1518	NC_008340	GC	3	6	69503	69508	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
1519	NC_008340	GCG	2	6	69516	69521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1520	NC_008340	GCCGC	2	10	69613	69622	0 %	0 %	40 %	60 %	114319228
1521	NC_008340	GGCC	2	8	69623	69630	0 %	0 %	50 %	50 %	114319228
1522	NC_008340	C	6	6	69629	69634	0 %	0 %	0 %	100 %	114319228
1523	NC_008340	CTA	2	6	69769	69774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319228
1524	NC_008340	AGG	2	6	69789	69794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319228
1525	NC_008340	CGG	2	6	69884	69889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319228
1526	NC_008340	CGGG	2	8	69914	69921	0 %	0 %	75 %	25 %	114319228
1527	NC_008340	GC	3	6	69926	69931	0 %	0 %	50 %	50 %	114319228
1528	NC_008340	TGG	2	6	69954	69959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319228
1529	NC_008340	AGG	2	6	69972	69977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319228
1530	NC_008340	GCA	2	6	70033	70038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319228
1531	NC_008340	GCC	2	6	70091	70096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319228
1532	NC_008340	CAC	2	6	70195	70200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319228
1533	NC_008340	GAC	2	6	70302	70307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319229
1534	NC_008340	GCA	2	6	70381	70386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319229
1535	NC_008340	GGGC	2	8	70559	70566	0 %	0 %	75 %	25 %	114319229
1536	NC_008340	GCTG	2	8	70594	70601	0 %	25 %	50 %	25 %	114319229
1537	NC_008340	GGCCAT	2	12	70634	70645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319229
1538	NC_008340	CCG	2	6	70651	70656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319229
1539	NC_008340	GTG	2	6	70794	70799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319229
1540	NC_008340	CGGG	2	8	70808	70815	0 %	0 %	75 %	25 %	114319229
1541	NC_008340	AGG	2	6	70819	70824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319229
1542	NC_008340	GGGC	2	8	70912	70919	0 %	0 %	75 %	25 %	114319229
1543	NC_008340	GGC	2	6	70961	70966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319229
1544	NC_008340	ACG	2	6	70975	70980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319229
1545	NC_008340	CGC	2	6	70988	70993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319229
1546	NC_008340	GGCG	2	8	71063	71070	0 %	0 %	75 %	25 %	114319229
1547	NC_008340	TGA	2	6	71080	71085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319229
1548	NC_008340	CTG	2	6	71205	71210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319229
1549	NC_008340	TGG	2	6	71233	71238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319229
1550	NC_008340	CGT	2	6	71430	71435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319230
1551	NC_008340	GCC	2	6	71464	71469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319230
1552	NC_008340	GGT	2	6	71484	71489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319230
1553	NC_008340	CGG	2	6	71493	71498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319230
1554	NC_008340	CGG	2	6	71592	71597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319230
1555	NC_008340	CGG	2	6	71600	71605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319230
1556	NC_008340	GCC	2	6	71671	71676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319230
1557	NC_008340	GCC	2	6	71717	71722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319230
1558	NC_008340	GCT	2	6	71730	71735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319230
1559	NC_008340	TCG	2	6	71738	71743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319230
1560	NC_008340	GAC	2	6	71800	71805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319230
1561	NC_008340	TGG	2	6	71807	71812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319230
1562	NC_008340	CGG	2	6	71823	71828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319230
1563	NC_008340	GGC	3	9	71841	71849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319230
1564	NC_008340	TGG	2	6	71891	71896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319230
1565	NC_008340	CAT	2	6	72047	72052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319231
1566	NC_008340	CGC	2	6	72062	72067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319231
1567	NC_008340	GAA	2	6	72149	72154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319231
1568	NC_008340	TGA	2	6	72160	72165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319231
1569	NC_008340	TCA	2	6	72232	72237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319231
1570	NC_008340	ATC	2	6	72294	72299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319231
1571	NC_008340	TGG	2	6	72307	72312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319231
1572	NC_008340	GAG	2	6	72336	72341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319231
1573	NC_008340	GCA	2	6	72356	72361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319231
1574	NC_008340	GCC	2	6	72366	72371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319231
1575	NC_008340	CGC	2	6	72374	72379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319231
1576	NC_008340	CAT	2	6	72398	72403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319231
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1581	NC_008340	GCC	2	6	72551	72556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319231
1582	NC_008340	GGA	2	6	72563	72568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319231
1583	NC_008340	ACCA	2	8	72573	72580	50 %	0 %	0 %	50 %	114319231
1584	NC_008340	CAG	2	6	72585	72590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319231
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1589	NC_008340	GC	3	6	72776	72781	0 %	0 %	50 %	50 %	114319231
1590	NC_008340	CGG	2	6	72794	72799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319231
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1595	NC_008340	GAC	2	6	73002	73007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319231
1596	NC_008340	CCA	2	6	73046	73051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319231
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1602	NC_008340	GTG	2	6	73228	73233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319231
1603	NC_008340	GCA	2	6	73235	73240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319231
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1605	NC_008340	CGA	3	9	73453	73461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319232
1606	NC_008340	CCTGC	2	10	73471	73480	0 %	20 %	20 %	60 %	114319232
1607	NC_008340	CCG	2	6	73506	73511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319232
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1620	NC_008340	GCCG	2	8	74120	74127	0 %	0 %	50 %	50 %	114319233
1621	NC_008340	GGC	2	6	74276	74281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319233
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1997	NC_008340	ATG	2	6	88588	88593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319243
1998	NC_008340	GTG	2	6	88636	88641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319243
1999	NC_008340	CGG	2	6	88682	88687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319243
2000	NC_008340	GC	3	6	88703	88708	0 %	0 %	50 %	50 %	114319243

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