MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73501	NC_008340	CCT	2	6	3241140	3241145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321999
73502	NC_008340	ATC	2	6	3241160	3241165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321999
73503	NC_008340	CCA	2	6	3241221	3241226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321999
73504	NC_008340	CAG	2	6	3241237	3241242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321999
73505	NC_008340	GCGG	2	8	3241249	3241256	0 %	0 %	75 %	25 %	114321999
73506	NC_008340	GCC	2	6	3241327	3241332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321999
73507	NC_008340	CCGG	2	8	3241536	3241543	0 %	0 %	50 %	50 %	114321999
73508	NC_008340	CGACCC	2	12	3241593	3241604	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321999
73509	NC_008340	CTC	2	6	3241633	3241638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321999
73510	NC_008340	GCC	2	6	3241690	3241695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321999
73511	NC_008340	GAT	2	6	3241792	3241797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321999
73512	NC_008340	TCC	2	6	3241856	3241861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321999
73513	NC_008340	CAC	2	6	3241888	3241893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321999
73514	NC_008340	GGC	2	6	3241927	3241932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321999
73515	NC_008340	TGG	2	6	3241950	3241955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321999
73516	NC_008340	GTC	2	6	3241996	3242001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321999
73517	NC_008340	GAG	2	6	3242068	3242073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321999
73518	NC_008340	GCCC	2	8	3242091	3242098	0 %	0 %	25 %	75 %	114321999
73519	NC_008340	TGC	2	6	3242148	3242153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321999
73520	NC_008340	CAG	2	6	3242170	3242175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321999
73521	NC_008340	C	6	6	3242182	3242187	0 %	0 %	0 %	100 %	114321999
73522	NC_008340	GCC	2	6	3242188	3242193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321999
73523	NC_008340	TTC	2	6	3242222	3242227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321999
73524	NC_008340	GCC	2	6	3242240	3242245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321999
73525	NC_008340	GCGCCA	2	12	3242262	3242273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321999
73526	NC_008340	CGG	2	6	3242285	3242290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321999
73527	NC_008340	CCT	2	6	3242313	3242318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321999
73528	NC_008340	CAC	2	6	3242350	3242355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321999
73529	NC_008340	AGAC	2	8	3242375	3242382	50 %	0 %	25 %	25 %	114321999
73530	NC_008340	TGG	2	6	3242385	3242390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321999
73531	NC_008340	TGA	2	6	3242391	3242396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321999
73532	NC_008340	CGT	2	6	3242439	3242444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321999
73533	NC_008340	CGG	2	6	3242456	3242461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321999
73534	NC_008340	CCA	2	6	3242559	3242564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321999
73535	NC_008340	GCG	3	9	3242651	3242659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321999
73536	NC_008340	TTA	2	6	3242660	3242665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114321999
73537	NC_008340	CAT	2	6	3242868	3242873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114322000
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73539	NC_008340	TGC	2	6	3242941	3242946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322000
73540	NC_008340	CCG	2	6	3242987	3242992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322000
73541	NC_008340	GGC	2	6	3243012	3243017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114322000
73542	NC_008340	CTC	2	6	3243072	3243077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114322000
73543	NC_008340	CCT	2	6	3243098	3243103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114322000
73544	NC_008340	GTA	2	6	3243111	3243116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114322000
73545	NC_008340	TCG	2	6	3243139	3243144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322000
73546	NC_008340	G	6	6	3243161	3243166	0 %	0 %	100 %	0 %	114322000
73547	NC_008340	TCA	2	6	3243167	3243172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114322000
73548	NC_008340	CAGCTG	2	12	3243201	3243212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114322000
73549	NC_008340	GCGA	2	8	3243241	3243248	25 %	0 %	50 %	25 %	114322000
73550	NC_008340	GTT	2	6	3243261	3243266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114322000
73551	NC_008340	CGC	2	6	3243303	3243308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322000
73552	NC_008340	CGCC	2	8	3243317	3243324	0 %	0 %	25 %	75 %	114322000
73553	NC_008340	GCAG	2	8	3243349	3243356	25 %	0 %	50 %	25 %	114322000
73554	NC_008340	GCCA	2	8	3243363	3243370	25 %	0 %	25 %	50 %	114322000
73555	NC_008340	CCA	2	6	3243682	3243687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114322001
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73558	NC_008340	CCACC	2	10	3243766	3243775	20 %	0 %	0 %	80 %	114322001
73559	NC_008340	GTT	2	6	3243776	3243781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114322001
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73566	NC_008340	GAA	2	6	3244421	3244426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114322001
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73572	NC_008340	CGCTAT	2	12	3244806	3244817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114322002
73573	NC_008340	CGCGGC	2	12	3244904	3244915	0 %	0 %	50 %	50 %	114322002
73574	NC_008340	GCT	3	9	3244922	3244930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322002
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73576	NC_008340	CGA	2	6	3244991	3244996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114322002
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73580	NC_008340	CCGG	2	8	3245165	3245172	0 %	0 %	50 %	50 %	114322002
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73585	NC_008340	TCCA	2	8	3245310	3245317	25 %	25 %	0 %	50 %	114322002
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73588	NC_008340	GC	3	6	3245458	3245463	0 %	0 %	50 %	50 %	114322002
73589	NC_008340	TGG	2	6	3245473	3245478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322002
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73599	NC_008340	CCA	2	6	3245918	3245923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114322003
73600	NC_008340	TGGG	2	8	3245956	3245963	0 %	25 %	75 %	0 %	114322003
73601	NC_008340	CGCC	2	8	3245973	3245980	0 %	0 %	25 %	75 %	114322003
73602	NC_008340	CTT	2	6	3246000	3246005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114322003
73603	NC_008340	CTGG	2	8	3246006	3246013	0 %	25 %	50 %	25 %	114322003
73604	NC_008340	CCTGG	2	10	3246024	3246033	0 %	20 %	40 %	40 %	114322003
73605	NC_008340	CCT	2	6	3246146	3246151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114322003
73606	NC_008340	GCC	2	6	3246157	3246162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322003
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73614	NC_008340	CGA	2	6	3246604	3246609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114322004
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73616	NC_008340	TGG	2	6	3246618	3246623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322004
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73733	NC_008340	TGG	2	6	3252114	3252119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322008
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73952	NC_008340	CCGC	2	8	3260587	3260594	0 %	0 %	25 %	75 %	114322015
73953	NC_008340	CCT	2	6	3260602	3260607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114322015
73954	NC_008340	CGGGCC	2	12	3260631	3260642	0 %	0 %	50 %	50 %	114322015
73955	NC_008340	GAT	2	6	3260684	3260689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114322015
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73958	NC_008340	CAG	2	6	3260765	3260770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114322015
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73960	NC_008340	CCA	2	6	3260818	3260823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114322015
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