MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008340	CCA	2	6	240926	240931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319370
5502	NC_008340	TGC	2	6	240953	240958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319370
5503	NC_008340	CGC	2	6	240989	240994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319370
5504	NC_008340	AGC	2	6	241003	241008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319370
5505	NC_008340	TGC	2	6	241036	241041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319370
5506	NC_008340	AGC	2	6	241042	241047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319370
5507	NC_008340	CAG	2	6	241065	241070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319370
5508	NC_008340	CGC	2	6	241239	241244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319371
5509	NC_008340	GTTCGC	2	12	241263	241274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5510	NC_008340	GTG	2	6	241282	241287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319371
5511	NC_008340	GCC	2	6	241291	241296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319371
5512	NC_008340	CCA	2	6	241299	241304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319371
5513	NC_008340	CGG	2	6	241365	241370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319371
5514	NC_008340	CAG	2	6	241381	241386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5515	NC_008340	GGCCAG	2	12	241396	241407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319371
5516	NC_008340	GCT	2	6	241413	241418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5517	NC_008340	CGA	2	6	241452	241457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5518	NC_008340	CAGGG	2	10	241463	241472	20 %	0 %	60 %	20 %	114319371
5519	NC_008340	TGTCGG	2	12	241473	241484	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114319371
5520	NC_008340	CGT	2	6	241518	241523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5521	NC_008340	GCT	2	6	241575	241580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5522	NC_008340	CAC	2	6	241633	241638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319371
5523	NC_008340	CCGG	2	8	241642	241649	0 %	0 %	50 %	50 %	114319371
5524	NC_008340	CAG	2	6	241690	241695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5525	NC_008340	GCC	2	6	241715	241720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319371
5526	NC_008340	CCG	2	6	241754	241759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319371
5527	NC_008340	GCC	2	6	241793	241798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319371
5528	NC_008340	GCG	2	6	241904	241909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319371
5529	NC_008340	GCC	2	6	241913	241918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319371
5530	NC_008340	GGGT	2	8	241991	241998	0 %	25 %	75 %	0 %	114319371
5531	NC_008340	AGC	2	6	242106	242111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5532	NC_008340	CATCT	2	10	242137	242146	20 %	40 %	0 %	40 %	114319371
5533	NC_008340	ACC	2	6	242171	242176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319371
5534	NC_008340	CGC	2	6	242187	242192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319371
5535	NC_008340	CGG	2	6	242193	242198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319371
5536	NC_008340	GC	3	6	242251	242256	0 %	0 %	50 %	50 %	114319371
5537	NC_008340	GCA	2	6	242265	242270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319371
5538	NC_008340	AGTTGG	2	12	242277	242288	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	114319371
5539	NC_008340	GGT	2	6	242316	242321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319371
5540	NC_008340	GGC	2	6	242362	242367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319371
5541	NC_008340	CA	3	6	242433	242438	50 %	0 %	0 %	50 %	114319371
5542	NC_008340	GCCG	2	8	242439	242446	0 %	0 %	50 %	50 %	114319371
5543	NC_008340	GTG	2	6	242496	242501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319372
5544	NC_008340	TCG	2	6	242515	242520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319372
5545	NC_008340	AGG	2	6	242560	242565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319372
5546	NC_008340	GTG	2	6	242566	242571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319372
5547	NC_008340	GAG	2	6	242580	242585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319372
5548	NC_008340	CGG	2	6	242893	242898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319373
5549	NC_008340	CGGTGA	2	12	242944	242955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319373
5550	NC_008340	G	7	7	242958	242964	0 %	0 %	100 %	0 %	114319373
5551	NC_008340	GC	3	6	242972	242977	0 %	0 %	50 %	50 %	114319373
5552	NC_008340	GGA	2	6	243017	243022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319373
5553	NC_008340	CGGA	2	8	243098	243105	25 %	0 %	50 %	25 %	114319373
5554	NC_008340	CTGG	2	8	243111	243118	0 %	25 %	50 %	25 %	114319373
5555	NC_008340	G	6	6	243128	243133	0 %	0 %	100 %	0 %	114319373
5556	NC_008340	ACG	2	6	243163	243168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319373
5557	NC_008340	TGC	2	6	243262	243267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319373
5558	NC_008340	GCC	2	6	243315	243320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319373
5559	NC_008340	GGA	2	6	243392	243397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319373
5560	NC_008340	TGG	2	6	243406	243411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319373
5561	NC_008340	GTC	2	6	243463	243468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319374
5562	NC_008340	CCT	3	9	243513	243521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319374
5563	NC_008340	CGG	2	6	243566	243571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319374
5564	NC_008340	GGT	2	6	243582	243587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319374
5565	NC_008340	GCCG	2	8	243642	243649	0 %	0 %	50 %	50 %	114319374
5566	NC_008340	GTT	2	6	243666	243671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319374
5567	NC_008340	GTC	2	6	243691	243696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319374
5568	NC_008340	GGA	2	6	243699	243704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319374
5569	NC_008340	GTC	2	6	243877	243882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319374
5570	NC_008340	CAG	2	6	243883	243888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319374
5571	NC_008340	TCA	2	6	243948	243953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319374
5572	NC_008340	TGC	2	6	244566	244571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319375
5573	NC_008340	CCGGC	2	10	244584	244593	0 %	0 %	40 %	60 %	114319375
5574	NC_008340	TGGC	2	8	244614	244621	0 %	25 %	50 %	25 %	114319375
5575	NC_008340	CAT	2	6	244649	244654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319375
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5577	NC_008340	GCT	2	6	244721	244726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319375
5578	NC_008340	GGC	2	6	244727	244732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319375
5579	NC_008340	CGG	3	9	244735	244743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319375
5580	NC_008340	GGGC	2	8	244789	244796	0 %	0 %	75 %	25 %	114319375
5581	NC_008340	CAG	3	9	244853	244861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
5582	NC_008340	GC	3	6	244867	244872	0 %	0 %	50 %	50 %	114319375
5583	NC_008340	G	6	6	244876	244881	0 %	0 %	100 %	0 %	114319375
5584	NC_008340	CCT	2	6	244891	244896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319375
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5586	NC_008340	GTGG	2	8	244973	244980	0 %	25 %	75 %	0 %	114319375
5587	NC_008340	CTGG	2	8	245000	245007	0 %	25 %	50 %	25 %	114319375
5588	NC_008340	AGC	2	6	245016	245021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
5589	NC_008340	GGT	2	6	245050	245055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319375
5590	NC_008340	GTA	2	6	245102	245107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319375
5591	NC_008340	ACG	2	6	245121	245126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
5592	NC_008340	CAT	2	6	245135	245140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319375
5593	NC_008340	G	6	6	245183	245188	0 %	0 %	100 %	0 %	114319375
5594	NC_008340	GCA	2	6	245215	245220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
5595	NC_008340	GTT	2	6	245260	245265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319375
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5597	NC_008340	CG	3	6	245387	245392	0 %	0 %	50 %	50 %	114319375
5598	NC_008340	TCA	2	6	245395	245400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319375
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5601	NC_008340	CCT	2	6	245805	245810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319376
5602	NC_008340	CGG	2	6	245826	245831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319376
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5604	NC_008340	ATG	2	6	245888	245893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319376
5605	NC_008340	GCC	2	6	245974	245979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319376
5606	NC_008340	CAC	2	6	245980	245985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319376
5607	NC_008340	GAA	2	6	245986	245991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319376
5608	NC_008340	GCC	2	6	246010	246015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319376
5609	NC_008340	CAT	2	6	246073	246078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319376
5610	NC_008340	CAG	2	6	246094	246099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319376
5611	NC_008340	GGCGA	2	10	246128	246137	20 %	0 %	60 %	20 %	114319376
5612	NC_008340	GTT	2	6	246172	246177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319376
5613	NC_008340	GCAC	2	8	246197	246204	25 %	0 %	25 %	50 %	114319376
5614	NC_008340	GTT	2	6	246259	246264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319376
5615	NC_008340	TGC	2	6	246294	246299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319376
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5617	NC_008340	CGG	2	6	246357	246362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319376
5618	NC_008340	TCA	2	6	246414	246419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319376
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5620	NC_008340	AGGA	2	8	246464	246471	50 %	0 %	50 %	0 %	114319376
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5984	NC_008340	ATGC	2	8	261111	261118	25 %	25 %	25 %	25 %	114319388
5985	NC_008340	G	6	6	261150	261155	0 %	0 %	100 %	0 %	114319388
5986	NC_008340	GCG	2	6	261167	261172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319388
5987	NC_008340	GCCGG	2	10	261268	261277	0 %	0 %	60 %	40 %	114319388
5988	NC_008340	GCCC	2	8	261279	261286	0 %	0 %	25 %	75 %	114319388
5989	NC_008340	CGA	2	6	261288	261293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319388
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5991	NC_008340	TAGA	2	8	261391	261398	50 %	25 %	25 %	0 %	114319389
5992	NC_008340	GCC	2	6	261448	261453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
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