MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_008340	ACC	2	6	329097	329102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319449
7502	NC_008340	CAG	2	6	329120	329125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319449
7503	NC_008340	CGG	2	6	329176	329181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319449
7504	NC_008340	GGC	3	9	329248	329256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319449
7505	NC_008340	CTG	2	6	329261	329266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319449
7506	NC_008340	CGG	2	6	329268	329273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319449
7507	NC_008340	GGC	2	6	329294	329299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319449
7508	NC_008340	GCC	2	6	329325	329330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319449
7509	NC_008340	GGA	2	6	329498	329503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319450
7510	NC_008340	CCA	2	6	329513	329518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319450
7511	NC_008340	GC	3	6	329586	329591	0 %	0 %	50 %	50 %	114319450
7512	NC_008340	TGG	2	6	329611	329616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319450
7513	NC_008340	GCA	2	6	329660	329665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319450
7514	NC_008340	TG	3	6	329973	329978	0 %	50 %	50 %	0 %	114319451
7515	NC_008340	CGA	2	6	329984	329989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319451
7516	NC_008340	AGC	2	6	330001	330006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319451
7517	NC_008340	GGA	2	6	330044	330049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319451
7518	NC_008340	CAC	2	6	330089	330094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319451
7519	NC_008340	CGC	2	6	330098	330103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319451
7520	NC_008340	CAGTTC	2	12	330123	330134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114319451
7521	NC_008340	CGG	2	6	330169	330174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319451
7522	NC_008340	CGA	2	6	330221	330226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319451
7523	NC_008340	GTG	3	9	330234	330242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319451
7524	NC_008340	GCC	2	6	330285	330290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319451
7525	NC_008340	GC	3	6	330309	330314	0 %	0 %	50 %	50 %	114319451
7526	NC_008340	AGG	2	6	330361	330366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319451
7527	NC_008340	GCC	2	6	330369	330374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319451
7528	NC_008340	CAT	2	6	330401	330406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319451
7529	NC_008340	CGG	3	9	330424	330432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319451
7530	NC_008340	CGG	2	6	330505	330510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319451
7531	NC_008340	CCA	2	6	330544	330549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319451
7532	NC_008340	GAG	2	6	330606	330611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319451
7533	NC_008340	CGG	2	6	330677	330682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319451
7534	NC_008340	CG	3	6	330722	330727	0 %	0 %	50 %	50 %	114319451
7535	NC_008340	GCT	2	6	330749	330754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319451
7536	NC_008340	ACC	2	6	330775	330780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319451
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7538	NC_008340	GGCCT	2	10	330858	330867	0 %	20 %	40 %	40 %	114319451
7539	NC_008340	CGA	2	6	330881	330886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319451
7540	NC_008340	GCC	2	6	330978	330983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319451
7541	NC_008340	ATG	2	6	331030	331035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319451
7542	NC_008340	ATC	2	6	331059	331064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319451
7543	NC_008340	GCG	2	6	331109	331114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319451
7544	NC_008340	GCT	2	6	331115	331120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319451
7545	NC_008340	CTA	2	6	331190	331195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319451
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7547	NC_008340	TGGC	2	8	331320	331327	0 %	25 %	50 %	25 %	114319452
7548	NC_008340	GCC	2	6	331329	331334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319452
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7550	NC_008340	CGT	2	6	331366	331371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319452
7551	NC_008340	CGCC	2	8	331407	331414	0 %	0 %	25 %	75 %	114319452
7552	NC_008340	ACC	2	6	331429	331434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319452
7553	NC_008340	CTG	2	6	331441	331446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319452
7554	NC_008340	GCG	2	6	331464	331469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319452
7555	NC_008340	GCCG	2	8	331526	331533	0 %	0 %	50 %	50 %	114319452
7556	NC_008340	CTG	2	6	331546	331551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319452
7557	NC_008340	CG	3	6	331552	331557	0 %	0 %	50 %	50 %	114319452
7558	NC_008340	GCG	2	6	331600	331605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319452
7559	NC_008340	GC	3	6	331621	331626	0 %	0 %	50 %	50 %	114319452
7560	NC_008340	TCG	2	6	331637	331642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319452
7561	NC_008340	GAC	2	6	331675	331680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319452
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7564	NC_008340	GGA	2	6	331821	331826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319452
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7570	NC_008340	TGGG	2	8	331972	331979	0 %	25 %	75 %	0 %	114319452
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7574	NC_008340	GAG	2	6	332167	332172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319452
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7580	NC_008340	GCT	2	6	332424	332429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319452
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7582	NC_008340	CAGGCG	2	12	332515	332526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319452
7583	NC_008340	TGA	2	6	332546	332551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319452
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7586	NC_008340	GGCC	2	8	332650	332657	0 %	0 %	50 %	50 %	114319452
7587	NC_008340	GCACC	2	10	332724	332733	20 %	0 %	20 %	60 %	114319452
7588	NC_008340	G	6	6	332777	332782	0 %	0 %	100 %	0 %	114319452
7589	NC_008340	GCAA	2	8	332792	332799	50 %	0 %	25 %	25 %	114319452
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7592	NC_008340	CGT	2	6	332923	332928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319453
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7601	NC_008340	CGG	2	6	333226	333231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319453
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7604	NC_008340	GTC	2	6	333336	333341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319453
7605	NC_008340	AGA	2	6	333344	333349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319453
7606	NC_008340	GTT	2	6	333377	333382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319453
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7611	NC_008340	GTT	2	6	333516	333521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319453
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7616	NC_008340	GGT	2	6	335262	335267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319454
7617	NC_008340	GCGG	2	8	335283	335290	0 %	0 %	75 %	25 %	114319454
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7621	NC_008340	CGG	2	6	335450	335455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319454
7622	NC_008340	GGC	3	9	335466	335474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319454
7623	NC_008340	GGA	2	6	335475	335480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319454
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7653	NC_008340	CTG	2	6	336669	336674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319455
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7855	NC_008340	CGC	2	6	343250	343255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319463
7856	NC_008340	GC	3	6	343423	343428	0 %	0 %	50 %	50 %	114319463
7857	NC_008340	CGC	2	6	343431	343436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319463
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7860	NC_008340	CGG	2	6	343491	343496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319463
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7983	NC_008340	ACC	2	6	348411	348416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319469
7984	NC_008340	GCCCC	2	10	348438	348447	0 %	0 %	20 %	80 %	114319469
7985	NC_008340	CCA	2	6	348448	348453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319469
7986	NC_008340	GCA	2	6	348500	348505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319469
7987	NC_008340	GCA	2	6	348544	348549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319469
7988	NC_008340	GCGCC	2	10	348556	348565	0 %	0 %	40 %	60 %	114319469
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7991	NC_008340	GGT	2	6	348668	348673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319469
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